基于SCoT、SRAP和SSR分子标记的220份辣椒种质资源遗传多样性分析

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作者 裴红霞 汪露瑶 +1 位作者 李生梅 高晶霞 《生物技术通报》 北大核心 2025年第8期165-174,共10页

【目的】深入解析保存在宁夏农林科学院辣椒种质资源的遗传多样性和亲缘关系,为辣椒种质资源的引进、保护和应用提供重要的理论依据。【方法】采用SCoT、SRAP和SSR 3种分子标记技术,对收集于全国15个地区的220份辣椒种质资源进行遗传多... 【目的】深入解析保存在宁夏农林科学院辣椒种质资源的遗传多样性和亲缘关系,为辣椒种质资源的引进、保护和应用提供重要的理论依据。【方法】采用SCoT、SRAP和SSR 3种分子标记技术,对收集于全国15个地区的220份辣椒种质资源进行遗传多样性分析。【结果】6个SCoT标记分别扩增出1-4条条带,14个SRAP标记分别扩增出2-4条条带,3个SSR标记分别扩增出2-5条条带,且所有标记均表现出100%的多态性条带百分比。进一步分析发现,SSR标记的平均多态性信息指数(PIC)最高,达到0.77,显著高于SCoT(0.55)和SRAP(0.55),表明SSR标记在遗传多态性检测中更具优势,其中,HpmsE088为最优SSR标记。聚类分析、主坐标分析和群体遗传结构分析将15个地区的种质划分为两大类群(Group 1和Group 2),其中Group 1包含中国四川、中国辽宁、中国新疆、中国山东、中国宁夏和中国湖南的种质,Group 2则包括中国(云南、江苏、河南、甘肃、北京和安徽)、荷兰、日本和美国的种质。此外,83.2%的种质表现出较高的纯合性。果形特征与聚类分组存在一定的相关性,Group 1中线形果实的辣椒种质比例显著高于Group 2,而所有短牛角形果实的辣椒种质均被归入Group 2。【结论】保存在宁夏农林科学院的辣椒种质资源具有较高的遗传多样性,根据遗传信息主要可以被划分为2组。 展开更多

关键词 辣椒 遗传多样性 scot标记 SRAP标记 SSR标记

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基于SCoT标记的黑稻种质资源遗传多样性分析

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作者 刘柯忻 张晓娟 +3 位作者 张卫平 李新生 吴升华 马秀奇 《植物遗传资源学报》 北大核心 2025年第2期260-270,共11页

黑稻种质资源分布广泛,遗传背景较为复杂,揭示黑稻材料的遗传背景、明确材料间的亲缘关系具有重要意义。本研究利用实验室前期筛选的30条SCoT引物对90份水稻材料(包括21份黑叶黑稻、24份紫叶黑稻、30份绿叶黑稻、15份白稻)进行遗传多样... 黑稻种质资源分布广泛,遗传背景较为复杂,揭示黑稻材料的遗传背景、明确材料间的亲缘关系具有重要意义。本研究利用实验室前期筛选的30条SCoT引物对90份水稻材料(包括21份黑叶黑稻、24份紫叶黑稻、30份绿叶黑稻、15份白稻)进行遗传多样性分析。结果显示,SCoT引物共扩增出194个条带,其中多态性条带165条,多态性比例为85%。等位基因数(Na)、有效等位基因数(Ne)、Nei′s基因多样性指数(H)以及Shannon′s信息指数(I)的平均值分别为1.9216、1.3922、0.2445和0.3836。聚类分析结果显示,在遗传相似系数为0.73处,将90份水稻材料分为4类。群体结构分析与聚类分析结果一致性较好,说明SCoT标记适用于黑稻遗传背景及亲缘关系的研究。供试水稻种质间的遗传相似系数主要分布在0.59~0.79之间,遗传相似度较高,分子方差分析显示,91%遗传变异来源于群体内,群体间的遗传变异为9%,说明供试水稻材料间遗传差异较小,应进一步丰富黑稻种质资源遗传多样性。本研究为黑稻杂交育种中的亲本选择提供参考依据,同时为黑稻品种的遗传改良、新品种培育提供理论依据。 展开更多

