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子宫颈癌淋巴结转移相关环状RNA的表达谱分析
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作者 李瑞 郭依琳 +4 位作者 王璐 许星月 卢富华 李梦琦 赵虎 《实用妇产科杂志》 北大核心 2025年第3期223-229,共7页
目的:筛选子宫颈癌淋巴结转移相关环状RNA(circRNA)的差异表达谱,分析其功能和作用机制。方法:收集40例子宫颈癌患者[有淋巴结转移20例(转移组)、无淋巴结转移20例(未转移组)]的癌组织标本。在两组中随机各选取3例标本,采用高通量测序... 目的:筛选子宫颈癌淋巴结转移相关环状RNA(circRNA)的差异表达谱,分析其功能和作用机制。方法:收集40例子宫颈癌患者[有淋巴结转移20例(转移组)、无淋巴结转移20例(未转移组)]的癌组织标本。在两组中随机各选取3例标本,采用高通量测序技术分析circRNA表达谱,并对差异表达circRNA来源的母基因进行京都基因与基因组百科全书(KEGG)和基因本体(GO)富集分析。采用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)技术验证差异倍数较高的4个显著上调的circRNA,行数据库预测构建竞争性内源性RNA(ceRNA)网络。对差异表达最显著的circRNA分析其与临床病理特征的关系,行子宫颈癌细胞系转染circRNA小干扰RNA(siRNA),分为circ RNA敲低组和阴性对照(si-NC)组,并采用活细胞计数(CCK-8)方法检测子宫颈癌SiHa细胞和HeLa细胞的增殖情况。结果:①共检测到2039个差异表达circRNA,差异表达circRNA来源的母基因主要富集在泛素介导的蛋白质水解、MAPK信号通路、内吞作用、细胞凋亡等信号通路。②筛选出转移组中差异倍数较高的4个显著上调的circRNA,即hsa_circ_0067492、hsa_circ_0004904、hsa_circ_0085465、hsa_circ_0007718。qRT-PCR技术验证显示,hsa_circ_0004904、hsa_circ_0085465、hsa_circ_0007718在淋巴结转移的子宫颈癌组织中均高表达(P<0.01)。hsa_circ_0004904可与hsa-miR-3916等微小RNA(miRNA)相互作用、hsa_circ_0085465可与hsa-miR-4659b-3p等miRNA相互作用、hsa_circ_0007718可与hsa-miR-127-5p等miRNA相互作用。③hsa_circ_0004904的高表达与低表达在有无淋巴结转移和脉管癌栓中差异有统计学意义(P<0.05)。与si-NC组相比,沉默hsa_circ_0004904转染24、48、72 h后,SiHa细胞和HeLa细胞的增殖能力均明显降低(P<0.05)。结论:伴有淋巴结转移的子宫颈癌中存在差异表达的circRNA,沉默后可显著抑制子宫颈癌细胞的增殖,其可能参与了淋巴结转移的发生发展,有望成为淋巴结转移的特异性生物标志物。 展开更多
关键词 子宫颈癌 环状rna 淋巴结转移 竞争性内源性rna 非编码rna
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非编码RNA在中耳胆脂瘤中的研究进展
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作者 王建涛 朱庆文 王宝山 《中华耳科学杂志》 北大核心 2025年第4期597-602,共6页
中耳胆脂瘤是耳鼻喉科常见疾病,近年来,其临床重要性日益凸显。数据显示,该病的年发病率为10/10万。目前临床上尚无有效的非手术治疗方法,且术后复发率高达40%。若未及时诊断和干预,可导致各种颅内、外并发症。胆脂瘤形成的发病机制研... 中耳胆脂瘤是耳鼻喉科常见疾病,近年来,其临床重要性日益凸显。数据显示,该病的年发病率为10/10万。目前临床上尚无有效的非手术治疗方法,且术后复发率高达40%。若未及时诊断和干预,可导致各种颅内、外并发症。胆脂瘤形成的发病机制研究多聚焦于细胞增殖、细胞凋亡及骨破坏等方面。多种非编码RNA因其在基因表达、细胞周期调节和疾病发生发展中的关键作用而备受关注,其中microRNA、长链非编码RNA和环状RNA的研究尤为深入。本文对非编码RNA在中耳胆脂瘤中的作用机制研究进展作一综述。 展开更多
关键词 中耳胆脂瘤 非编码rna MICROrna 环状rna 长链非编码rna
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环状RNA hsa_circ_0081621促进人喉鳞状细胞癌细胞的恶性生物学行为
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作者 刘胜辉 艾雪迎 +4 位作者 徐玉茹 李姝琪 刘猛 胡国斌 单保恩 《中国肿瘤生物治疗杂志》 北大核心 2025年第6期579-586,共8页
