摘要
采用PCR技术和DNA克隆测序技术,随机测定了3头斑海豹mtDNA控制区(D-loop区)CSB-3上、下游1000 bp左右的序列,每头斑海豹任选14个克隆菌斑进行测序,结果所得序列均无重复,得到42个单倍型。结合GenBank已发表的斑海豹mtDNA控制区序列(Phoca largha,AM181031),通过ClustalX1.83、MEGA3.1和FastPCRv3.6等生物信息学软件进行序列比对,发现我国珍稀保护动物斑海豹个体内线粒体DNA(mtDNA)的控制区CSB-3之后存在异质型现象,且存在数目不等的串联重复序列。从分子水平进行了不同类型重复序列变化规律的研究,初探了mtDNA控制区异质型在斑海豹中的存在情况。
We investigate mitochondrial heteroplasmy of the spotted seal(Phoca largha) using PCR and cloning technique.The sequences of mitochondria control region of three individuals were sequenced randomly.Fourteen sequences each individual were sequenced and 42 haplotypes were obtained.Heteroplasmy was detected between different individuals and even varied in the same individual.
出处
《生物技术通报》
CAS
CSCD
北大核心
2009年第S1期248-261,276,共15页
Biotechnology Bulletin
基金
国家海洋908项目辽宁专项(LN-908-01-01-06)
辽宁省海洋与渔业科研计划项目(200801)
关键词
斑海豹
MTDNA控制区
串联重复序列
异质型
Spotted seal
D-loop region of mitochondria DNA
Tandem repeat?array
Heteroplasmy
作者简介
高祥刚(1980-),男,助理研究员,研究方向:水产生物技术,E-mail:xiangganggao@163.com;通讯作者:赫崇波(1961-),男,研究员,硕士生导师,研究方向:水产分子遗传学,E-mail:hechongbo@hotmail.com
