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tRNA衍生片段和tRNA半分子的生物学功能及其在疾病发生中的作用 被引量:6
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作者 朱林文 谢依 郭俊明 《生物化学与生物物理进展》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2017年第7期565-572,共8页
tRNA衍生片段(tRNA-derived RNA fragment,t RF)和tRNA半分子(tRNA halves,ti RNA)由成熟tRNA或其前体tRNA在不同位点特异性剪切产生,它们是一类广泛存在于原核生物和真核生物转录组中的非编码小RNA分子.t RF主要有tRF-5、tRF-3和tRF-1... tRNA衍生片段(tRNA-derived RNA fragment,t RF)和tRNA半分子(tRNA halves,ti RNA)由成熟tRNA或其前体tRNA在不同位点特异性剪切产生,它们是一类广泛存在于原核生物和真核生物转录组中的非编码小RNA分子.t RF主要有tRF-5、tRF-3和tRF-1等3亚类,分别来自成熟tRNA的D环至反密码环茎区间切割至5′端、T环开始至3′端和前体tRNA的3′端尾部,其长度为14~30个核苷酸(nucleotide,nt).ti RNA主要有5′ti RNA和3′ti RNA等2亚类,是在成熟tRNA反密码子环处切割分别产生,其长度为29~50 nt.t RF和ti RNA具有多种生物学功能,既可以在应激反应中作为信号分子,又可以作为基因表达的调节者.它们与人类多种疾病(如肿瘤、神经退行性疾病、代谢性疾病和传染病等)的发生密切相关,有希望成为疾病诊断的新型标志物.本文就t RF和ti RNA的分类、生物学功能以及与人类疾病的关系作一综述. 展开更多
关键词 trna衍生片段 trna分子 基因表达调控 疾病发生
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tRNA衍生片段的鉴定及对靶分子的调节机制 被引量:1
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作者 黄炯杰 陈乐意 廖奇 《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第4期438-451,共14页
随着测序技术的发展和对tRNA衍生小分子(tRNA-derived small RNA,tsRNAs)的深入研究,越来越多的tsRNAs及其功能在各物种中被鉴定。tsRNAs根据切割位点的不同可分为tRNA衍生片段(tRNA-derived fragment,tRF)和tRNA应激诱导RNA(tRNA-deriv... 随着测序技术的发展和对tRNA衍生小分子(tRNA-derived small RNA,tsRNAs)的深入研究,越来越多的tsRNAs及其功能在各物种中被鉴定。tsRNAs根据切割位点的不同可分为tRNA衍生片段(tRNA-derived fragment,tRF)和tRNA应激诱导RNA(tRNA-derived stress-induced RNA,tiRNA),其中tRF是一类具有调节功能的非编码RNA。为了加深对tRF的研究,近年来一些基于测序数据的tRF鉴定方法和相关数据库不断涌现,前者主要包括Telonis等人的算法和tDRmapper方法,后者主要有tRFdb、tRF2Cancer和MINTbase等。同时这两者为tRF的深入研究提供了更有效的工具。大量的研究表明,tRF主要以类似miRNA的方式对RNA、DNA及蛋白质进行调节,但也存在特异的作用方式。随着对这三者的深入研究,研究人员发现tRF在人类疾病的各种生物过程中也扮演着重要的角色,例如可以作为生物标志物。因此本文主要对tRF的鉴定方法、数据库、对靶分子的调节机制及其与人类疾病的关系作一综述。 展开更多
关键词 trna衍生分子 trna衍生片段 数据库 生物信息学鉴定
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tRNA来源的小RNA在神经精神疾病中的作用研究进展
