tRNA衍生片段和tRNA半分子的生物学功能及其在疾病发生中的作用 被引量：6

1

作者 朱林文 谢依 郭俊明 《生物化学与生物物理进展》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2017年第7期565-572,共8页

tRNA衍生片段(tRNA-derived RNA fragment,t RF)和tRNA半分子(tRNA halves,ti RNA)由成熟tRNA或其前体tRNA在不同位点特异性剪切产生,它们是一类广泛存在于原核生物和真核生物转录组中的非编码小RNA分子.t RF主要有tRF-5、tRF-3和tRF-1... tRNA衍生片段(tRNA-derived RNA fragment,t RF)和tRNA半分子(tRNA halves,ti RNA)由成熟tRNA或其前体tRNA在不同位点特异性剪切产生,它们是一类广泛存在于原核生物和真核生物转录组中的非编码小RNA分子.t RF主要有tRF-5、tRF-3和tRF-1等3亚类,分别来自成熟tRNA的D环至反密码环茎区间切割至5′端、T环开始至3′端和前体tRNA的3′端尾部,其长度为14~30个核苷酸(nucleotide,nt).ti RNA主要有5′ti RNA和3′ti RNA等2亚类,是在成熟tRNA反密码子环处切割分别产生,其长度为29~50 nt.t RF和ti RNA具有多种生物学功能,既可以在应激反应中作为信号分子,又可以作为基因表达的调节者.它们与人类多种疾病(如肿瘤、神经退行性疾病、代谢性疾病和传染病等)的发生密切相关,有希望成为疾病诊断的新型标志物.本文就t RF和ti RNA的分类、生物学功能以及与人类疾病的关系作一综述. 展开更多

关键词 tRNA衍生片段 tRNA半分子 基因表达调控 疾病发生

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环状RNA的生物学功能及其在胃肠肿瘤发生中的作用 被引量：4

2

作者 赵乾富 陈仕俊 +1 位作者 肖丙秀 郭俊明 《生物化学与生物物理进展》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2018年第6期601-612,共12页

环状RNA(circular RNA,circ RNA)是广泛存在于真核生物转录组的内源性非编码RNA.与线性RNA不同,circ RNA不易被酶解,具有更加稳定的结构.circ RNA具有微小RNA(micro RNA,mi RNA)海绵、RNA结合蛋白海绵、调节转录以及翻译蛋白质等多种生... 环状RNA(circular RNA,circ RNA)是广泛存在于真核生物转录组的内源性非编码RNA.与线性RNA不同,circ RNA不易被酶解,具有更加稳定的结构.circ RNA具有微小RNA(micro RNA,mi RNA)海绵、RNA结合蛋白海绵、调节转录以及翻译蛋白质等多种生物学功能,能够在转录水平或转录后水平调节基因的表达.近期的研究发现,circ RNA在调控肿瘤细胞增殖、迁移和侵袭过程中扮演着重要的角色.胃肠肿瘤是我国常见且死亡率高的恶性肿瘤,研究者在胃肠肿瘤中发现大量异常表达的circ RNA(如:hsa_circ_0014717、hsa_circ_0001017、hsa_circ_0061276、hsa_circ_0125965和hsa_circ_KLDHC10等).本文首先阐述circ RNA的形成机制和生物学功能;然后结合国内外胃肠肿瘤相关circ RNA的最新研究进展和本课题组相关研究成果,对circ RNA影响胃肠肿瘤发生的机制作一综述,并希望能以此为胃肠肿瘤的诊断和治疗提供新的理论依据. 展开更多

关键词 环状RNA 微小RNA RNA-RNA相互作用 胃肠肿瘤 肿瘤诊断

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长链非编码RNA的作用机制及其研究方法 被引量：68

3

作者 夏天 肖丙秀 郭俊明 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2013年第3期269-280,共12页

长链非编码RNA(Long non-coding RNA,lncRNA)通过多种机制发挥其生物学功能,这些机制包括基因印记、染色质重塑、细胞周期调控、剪接调控、mRNA降解和翻译调控等。lncRNA通过这些作用机制在不同水平进行基因表达调控。在研究lncRNA功能... 长链非编码RNA(Long non-coding RNA,lncRNA)通过多种机制发挥其生物学功能,这些机制包括基因印记、染色质重塑、细胞周期调控、剪接调控、mRNA降解和翻译调控等。lncRNA通过这些作用机制在不同水平进行基因表达调控。在研究lncRNA功能的过程中,研究方法的建立和应用起着非常重要的作用。目前用于lncRNA研究的主要方法有:微阵列、转录组测序、Northern印迹、实时荧光定量逆转录-聚合酶链反应、荧光原位杂交、RNA干扰和RNA结合蛋白免疫沉淀等。文章着重介绍了3种前沿方法,即:在线快速预测RNA与蛋白质相互作用的catRAPID、RNA纯化的染色质分离(Chromatin isolation by RNA purification,ChIRP)以及非编码RNA沉默与定位分析技术(Combined knockdown and localization analysis of non-coding RNAs,c-KLAN)。 展开更多

