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N6-腺苷甲基化调控脂肪生成的研究进展
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作者 周锐 吴德 +3 位作者 车炼强 林燕 冯斌 方正锋 《畜牧兽医学报》 北大核心 2025年第5期1995-2003,共9页
N6-甲基腺嘌呤(N6-methyladenosine,m6A)修饰是真核mRNA中普遍存在的一种动态可逆修饰,对脂肪代谢调控具有重要作用。m6A修饰通过调节mRNA的稳定性、剪接、运输及翻译等过程,参与脂肪细胞分化、脂质合成和分解等生物学过程。本文系统地... N6-甲基腺嘌呤(N6-methyladenosine,m6A)修饰是真核mRNA中普遍存在的一种动态可逆修饰,对脂肪代谢调控具有重要作用。m6A修饰通过调节mRNA的稳定性、剪接、运输及翻译等过程,参与脂肪细胞分化、脂质合成和分解等生物学过程。本文系统地综述了m6A修饰调控脂肪细胞分化、脂质合成和分解的作用机制,旨在为调控动物脂质生成、提高肉品质、促进畜牧业发展提供新策略。 展开更多
关键词 n6-甲基 脂代谢 脂质生成 棕色脂肪 脂噬
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血管性痴呆模型大鼠大脑皮质N6-甲基腺苷甲基化修饰水平的变化
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作者 邓汝东 周贤熙 +4 位作者 周丽亭 周奕晴 翁安莉 张赛霞 伍趣京 《神经解剖学杂志》 CAS CSCD 2022年第5期572-576,共5页
目的:研究N6-甲基腺苷甲基化(m6A)修饰参与血管性痴呆(VD)的机制。方法:36只SD雄性大鼠按照随机原则分为假手术组(sham)和血管性痴呆模型组(BCCAO),BCCAO大鼠结扎双颈总动脉,sham组大鼠不结扎双侧颈总动脉。免疫组织化学染色、real time... 目的:研究N6-甲基腺苷甲基化(m6A)修饰参与血管性痴呆(VD)的机制。方法:36只SD雄性大鼠按照随机原则分为假手术组(sham)和血管性痴呆模型组(BCCAO),BCCAO大鼠结扎双颈总动脉,sham组大鼠不结扎双侧颈总动脉。免疫组织化学染色、real time RT-PCR和Western Blot检测大鼠大脑皮质YTH结构域蛋白1(YTHDF1)、YTH结构域蛋白2(YTHDF2)、YTH结构域蛋白3(YTHDF3)、去甲基化酶ALKB同源蛋白3(ALKBH3)、去甲基化酶ALKB5同源蛋白5(ALKBH5)和甲基转移酶样蛋白3(METTL3)的表达变化。结果:与sham组相比,免疫组织化学染色结果显示:BCCAO大鼠大脑皮质中YTHDF1、YTHDF2、YTHDF3、ALKBH3和ALKBH5阳性表达增加,METTL3阳性表达减少;RT-qPCR结果显示:BCCAO大鼠大脑皮质中YTHDF1、YTHDF2、YTHDF3、ALKBH3和ALKBH5 mRNA表达上升,METTL3 mRNA表达下降;Western Blot结果显示:BCCAO大鼠大脑皮质中YTHDF1、YTHDF2、YTHDF3、ALKBH3和ALKBH5蛋白质表达增加,METTL3蛋白质表达减少。结论:m6A甲基化修饰系统参与VD大鼠大脑皮质中的病理过程。 展开更多
关键词 n6-甲基甲基 血管性痴呆 RnA甲基 颈总动脉结扎 大鼠
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8-氯腺苷诱导的组蛋白H3K79双甲基化促进NBS1和p21的基因转录激活 被引量:1
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作者 刘畅 李文娟 +5 位作者 陈瑜 丁卫 安国顺 李淑艳 倪菊华 贾弘禔 《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2009年第11期1035-1040,共6页