3
作者 初帅 吴婷婷 +4 位作者 洪青晓 陈为升 周文华 刘惠芬 禹海航 《中国药理学通报》 北大核心 2025年第2期219-225,共7页
转运核糖核酸(tRNA)衍生的小分子RNA(transfer-RNA derived small RNA,tsRNA)是近年来新发现的一类由成熟tRNA或其前体通过特殊的内切酶介导产生的非编码RNA。已有的研究揭示,tsRNA能够在转录及转录后水平上调控基因表达,能以表观遗传... 转运核糖核酸(tRNA)衍生的小分子RNA(transfer-RNA derived small RNA,tsRNA)是近年来新发现的一类由成熟tRNA或其前体通过特殊的内切酶介导产生的非编码RNA。已有的研究揭示,tsRNA能够在转录及转录后水平上调控基因表达,能以表观遗传调控因子方式,在多种生物体的生理和病理过程中发挥重要作用,因此,其逐渐成为生物医学的研究热点而引起广泛关注。而且越来越多的证据显示,tsRNA通过对应激反应、细胞增殖与凋亡、神经发育、突触可塑性、神经炎症与免疫调节、表观遗传、RNA加工和蛋白质翻译调控等参与许多神经精神疾病的发生和发展过程。该文主要就tsRNA的生成和分类及其生物学功能,阐述tsRNA在神经发育和神经精神疾病中的作用和可能作用机制,从而进一步揭示tsRNA作为神经精神疾病可靠生物标志物和治疗靶点的潜力。 展开更多
关键词 trna来源的小RNA trna衍生的应激诱导的RNA trna衍生片段 神经精神疾病 基因调控 生物标志物
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tRNA衍生片段在肿瘤中的研究进展
4
作者 周永强 吴永娜 李汛 《中国肿瘤临床》 CAS CSCD 北大核心 2019年第14期745-749,共5页
tRNA衍生片段(tRNA-derived fragments,tRF&tiRNA)为近年来新发现的一类非编码RNA(non-coding RNA,ncRNA),其在外周血循环中表达稳定.tRF&tiRNA通过调控基因表达与基因沉默、调节细胞增殖与凋亡、调节翻译等方式在人类肿瘤中发... tRNA衍生片段(tRNA-derived fragments,tRF&tiRNA)为近年来新发现的一类非编码RNA(non-coding RNA,ncRNA),其在外周血循环中表达稳定.tRF&tiRNA通过调控基因表达与基因沉默、调节细胞增殖与凋亡、调节翻译等方式在人类肿瘤中发挥重要作用.tRF&tiRNA组织特异性、高度丰富且稳定、广泛存在的特征使其在肿瘤领域的研究中具有明显优势.tRF&tiRNA的异常表达可能为肿瘤中潜在的诊断、预后判断的生物标志物或治疗靶点.本文通过总结tRF&tiRNA不同亚型的来源、结构、生物学特征及功能,探讨其与肿瘤的潜在关系及作用机制,以期为肿瘤的早期诊断及靶向治疗提供新思路. 展开更多
关键词 trna衍生片段 TRF tiRNA 肿瘤
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血管生成素与tRNA片段化 被引量:1
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作者 付汉江 郑晓飞 《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2015年第12期1242-1246,共5页
t RNA主要功能是转运氨基酸参与蛋白质合成,在蛋白质生物合成过程中起着关键性的作用.近年来发现,t RNA是细胞内小RNA分子的重要来源,具有其它重要的生物学功能.来源于成熟t RNA分子的t RNA片段根据切割位置及生成机制的不同,主要分为两... t RNA主要功能是转运氨基酸参与蛋白质合成,在蛋白质生物合成过程中起着关键性的作用.近年来发现,t RNA是细胞内小RNA分子的重要来源,具有其它重要的生物学功能.来源于成熟t RNA分子的t RNA片段根据切割位置及生成机制的不同,主要分为两类:一类是t RNA半分子(t RNA halves);另一类是较小的t RNA片段,称为t RFs(t RNA fragments).在哺乳动物细胞中,t RNA半分子由血管生成素在t RNA分子反密码环处切割生成.本文主要针对t RNA半分子的加工机制、功能及在临床上的潜在应用进行综述. 展开更多
