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PCR-SSCP分析实践 被引量:12
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作者 蔡辉国 陈佩贞 +3 位作者 张立冬 彭琼 纪新军 马双 《生物化学与生物物理进展》 SCIE CAS CSCD 北大核心 1995年第5期473-475,共3页
介绍了一种在一般实验室都能使用的适用于SSCP分析电泳的改良方法.并对如何设计引物、选择PCR条件和分析结果进行了讨论.
关键词 聚合酶链反应 单链构象多态性 临床检验
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光滑假丝酵母菌ITSⅠ区PCR-SSCP分子流行病学分析
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作者 王菡 于仁涛 +2 位作者 刘建玲 纪蕾 韩黎 《中国感染控制杂志》 CAS 2008年第3期152-156,共5页
目的建立基于聚合酶链反应的单链构象多态性分析(PCR-SSCP)技术,对引起常见医院感染的光滑假丝酵母菌进行基因多态性分析,并探讨改善其灵敏度和分辨率的优化条件。方法采用PCR-SSCP技术对临床分离的19株光滑假丝酵母菌以及1株标准株ATCC... 目的建立基于聚合酶链反应的单链构象多态性分析(PCR-SSCP)技术,对引起常见医院感染的光滑假丝酵母菌进行基因多态性分析,并探讨改善其灵敏度和分辨率的优化条件。方法采用PCR-SSCP技术对临床分离的19株光滑假丝酵母菌以及1株标准株ATCC90030的rDNA的ITSⅠ区(引物ITS1/ITS2)和ITSⅡ区(引物ITS3/ITS4)多态性进行分析,并对PCR-SSCP的条件进行优化。结果ITSⅠ区较ITSⅡ区保守性低,变异性较强,较为适合SSCP分型。针对ITSⅠ区,SSCP电泳在无甘油时,4℃和15℃均将菌株分为6型,但各型所含菌株不同;存在5%甘油时,SSCP电泳分辨率明显增高。结论在15℃及5%甘油存在的条件下,针对ITSI区的PCR-SSCP分型是一种快速、简便的适合于致医院感染光滑假丝酵母菌分型的新流行病学研究手段。 展开更多
关键词 光滑假丝酵母菌 pcr-sscp 流行病学研究 真菌
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应用PCR-SSCP检测β地中海贫血基因突变
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作者 朱益军 刘敬忠 吴冠芸 《高技术通讯》 EI CAS CSCD 1993年第6期25-27,共3页
关键词 β 地中海贫血 检测 基因
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脊柱结核脓液中结核分枝杆菌耐利福平基因检测的实验研究 被引量:1
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作者 葛建忠 王自立 +5 位作者 秦世炳 乔永东 张健源 刘忠泉 张宗德 李传友 《中国脊柱脊髓杂志》 CAS CSCD 2004年第12期745-747,共3页
目的:探讨脊柱结核脓液中结核分枝杆菌对利福平(RFP)的耐药机制;评价聚合酶链反应-单链构象多态性(polymerasechainreactionsingle-strandconformationpolymorphism,PCR-SSCP)在脊柱结核检测耐RFP基因中的临床应用价值。方法:将脊柱结... 目的:探讨脊柱结核脓液中结核分枝杆菌对利福平(RFP)的耐药机制;评价聚合酶链反应-单链构象多态性(polymerasechainreactionsingle-strandconformationpolymorphism,PCR-SSCP)在脊柱结核检测耐RFP基因中的临床应用价值。方法:将脊柱结核病灶中的脓液经预处理后接种于改良罗氏培养基上,对所培养出的菌株应用PCR-SSCP进行检测。检测包括核心区域(耐药决定区域)在内的rpoB基因。结果:PCR-SSCP检测耐RFP菌株的灵敏度和特异性均为100%,与常规经典药物敏感试验无差异(P<0.05),但检测时间明显缩短,仅用2d。结论:rpoB基因突变是结核分枝杆菌对RFP耐药的重要机制,应用PCR-SSCP检测具有较高的灵敏性、特异性及快速性,是一种对脊柱结核耐RFP菌株快速检测的方法。 展开更多
关键词 脊柱结核 结核分枝杆菌 药物耐受性 聚合酶链反应-单链构象多态性
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大鼠肝癌变中p53点突变及其蛋白表达的研究 被引量:1
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作者 张新立 史景泉 卞修武 《第三军医大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2001年第8期885-888,共4页
目的 研究大鼠肝癌变中突变型P53蛋白(mP53)的表达及 p53基因第6外显子点突变。方法 通过DEN诱发的启动模型和肝癌模型,应用免疫组化、MDT-PCR-SSCP和直接测序技术分别研究mP53表达和 p53基因第6... 目的 研究大鼠肝癌变中突变型P53蛋白(mP53)的表达及 p53基因第6外显子点突变。方法 通过DEN诱发的启动模型和肝癌模型,应用免疫组化、MDT-PCR-SSCP和直接测序技术分别研究mP53表达和 p53基因第6外显子点突变。结果 mP53阳性细胞仅见于癌前个别肝细胞增生结节中,8/18例(44.44%)肝细胞癌呈mP53阳性;8例mP53阳性肝癌中仅有1例(12.50%)被检出p53基因第6外显子发生点突变,即第208位密码子第1碱基C—G颠换。结论 在 DEN诱发的启动模型和肝癌模型中 p53基因突变可发生于大鼠肝癌变之癌前及肝癌形成阶段,且第6外显子突变率低。 展开更多