目的:探究环状RNA hsa_circ_0081621对人喉鳞状细胞癌AMC-HN-8和TU177细胞恶性生物学行为的影响。方法:常规培养AMC-HN-8和TU177细胞,用转染试剂将si-NC、si-hsa_circ_0081621、空载体(vector)和hsa_circ_0081621过表达载体(hsa_circ_00... 目的:探究环状RNA hsa_circ_0081621对人喉鳞状细胞癌AMC-HN-8和TU177细胞恶性生物学行为的影响。方法:常规培养AMC-HN-8和TU177细胞,用转染试剂将si-NC、si-hsa_circ_0081621、空载体(vector)和hsa_circ_0081621过表达载体(hsa_circ_0081621-OE)转染至AMC-HN-8和TU177细胞,分别记作si-NC、si-hsa_circ_0081621、vector和hsa_circ_0081621-OE组。用CCK-8法、克隆形成实验、划痕愈合实验和Transwell小室实验分别检测敲减或过表达hsa_circ_0081621对AMC-HN-8和TU177细胞增殖、迁移和侵袭能力的影响。结果:在AMC-HN-8和TU177中成功地敲减或过表达了hsa_circ_0081621;敲减或过表达hsa_circ_0081621能显著抑制或促进AMC-HN-8和TU177细胞的增殖、迁移和侵袭能力(P<0.01或P<0.001或P<0.0001)。结论:hsa_circ_0081621可促进人喉鳞状细胞癌AMC-HN-8和TU177细胞的恶性生物学行为。 展开更多
关键词 喉鳞状细胞癌 AMC-HN-8细胞 TU177细胞 环状rna hsa_circ_0081621 增殖 迁移 侵袭
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circRNA-miRNA-mRNA调控网络的挖掘以筛选缺血性脑卒中的潜在治疗药物 被引量:1
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作者 吴玉敏 王钟兴 于瑜 《中山大学学报(医学科学版)》 北大核心 2025年第3期456-465,共10页
【目的】挖掘缺血性脑卒中潜在的circRNA-miRNA-mRNA调控网络及其相应的治疗药物。【方法】利用GEO数据库发布的数据并选择研究大脑中动脉栓塞(MCAO)小鼠RNA表达水平的3个数据集GSE115697、GSE51586和GSE137482,使用R中的Limma包来筛选... 【目的】挖掘缺血性脑卒中潜在的circRNA-miRNA-mRNA调控网络及其相应的治疗药物。【方法】利用GEO数据库发布的数据并选择研究大脑中动脉栓塞(MCAO)小鼠RNA表达水平的3个数据集GSE115697、GSE51586和GSE137482,使用R中的Limma包来筛选差异表达的mRNA(DEmRNA)、DEcircRNA和DEmiRNA。采用MiRWalk、StarBase等多种生物信息学方法结合的综合策略来挖掘与脑卒中相关的circRNA-miRNA-mRNA网络,由Cytoscape软件完成核心子网络的筛选和可视化输出。通过基因本体(GO)富集分析及京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路分析研究ceRNA网络的功能,以富集超过10个基因且假发现率(FDR)<0.05的通路认为具有统计学意义。最后使用药物基因组学数据库connectivity map(CMap)筛选潜在的脑卒中治疗药物,并对野生型小鼠构建MCAO模型验证药物治疗效果。【结果】共筛选得出1249个DEmRNA、294个DEmiRNA和70个DEcircRNA,并发现3个circRNA-miRNA-mRNA调控网络可能与缺血性脑卒中密切相关。根据上述结果筛选得出Austricine、Metyrapone和Desoxypeganine这3种最有可能逆转由脑卒中相关ceRNA网络引起的改变的药物,并以Metyrapone为例验证所筛选药物对缺血性脑卒中确实可以改善术后第一(P=0.0014)、二天(P=0.0161)的神经功能损伤和减少脑梗死体积(P=0.0049),发挥脑保护作用。【结论】本研究从circRNA-miRNA-mRNA网络视角为缺血性脑卒中的发病机制提供了新的见解,本文预测得出的3种药物为缺血性脑卒中的治疗方法提供了新的线索。 展开更多
关键词 缺血性脑卒中 circrna Mrna 竞争性内源性rna CMap数据库
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环状RNA在肺动脉高压中的作用和机制 被引量:1
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作者 宋新月 朱大岭 《生理科学进展》 北大核心 2025年第1期22-29,共8页
环状RNA(circular RNA, circRNA)作为内源性的非编码RNA在真核生物转录组中普遍存在,调控生物体生命活动的各个方面,如转录调控、表观遗传修饰、信号传导、染色质修饰等,与多种疾病密切相关,发挥着不可或缺的作用。近年来,随着对circRN... 环状RNA(circular RNA, circRNA)作为内源性的非编码RNA在真核生物转录组中普遍存在,调控生物体生命活动的各个方面,如转录调控、表观遗传修饰、信号传导、染色质修饰等,与多种疾病密切相关,发挥着不可或缺的作用。近年来,随着对circRNA研究的不断深入,与肺动脉高压相关的circRNA逐渐被挖掘,使其成为当前肺动脉高压发病机制研究中的新热点。本文重点介绍了circRNA在肺动脉高压领域的研究现状,并探究了其在肺动脉高压中的作用和机制。 展开更多
关键词 肺动脉高压 环状rna 肺血管重构 基因调控 rna剪切 超级增强子 分子机制
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环状RNA mmu_circ_0000818在地塞米松导致的MC3T3-E1细胞凋亡中的作用及机制
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作者 杨慧霞 丁宁 +5 位作者 马润秋 李桂忠 郝银菊 马胜超 姜怡邓 白志刚 《实用医学杂志》 北大核心 2025年第4期478-489,共12页