组蛋白H3第79位赖氨酸甲基化(H3K79me)修饰有单甲基、双甲基及三甲基3种形式,是常染色质的标志.然而,对于组蛋白H3K79三种甲基化各自在基因转录、DNA损伤修复中所起的作用尚不十分清楚.本研究以8-氯腺苷(8-Cl-Ado)为DNA双链断裂(DNAdoub... 组蛋白H3第79位赖氨酸甲基化(H3K79me)修饰有单甲基、双甲基及三甲基3种形式,是常染色质的标志.然而,对于组蛋白H3K79三种甲基化各自在基因转录、DNA损伤修复中所起的作用尚不十分清楚.本研究以8-氯腺苷(8-Cl-Ado)为DNA双链断裂(DNAdouble-stranded breaks,DSB)诱导剂,采用Western印迹,在人肺癌细胞H1299检测出了DNA修复分子NBS1、细胞周期检验点相关分子p21,并发现H3K79me1、H3K79me2和H3K79me3三种甲基化修饰的组蛋白明显增加;染色质免疫共沉淀结合实时定量PCR实验显示,只有H3K79me2与DNA损伤检验点分子p21、DNA修复分子NBS1的启动子区域相结合,说明H3K79双甲基化修饰与这些基因的转录激活有关.结果提示,在8-氯腺苷引起DSB时,是H3K79me2、而不是H3K79me1和H3K79me3参与NBS1和p21基因转录激活时的染色质重塑.8-氯腺苷诱导H3K79双甲基化增强、促进H3K79me2所在染色质区域的NBS1和p21基因转录激活可能是8-Cl-Ado抑制肿瘤细胞生长作用机制之一. 展开更多
关键词 8- DnA双链断裂 H3K79甲基 nBS1 P21 表观遗传调控
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有氧运动调节circRNAs m6A甲基化修饰改善高脂饮食小鼠心脏病理性重塑研究 被引量:1
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作者 徐祖杰 马哲莹 +1 位作者 张冰 田振军 《体育科学》 CSSCI 北大核心 2024年第2期63-76,共14页
目的:通过甲基化RNA免疫沉淀测序(MeRIP-seq)和转录组测序(RNA-seq)绘制N6-甲基腺苷(m6A)修饰图谱,探讨环状RNA(circRNAs)m6A甲基化修饰在有氧运动改善高脂饮食小鼠心脏病理性重塑中的作用。方法:C57BL/6J野生型小鼠随机分为正常饮食安... 目的:通过甲基化RNA免疫沉淀测序(MeRIP-seq)和转录组测序(RNA-seq)绘制N6-甲基腺苷(m6A)修饰图谱,探讨环状RNA(circRNAs)m6A甲基化修饰在有氧运动改善高脂饮食小鼠心脏病理性重塑中的作用。方法:C57BL/6J野生型小鼠随机分为正常饮食安静(normal diet-sedentary,ND-SED)组、正常饮食运动(normal diet-exercise,ND-EX)组、高脂饮食安静(high-fat diet-sedentary,HFD-SED)组和高脂饮食运动(high-fat diet-exercise,HFD-EX)组。ND-SED组和ND-EX组小鼠给予普通饲料喂养,HFD-SED组和HFD-EX组小鼠给予60%脂肪供能高脂饲料喂养12周后,ND-EX组和HFD-EX组小鼠进行8周有氧运动。运动干预结束后,检测小鼠体重、体脂含量和心功能。采血、取心脏,检测血清TC和TG含量,酶联免疫吸附测定检测心脏组织TG含量,RT-qPCR检测m6A调节因子,Western blot检测METTL3和FTO蛋白表达,比色法检测心脏组织m6A RNA甲基化含量,MeRIP-seq检测HFD-SED组和HFD-EX组小鼠心脏circRNAs m6A甲基化修饰,SRAMP预测发生m6A甲基化差异和表达差异的circRNA甲基化位点,MeRIP-qPCR验证其m6A水平。结果:8周有氧运动显著降低了高脂饮食小鼠体重和体脂含量,提高了左心室射血分数和短轴缩短率,抑制心脏纤维化和脂质沉积,改善心脏病理性重塑。有氧运动可以显著降低高脂饮食小鼠心脏m6A甲基化水平,甲基转移酶METTL3在其中发挥了重要作用。MeRIP-seq显示,HFD-SED组和HFD-EX组小鼠心脏受m6A修饰的circRNAs大部分都只具有1个m6A修饰位点,且m6A circRNAs主要来自重叠区和外显子。与HFD-SED组比较,HFD-EX组小鼠心脏有13个circRNAs发生了甲基化上调,19个circRNAs发生了甲基化下调,两组差异甲基化的circRNAs大部分来源于重叠区,长度主要富集在1~10000 bps,大部分位于1号、7号和13号染色体上。