关键词 长链非编码RNA 作用机制 基因表达调控 研究方法

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lncRNA:肿瘤分子诊断中的一颗新星 被引量：20

4

作者 李琪儿 叶国良 郭俊明 《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第3期233-240,共8页

长链非编码RNA(lncRNA)是一类长度大于200个核苷酸、不具有蛋白质编码功能的转录本.许多研究已经证实,lncRNA在多种类型的肿瘤中存在异常表达,在肿瘤发生、发展中起着致癌或抑癌作用,是肿瘤发生的一类重要因素.分析lncRNA的方法有表达... 长链非编码RNA(lncRNA)是一类长度大于200个核苷酸、不具有蛋白质编码功能的转录本.许多研究已经证实,lncRNA在多种类型的肿瘤中存在异常表达,在肿瘤发生、发展中起着致癌或抑癌作用,是肿瘤发生的一类重要因素.分析lncRNA的方法有表达芯片技术、实时定量逆转录-聚合酶链反应技术、原位杂交技术和RNA深度测序技术等.目前已在组织、血液、尿液和唾液等检材中检测到肿瘤相关lncRNA.因此,lncRNA有望成为新型肿瘤标志物应用于肿瘤诊断和预后判定. 展开更多

关键词 长链非编码RNA 肿瘤 肿瘤标志物 分子诊断

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环状RNA与人类疾病 被引量：21

5

作者 付丽云 胡耀仁 郭俊明 《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2015年第8期771-778,共8页

环状RNA(circular RNAs,circRNAs)是一类广泛存在于各种生物细胞中具有调控基因表达功能的非编码RNA,具有结构稳定和组织特异性表达等特征.有些circRNA分子富含微小RNA结合位点,可通过充当竞争性内源RNA的角色来发挥作用,如CDR1as对miR-... 环状RNA(circular RNAs,circRNAs)是一类广泛存在于各种生物细胞中具有调控基因表达功能的非编码RNA,具有结构稳定和组织特异性表达等特征.有些circRNA分子富含微小RNA结合位点,可通过充当竞争性内源RNA的角色来发挥作用,如CDR1as对miR-7的海绵作用与肺癌、乳腺癌、胶质瘤及肌萎缩性脊髓侧索硬化等疾病发生相关.c ANRIL可通过影响多梳家族参与动脉粥样硬化的发生.大量circRNA的发现及其结构和功能的阐明不仅可以使我们更加深入地了解疾病的发生机制,而且为相关疾病的预防、诊断和治疗提供了新的方向. 展开更多

关键词 环状RNA 竞争性内源RNA 微小RNA海绵 基因表达调控

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竞争性内源RNA：一种全新的基因表达调控模式 被引量：9

6

作者 夏天 肖丙秀 郭俊明 《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第12期1075-1081,共7页

竞争性内源RNA(ceRNA)假说是一种全新的基因表达调控模式:mRNA、假基因转录物和长链非编码RNA等转录物通过microRNA应答元件竞争结合相同的microRNA来调控各自的表达水平,从而影响细胞的功能.迄今为止,多家实验室已从生物信息学、细胞... 竞争性内源RNA(ceRNA)假说是一种全新的基因表达调控模式:mRNA、假基因转录物和长链非编码RNA等转录物通过microRNA应答元件竞争结合相同的microRNA来调控各自的表达水平,从而影响细胞的功能.迄今为止,多家实验室已从生物信息学、细胞生物学和动物实验等层面验证了该假说.本文追溯了ceRNA假说提出的历程,讨论了ceRNA调控网络的影响因素,并提出了一些有待进一步完善的内容.ceRNA假说大大拓展了人类基因组中功能遗传信息的范畴,也为解析一些人类疾病发生的机制提供了新线索. 展开更多

关键词 基因表达调控 竞争性内源RNA(ceRNA) 转录物 microRNA应答元件

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非编码RNA在肿瘤细胞糖代谢中的调控作用 被引量：5

7

作者 莫小燕 张晓宏 郭俊明 《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第1期10-16,共7页