目的筛选激素性股骨头坏死(steroid-induced osteonecrosis of femoral head,SONFH)成骨细胞中差异表达的凋亡相关环状RNA(circular RNA,circRNA),并研究其对成骨细胞凋亡的作用及机制。方法(1)培养小鼠MC3T3-E1细胞,分为Control组和dex... 目的筛选激素性股骨头坏死(steroid-induced osteonecrosis of femoral head,SONFH)成骨细胞中差异表达的凋亡相关环状RNA(circular RNA,circRNA),并研究其对成骨细胞凋亡的作用及机制。方法(1)培养小鼠MC3T3-E1细胞,分为Control组和dexamethasone(DEX)组;(2)采用Western blot检测各组细胞BCL2-Associated X的蛋白质(Bax)和B淋巴细胞瘤-2(Bcl-2)蛋白的表达,TUNEL染色和流式细胞术检测细胞凋亡情况;(3)提取正常和DEX处理的MC3T3-E1细胞RNA,进行RNA测序,筛选出差异表达的circRNAs,并通过GO和KEGG分析其功能;(4)筛选出差异表达的mmu_circ_0000818并进行细胞水平验证以及UCSC Genome Browser Gateway和circbase网站分析mmu_circ_0000818在染色体的位置和保守性;(5)构建mmu_circ_0000818过表达质粒及小干扰RNA(siRNA)并转染细胞,流式细胞术检测各组MC3T3-E1细胞凋亡情况。结果(1)与Control组相比,DEX组MC3T3-E1细胞凋亡升高(P<0.01);(2)根据log2foldchange(≥2)和P值(P<0.05)筛选差异表达的circRNAs,与Control组相比,DEX组中共有234个表达差异的circRNAs,其中上调的138个,下调的96个。差异表达circRNAs的靶基因利用GO和KEGG进行富集分析,Apoptosis(凋亡)和PI3K-Akt signaling pathway(磷脂酰肌醇-3激酶/蛋白激酶B信号通路)差异最显著。(3)qRT-PCR结果显示,与Control组相比,DEX组MC3T3-E1细胞中mmu_circ_0000818表达明显升高(P<0.01),UCSC Genome Browser Gateway和circbase分析发现mmu_circ_0000818主要位于17:78712463-78715086,由Crim1基因第6~7外显子环化形成并且在不同物种间具有高的保守性。(4)流式细胞术结果提示抑制mmu_circ_0000818可改善DEX引起的MC3T3-E1细胞凋亡,过表达则促进其凋亡。结论mmu_circ_0000818在DEX处理的MC3T3-E1细胞中显著增高,降低其可抑制DEX引起的细胞凋亡。 展开更多
关键词 环状rna mmu_circ_0000818 地塞米松 MC3T3-E1细胞 rna测序 凋亡
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环状RNA在肿瘤诊疗中的应用 被引量:2
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作者 杨奕 欧阳松应 吴军军 《中国生物化学与分子生物学报》 北大核心 2025年第3期344-352,共9页
环状RNA(circular RNA,circRNA)是一种具有共价闭环结构的单链RNA,相较于线性RNA具有更稳定的结构以及更低的免疫原性。大量研究表明,circRNA具有保守性、稳定性和组织特异性等特点,同时可以充当microRNA(miRNA)海绵,与蛋白质和翻译模... 环状RNA(circular RNA,circRNA)是一种具有共价闭环结构的单链RNA,相较于线性RNA具有更稳定的结构以及更低的免疫原性。大量研究表明,circRNA具有保守性、稳定性和组织特异性等特点,同时可以充当microRNA(miRNA)海绵,与蛋白质和翻译模板相互作用,调节基因表达和信号转导等生物学功能。基于circRNA的特性以及多种生物学功能,部分内源性circRNA在肿瘤的发生及发展中发挥重要调控作用,具有作为生物标志物和治疗靶点的潜力。此外,mRNA药物在实际应用中具有不稳定易降解、翻译效率低和免疫原性等限制。工程化可翻译的外源性circRNA可解决线性mRNA应用的部分缺陷,成为新型有潜力的高效药物。在本文中,介绍了circRNA在体内生物发生的机制,具体的生物学功能,在肿瘤中的诊疗应用现状。包括内源性circRNA在肿瘤中的诊断应用,外源性circRNA的设计合成策略,以及详细列举目前工程化circRNA疫苗利用其稳定高效表达蛋白质的功能在肿瘤治疗方面的一些设计和应用进展。最后,我们就当前circRNA的临床诊断应用问题,外源性circRNA的治疗应用挑战以及展望进行讨论。 展开更多
关键词 环状rna 生物标志物 疾病诊断 疫苗 免疫治疗
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基于转录组测序的蓖麻毒素诱导巨噬细胞焦亡中氧化应激相关基因及环状RNA表达谱分析
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作者 卢楠 董明鑫 +5 位作者 于磊 孙成彪 王燕 许娜 刘文森 葛淑敏 《吉林大学学报(医学版)》 北大核心 2025年第4期1007-1018,共12页