关键词 黑稻 scot标记 遗传多样性

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基于SCoT分子标记的葡萄种质资源遗传多样性分析

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作者 唐凡 魏一杰 +2 位作者 闫晓伟 王进 梁东 《福建农业学报》 北大核心 2025年第5期433-440,共8页

【目的】葡萄(Vitis vinifera L.)种质资源丰富,品种繁多,解析葡萄主要栽培品种的亲缘关系,可为挖掘优异的种质资源和亲本选配等提供依据。【方法】以77份葡萄种质资源为材料,提取葡萄叶片总DNA进行PCR扩增,采用SCoT分子标记技术进行遗... 【目的】葡萄(Vitis vinifera L.)种质资源丰富,品种繁多,解析葡萄主要栽培品种的亲缘关系,可为挖掘优异的种质资源和亲本选配等提供依据。【方法】以77份葡萄种质资源为材料,提取葡萄叶片总DNA进行PCR扩增,采用SCoT分子标记技术进行遗传多样性分析,并采用Structure2.3.4软件进行群体遗传结构分析。【结果】从36条SCoT引物筛选出10条多态性丰富且扩增稳定的引物,共检测到68个扩增条带,其中65个为多态性条带,总体多态性比率为95.7%;平均6.8条带/引物,引物的条带多态性比率分布在80%~100%;遗传多样性分析所得平均基因遗传多样性指数为0.3882。聚类结果显示,77份葡萄遗传相似系数为0.59~0.97,当遗传相似系数为0.626时,可将群体分为两大类群,Pop1中包含34份种质,大部分为欧美杂种葡萄品种(V.vinifera×V.labrusca L.),Pop2中包含43份种质,大部分为欧亚种葡萄品种(V.vinifera),各类群成员遗传背景较纯。【结论】SCoT分子标记可以对葡萄种质的遗传多样性进行鉴定,本研究结果为四川葡萄种质资源亲缘关系分析、杂交亲本选配、分子标记辅助育种等提供了参考。 展开更多

关键词 葡萄 scot分子标记 遗传多样性 亲缘关系

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重楼属植物遗传多样性的SCOT标记 被引量：15

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作者 李壮 辛本华 +2 位作者 杨华 刘晨 田孟良 《广西植物》 CAS CSCD 北大核心 2014年第3期315-319,368,共6页

为评估重楼属植物的基因资源开发前景,初步探讨了SCOT标记技术在重楼属植物遗传多样性研究上的应用。采用目标起始密码子多态性(Start codon targeted polymorphism,SCOT)技术,对重楼属9个种40份材料进行基因组DNA多态性分析。结果表明... 为评估重楼属植物的基因资源开发前景,初步探讨了SCOT标记技术在重楼属植物遗传多样性研究上的应用。采用目标起始密码子多态性(Start codon targeted polymorphism,SCOT)技术,对重楼属9个种40份材料进行基因组DNA多态性分析。结果表明:四川地区重楼属植物具有丰富的遗传多样性,40份供试材料可聚为4类:狭叶重楼单独聚为第一类;球药隔重楼、卵叶重楼、金线重楼及滇重楼聚为第二类;黑籽重楼与七叶一枝花聚为第三类;五指莲与毛重楼聚为第四类。说明SCOT标记能够对重楼属植物进行准确的分子鉴定,为重楼属植物的种类鉴定和种间的分类地位提供分子生物学依据,同时也为深入探究重楼皂苷合成关键酶基因定位研究提供重要参考。 展开更多

关键词 重楼 scot标记 多态性 聚类分析

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目标起始密码子多态性(SCoT)分子标记技术在花生属中的应用 被引量：77

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作者 熊发前 蒋菁 +5 位作者 钟瑞春 韩柱强 贺梁琼 李忠 庄伟建 唐荣华 《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2010年第12期2055-2061,共7页