RNA-seq显示,与HFD-SED组比较,HFD-EX组小鼠心脏有40个circRNAs发生差异表达,其中22个显著上调,18个显著下调。MeRIP-seq和RNA-seq联合分析发现,只有circRNA_4614|Chr7:127484542_127486889_+(以下简称“circRNA_4614”)同时发生m6A甲基化差异和表达差异,其m6A水平和表达水平均显著上调。SRAMP预测显示,circRNA_4614存在8个潜在的m6A位点,其中1个位点具有非常高置信度,2个位点具有高置信度。MeRIP-qPCR验证显示,与HFD-SED组比较,HFD-EX组小鼠心脏circRNA_4614的m6A水平显著上调,其趋势与MeRIP-seq测序结果一致。结论:有氧运动可以显著降低高脂饮食小鼠心脏m6A甲基化水平,调节心脏circRNAs表达谱和m6A修饰谱。circRNA_4614介导的m6A修饰在有氧运动改善肥胖性心脏重塑中可能发挥重要作用。 展开更多
关键词 环状核糖核酸 有氧运动 n6-甲基甲基 肥胖 心脏病理性重塑
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ABCA1、ACAT1 DNA甲基化在Hcy致THP-1单核源性泡沫细胞胆固醇流出中作用研究 被引量:9
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作者 杨安宁 王磊 +8 位作者 周龙霞 赵丽 王艳华 蔡欣 曹成建 杨程 陈久凯 马文斌 姜怡邓 《中国药理学通报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第3期44-48,共5页
目的探讨ABCA1、ACAT1 DNA甲基化在同型半胱氨酸(Hcy)致THP-1单核源性泡沫细胞胆固醇流出中的作用。方法复制泡沫细胞模型,用50、100、200、500μmol·L-1Hcy和100μmol·L-1Hcy+叶酸+维生素B12(100+F+V)干预,并设对照组(0μmol... 目的探讨ABCA1、ACAT1 DNA甲基化在同型半胱氨酸(Hcy)致THP-1单核源性泡沫细胞胆固醇流出中的作用。方法复制泡沫细胞模型,用50、100、200、500μmol·L-1Hcy和100μmol·L-1Hcy+叶酸+维生素B12(100+F+V)干预,并设对照组(0μmol·L-1Hcy)。油红O染色观察泡沫细胞形成,巢式降落式甲基化特异性PCR(nMS-PCR)检测ABCA1、ACAT1 DNA甲基化水平,并分析两者比值变化;ELISA-like法检测DNA甲基转移酶(DNMTs)活性;化学比色法分析细胞内胆固醇含量。结果成功复制了泡沫细胞模型;给予不同浓度Hcy刺激后,ABCA1 DNA甲基化改变呈上升趋势,ACAT1 DNA甲基化改变呈下降趋势,给予100+F+V干预后可逆转上述变化,其中ABCA1 DNA甲基化改变更明显;同时,不同浓度Hcy可使泡沫细胞内DNMTs活性和胆固醇含量增加。结论 ABCA1和ACAT1 DNA甲基化的改变参与了Hcy致THP-1单核源性泡沫细胞胆固醇流出,DNMTs可能起关键调控作用。 展开更多
关键词 同型半胱氨酸 泡沫细胞 三磷酸-结合转运子A1 酰基辅酶A 胆固醇酰基转移酶1 DnA甲基 胆固醇流出
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N6-甲基腺苷修饰在心脑血管疾病中的研究进展
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作者 叶维贞 刘向荣 《中国卒中杂志》 2021年第1期81-86,共6页
N 6-甲基腺苷(N6-methyladenosine,m6A)是丰度最高的RNA表观遗传学修饰。本文介绍m6A修饰及相关调控蛋白m6A甲基转移酶、m6A去甲基化酶及m6A结合蛋白的特点及功能,并重点综述m6A修饰在高血压、糖尿病等心脑血管疾病危险因素中的作用及... N 6-甲基腺苷(N6-methyladenosine,m6A)是丰度最高的RNA表观遗传学修饰。本文介绍m6A修饰及相关调控蛋白m6A甲基转移酶、m6A去甲基化酶及m6A结合蛋白的特点及功能,并重点综述m6A修饰在高血压、糖尿病等心脑血管疾病危险因素中的作用及其在相应疾病发生发展中的最新研究进展。 展开更多