目的:利用转录组测序及生物信息学技术,分析鉴定蓖麻毒素(RT)诱导小鼠单核巨噬细胞(RAW264.7)焦亡中与氧化应激相关的基因和环状RNA(circRNA)表达谱,并初步分析其潜在功能。方法:使用RT处理单核巨噬细胞(RAW264.7细胞)构建细胞焦亡模型... 目的:利用转录组测序及生物信息学技术,分析鉴定蓖麻毒素(RT)诱导小鼠单核巨噬细胞(RAW264.7)焦亡中与氧化应激相关的基因和环状RNA(circRNA)表达谱,并初步分析其潜在功能。方法:使用RT处理单核巨噬细胞(RAW264.7细胞)构建细胞焦亡模型,分为对照组、40μg·L^(-1)RT组和80μg·L^(-1)RT组。采用透射电镜观察各组RAW264.7细胞形态表现,Western blotting法检测各组细胞中细胞焦亡通路中蛋白表达水平,选择80μg·L^(-1)RT进行后续实验,利用转录组测序技术(RNA-Seq)获得对照组和RT组RAW264.7细胞中circRNA表达谱及mRNA表达谱,并进行生物信息学分析。结果:与对照组比较,40和80μg·L^(-1)RT组细胞均发生形态改变,细胞呈现出明显焦亡样形态改变,表现为濒死细胞出现明显肿胀,质膜上出现特征性的大气泡。与对照组比较,40和80μg·L^(-1)RT组中消皮素D N端结构域(GSDMD-N)蛋白表达水平升高(P<0.05),与40μg·L^(-1)RT组比较,80μg·L^(-1)RT组细胞中GSDMD-N蛋白表达水平升高(P<0.05),故后续实验RT浓度选取80μg·L^(-1)。共鉴定出差异表达信使RNA(mRNA)2930个,差异表达circRNA 24个。构建的circRNA-微小RNA(miRNA)-mRNA竞争性内源RNA(ceRNA)调控网络由7个circRNAs、12个miRNA和13个mRNA组成。基因本体论(GO)功能富集分析,在生物过程(BP)中差异表达基因所调节的功能主要有免疫反应和氧化应激反应等;在细胞组分(CC)中差异表达基因主要定位于质膜外侧和细胞前缘;在分子功能(MF)中主要参与转运体跨膜活性和激素受体结合等。京都基因与基因组百科全书(KEGG)信号通路富集分析,差异表达基因主要富集于Toll样受体信号通路、叉头框蛋白O(FoxO)信号通路和核因子κB(NF-κB)信号通路。蛋白-蛋白相互作用(PPI)网络,通过CytoHubba筛选出基质金属蛋白酶9(MMP9)、超氧化物歧化酶2(SOD2)和鸡肉瘤病毒基因(Src)等前10位连接度最高的Hub基因。结论:RT处理后RAW264.7细胞中氧化应激相关基因和circRNA表达谱发生变化,筛选得到的差异表达circRNA和mRNA可能作为潜在靶点通过氧化应激途径调控RT诱导的RAW264.7细胞焦亡。 展开更多
关键词 蓖麻毒素 细胞焦亡 氧化应激 环状rna 竞争性内源rna
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缺氧诱导的人视网膜微血管内皮细胞中环状RNA的差异表达及功能预测
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作者 陈娟 王宁 +3 位作者 夏明明 张国明 罗先琼 马健 《暨南大学学报(自然科学与医学版)》 北大核心 2025年第3期296-307,321,共13页
目的:探究环状RNA(circular RNA,circRNA)在缺氧诱导的人视网膜微血管内皮细胞(human retinal microvascular endothelial cells, HRMECs)中的差异表达及其功能,为早产儿视网膜病变(retinopathy of prematurity, ROP)的发病机制提供新... 目的:探究环状RNA(circular RNA,circRNA)在缺氧诱导的人视网膜微血管内皮细胞(human retinal microvascular endothelial cells, HRMECs)中的差异表达及其功能,为早产儿视网膜病变(retinopathy of prematurity, ROP)的发病机制提供新见解。方法:分离提取HRMECs,建立ROP细胞缺氧模型,通过全转录组测序分析circRNA差异表达谱;采用qRT-PCR验证8个差异表达circRNA(differentially expressed circular RNA, DE-circRNA),并进行GO和KEGG通路分析;利用生物信息学技术构建circRNA-miRNA-mRNA调控网络。结果:在正常培养与缺氧诱导之间共有1 714个circRNA呈现差异表达,其中899个上调,815个下调(q<0.05,差异倍数>2)。GO分析结果显示,DE-circRNA主要富集于凋亡信号通路的正调控等生物过程,而KEGG分析结果提示其主要涉及肿瘤相关信号通路、肿瘤坏死因子信号通路等。circRNA-miRNA-mRNA网络分析结果表明,hsa_circ_0140253可能通过hsa-miR-210-3p/ERFE和hsa-miR-210-3p/PPARGC1A轴在ROP的发生发展中发挥潜在调控作用。结论:本研究揭示了HRMECs缺氧模型中的circRNA差异表达谱,提示hsa_circ_0140253可能通过竞争性内源RNA(competing endogenous RNA,ceRNA)的机制参与ROP的发生发展。 展开更多
关键词 早产儿视网膜病变 缺氧 人视网膜微血管内皮细胞 环状rna 竞争性内源rna
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禽腺病毒血清4型感染LMH细胞的环状RNA表达分析
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作者 殷冬冬 朱梦琪 +7 位作者 兰梦蝶 朱星星 尹磊 沈学怀 王洁茹 赵瑞宏 戴银 潘孝成 《华北农学报》 北大核心 2025年第4期219-224,共6页