花生属分子标记领域的研究远落后于其他物种,而栽培种花生因其遗传基础狭窄,用大多数分子标记技术都难以检测到丰富的分子标记,因此限制了花生属野生种在改良花生栽培种方面的利用以及建立花生分子标记辅助育种技术体系。本文分别对花生... 花生属分子标记领域的研究远落后于其他物种,而栽培种花生因其遗传基础狭窄,用大多数分子标记技术都难以检测到丰富的分子标记,因此限制了花生属野生种在改良花生栽培种方面的利用以及建立花生分子标记辅助育种技术体系。本文分别对花生属4个区组的16份种质资源和8份花生栽培种资源采用与功能基因相关的SCoT分子标记技术研究了花生属种间和栽培种内遗传多样性和亲缘关系。23条SCoT引物在花生属试材基因组中的扩增位点共194个,其中多态性位点130个,多态性达67.01%,通过聚类分析研究了它们之间的亲缘关系;在栽培种内筛选出19条多态性引物,在8份试材基因组中扩增位点198个,其中多态性位点67个,多态性为33.84%,表明SCoT分子标记技术能在花生栽培种内检测出一定程度的DNA多态性。 展开更多

关键词 花生 目标起始密码子多态性 分子标记 遗传多样性

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基于SCoT标记的芥菜种质遗传多样性与指纹图谱 被引量：21

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作者 林清 龙治坚 +5 位作者 韩国辉 何桥 向素琼 范永红 唐佳佳 梁国鲁 《中国蔬菜》 北大核心 2013年第06X期31-39,共9页

利用SCoT标记对46份芥菜种质资源进行遗传多样性分析。从70条引物中筛选出21条用于PCR扩增,共扩增出200条条带,其中多态性条带140条,多态性比率为70%。供试材料相似系数介于0.77～0.95之间,平均Nei’s基因多样性为0.198,平均Shannon信... 利用SCoT标记对46份芥菜种质资源进行遗传多样性分析。从70条引物中筛选出21条用于PCR扩增,共扩增出200条条带,其中多态性条带140条,多态性比率为70%。供试材料相似系数介于0.77～0.95之间,平均Nei’s基因多样性为0.198,平均Shannon信息指数为0.301,平均多态信息含量为0.8227。利用UPGMA构建46份芥菜种质资源的聚类树状图,在相似系数D1=0.780处,可以将46份芥菜种质分为两大类;而在D2=0.807处,第Ⅱ类可进一步细分为5个亚类。选出清晰的16个多态性位点,构建46份芥菜种质的SCoT指纹图谱,结果由引物SP4、SP19、SP20、SP23、SP30所构建的DNA指纹图谱可将供试材料完全区分开。 展开更多

关键词 芥菜 scot标记 遗传多样性 指纹图谱

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广西斑茅遗传多样性的SCoT标记分析 被引量：7

7

作者 宋焕忠 张荣华 +9 位作者 杨海霞 张革民 罗霆 高轶静 刘昔辉 段维兴 韦霖斌 方位宽 危晓丽 黄玉新 《西南农业学报》 CSCD 北大核心 2014年第1期59-64,共6页

利用SCoT分子标记技术对采自广西的50份斑茅无性系进行遗传多样性分析,从46条引物中筛选出扩增结果稳定、条带清晰和有多态性的引物15条,扩增位点336个,其中多态性位点284个,多态性为83.93%,说明广西斑茅具有较丰富的遗传多样性。根据... 利用SCoT分子标记技术对采自广西的50份斑茅无性系进行遗传多样性分析,从46条引物中筛选出扩增结果稳定、条带清晰和有多态性的引物15条,扩增位点336个,其中多态性位点284个,多态性为83.93%,说明广西斑茅具有较丰富的遗传多样性。根据研究结果进行聚类分析,在相似系数0.73的水平,可将50份斑茅无性系归为4大类;在相似系数0.76的水平,可将第Ⅳ类分成6种类型,同一地区的斑茅无性系基本聚在同一类,呈现出一定的地域性分布规律。 展开更多

关键词 斑茅 scot标记 遗传多样性 广西

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菠萝种质目标起始密码子(SCoT)遗传多样性分析 被引量：8