关键词 血管生成素 trna trna分子
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tRNA修饰在胶质瘤中的研究进展
6
作者 翟贝 魏灯 王萍 《中国肿瘤临床》 CAS CSCD 北大核心 2024年第11期567-571,共5页
转运RNA(transfer RNA,tRNA)是哺乳动物细胞中修饰程度最高的RNA,其修饰不仅高度动态,并且易受环境条件的影响。肿瘤发生常伴有tRNA修饰异常。研究发现tRNA修饰酶在多种肿瘤组织中异常表达,与发病机制密切相关。胶质瘤是最常见的原发性... 转运RNA(transfer RNA,tRNA)是哺乳动物细胞中修饰程度最高的RNA,其修饰不仅高度动态,并且易受环境条件的影响。肿瘤发生常伴有tRNA修饰异常。研究发现tRNA修饰酶在多种肿瘤组织中异常表达,与发病机制密切相关。胶质瘤是最常见的原发性中枢神经系统肿瘤,恶性程度最高,预后极差。本文主要针对胶质瘤相关的几种t RNA修饰予以综述,描述其在胶质瘤发生发展中的功能和机制,为探索tRNA异常修饰生成的衍生片段作为胶质瘤诊断的生物标志物,以及设计靶向表观遗传调控因子的小分子抑制剂作为胶质瘤的治疗靶点提供新思路。 展开更多
关键词 胶质瘤 trna修饰 甲基化 trna衍生片段
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转运RNA衍生片段在甲状腺癌发病机制中的作用
7
作者 彭妙官 赖英荣 《中山大学学报(医学科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2022年第3期437-448,共12页
【目的】探讨tRNA衍生片段(tRFs)3'tiR_026_GlnCTG(n)在甲状腺乳头状癌(PTC)中的表达及其致癌机制。【方法】首先取2对PTC和邻近正常甲状腺组织用于高通量芯片检测,筛选差异tRFs。在芯片结果基础上,我们在10对PTC和邻近正常甲状腺... 【目的】探讨tRNA衍生片段(tRFs)3'tiR_026_GlnCTG(n)在甲状腺乳头状癌(PTC)中的表达及其致癌机制。【方法】首先取2对PTC和邻近正常甲状腺组织用于高通量芯片检测,筛选差异tRFs。在芯片结果基础上,我们在10对PTC和邻近正常甲状腺组织中验证了差异明显的tRNA衍生片段的表达。接着扩大样本量,继续收集共46例患者的PTC和邻近正常甲状腺组织,通过定量聚合酶链反应(qPCR)验证3'tiR_026_GlnCTG(n)的表达量。将3'tiR_026_GlnCTG(n)的mimic转染到PTC细胞系中,通过定量反转录聚合酶链反应(qRT-PCR)检测表达水平,证实成功转染。同时,裂解转染的细胞系,提取蛋白,用包括MEK/ERK/p90RSK信号通路在内的相关抗体进行孵育,并进行蛋白免疫印迹(WB)。【结果】3'tiR_026_GlnCTG(n)是PTC组织与相邻正常甲状腺组织中表达水平差异最显著的tRFs之一(P<0.05)。过表达3'tiR_026_GlnCTG(n)促进KTC1细胞及BCPAP细胞的迁移、侵袭和增殖能力,用MEK/ERK通路抑制剂处理后降低KTC1细胞及BCPAP细胞迁移、侵袭和增殖能力。在3'tiR_026_GlnCTG(n)过表达的细胞中,MEK、ERK及其下游靶点p90RSK的磷酸化水平显著升高。【结论】3'tiR_026_GlnCTG(n)可能通过激活MEK/ERK/p90RSK通路参与PTC的发生、发展。这将对PTC的发病机制提供新的认识,并为其治疗策略提供新思路。 展开更多
关键词 甲状腺乳头状癌 trna衍生片段 致癌
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转运RNA衍生的小RNA研究概述
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作者 骆雅鑫 胡雪峰 《生物学教学》 北大核心 2024年第1期2-5,共4页