为分析禽腺病毒血清4型(FAdV-4)感染鸡肝癌细胞(LMH)后环状RNA(circRNA)的表达谱变化,进一步研究circRNA在FAdV-4感染过程中的调控作用,以FAdV-4感染的LMH和未感染细胞为对象进行转录组测序,对差异表达circRNA进行GO功能和KEGG信号通路... 为分析禽腺病毒血清4型(FAdV-4)感染鸡肝癌细胞(LMH)后环状RNA(circRNA)的表达谱变化,进一步研究circRNA在FAdV-4感染过程中的调控作用,以FAdV-4感染的LMH和未感染细胞为对象进行转录组测序,对差异表达circRNA进行GO功能和KEGG信号通路富集分析,通过实时荧光定量PCR(qRT-PCR)对随机挑选的5个circRNA进行验证。结果表明,感染组和未感染组的circRNA分布于绝大多数染色体上,且长度主要集中在300~1000 bp。差异表达分析筛选出72个circRNA,32个circRNA表达水平显著上调,40个circRNA表达水平下调。GO功能分析,差异circRNA来源基因主要富集在细胞过程、代谢过程、催化活性和核酸结合转录因子活性等进程。KEGG通路分析显示,差异表达circRNA主要富集在Notch信号通路、RNA降解和MAPK信号通路。qRT-PCR结果表明,被验证的5个circRNA表达水平与测序结果趋势一致,进一步验证了测序结果的可靠性。本研究对FAdV-4感染LMH细胞的circRNA表达谱进行分析,并筛选出差异表达的circRNA,为探究circRNA在FAdV-4感染过程中的功能及宿主与FAdV-4互作机制提供数据支持。 展开更多
关键词 禽腺病毒血清4型 LMH细胞 转录组测序 环状rna 差异表达
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环状RNA hsa_circ_0046701在胶质瘤组织中的表达及其对胶质瘤U251细胞增殖、迁移与侵袭的影响
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作者 曹崇威 王松涛 +1 位作者 王明磊 刘应许 《中国肿瘤生物治疗杂志》 北大核心 2025年第4期386-391,共6页
目的:探讨环状RNA hsa_circ_0046701在胶质瘤组织中的表达及其对胶质瘤U251细胞增殖、迁移与侵袭的影响。方法:收集2022年6月至2023年3月期间在同济大学附属普陀人民医院接受手术治疗的52例胶质瘤患者的瘤组织标本及临床资料,另收集30... 目的:探讨环状RNA hsa_circ_0046701在胶质瘤组织中的表达及其对胶质瘤U251细胞增殖、迁移与侵袭的影响。方法:收集2022年6月至2023年3月期间在同济大学附属普陀人民医院接受手术治疗的52例胶质瘤患者的瘤组织标本及临床资料,另收集30例正常脑组织标本作为对照。通过qPCR法检测胶质瘤组织中hsa_circ_0046701表达水平,分析其与患者临床特征间的关系,通过Kaplan-Meier法分析hsa_circ_0046701水平与生存预后的关系。利用RNA干扰技术,分别将circ_0046701过表达及空载体(vector)、siRNA-circ_0046701及阴性对照(si-NC)质粒转染到胶质瘤U251细胞中,实验分为si-circ_0046701组、si-NC组、circ_0046701 OE组、Vector组。应用CCK-8法、Transwell小室实验检测各组细胞的增殖、迁移及侵袭能力,WB法检测各组细胞中vimentin、Snail、E-cadherin和cyclin D1蛋白的表达。结果:胶质瘤组织中hsa_circ_0046701表达显著高于正常脑组织(P<0.01)。hsa_circ_0046701高表达组患者WHO脑胶质瘤分级(Ⅲ~Ⅳ级)占比显著高于低表达组(P<0.01),其高表达组患者术后生存期显著短于低表达组。与si-NC组相比,si-circ_0046701组U251细胞的增殖能力显著降低(P<0.05或P<0.01)、迁移及侵袭细胞数均显著减少(均P<0.01),细胞中vimentin、Snail、cyclin D1蛋白表达均明显降低(均P<0.01)、E-cadherin蛋白表达明显增高(P<0.01);与Vector组相比,circ_0046701 OE组U251细胞的增殖能力显著升高(P<0.01)、迁移及侵袭细胞数均显著增多(均P<0.01),细胞中vimentin、Snail、cyclin D1蛋白表达均显著增高(均P<0.01)、E-cadherin蛋白表达明显降低(P<0.01)。结论:环状RNA hsa_circ_0046701在胶质瘤组织中呈高表达,并与患者的不良预后密切相关;敲低hsa_circ_0046701表达能够抑制脑胶质瘤U251细胞的增殖、迁移及侵袭能力。 展开更多
关键词 环状rna hsa_circ_0046701 胶质瘤 U251细胞 增殖 迁移 侵袭
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基于m 6A修饰的环状RNA在脂质代谢中的调控功能 被引量:1
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作者 张笑笑 《中国生物化学与分子生物学报》 北大核心 2025年第2期230-237,共8页