8

作者 王健胜 贺军虎 +2 位作者 陈华蕊 陈业渊 乔飞 《植物遗传资源学报》 CAS CSCD 北大核心 2015年第4期848-856,共9页

利用SCo T分子标记技术对来自9个国家或地区的46份菠萝种质进行了遗传多样性分析,并对SCo T标记在菠萝研究中的效率做了探讨。结果表明,SCo T标记在菠萝种质中具有丰富的多态性,引物多态性条带百分比在75%-100%之间,平均为94.61%;引物... 利用SCo T分子标记技术对来自9个国家或地区的46份菠萝种质进行了遗传多样性分析,并对SCo T标记在菠萝研究中的效率做了探讨。结果表明,SCo T标记在菠萝种质中具有丰富的多态性,引物多态性条带百分比在75%-100%之间,平均为94.61%;引物的有效等位基因数（Ne）、Nei＇s基因多样性指数（H）、Shannon＇s信息指数（I）和多态性信息含量（PIC）平均值分别为1.45、0.27、0.41和0.28,表明SCo T标记具有较高的多态性检测效率。基于SCo T标记计算获得的遗传相似系数对菠萝种质做聚类分析,46份菠萝种质可被划分为5个类群,其中,第Ⅰ类群所包含的菠萝种质数量最多,占菠萝种质总数的84.78%。主成分分析获得了与聚类分析不尽一致的结论,但两者反映的种质亲缘关系基本一致。本研究结果将为我国菠萝种质的鉴定、保存和科学利用提供一定的理论依据。 展开更多

关键词 菠萝种质 scot标记 遗传多样性

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SCoT分子标记技术在木薯遗传多样性分析中的应用 被引量：13

9

作者 周慧文 单建伟 +1 位作者 冯斗 严华兵 《热带作物学报》 CSCD 北大核心 2015年第8期1440-1444,共5页

应用SCo T标记对不同来源的28份木薯种质资源进行遗传多样性和亲缘关系分析。结果表明：从36条引物中筛选出19条重复性好、条带清晰的引物对28份木薯材料进行PCR扩增。共扩增出171条带,其中多态性条带123条,平均每条引物扩增多态性条带... 应用SCo T标记对不同来源的28份木薯种质资源进行遗传多样性和亲缘关系分析。结果表明：从36条引物中筛选出19条重复性好、条带清晰的引物对28份木薯材料进行PCR扩增。共扩增出171条带,其中多态性条带123条,平均每条引物扩增多态性条带6.5条,多态性条带比率为71.9%。经NTSYS-pc2.10e软件计算分析,28份木薯种质间遗传相似系数在0.631-0.930之间。利用UPGMA法进行聚类的结果显示：在系数0.68处,木薯材料分为2大类,品种BRA354单独成为一类;在系数为0.734处,28份木薯种质资源主要聚为5大类,聚类结果与材料来源有一定相关性。SCo T标记能在木薯种质间检测出一定程度的遗传多样性,可为木薯遗传育种提供新的技术支持。 展开更多

关键词 木薯 scot 分子标记 遗传多样性

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SCOT分子标记在油菜遗传多样性研究中的应用 被引量：6

10

作者 张羽 张晓娟 +2 位作者 李英 谌国鹏 孙晓敏 《西南农业学报》 CSCD 北大核心 2015年第6期2395-2400,共6页

为探索SCOT标记在油菜遗传多样性研究中的应用,本利用36对有多态性的SCOT标记和在油菜多样性分析中广泛使用的30对SRAP标记,对65份陕南地区甘蓝型油菜高代材料进行遗传多样性分析。结果表明,SCOT标记平均每个标记检测到5个等位变异,每个... 为探索SCOT标记在油菜遗传多样性研究中的应用,本利用36对有多态性的SCOT标记和在油菜多样性分析中广泛使用的30对SRAP标记,对65份陕南地区甘蓝型油菜高代材料进行遗传多样性分析。结果表明,SCOT标记平均每个标记检测到5个等位变异,每个SCOT位点的遗传多态性信息含量在0.28~0.81,平均值为0.57,供试材料的遗传相似系数集中在0.56~0.89。平均每个SRAP标记检测到4个等位基因,每个SRAP位点的遗传多态性信息含量在0.17~0.85,平均值为0.51。供试材料的遗传相似系数集中在0.50~0.88。本试验得出,SCOT标记的聚类结果和SRAP标记近似,SCOT标记的多态性高于SRAP标记,SCOT标记可以用于油菜遗传多样性的研究。 展开更多