关键词 肝癌变 突变型P53蛋白 多聚酶链反应 动物实验 肝肿瘤
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青老年肺癌患者p53基因突变情况的对比研究
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作者 胡咏武 董光同 +3 位作者 李红智 高元兴 蒋成榜 郑哲 《中国肺癌杂志》 CAS 2001年第5期333-335,共3页
目的 分析 45例青老年肺癌中p5 3基因突变 ,比较青年肺癌与老年肺癌p5 3基因突变的差异。方法  45例患者均为温州医学院附属第一医院胸外科收治的病例 ,其中 2 2例为 2 0~ 45岁肺癌患者 ,2 3例为5 5~ 80岁肺癌患者。应用PCR SSCP银... 目的 分析 45例青老年肺癌中p5 3基因突变 ,比较青年肺癌与老年肺癌p5 3基因突变的差异。方法  45例患者均为温州医学院附属第一医院胸外科收治的病例 ,其中 2 2例为 2 0~ 45岁肺癌患者 ,2 3例为5 5~ 80岁肺癌患者。应用PCR SSCP银染技术检测p5 3基因的突变情况 ,并进行PCR产物直接测序。结果 发现青年组和老年组中p5 3基因突变情况基本相同 ( 5 0 .0 %比 5 2 .2 % ) ,其中小细胞肺癌突变率分别为 70 .0 %( 7/10 )和 75 .0 % ( 6 /8) ,非小细胞肺癌突变率分别为 33 .3 % ( 4 /12 )和 40 .0 % ( 6 /15 ) ,差异均无显著性 (P >0 .0 5 )。结论 青年肺癌和老年肺癌p5 3基因突变并无明显差异 ,提示p5 3基因的突变不属“先天” 展开更多
关键词 肺肿瘤 P53基因 聚合酶逻反应 单链构象多态性 银染技术 小细胞肺癌突变 非小细胞肺癌突变
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BIGH3基因的Arg555Trp突变引起颗粒状角膜营养不良 被引量:3
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作者 陈利丽 俞萍 +5 位作者 顾扬顺 杨月红 阎小毅 葛振 吕娜 郭磊 《眼科研究》 CSCD 北大核心 2005年第1期60-62,共3页
 目的 阐明颗粒状角膜营养不良(CDGGⅠ )的发病机制。 方法 采用聚合酶链式反应 -单链构象多态性(PCR SSCP)分析,对 1个CDGGⅠ病例进行BIGH3基因第 12号外显子的突变筛查,并对发现的异常泳动带进行DNA测序,以确定突变位点。 结果 C...  目的 阐明颗粒状角膜营养不良(CDGGⅠ )的发病机制。 方法 采用聚合酶链式反应 -单链构象多态性(PCR SSCP)分析,对 1个CDGGⅠ病例进行BIGH3基因第 12号外显子的突变筛查,并对发现的异常泳动带进行DNA测序,以确定突变位点。 结果 CDGGⅠ患者在 12号外显子有Arg555Trp突变。 结论 BIGH3基因突变Arg555Trp是导致CDGG1的原因。 展开更多
关键词 BIGH3 基因突变 聚合酶链式反应 单链构象多态性分析
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陇东绒山羊KRTAP2-1基因鉴定及其对羊绒性状影响的研究 被引量:2
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作者 孙凯 赵孟丽 +5 位作者 郝志云 王建清 沈继源 宋宜泽 柯娜 王继卿 《核农学报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第5期1091-1098,共8页
角蛋白关联蛋白(KAPs)是羊绒纤维的主要结构成分,但尚未在山羊基因组中鉴定出KRTAP2-1基因,本研究以人类KRTAP2-1基因为模板,在山羊基因组中进行同源性搜索,在19号染色体上发现了一个399 bp的开放阅读框。采用聚合酶链反应-单链构象多态... 角蛋白关联蛋白(KAPs)是羊绒纤维的主要结构成分,但尚未在山羊基因组中鉴定出KRTAP2-1基因,本研究以人类KRTAP2-1基因为模板,在山羊基因组中进行同源性搜索,在19号染色体上发现了一个399 bp的开放阅读框。采用聚合酶链反应-单链构象多态性(PCR-SSCP)方法,在249只陇东山羊上检测到7条不同的序列(A-G)。进化树结果表明,这7条序列与人类和绵羊的KAP2-1序列有较高的同源性,表明该序列是山羊KRTAP2-1的7个等位基因。测序结果表明,KRTAP2-1基因中存在12个单核苷酸多态性(SNPs)(5个SNPs位于编码区,7个SNPs位于非编码区),以及c.-61-63delCTC和c.9395delCCG两个碱基缺失,其中c.9395delCCG引起了第32位精氨酸的移码缺失。山羊KAP2-1蛋白含有丰富的半胱氨酸、脯氨酸、苏氨酸和丝氨酸。相关性分析表明,等位基因C的存在与较小的羊绒纤维直径相关(存在:13.4±0.05μm;缺失:13.6±0.03μm;P=0.010)。本研究表明,山羊KRTAP2-1基因有丰富的多态性,可作为陇东绒山羊羊绒纤维直径选育的分子标记用于生产实践。 展开更多
关键词 KRTAP2-1基因 山羊 聚合酶链反应-单链构象多态性(pcr-sscp) 羊绒纤维直径
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