非编码RNA(non-coding RNA,nc RNA)是一类不具有蛋白质编码潜能的RNA,可分为管家nc RNA和调控性nc RNA。微RNA(micro RNA,mi RNA)是研究得比较清楚的一类调控性nc RNA,不仅可调控细胞分化、增殖和凋亡,还可通过调节糖酵解途径中的限速酶... 非编码RNA(non-coding RNA,nc RNA)是一类不具有蛋白质编码潜能的RNA,可分为管家nc RNA和调控性nc RNA。微RNA(micro RNA,mi RNA)是研究得比较清楚的一类调控性nc RNA,不仅可调控细胞分化、增殖和凋亡,还可通过调节糖酵解途径中的限速酶[如己糖激酶(hexokinase,HK)、磷酸果糖激酶(phosphofructokinase,PFK)和丙酮酸激酶(pyruvate kinase,PK)]来调控肿瘤细胞的糖代谢。长链非编码RNA(long non-coding RNA,lnc RNA)是另一类近年来引起重视的调控性nc RNA,它们可通过调节癌基因c-Myc、葡糖转运蛋白(glucose transporter,GLUT)、HK和缺氧诱导因子等来调控肿瘤细胞的糖代谢。深入了解mi RNA和lnc RNA等调控性nc RNA调控肿瘤细胞糖代谢的机制不仅可以使我们更加深入地了解肿瘤的发生机制,而且可能为肿瘤的预防、诊断和治疗提供新方向。 展开更多

关键词 非编码RNA 糖代谢 肿瘤 代谢调节

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核仁小RNA在肿瘤发生中的作用 被引量：2

8

作者 肖丙秀 夏天 郭俊明 《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第12期1087-1092,共6页

核仁小RNA(small nucleolar RNA,snoRNA)是一类真核细胞核仁中的60～300个核苷酸长度的非编码RNA,主要参与rRNA和其它小RNA转录后的成熟加工过程.它们与肿瘤的关系曾一度被人们所忽视,然而,近年来有关snoRNA新功能的研究证明,它们与肿... 核仁小RNA(small nucleolar RNA,snoRNA)是一类真核细胞核仁中的60～300个核苷酸长度的非编码RNA,主要参与rRNA和其它小RNA转录后的成熟加工过程.它们与肿瘤的关系曾一度被人们所忽视,然而,近年来有关snoRNA新功能的研究证明,它们与肿瘤的发生、发展密切相关.snoRNA以多种方式参与肿瘤的发生:一些snoRNA(如:U50、SNORD12、SNORD12b、SNORD12c、SNORD44和h5sn2等)具有抑癌活性,而另一些snoRNA(如:SNORD33、SNORD66、SNORD76、SNORD112、SNORD113、SNORD114、SNORA42、U70C和ACA59B等)具有促癌活性.另外,编码snoRNA基因的异常也被发现与肿瘤的发生有关.因此,开展snoRNA与肿瘤关系的研究将有可能为肿瘤诊治提供新线索. 展开更多

关键词 核仁小RNA 肿瘤 肿瘤发生 促癌活性 抑癌活性

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肿瘤发生过程中miRNA与lncRNA的相互作用 被引量：10

9

作者 陈声灿 肖丙秀 郭俊明 《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第11期1055-1061,共7页

非编码RNA(non-coding RNA,ncRNA)是生物体内普遍存在,且对生命活动具有重要调控作用的生物分子.以微RNA(microRNA,miRNA)和长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)为代表的ncRNA分子在肿瘤发生和发展过程中都有重要的作用.越来越... 非编码RNA(non-coding RNA,ncRNA)是生物体内普遍存在,且对生命活动具有重要调控作用的生物分子.以微RNA(microRNA,miRNA)和长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)为代表的ncRNA分子在肿瘤发生和发展过程中都有重要的作用.越来越多研究发现,miRNA和lncRNA之间的关系是非常密切的,某些lncRNA(如H19和BIC)可以作为miRNA的前体,通过加工成miRNA而发挥作用.有些miRNA通过作用于lncRNA影响肿瘤的发生(如:miR-129与MEG3,let-7与H19);同样地,有些lncRNA通过作用于miRNA影响肿瘤的发生(如:HULC与miR-372,PTCSC3与miR-574-5p,ciRS-7与miR-7,Sry与miR-138).miRNA与lncRNA之间既可以直接相互作用,也可以通过其它分子(特别是蛋白质或蛋白质复合物)间接地影响着肿瘤的发生和发展.揭示miRNA和lncRNA相互作用在肿瘤发生中的作用可以为肿瘤的诊断和治疗提供新思路. 展开更多

关键词 微RNA 长链非编码RNA RNA-RNA相互作用 肿瘤发生

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长链非编码RNA在胃癌发生中的作用及其应用 被引量：12

10

作者 杨允奔 李田文 郭俊明 《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第4期388-395,共8页