关键词 scot标记 SRAP标记 油菜 遗传多样性

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基于SCoT标记的朱顶红品种遗传多样性分析 被引量：6

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作者 王黎 徐郝 +5 位作者 俞云栋 张海珍 高燕会 沈笑 金晨莺 陈轶敏 《浙江农林大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第5期930-938,共9页

【目的】进一步从分子水平分析朱顶红Hippeastrum rutilum品种间的遗传多样性、亲缘关系和亲本鉴定。【方法】利用正交试验设计方法筛选朱顶红目标起始密码子多态性分子标记(SCoT)体系,并以41份朱顶红品种为材料对遗传多样性和亲缘关系... 【目的】进一步从分子水平分析朱顶红Hippeastrum rutilum品种间的遗传多样性、亲缘关系和亲本鉴定。【方法】利用正交试验设计方法筛选朱顶红目标起始密码子多态性分子标记(SCoT)体系,并以41份朱顶红品种为材料对遗传多样性和亲缘关系进行分析。【结果】①朱顶红SCoT标记最佳反应体系(20μL):包括DNA 40 ng,引物0.1μmol·L^−1;MgCl22.0 mmol·L^−1,dNTPs 0.4 mmol·L^−1和rTaq DNA聚合酶0.75 U(1 U=16.67 nkat)。②12条SCoT引物从41份朱顶红品种获得77条多态性条带,平均多态性比率高达86.52%。朱顶红品种间遗传相似系数为0.2923~0.8343,表明41份朱顶红品种间遗传多样性较高,遗传范围广。③非加权配对算术平均法(UPGMA)聚类表明:朱顶红SCoT标记聚类与花色的相关性较大,但与瓣型相关性不大。在遗传相似系数0.4200处将41份朱顶红品种分为两大类:第Ⅰ大类既有重瓣品种又有单瓣品种,第Ⅰ大类又分为4个小类,其中相似花色的聚为一类,Ⅰd小类中单瓣、白色的‘绣球’‘Hydrangea’(20号)和红色的‘奇迹’‘Miracle’(22号)可能是重瓣、橙红和白色组成的复色花(21号‘迎春’‘Yingchun’)的亲本;第Ⅱ大类品种多为复色花。【结论】SCoT标记技术可有效地应用于朱顶红品种间遗传多样性分析和可能亲本的鉴定。 展开更多

关键词 植物育种 朱顶红 scot标记 遗传多样性 亲本鉴定

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甘蔗单花粉全基因组扩增(WGA)与SCoT分子标记研究 被引量：6

12

作者 陈平华 陈如凯 +8 位作者 许莉萍 王恒波 陈利平 林冰 施桂姣 张卓 高三基 郭晋隆 潘永保 《热带作物学报》 CSCD 2011年第11期2069-2075,共7页

从一个完整的甘蔗花粉囊中分离出单个花粉粒．利用特制取样器进行收集，采用碱裂解法释放单花粉DNA．裂解液可以直接作为WGA模板进行全基因组扩增．制备出单个花粉粒大量DNA。通过5SrRNA—ITS鉴定WGA产物真实性．并以目标起始密码子多... 从一个完整的甘蔗花粉囊中分离出单个花粉粒．利用特制取样器进行收集，采用碱裂解法释放单花粉DNA．裂解液可以直接作为WGA模板进行全基因组扩增．制备出单个花粉粒大量DNA。通过5SrRNA—ITS鉴定WGA产物真实性．并以目标起始密码子多态性标记对真实的WGA产物进行分析，显示出丰富的多态性。利用NTSYSpc软件分析花粉粒间遗传距离，并进行聚类分析，显示单花粉间遗传距离变幅为0．0888-0．3654，在相似系数0．187处．受试花粉粒中的36个明显分为2组．占总数的69％。说明减数分裂染色体重组过程中，有一定比例的基因位点为多数花粉粒所共有。根据SCoT标记聚类图可将所有供试花粉分为4大类．不同类花粉粒的分布具有一定的规律性． 展开更多