环状RNA(circular RNA,circRNA)是前体信使RNA(pre-messenger RNA,pre-mRNA)经可变剪接产生的单链、共价闭合非编码RNA,具有高稳定性、序列保守性和疾病特异性表达的优势,因此吸引了广大关注。N6甲基腺苷(N6-methyladenosine,m 6A)甲基... 环状RNA(circular RNA,circRNA)是前体信使RNA(pre-messenger RNA,pre-mRNA)经可变剪接产生的单链、共价闭合非编码RNA,具有高稳定性、序列保守性和疾病特异性表达的优势,因此吸引了广大关注。N6甲基腺苷(N6-methyladenosine,m 6A)甲基化发生在N6位置,是包括mRNA和非编码RNA(non-coding RNA,ncRNA)在内的真核生物内部转录修饰中最丰富和保守的一类。CircRNA和m 6A修饰已被证实,在调节脂质代谢在内的多种关键生物过程中发挥重要作用。随着测序技术的飞速发展,在转录物组范围内进行m 6A甲基化修饰的circRNA被广泛报道,并且发现它们参与了脂质代谢过程。即m 6A修饰参与调控circRNA的生物发生、降解、输出和翻译,circRNA也可以通过影响甲基化转移酶、去甲基化酶和甲基化阅读蛋白来调节m 6A修饰调控脂质代谢过程。因此,本文总结了与脂质代谢相关的m 6A修饰、circRNA及两者之间相互作用的最新突破,讨论了m 6A修饰的circRNA通过调控脂质合成、分解及脂质过氧化等脂代谢过程,尤其在脂质合成过程中发挥重要作用。对m 6A修饰的circRNA在脂质代谢中调控功能的综合分析揭示了其在脂质代谢途径中的重要作用,并为未来脂代谢异常相关疾病的研究提供了新的视角和理论依据。 展开更多
关键词 环状rna m^(6)A修饰 脂质代谢 调控功能
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非编码RNA的引导RNA的设计及其应用
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作者 秦玉婷 潘森涛 陈渝萍 《生物技术通报》 北大核心 2025年第3期71-82,共12页
非编码RNA (non-coding RNA, ncRNA)是指通常不编码蛋白质的功能性RNA分子,多通过调控编码基因的表达和功能发挥重要的生理作用。微小RNA (microRNA, miRNA)、环状RNA (circular RNA, circRNA)及长编码RNA (long non-coding RNA, lncRNA... 非编码RNA (non-coding RNA, ncRNA)是指通常不编码蛋白质的功能性RNA分子,多通过调控编码基因的表达和功能发挥重要的生理作用。微小RNA (microRNA, miRNA)、环状RNA (circular RNA, circRNA)及长编码RNA (long non-coding RNA, lncRNA)是目前已知的三大类具有重要生理和病理意义的调控型ncRNA,其基因的缺失重排和表达失调与多种疾病的发生发展密切相关。成簇规律间隔短回文重复序列及相关蛋白质系统(clustered regularly interspaced short palindromic repeats and CRISPR-associated proteins, CRISPR/Cas)是一类广泛存在于细菌和古菌中的免疫防御系统,由CRISPR相关蛋白(CRISPRassociated proteins, Cas)和引导RNA (guide RNAs, gRNA)共同组成。该系统利用gRNA引导Cas核酸酶剪切和清除外源基因,因此Cas酶对靶DNA/RNA的精准识别和有效切割是由gRNA决定的。CRISPR/Cas技术具有优异的基因组定点编辑和转录本特异性剪切能力,能精准高效地编辑、干预和检测ncRNA的异常,帮助人们成功诊治疾病。本文在总结Cas9和Cas13 gRNA的组成和设计原则的基础上,针对miRNA、circRNA及lncRNA基因和其RNA自身或RNA形成过程中产生的特殊分子特征,重点介绍针对三类ncRNA的gRNA的设计策略和敲除靶点的选择,以及Cas9和Cas13核酸酶如何在gRNA高特异性和高效率的引导下,对异常miRNA、circRNA和lncRNA进行精准检测和干预。进一步讨论3类ncRNA的gRNA设计异同点和CRISRP/Cas应用在ncRNA上所面临的挑战,并对未来精准靶向ncRNA的gRNA设计进行展望,旨在为CRISPR/Cas技术在治疗ncRNA相关疾病上的应用提供参考。 展开更多
关键词 CRISPR/Cas guide rna 非编码rna MIrnaS circrnas lncrnas 敲除靶点
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RNA结合蛋白HuR与非编码RNA相互作用在疾病中的研究进展
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作者 黄勇 袁小漫 +1 位作者 刘凌蔚 李松沛 《中国药理学通报》 北大核心 2025年第4期601-605,共5页
RNA结合蛋白人类抗原R(human antigen R,HuR)是胚胎致死性异常视觉样1(embryonic lethal abnormal vision-like 1,ELAVL1)基因编码的蛋白产物,在人体细胞中普遍表达,主要通过与含AU富集元件(AU-enriched elements,AREs)的mRNA结合调节m... RNA结合蛋白人类抗原R(human antigen R,HuR)是胚胎致死性异常视觉样1(embryonic lethal abnormal vision-like 1,ELAVL1)基因编码的蛋白产物,在人体细胞中普遍表达,主要通过与含AU富集元件(AU-enriched elements,AREs)的mRNA结合调节mRNA稳定性来参与转录后调控。近年来,大量研究表明,HuR还可与非编码RNA(non-coding RNA,ncRNA)相互作用来参与基因表达的调控,包括长链ncRNA、环状RNA、微小RNA和穹窿体RNA等。HuR和这些ncRNA的相互作用在肿瘤等多种疾病的发生和发展中起了关键作用,由于肿瘤方面的研究已经有综述进行归纳总结,该综述主要总结HuR-ncRNA相互作用在肿瘤以外的疾病中的作用。 展开更多
关键词 人类抗原R 非编码rna MIrna lncrna circrna 转录后调控