关键词 n6-甲基 心血管疾病 脑血管疾病 危险因素 表观遗传学修饰
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基于转录组学联合m6A筛选类风湿关节炎基因及化合物Q-1的干预
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作者 杨欣 姚血明 黄聪 《科学技术与工程》 北大核心 2025年第23期9734-9739,共6页
基于转录组学联合N6-甲基腺嘌呤(N6-Methyladenosine,m6A)筛选类风湿关节炎(rheumatoid arthritis,RA)基因及化合物Q-1的干预进行研究。复制大鼠胶原诱导关节炎模型,检测各组大鼠血清中肿瘤坏死因子-α(tumour necrosis factor-alpha,T... 基于转录组学联合N6-甲基腺嘌呤(N6-Methyladenosine,m6A)筛选类风湿关节炎(rheumatoid arthritis,RA)基因及化合物Q-1的干预进行研究。复制大鼠胶原诱导关节炎模型,检测各组大鼠血清中肿瘤坏死因子-α(tumour necrosis factor-alpha,TNF-α)、白细胞介素-6(interleukin 6,IL-6)、白细胞介素1β(interleukin1β,IL-1β)的含量。转录组测序分析踝关节组织差异基因,对差异基因进行信号通路分析。将RA差异表达基因和26个m6A系统基因进行交集分析,对锌指CCCH型含13(zinc finger CCCH domain-containing protein 13,ZC3H13),胰岛素样生长因子结合蛋白2(insulin-like growth factor binding protein 2,IGFBP2)进行受试者工作特征曲线(receiveroperating characteristic curve,ROC)分析,采用分子对接分析化合物Q-1与ZC3H13,IGFBP2的结合情况。与正常对照组比较,模型组大鼠血清中TNF-α、IL-6、IL-1β的含量明显升高(P【0.01)。与正常对照组相比,模型组共鉴定出1300个差异基因。其中上调805个差异基因,下调495个差异基因。与26个m6A系统基因进行交集,获得2个m6A基因(ZC3H13,IGFBP2)。通过分子对接发现化合物Q-1与ZC3H13有强烈的结合(total score】7),与IGFBP2有较好的结合(total score】5)。化合物Q-1与ZC3H13形成4个氢键(天冬氨酸1054,精氨酸999,谷氨酸1057,谷氨酰胺99),与IGFBP2形成2个(精氨酸201,亮氨酸217)。ZC3H13,IGFBP2可能通过m6A修饰调节生物代谢,为RA诊疗的靶点。化合物Q-1与ZC3H13,IGFBP2有较好的结合。 展开更多
关键词 合物Q-1 类风湿关节炎 转录组学 n6-甲基修饰
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甲基转移酶样3对巨核细胞系花生四烯酸代谢通路的影响和机制
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作者 张嘉祺 刘雯雯 +2 位作者 王茜婷 陈夏欢 刘梅林 《中国心血管杂志》 北大核心 2025年第1期75-85,共11页
目的探讨甲基转移酶样3(METTL3)对人成巨核细胞白血病细胞(MEG-01)花生四烯酸(AA)代谢通路的影响和相关机制。方法构建METTL3差异表达的MEG-01,分为正常对照(Blank)组、METTL3过表达(OE)组和过表达阴性对照(OE-NC)组、METTL3敲低(KD)组... 目的探讨甲基转移酶样3(METTL3)对人成巨核细胞白血病细胞(MEG-01)花生四烯酸(AA)代谢通路的影响和相关机制。方法构建METTL3差异表达的MEG-01,分为正常对照(Blank)组、METTL3过表达(OE)组和过表达阴性对照(OE-NC)组、METTL3敲低(KD)组和敲低阴性对照(KD-NC)组。