关键词 甘蔗 单花粉 全基因组扩增 scot分子标记 遗传分布

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贵州栽培灰毡毛忍冬的遗传多样性ISSR与SCoT标记 被引量：3

13

作者 赵丹 丁铃 +4 位作者 周涛 魏升华 熊厚溪 肖承鸿 艾强 《贵州农业科学》 CAS 北大核心 2014年第1期21-25,共5页

为了考察贵州栽培灰毡毛忍冬种源的遗传多样性水平,采用ISSR标记与SCoT标记分析方法对贵州省黔西县、绥阳县、金沙县和道真县的灰毡毛忍冬栽培类群进行遗传多样性分析。结果显示:1)ISSR标记与SCoT标记分析的多样性指数值趋势一致,在物... 为了考察贵州栽培灰毡毛忍冬种源的遗传多样性水平,采用ISSR标记与SCoT标记分析方法对贵州省黔西县、绥阳县、金沙县和道真县的灰毡毛忍冬栽培类群进行遗传多样性分析。结果显示:1)ISSR标记与SCoT标记分析的多样性指数值趋势一致,在物种水平上的多态位点百分率(PPL)分别为72.73%和67.78%,基因分化系数(Gst)为0.329 7和0.415 0,栽培类群内的个体遗传差异大于类群间。2)在栽培类群间,黔西类群的遗传多样性水平、有效等位基因数高于其他类群,其次是绥阳类群,道真类群最低。3)遗传聚类显示,道真栽培类群独立为一类,黔西、绥阳与金沙类群聚为一类。SCoT标记方法更适合于灰毡毛忍冬种质资源遗传多样性的分子评价。 展开更多

关键词 灰毡毛忍冬 遗传多样性 ISSR标记 scot标记 贵州

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梨SCoT-PCR反应体系的优化及‘库尔勒香梨’营养系变异鉴定 被引量：10

14

作者 和世玉 牛建新 马建江 《果树学报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第11期1337-1346,共10页

【目的】建立稳定性好、可重复性强、多态性扩增效果好的‘库尔勒香梨’SCoT-PCR反应体系,证明SCoT分子标记可以用于梨属植物优良营养系的鉴定。【方法】以新疆库尔勒农二师29团、33团和34团的‘库尔勒香梨’优良营养系为试材,通过L25(... 【目的】建立稳定性好、可重复性强、多态性扩增效果好的‘库尔勒香梨’SCoT-PCR反应体系,证明SCoT分子标记可以用于梨属植物优良营养系的鉴定。【方法】以新疆库尔勒农二师29团、33团和34团的‘库尔勒香梨’优良营养系为试材,通过L25(56)正交试验设计对‘库尔勒香梨’SCoT-PCR反应体系进行筛选,并对扩增反应程序进行优化,运用正交设计直观分析法和正交设计助手Ⅱ软件对正交设计扩增结果进行分析,从筛选出的20个引物中随机选择2条引物对24份材料扩增,用DNAMAN、Editseq、ORF Finder和NCBI-BLAST-tblastx对测序结果分析。【结果】优化后的香梨SCoT-PCR 20μL反应分析体系含(2.5 mmol·L^(-1)10×buffer with Mg^(2+))2.5μL、Taq酶1.5 U、引物10μmol·L^(-1)、模板DNA25 ng、dNTPs 1.6 mmol·L^(-1)。反应程序为94℃预变性4 min;94℃变性1 min,52℃退火45 s,72℃延伸1 min,30次循环;72℃延伸8 min。对测序结果分析表明:扩增产物的大小为200~2 000 bp,23份材料与对照材料存在单碱基的缺失,利用单碱基变异可以区分出24份材料,说明18份优良营养系材料发生了遗传变异。【结论】SCoT分子标记可用于梨树营养系变异的鉴定。 展开更多