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非编码RNA介导的凋亡在肺癌中的研究进展
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作者 刘德伟 吴东 +2 位作者 黄丹 招轩娜 吴斌 《中国临床药理学与治疗学》 北大核心 2025年第7期968-976,共9页
肺癌是临床上最常见的恶性肿瘤,严重威胁人类健康。近些年,随着生物信息学技术的发展,大量非编码RNA(non-coding RNA,ncRNA)被发现在肺癌细胞的凋亡调控中发挥关键作用。本文综述了ncRNA(miRNA,lncRNA,circRNA,piRNA)介导的凋亡在肺癌... 肺癌是临床上最常见的恶性肿瘤,严重威胁人类健康。近些年,随着生物信息学技术的发展,大量非编码RNA(non-coding RNA,ncRNA)被发现在肺癌细胞的凋亡调控中发挥关键作用。本文综述了ncRNA(miRNA,lncRNA,circRNA,piRNA)介导的凋亡在肺癌中的研究进展,旨在为ncRNA治疗肺癌提供新的理论依据。 展开更多
关键词 肺癌 凋亡 非编码rna mirna lncrna circrna PIrna
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竞争性内源性RNA在牙周炎中的作用及机制的研究进展
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作者 范兴丽 潘乐 +2 位作者 赵家园 项秋猛 陈启林 《国际口腔医学杂志》 北大核心 2025年第3期317-322,共6页
竞争性内源性RNA (ceRNA)可以通过转录调节炎症相关介质的反应进而调控牙周炎的进展。ceRNA,包括长链非编码RNA、环状RNA、信使RNA等,可与微小RNA结合,构成ceRNA网络,调控下游靶基因的表达,影响牙周炎的发生、发展。本文总结了已经通过... 竞争性内源性RNA (ceRNA)可以通过转录调节炎症相关介质的反应进而调控牙周炎的进展。ceRNA,包括长链非编码RNA、环状RNA、信使RNA等,可与微小RNA结合,构成ceRNA网络,调控下游靶基因的表达,影响牙周炎的发生、发展。本文总结了已经通过实验验证的ceRNA在调控牙周炎发生发展中的作用及机制,对包括抑制和促进牙周炎发生发展两个方面的研究进展进行综述,为未来牙周炎的研究提供新思路。 展开更多
关键词 竞争性内源性rna 牙周炎 微小rna 长链非编码rna 环状rna
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基于微阵列数据的circRNA-miRNA-mRNA竞争性内源RNA网络构建及其与自身免疫性肝炎小鼠模型肝损伤的相关性分析
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作者 郭地 刘莹 刘杨 《临床肝胆病杂志》 北大核心 2025年第5期878-887,共10页
目的构建环状RNA(circRNA)-微小RNA(miRNA)-信使RNA(mRNA)竞争性内源RNA(ceRNA)网络,探讨其在刀豆蛋白A诱导的自身免疫性肝炎(AIH)小鼠模型中的潜在调控机制,并验证关键基因的表达与肝损伤的关系。方法使用高通量数据筛选差异表达的circ... 目的构建环状RNA(circRNA)-微小RNA(miRNA)-信使RNA(mRNA)竞争性内源RNA(ceRNA)网络,探讨其在刀豆蛋白A诱导的自身免疫性肝炎(AIH)小鼠模型中的潜在调控机制,并验证关键基因的表达与肝损伤的关系。方法使用高通量数据筛选差异表达的circRNA、miRNA和mRNA,基于Pearson相关分析和Miranda程序预测miRNA与mRNA及circRNA的配对关系,构建ceRNA网络。对网络中的差异表达基因进行GO和KEGG富集分析。选取SPF级雄性C57BL/6小鼠12只,采用随机数字表法分为对照组和模型组,每组6只,模型组通过尾静脉注射刀豆蛋白A构建AIH小鼠模型,对照组注射生理盐水。通过qRT-PCR和Western Blot方法验证circ_0001577、miR-7055-3p和Akt3的表达。测定血清转氨酶(ALT、AST)和肝组织中丙二醛(MDA)及一氧化氮(NO)含量,并分析其与基因表达的相关性。计量资料两组间比较采用成组t检验。使用Spearman相关分析法分析基因表达与肝损伤指标之间的相关性。结果构建了包含5795个circRNAmiRNA-mRNA配对的ceRNA网络,发现circ_0001577为中心基因。与对照组小鼠比较,模型组中的circ_0001577和Akt3表达上调,miR-7055-3p下调,差异均有统计学意义(P值均<0.05),且circ_0001577与Akt3呈正相关(r=0.861,P<0.001),miR-7055-3p与两者呈负相关(r值分别为−0.644、−0.855,P值均<0.05)。模型组小鼠肝脏Akt3蛋白表达显著高于对照组(1.04±0.10 vs 0.72±0.06,t=−6.49,P=0.001),并与circ_0001577呈正相关(r=0.579,P=0.048),与miR-7055-3p呈负相关(r=−0.891,P<0.001)。模型组小鼠血清ALT、AST和肝组织MDA、NO含量较对照组均显著增加(P值均<0.05),上述肝损伤指标与circ_0001577、Akt3呈正相关(r值分别为0.849、0.865、0.811、0.801;0.889、0.954、0.938、0.961,P值均<0.05),与miR-7055-3p呈负相关(r值分别为−0.687、−0.818、−0.833、−0.870,P值均<0.05),且与Akt蛋白表达呈正相关(r值分别为0.648、0.796、0.848、0.860,P值均<0.05)。结论circ_0001577通过竞争性吸附miR-7055-3p,导致Akt3抑制被解除,进而促进Akt3的表达,参与AIH的发生发展。circ_0001577及其相关通路可能成为AIH的潜在治疗靶点。 展开更多