转运RNA(tRNA)衍生的小RNA(tsRNAs)是由成熟tRNA或前体tRNA在应激条件下经特定核酸酶切割后所产生的一类小非编码RNA,具有高保守性、组织特异性和疾病相关性等特点,可作为生物标志物及治疗靶点。本文从tsRNAs的发现、分类、生物学功能... 转运RNA(tRNA)衍生的小RNA(tsRNAs)是由成熟tRNA或前体tRNA在应激条件下经特定核酸酶切割后所产生的一类小非编码RNA,具有高保守性、组织特异性和疾病相关性等特点,可作为生物标志物及治疗靶点。本文从tsRNAs的发现、分类、生物学功能及其在疾病中的作用等方面对其研究现状进行综述,以期为表观遗传学相关内容的教学提供参考信息。 展开更多
关键词 非编码RNA 转运RNA 衍生片段 转运RNA分子
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胶原诱导性关节炎大鼠血浆tRF和tiRNA的差异表达及功能分析
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作者 陈代奕 文宇琪 +4 位作者 何彩林 胡恩 杨曌宇 熊新贵 杨波 《中国免疫学杂志》 北大核心 2025年第5期1041-1047,共7页
目的:探究胶原诱导性关节炎(CIA)大鼠血浆转运RNA衍生片段(tRF)和转运RNA半分子(tiRNA)的差异表达,并对其靶基因进行生物学功能及通路的富集分析,为类风湿关节炎(RA)的诊断和治疗寻找新的靶点。方法:皮下注射Ⅱ型胶原建立RA大鼠模型,通... 目的:探究胶原诱导性关节炎(CIA)大鼠血浆转运RNA衍生片段(tRF)和转运RNA半分子(tiRNA)的差异表达,并对其靶基因进行生物学功能及通路的富集分析,为类风湿关节炎(RA)的诊断和治疗寻找新的靶点。方法:皮下注射Ⅱ型胶原建立RA大鼠模型,通过关节炎指数(AI)积分、HE染色评价疾病模型;利用Illumina平台测序获取tRF和tiRNA表达谱,RT-qPCR用于tRF和tiRNA表达量的验证;结合miRanda和TargetScan数据库预测差异表达tRF和tiRNA的靶基因;GO和KEGG富集分析对靶基因功能进行注释。结果:CIA模型大鼠血浆共有25个差异表达的tRFs和tiRNAs,其中23个上调,2个下调;筛选出6个CIA大鼠特异性表达tRFs和tiRNAs,分别为Other-36:73-tRNA-Arg-CCT-4、Other-57:70-tRNA-Glu-CTC-1-M3、tRF-1:32-Gly-CCC-1-M2、tRF-1:31-Gly-CCC-1-M2、tRF-1:32-Pro-AGG-1-M4和tRF-1:32-Glu-TTC-2-M2,其靶基因GO分析主要涉及细胞器相关条目,KEGG分析富集到多条与RA相关的经典信号通路。结论:差异表达tRFs和tiRNAs的靶基因可能参与调控RA的重要病理生理过程及药物治疗的作用靶点。 展开更多
关键词 类风湿关节炎 胶原诱导性关节炎 转运RNA衍生片段 转运RNA分子
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5'-tRF-GlyGCC在结直肠癌早期诊断价值
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作者 王龙 吴映敏 +1 位作者 尚莎 王璐 《实用医学杂志》 北大核心 2025年第11期1730-1735,共6页
目的 检测5'-tRF-GlyGCC在外周血中的含量,并探讨其含量在结直肠癌(colorectal cancer,CRC)早期诊断中的应用价值。方法 随机收集同一时期贵州医科大学附属医院99例结直肠癌患者、11例肠炎患者、17例结直肠息肉患者和99例健康人群... 目的 检测5'-tRF-GlyGCC在外周血中的含量,并探讨其含量在结直肠癌(colorectal cancer,CRC)早期诊断中的应用价值。方法 随机收集同一时期贵州医科大学附属医院99例结直肠癌患者、11例肠炎患者、17例结直肠息肉患者和99例健康人群外周血标本,用实时荧光定量PCR检测外周血总RNA中的5'-tRF-GlyGCC,建立受试者工作特征曲线(ROC),分析5'-tRF-GlyGCC含量在结直肠癌早期诊断中的价值,并探讨其含量与CRC患者临床、病理特征之间的关系。结果 5'-tRF-GlyGCC在CRC患者及结直肠息肉患者外周血中的含量显著高于健康人群及肠炎患者,差异有统计学意义(P <0.05)。5'-tRF-GlyGCC诊断结直肠癌的曲线下面积(AUC)为0.817(95%CI:0.763~0.871),诊断灵敏度为56.7%,特异度为99.9%。外周血中5'-t RF-GlyGCC含量与CRC患者CEA、CA19-9水平显著正相关。结论 检测外周血中5'-tRFGlyGCC在CRC早期诊断中具有较高应用价值。 展开更多