关键词 '库尔勒香梨’ scot分子标记 正交设计 体系优化 优良营养系

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SCOT标记分析抗菌核病油菜资源的遗传多样性 被引量：3

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作者 张羽 张晓娟 +2 位作者 陈进 孙晓敏 折建霞 《四川农业大学学报》 CSCD 北大核心 2015年第4期351-356,共6页

【目的】探索SCOT标记在油菜遗传多样性研究中的应用。【方法】以8份具有代表性的甘蓝型油菜品种（系）,对130个SCOT引物进行筛选。综合考虑多态性的大小,条带的清晰度,筛选出40个SCOT引物作为核心引物,对43份在田间接种鉴定表现抗菌核... 【目的】探索SCOT标记在油菜遗传多样性研究中的应用。【方法】以8份具有代表性的甘蓝型油菜品种（系）,对130个SCOT引物进行筛选。综合考虑多态性的大小,条带的清晰度,筛选出40个SCOT引物作为核心引物,对43份在田间接种鉴定表现抗菌核病的油菜材料进行遗传多样性分析。【结果】SCOT标记共检测到372个位点,每个引物可以检测到5~12个多态性位点,多态性信息含量值（PIC）介于0.25~0.99,平均值为0.65。供试材料的遗传相似系数集中在0.60~0.88之间。遗传相似度较高,亲缘关系较近。【结论】SCOT标记可以用于油菜遗传多样性的研究。 展开更多

关键词 scot标记 油菜 遗传多样性

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SCoT分子标记在割手密遗传图谱构建中的应用 被引量：24

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作者 罗霆 杨海霞 +8 位作者 岑华飞 刘许辉 高轶静 段维兴 张荣华 刘昔辉 宋焕忠 黄玉新 张革民 《植物遗传资源学报》 CAS CSCD 北大核心 2013年第4期704-710,共7页

以割手密GXS85-30×GXS87-16的杂交后代为材料,应用目标起始密码子多态性(SCoT)分子标记对杂交后代进行杂种鉴定,获得由157个单株组成的F1杂种群,同时对比SCoT、AFLP和SSR分子标记在割手密基因组多态性分析和获得分离标记的效果,证... 以割手密GXS85-30×GXS87-16的杂交后代为材料,应用目标起始密码子多态性(SCoT)分子标记对杂交后代进行杂种鉴定,获得由157个单株组成的F1杂种群,同时对比SCoT、AFLP和SSR分子标记在割手密基因组多态性分析和获得分离标记的效果,证实SCoT在扩增DNA多态性上优于SSR分子标记,在获取分离标记上优于AFLP分子标记,验证了SCoT分子标记技术在割手密遗传分析中的应用效果,为割手密遗传分析和遗传图谱构建提供了一种新型高效的目的基因分子标记技术。 展开更多

关键词 割手密 scot分子标记 分离标记 遗传图谱构建 遗传分析

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SCoT标记在甘蔗上的创新利用 被引量：2

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作者 吴建明 黄杏 +3 位作者 丘立杭 陈荣发 李杨瑞 甘崇昆 《中国糖料》 2017年第1期51-53,56,共4页

SCo T是一种新型的分子标记,2009年开发以来已经成功应用于种质资源亲缘关系的鉴定、发育进化分析、遗传图谱的构建、基因差异表达分析等诸多研究领域。作者根据SCo T技术原理,首次将SCo T标记应用于甘蔗基因差异表达分析,结合自身研究... SCo T是一种新型的分子标记,2009年开发以来已经成功应用于种质资源亲缘关系的鉴定、发育进化分析、遗传图谱的构建、基因差异表达分析等诸多研究领域。作者根据SCo T技术原理,首次将SCo T标记应用于甘蔗基因差异表达分析,结合自身研究结果对SCo T标记在甘蔗上的研究应用现状进行综述,并就SCo T技术应用于基因差异表达所面临的挑战和未来发展前景进行了分析与讨论,以期为科研工作者在甘蔗分子标记的选择上多一种参考依据。 展开更多