采用定量聚合酶链反应(qPCR)法和免疫印迹(Western blot)法检测各组METTL3、YTH结构域家族蛋白(YTHDF1、YTHDF2)以及参与AA代谢的关键基因前列腺素内过氧化物合酶1/环氧合酶-1(PTGS1/COX-1)、前列腺素内过氧化物合酶2/环氧合酶-2(PTGS2/COX-2)、血栓素A合酶1(TBXAS1)、前列腺素I_(2)合酶(PTGIS)和前列腺素I_(2)受体(PTGIR)的表达量变化。采用酶联免疫吸附分析(ELISA)法测定细胞培养上清中AA代谢产物前列腺素H_(2)(PGH_(2))和血栓素B_(2)(TXB_(2))的水平。采用蛋白稳定性实验和RNA结合蛋白质免疫沉淀(RIP)实验验证YTHDF1与COX-1 mRNA的结合情况。结果qPCR和Western blot检测显示,OE组YTHDF1、PTGS1/COX-1的mRNA和蛋白水平较OE-NC组升高,KD组较KD-NC组降低(均为P<0.05)。ELISA测定显示,细胞培养上清中OE组PGH_(2)、TXB_(2)的含量高于OE-NC组,KD组TXB_(2)的含量低于KD-NC组(均为P<0.05)。蛋白稳定性实验和RIP实验证实,METTL3通过YTHDF1参与COX-1 mRNA的翻译调控。结论METTL3可能通过促进N6-甲基腺苷(m6A)修饰介导的COX-1 mRNA翻译效率,调控巨核细胞系的AA代谢通路。 展开更多
关键词 甲基转移酶样3 n6-甲基甲基 MEG-01细胞 花生四烯酸 心血管疾病
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m6A甲基化修饰在前列腺癌发生发展中的调控机制
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作者 张乐 王振 张钰哲 《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第8期1047-1058,共12页
N6-腺苷甲基化(N6-adenosine methylation)是腺苷N6位点的甲基化形式,常出现在真核生物的mRNA中,是最常见的RNA内部修饰的方式之一。研究表明,m6A通过调节基因的表达来影响细胞的生物过程;同时m6A的调控因子也在各种癌症的发生、发展中... N6-腺苷甲基化(N6-adenosine methylation)是腺苷N6位点的甲基化形式,常出现在真核生物的mRNA中,是最常见的RNA内部修饰的方式之一。研究表明,m6A通过调节基因的表达来影响细胞的生物过程;同时m6A的调控因子也在各种癌症的发生、发展中发挥着关键作用。前列腺癌(prostate cancer,PCa)是一种常见的男性恶性肿瘤,超过60岁的男性的患病风险逐年攀升,并且随着人口老龄化的问题,可以预计PCa的患病数目会继续升高。近年来,关于m6A在肿瘤发生发展中的作用逐渐受到广泛关注,但是m6A甲基化修饰在PCa中的研究仍然有限,因此,进一步探讨二者之间的关系显得尤为重要。本文综述了近年来关于m6A甲基化修饰在PCa中的作用、机制及应用的研究进展,尤其详细综述了METTL3,FTO,YTHDF2三种经典的m6A相关调控蛋白质在PCa中的作用机制;并阐述了m6A在晚期PCa(例如:去势抵抗性前列腺癌,骨转移性前列腺癌)中的潜在应用。从甲基化修饰角度为PCa的早期诊断、治疗和预后挖掘一套有效治疗策略,为实现个体化治疗提供更多理论参考。 展开更多
关键词 n6-甲基 前列 去势抵抗性前列 骨转移性前列 免疫治疗
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果蝇RNA m^(6)A修饰通路因子的筛选 被引量:1
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作者 高舒阳 陆厚光 +1 位作者 王艳花 严冬 《遗传》 北大核心 2025年第4期476-488,共13页