长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)是一类长度大于200个核苷酸的非编码RNA,参与肿瘤的发生和发展过程。我国新诊断胃癌患者数和胃癌死亡数均位居各国之首。本文就lncRNA在胃癌发生、发展过程中的作用及其应用价值作一综述。H1... 长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)是一类长度大于200个核苷酸的非编码RNA,参与肿瘤的发生和发展过程。我国新诊断胃癌患者数和胃癌死亡数均位居各国之首。本文就lncRNA在胃癌发生、发展过程中的作用及其应用价值作一综述。H19、胃癌高表达转录本1(gastric carcinoma high expressed transcript 1,GHET1)和结直肠癌相关转录本1(colon cancer associated transcript 1,CCAT1)等lncRNA可与c-Myc相互作用促进胃癌发生;而母系印记基因3(maternally expressed gene 3,MEG3)则可抑制胃癌形成。FOXF1毗连非编码发育调控RNA(FOXF1 adjacent non-coding developmental regulatory RNA,FENDRR)、肺腺癌相关转录本1(metastasis-associated lung adenocarcinoma transcript 1,MALAT1)和HOX反义基因间RNA(HOX antisense intergenic RNA,HOTAIR)等lncRNA与胃癌转移有关。MEG3、胃癌相关转录本1(gastric cancer associated transcript 1,GACAT1)、胃癌相关转录本2(GACAT2)、胃癌相关转录本3(GACAT3)、H19和基因间长链非编码RNA152(long intergenic non-protein-coding RNA 152,LINC00152)等有希望成为新型胃癌诊断标志物;而H19、MEG3和MALAT1有可能成为胃癌治疗的新靶点。 展开更多

关键词 长链非编码RNA 胃癌 肿瘤发生 分子诊断

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环状RNA:胃癌诊治的新星 被引量：2

11

作者 马亦波 马东南 郭俊明 《生物化学与生物物理进展》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2022年第4期714-724,共11页

环状RNA(circular RNA,circRNA)是一类闭合环状结构的RNA分子,广泛分布于各种组织中,它比线性RNA更稳定。circRNA分为外显子circRNA、外显子-内含子circRNA和内含子circRNA等3类。circRNA的主要功能为充当微RNA海绵、与RNA结合蛋白结合... 环状RNA(circular RNA,circRNA)是一类闭合环状结构的RNA分子,广泛分布于各种组织中,它比线性RNA更稳定。circRNA分为外显子circRNA、外显子-内含子circRNA和内含子circRNA等3类。circRNA的主要功能为充当微RNA海绵、与RNA结合蛋白结合、翻译成蛋白质和调节转录等。近年来,大量研究表明,circRNA的异常表达在胃癌发生发展过程中起着至关重要的作用。circPTPN22、hsa_circ_0001772、circCYFIP2、hsa_circ_0017639和circPIP5K1A等的上调以及hsa_circ_002059、hsa_circ_0000190和circMTO1等的下调与胃癌的增殖和转移密切相关;而hsa_circ_0001313等影响胃癌细胞的顺铂耐药性。组织、血浆及外泌体中circPTPN22、hsa_circ_102958、hsa_circ_0141633、hsa_circ_0065149和hsa_circ_0026344等是胃癌新型诊断标志物;而hsa_circ_0005529、circ-RanGAP1、circPIP5K1A和circMAT2B等有希望成为胃癌治疗的新靶点。这些胃癌相关circRNA的研究成果有助于认识胃癌发生机制,并为胃癌的诊治提供基础。 展开更多

关键词 环状RNA 胃癌 生物标志物 治疗靶点

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环状RNA影响肝疾病的发生发展 被引量：3

12

作者 沈丽丽 付丽云 郭俊明 《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第12期1303-1311,共9页

环状RNA(circular RNA,circRNA)广泛存在于多种生物细胞中,是一类由3′末端和5′末端经反向剪接共价结合形成的RNA分子。circRNA具有保守性、结构稳定、组织细胞特异性表达等特征。它们具有调控基因转录、充当微RNA海绵、参与蛋白质翻... 环状RNA(circular RNA,circRNA)广泛存在于多种生物细胞中,是一类由3′末端和5′末端经反向剪接共价结合形成的RNA分子。circRNA具有保守性、结构稳定、组织细胞特异性表达等特征。它们具有调控基因转录、充当微RNA海绵、参与蛋白质翻译及充当蛋白质诱饵等重要生物学功能,可影响细胞的增殖、凋亡、周期、迁移、侵袭和上皮间质转化等过程。circRNA与病毒性肝炎、肝纤维化、肝细胞肝癌、脂肪性肝病等重要肝疾病的病理生理过程密切相关。鉴于肝疾病是我国最常见的一类重大疾病,本文总结了国内外关于circRNA影响肝疾病发生发展的机制,希望为预防、诊断和治疗肝疾病提供新思路。 展开更多

关键词 环状RNA 肝疾病 作用机制 诊断

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