关键词 结直肠癌 外周血 trna衍生的小RNA片段 早期诊断
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tRF-Pro-CGG对小鼠胰腺癌细胞生物学行为的影响及其分子机制 被引量:1
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作者 符庆胜 金雷 +4 位作者 张旭东 徐荧晨 朱春富 秦锡虎 吴宝强 《中国癌症杂志》 CAS CSCD 北大核心 2023年第3期241-249,共9页
背景与目的:tRNA衍生的片段(tRNA-derived fragments,tRF)是一类长度为14~30 nt的小分子非编码RNA,其影响着恶性肿瘤的发展进程。本研究旨在探讨tRF-Pro-CGG对小鼠胰腺癌细胞生物学行为的影响及其可能的分子机制。方法:采用实时荧光定... 背景与目的:tRNA衍生的片段(tRNA-derived fragments,tRF)是一类长度为14~30 nt的小分子非编码RNA,其影响着恶性肿瘤的发展进程。本研究旨在探讨tRF-Pro-CGG对小鼠胰腺癌细胞生物学行为的影响及其可能的分子机制。方法:采用实时荧光定量聚合酶链反应(real-time fluorescence quantitative polymerase chain reaction,RTFQ-PCR)检测tRFPro-CGG在小鼠胰腺癌细胞系pan02、LTPA,人胰腺癌细胞系Capan-2和正常胰腺细胞HPDE6-C7中的表达水平。通过慢病毒转染技术过表达pan02细胞及敲低LTPA细胞中tRF-Pro-CGG的表达,采用RTFQ-PCR和蛋白质印迹法(Western blot)检测过表达和敲低效果。采用细胞计数试剂盒-8(cell counting kit-8,CCK-8)检测细胞增殖情况。采用transwell实验检测细胞迁移和侵袭能力。采用动物模型检测tRF-Pro-CGG对胰腺癌裸鼠移植瘤生长和转移的影响。采用H-E染色观察移植瘤的组织病理学结构。采用Western blot检测移植瘤组织中Ki-67增殖指数、转移相关蛋白E-钙黏蛋白(E-cadherin)、波形蛋白(vimentin)的表达及磷脂酰肌醇3-激酶(phosphoinositide 3-kinase,PI3K)/蛋白激酶B(protein kinase B,AKT)信号转导通路蛋白的表达及磷酸化情况。结果:小鼠胰腺癌细胞系pan02中tRF-Pro-CGG表达最低,在pan02细胞中转染tRF-Pro-CGG mimics后,tRF-Pro-CGG的mRNA和蛋白表达水平均显著升高(P<0.01),细胞增殖能力显著降低(P<0.01),细胞迁移(P<0.001)和侵袭能力(P<0.001)显著降低,裸鼠移植瘤体积(P<0.01)和重量(P<0.001)均显著降低,裸鼠移植瘤组织中出现明显坏死和凋亡细胞;裸鼠移植瘤组织中Ki-67增殖指数和vimentin的表达显著降低(P<0.001),而E-cadherin的表达显著升高(P<0.001),PI3K、P-PI3K、AKT和P-AKT的表达显著降低(P<0.001),胰腺癌肝转移例数差异无统计学意义(P>0.05)。小鼠胰腺癌细胞系LTPA中tRF-Pro-CGG表达最高,在LTPA细胞中转染tRF-Pro-CGG inhibitor后,tRF-Pro-CGG的mRNA和蛋白表达水平显著降低(P<0.01),细胞增殖能力显著升高(P<0.01),细胞迁移(P<0.001)和侵袭能力(P<0.001)显著升高,裸鼠移植瘤体积(P<0.01)和重量(P<0.01)均显著升高,裸鼠移植瘤组织中出现少量的坏死及凋亡细胞;裸鼠移植瘤组织中Ki-67和vimentin的表达显著升高(P<0.001),而E-cadherin的表达显著降低(P<0.001),PI3K、P-PI3K、AKT和P-AKT的表达显著升高(P<0.001),胰腺癌肝转移例数差异无统计学意义(P>0.05)。结论:过表达tRF-Pro-CGG可以抑制小鼠胰腺癌细胞增殖、迁移和侵袭,抑制胰腺癌裸鼠移植瘤的生长,下调Ki-67增殖指数、vimentin的表达水平和PI3K/AKT磷酸化水平。tRF-Pro-CGG可能通过调节PI3K/AKT信号转导通路抑制胰腺癌的发生、发展。 展开更多