N^(6)-甲基腺嘌呤(N^(6)-methyladenosine,m^(6)A)是mRNA中含量最丰富的化学修饰之一,在动植物发育和各种生理病理过程中发挥关键性的作用。先前的研究已经发现了m^(6)A甲基转移酶复合体、去甲基化酶以及m^(6)A结合蛋白,但作为一条相对... N^(6)-甲基腺嘌呤(N^(6)-methyladenosine,m^(6)A)是mRNA中含量最丰富的化学修饰之一,在动植物发育和各种生理病理过程中发挥关键性的作用。先前的研究已经发现了m^(6)A甲基转移酶复合体、去甲基化酶以及m^(6)A结合蛋白,但作为一条相对较新的RNA修饰通路,可能还存在新的m^(6)A修饰因子。为了探究m^(6)A修饰对组织和器官的影响,本研究在果蝇(Drosophila melanogaster)眼成虫盘中过表达m^(6)A结合蛋白基因Ythdc1。结果显示,过表达Ythdc1导致雄性异位表达Sxl蛋白,雌雄均出现粗糙眼表型,同时也激活了JNK和细胞凋亡通路。为了利用粗糙眼表型进行m^(6)A修饰因子的筛选,本研究进一步构建了过表达Ythdc1的稳定果蝇品系。通过对1,500多个果蝇RNAi品系的筛选,成功鉴定到多个可能参与m^(6)A修饰的抑制子和增强子。这些基因目前在m^(6)A中的研究较少,因此进一步对它们进行了验证和初步的机制探索。总之,本研究发现了m^(6)A修饰通路的多个潜在因子,丰富了对m^(6)A修饰通路调控网络的认知,为探索m^(6)A修饰通路新的调控机制提供了思路和方向。 展开更多
关键词 果蝇 n6-甲基嘌呤 Ythdc1 Sxl 修饰因子筛选
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METTL3介导m6A修饰长链非编码RNA THAP7-AS1表达上调促进肺癌发生的作用及机制研究
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作者 张瑜 王彦宏 刘美 《中国肺癌杂志》 CAS CSCD 北大核心 2023年第12期919-933,共15页
背景与目的肺癌是对人类健康的一大威胁,有关肺癌发生发展的分子机制复杂且知之尚少,探索与肺癌发展相关的分子标志物有利于提高早期诊断和治疗的效果。长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)THAP7-AS1已知在胃癌中高表达,但在其... 背景与目的肺癌是对人类健康的一大威胁,有关肺癌发生发展的分子机制复杂且知之尚少,探索与肺癌发展相关的分子标志物有利于提高早期诊断和治疗的效果。长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)THAP7-AS1已知在胃癌中高表达,但在其他癌症中研究较少。本研究旨在探究甲基转移酶样3(methyltransferase-like 3,METTL3)介导N6-甲基腺苷(N6-methyladenosine,m6A)修饰lncRNA THAP7-AS1表达上调促进肺癌发生的作用及机制。方法收集120例肺癌与对应癌旁组织样本,lncRNA微阵列分析差异表达的lncRNA,实时荧光定量聚合酶链式反应(real-time quantitative polymerase chain reaction,qRT-PCR)检测肺癌、癌旁组织、肺癌细胞系THAP7-AS1表达,分析THAP7-AS1对肺癌的诊断价值以及其表达水平与肺癌患者生存率、临床病理特征的关系。通过生物信息学分析、甲基化RNA免疫共沉淀(methylated RNA immunoprecipitation,meRIP)、RNA pulldown实验、RIP实验探究THAP7-AS1的分子调节机制;通过MTS、克隆形成、划痕、Transwell、体内异种移植实验测定各组SPC-A-1、NCI-H1299细胞增殖、迁移、侵袭、成瘤能力,Western blot检测磷脂酰肌醇-3激酶/蛋白激酶B(phosphoinositide 3-kinase/protein kenase B,PI3K/AKT)信号通路蛋白表达。结果肺癌组织、细胞系THAP7-AS1表达升高(P<0.05),对肺癌具有一定的诊断价值[曲线下面积(area under the curve,AUC)=0.737],其表达水平与患者总生存率、肿瘤大小、肿瘤原发灶-淋巴结-转移(tumor-node-metastasis,TNM)分期、淋巴结转移相关(P<0.05)。METTL3介导的m6A修饰能够增强THAP7-AS1表达。