关键词 肝炎 自身免疫性 rna 环状 rnaS rna 信使 小鼠 近交C57BL
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CircRNA-miRNA调控猪脂肪沉积的研究进展
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作者 张悫 田慧丽 +2 位作者 亓鹏 夏振宇 肖发沂 《猪业科学》 2025年第8期100-101,共2页
环状RNA(circRNA),作为一种内源性的非编码RNA分子,其特征在于其独特的共价闭合环状结构。研究发现在哺乳动物的各种组织中都存在circRNA的表达,并且发挥着重要的作用。miRNA(microRNA),作为一类长度介于20~25个核苷酸之间的内源性非编... 环状RNA(circRNA),作为一种内源性的非编码RNA分子,其特征在于其独特的共价闭合环状结构。研究发现在哺乳动物的各种组织中都存在circRNA的表达,并且发挥着重要的作用。miRNA(microRNA),作为一类长度介于20~25个核苷酸之间的内源性非编码单链RNA分子,其广泛存在于真核细胞中。 展开更多
关键词 脂肪沉积 哺乳动物 MIrna 非编码rna circrna
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环状RNA hsa_circ_0085576调控微小RNA-498/B细胞特异性莫洛尼鼠白血病病毒整合位点1轴对口腔鳞状细胞癌细胞迁移和侵袭的影响 被引量:1
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作者 李立恒 王蕊 +5 位作者 王晓明 张智轶 张璇 安峰 王芹 张凡 《国际口腔医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2024年第1期60-67,共8页
目的探究环状RNA hsa_circ_0085576对口腔鳞状细胞癌(OSCC)细胞迁移和侵袭的影响及其分子机制。方法使用实时荧光定量聚合酶链反应(qRT-PCR)和蛋白印迹法检测OSCC细胞中hsa_circ_0085576、微小RNA-498(miR-498)以及B细胞特异性莫洛尼鼠... 目的探究环状RNA hsa_circ_0085576对口腔鳞状细胞癌(OSCC)细胞迁移和侵袭的影响及其分子机制。方法使用实时荧光定量聚合酶链反应(qRT-PCR)和蛋白印迹法检测OSCC细胞中hsa_circ_0085576、微小RNA-498(miR-498)以及B细胞特异性莫洛尼鼠白血病病毒整合位点1(BMI-1)的表达水平。使用CCK-8、划痕实验、Transwell实验以及qRT-PCR、蛋白印迹法分别检测SCC-15细胞增殖活力、迁移及侵袭能力以及相关基因和蛋白的相对表达量。结果OSCC细胞中hsa_circ_0085576与BMI-1表达上调,miR-498表达下调(P<0.05)。下调hsa_circ_0085576表达或过表达miR-498后SCC-15细胞的增殖活性、划痕愈合率、侵袭细胞数目以及细胞周期蛋白D1、波形蛋白表达水平下调,miR-498和E-钙黏蛋白表达水平上调(P<0.05);抑制miR-498表达可减弱下调hsa_circ_0085576表达对OSCC细胞增殖、迁移及侵袭的抑制作用;上调BMI-1表达可减弱过表达miR-498对OSCC细胞增殖、迁移及侵袭的抑制作用。结论下调hsa_circ_0085576表达可通过激活miR-498/BMI-1轴抑制OSCC细胞增殖、迁移及侵袭。 展开更多
关键词 环状rna hsa_circ_0085576 微小rna-498 B细胞特异性莫洛尼鼠白血病病毒整合位点1 口腔鳞状细胞癌
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小细胞外囊泡及其携带的非编码RNA在非酒精性脂肪性肝病中的作用
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作者 李想 李晔 《生物化学与生物物理进展》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2024年第5期1054-1066,共13页
小细胞外囊泡(small extracellular vesicles,sEVs)是由细胞分泌的一种细胞外囊泡,产生于多泡体,多泡体与质膜融合并释放到细胞外基质。由于小细胞外囊泡可以携带分子质量相对较小的核酸、蛋白质、脂质,能够执行细胞间物质传递、细胞间... 小细胞外囊泡(small extracellular vesicles,sEVs)是由细胞分泌的一种细胞外囊泡,产生于多泡体,多泡体与质膜融合并释放到细胞外基质。由于小细胞外囊泡可以携带分子质量相对较小的核酸、蛋白质、脂质,能够执行细胞间物质传递、细胞间通讯等功能。因此,小细胞外囊泡及其携带的非编码RNA不仅参与细胞正常生理过程,也可以在多种疾病的发生发展过程中起重要作用。本文综述了小细胞外囊泡在非酒精性脂肪性肝病(NAFLD)中的作用,小细胞外囊泡及其携带的非编码RNA不仅有望成为NAFLD诊断的标志物,同时也具有治疗NAFLD的潜在作用,或能为治疗NAFLD提供新思路。 展开更多
关键词 小细胞外囊泡 非酒精性脂肪性肝病 非编码rna 微小rna 长链非编码rna 环状rna
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