关键词 甘蔗 分子标记 SCO T 差异表达

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SCoT分子标记的研究现状及在茶树育种中的应用前景 被引量：2

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作者 李佼 李秀峰 +1 位作者 陈曦 张羽 《茶叶通讯》 2015年第3期8-12,共5页

目标起始密码子多态性(Start codon targeted polymorphism,SCo T)是一种针对ATG起始密码子及侧翼序列保守性开发的新型目的基因分子标记,具有操作简便、多态性高、遗传稳定性好和成本低等优势,已经被广泛应用于多种植物的遗传研究。本... 目标起始密码子多态性(Start codon targeted polymorphism,SCo T)是一种针对ATG起始密码子及侧翼序列保守性开发的新型目的基因分子标记,具有操作简便、多态性高、遗传稳定性好和成本低等优势,已经被广泛应用于多种植物的遗传研究。本文介绍了SCo T标记的原理、引物设计、PCR体系优化,综述了SCo T标记在多种植物中的应用进展,并展望了其在茶树育种上的应用前景。 展开更多

关键词 scot 分子标记 茶树 茶树育种

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利用SCoT引物鉴别15个甜菜品种 被引量：1

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作者 邳植 吴则东 黄林玉 《中国糖料》 2020年第4期36-39,共4页

为了探讨利用SCoT引物鉴别甜菜品种的可能性,利用3个多态性较好的SCoT引物对15个已经登记的甜菜品种进行扩增。结果表明3条引物SCoT2、SCoT12和SCoT21均表现出了很好的多态性,利用特征谱带法,SCoT12和SCoT21这两条引物单独使用均可鉴别... 为了探讨利用SCoT引物鉴别甜菜品种的可能性,利用3个多态性较好的SCoT引物对15个已经登记的甜菜品种进行扩增。结果表明3条引物SCoT2、SCoT12和SCoT21均表现出了很好的多态性,利用特征谱带法,SCoT12和SCoT21这两条引物单独使用均可鉴别全部的15个甜菜品种,而SCoT2也可以鉴别除了2号和9号以外的其它13个品种。利用SCoT分子标记技术可以实现较少引物快速鉴定甜菜品种真实性的目的,为保护甜菜育种家以及农民的利益,促进我国甜菜产业的健康发展发挥重要的作用。 展开更多

关键词 甜菜 品种鉴定 指纹图谱 scot 分子标记

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17个枸杞品种的SCoT遗传多样性 被引量：13

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作者 马利奋 尹跃 +3 位作者 赵建华 王亚军 戴国礼 安巍 《浙江农业学报》 CSCD 北大核心 2018年第10期1665-1670,共6页

采用目标起始密码子多态性(SCo T)分子标记对17个枸杞品种进行遗传多样性分析。从80条引物中筛选出19条重复性好、条带清晰的引物进行PCR扩增,共扩增到96个条带,其中多态性条带71条,多态性比率为73. 96%。多态信息含量(PIC)变化范围为0.... 采用目标起始密码子多态性(SCo T)分子标记对17个枸杞品种进行遗传多样性分析。从80条引物中筛选出19条重复性好、条带清晰的引物进行PCR扩增,共扩增到96个条带,其中多态性条带71条,多态性比率为73. 96%。多态信息含量(PIC)变化范围为0. 055(SCo T-29)~0. 239(SCo T-66),平均为0. 132。聚类分析和主坐标分析结果表明,供试的17个枸杞品种遗传相似系数为0. 43~1. 00,在遗传相似系数为0. 87处可将所有品种分为3个类群。综上,利用SCo T分子标记可揭示枸杞品种资源的遗传多样性,为枸杞品种资源保护和利用提供科学依据。 展开更多

关键词 枸杞 品种 scot标记 遗传多样性

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