与SPC-A-1、NCI-H1299细胞NC组、sh-NC组相比,THAP7-AS1组增殖、迁移、侵袭能力提高(P<0.05),移植瘤体积、质量增大(P<0.05),sh-THAP7-AS1组增殖、迁移、侵袭能力下降(P<0.05)。THAP7-AS1与Cullin蛋白4B(Cullin 4B,CUL4B)存在特异结合。与SPC-A-1、NCI-H1299细胞Vector组相比,THAP7-AS1组增殖、迁移、侵袭能力、磷脂酰肌醇-4,5-二磷酸3-激酶催化亚基α(phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit alpha,PI3KCA)、磷脂酰肌醇-3激酶催化亚基δ(phosphoinositide-3 kinase-catalytic subunit delta,PI3KCD)、磷酸化磷脂酰肌醇3-激酶(phospho-phosphatidylinositol 3-kinase,p-PI3K)、磷酸蛋白激酶B(phospho-protein kinase B,p-AKT)、磷酸哺乳动物雷帕霉素靶蛋白(phosphomammalian target of rapamycin,p-mTOR)表达水平升高(P<0.05)。结论LncRNA THAP7-AS1通过METTL3介导的m6A修饰稳定表达,与CUL4B结合激活PI3K/AKT信号通路,促进肺癌发生发展。 展开更多
关键词 甲基转移酶样3 n6-甲基 长链非编码RnA THAP7-AS1 肺肿瘤 增殖
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m6A甲基化修饰在植物生长发育中的功能研究进展
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作者 杨庆玲 向小雪 娄红梅 《安徽农业科学》 CAS 2022年第5期15-17,共3页
N6-甲基腺苷(m6A)是真核mRNA最丰富的内部修饰,在人类和其他哺乳动物的生长发育中发挥重要的生物功能,在植物中也发挥着至关重要的调控作用,其在植物中的功能和分子调控机制一直是研究的热点。概述了m6A甲基化的基本组成以及其在动植物... N6-甲基腺苷(m6A)是真核mRNA最丰富的内部修饰,在人类和其他哺乳动物的生长发育中发挥重要的生物功能,在植物中也发挥着至关重要的调控作用,其在植物中的功能和分子调控机制一直是研究的热点。概述了m6A甲基化的基本组成以及其在动植物中的相应组分,重点阐述了其在植物生长发育中的作用,探讨目前存在的问题,旨在为深入研究m6A甲基化在植物中的作用机制以及提高植物生产力、培育优良品种提供理论依据。 展开更多
关键词 RnA修饰 n6-甲基(m6A) 甲基 植物生长发育
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WTAP通过调节BMI1 mRNA的m6A修饰促进胶质瘤细胞增殖和有氧糖酵解
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作者 刁新峰 李新茂 +1 位作者 候亮 魏志玄 《中国癌症杂志》 CAS CSCD 北大核心 2023年第7期655-663,共9页
背景与目的:甲基转移酶Wilms瘤1-相关蛋白(Wilms’tumor 1-associating protein,WTAP)被证实在肿瘤中发挥重要作用,本研究旨在从N6-甲基腺苷(N6-methyladenosine,m6A)修饰的角度探讨WTAP在胶质瘤发生、发展过程中的作用及其机制。方法:... 背景与目的:甲基转移酶Wilms瘤1-相关蛋白(Wilms’tumor 1-associating protein,WTAP)被证实在肿瘤中发挥重要作用,本研究旨在从N6-甲基腺苷(N6-methyladenosine,m6A)修饰的角度探讨WTAP在胶质瘤发生、发展过程中的作用及其机制。方法:通过芯片筛选胶质瘤中差异表达的m6A调节因子,采用实时荧光定量聚合酶链反应(real-time fluorescence quantitative polymerase chain reaction,RTFQ-PCR)和蛋白质印迹法(Western blot)评估WTAP/B细胞特异性莫洛尼氏鼠白血病病毒整合位点1(B cell-specific Moloney murine leukemia virus integration site 1,BMI1)在胶质瘤组织和细胞系中的表达。