关键词 胰腺癌 trna衍生片段-Pro-CGG 增殖 迁移 侵袭 裸鼠移植瘤模型
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tRF和tiRNA在疾病中的研究进展 被引量:1
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作者 谢玉鑫 王晚璞 《重庆医科大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第10期1173-1176,共4页
对下一代测序数据的深入分析,揭示了许多具有不同功能的小分子非编码RNA。近年来,来源于tRNA衍生的小分子RNA(transfer-RNA derived small RNAs,tsRNAs)引起了广泛关注。tsRNAs主要有2种类型,即tRNA半分子(tRNA-derived stress-induced ... 对下一代测序数据的深入分析,揭示了许多具有不同功能的小分子非编码RNA。近年来,来源于tRNA衍生的小分子RNA(transfer-RNA derived small RNAs,tsRNAs)引起了广泛关注。tsRNAs主要有2种类型,即tRNA半分子(tRNA-derived stress-induced RNA,tiRNA)和t RNA衍生片段(tRNA-derived fragment,tRF)。它们根据在前体或成熟tRNA转录物的切割位置不同而产生。这些tRF和tiRNA的核苷酸组成、生物发生和功能具有异质性。新的研究表明,tRF和tiRNA不仅是tRNA降解的碎片,而且在许多特定的生理和病理过程中起调节作用。本文综述tRF和tiRNA的类型,提出tRF和tiRNA的生物学功能和作用机制的新概念,重点介绍tRF和tiRNA在人类疾病中的潜在应用,并提出目前存在的问题和未来的研究方向。 展开更多
关键词 trna衍生片段和trna半分子 生物学功能 疾病
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tsRNAs与肿瘤关系的研究进展 被引量:1
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作者 何小雪 樊希蕊 +1 位作者 黄芸 王辉 《中国肿瘤临床》 CAS CSCD 北大核心 2020年第2期85-88,共4页
转运RNA(transfer RNA,tRNA)衍生的小RNAs(transfer RNA-derived small RNAs,tsRNAs)是来源于成熟tRNA或tRNA前体的一类新兴的非编码单链RNAs,主要包括tRNA衍生片段(tRNA-derived RNA fragments,tRFs)和tRNA半分子(tRNA halves,tiRNAs)... 转运RNA(transfer RNA,tRNA)衍生的小RNAs(transfer RNA-derived small RNAs,tsRNAs)是来源于成熟tRNA或tRNA前体的一类新兴的非编码单链RNAs,主要包括tRNA衍生片段(tRNA-derived RNA fragments,tRFs)和tRNA半分子(tRNA halves,tiRNAs)两类。tsRNAs在多种肿瘤中存在差异性表达,并且影响肿瘤的增殖、侵袭或转移过程,尽管其背后的机制尚未完全阐明,但有成为肿瘤新的生物标志物及治疗靶点的潜力。本文对tsRNAs与常见肿瘤的关系进行综述,以期为肿瘤的诊断、治疗及预防提供新思路。 展开更多
关键词 tsRNAs trna衍生片段 trna分子 肿瘤
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