借助四甲基偶氮唑盐(methyl thiazoyl terazolium,MTT)探究WTAP/BMI1对胶质瘤细胞增殖的作用。采用细胞外酸化率(extracellular acidification rate,ECAR)试剂盒、葡萄糖消耗及乳酸生成检测试剂盒评估胶质瘤细胞有氧糖酵解情况。结果:相对于正常组织,WTAP、BMI1在胶质瘤组织中表达上调。此外,相对于HEB细胞中的WTAP(1.01±0.13)和BMI1(1.02±0.11)表达,U251细胞中的WTAP(2.38±0.17)、BMI1(2.25±0.14)表达增强(P均<0.05)。敲减WTAP在体外能抑制细胞增殖和糖酵解能力,而过表达WTAP则显示相反效果。过表达WTAP对胶质瘤细胞增殖、糖酵解的作用能被敲减BMI1部分挽救(P均<0.05)。在机制上,WTAP促进BMI1的m6A甲基化修饰,使BMI1 mRNA的稳定性增强(P均<0.05)。结论:WTAP能以m6A甲基化依赖方式促进BMI1表达,从而促进胶质瘤细胞增殖和有氧糖酵解,靶向WTAP的分子治疗手段可能为改善胶质瘤治疗效果提供新方向。 展开更多
关键词 胶质瘤 n6-甲基修饰 有氧糖酵解 甲基转移酶
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基于双层BiGRU网络的哺乳动物组织m^(6)A甲基化位点预测
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作者 李慧敏 陈鹏辉 +3 位作者 唐轶 徐权峰 胡梦 王煜 《生物化学与生物物理进展》 SCIE CSCD 北大核心 2023年第12期3032-3044,共13页
目的N6-甲基化腺苷(N6-methyladenosine,m^(6)A)是RNA中最常见、最丰富的化学修饰,在很多生物过程中发挥着重要作用。目前已经发展了一些预测m^(6)A甲基化位点的计算方法。然而,这些方法在针对不同物种或不同组织时,缺乏稳健性。为了提... 目的N6-甲基化腺苷(N6-methyladenosine,m^(6)A)是RNA中最常见、最丰富的化学修饰,在很多生物过程中发挥着重要作用。目前已经发展了一些预测m^(6)A甲基化位点的计算方法。然而,这些方法在针对不同物种或不同组织时,缺乏稳健性。为了提升对不同组织中m^(6)A甲基化位点预测的稳健性,本文提出一种能结合序列反向信息来提取数据更高级特征的双层双向门控循环单元(bidirectional gated recurrent unit,Bi GRU)网络模型。方法本文选取具有代表性的哺乳动物组织m^(6)A甲基化位点数据集作为训练数据,通过对模型网络、网络结构、层数和优化器等进行搭配,构建双层Bi GRU网络。结果将模型应用于人类、小鼠和大鼠共11个组织的m^(6)A甲基化位点预测上,并与其他方法在这11个组织上的预测能力进行了全面的比较。结果表明,本文构建的模型平均预测接受者操作特征曲线下面积(area under the receiver operating characteristiccurve,AUC)达到93.72%,与目前最好的预测方法持平,而预测准确率(accuracy,ACC)、敏感性(sensitivity,SN)、特异性(specificity,SP)和马修斯相关系数(Matthews correlation coefficient,MCC)分别为90.07%、90.30%、89.84%和80.17%,均高于目前的m^(6)A甲基化位点预测方法。结论和已有研究方法相比,本文方法对11个哺乳动物组织的m^(6)A甲基化位点的预测准确性均达到最高,说明本文方法具有较好的泛化能力。 展开更多
关键词 n6-甲基位点 双向门控循环单元 碱基序列 深度学习
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m6A修饰的circRNA在肝细胞癌中的研究进展 被引量:1
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作者 褚凤冉 刘路政 武金才 《海南医学院学报》 CAS 北大核心 2024年第2期155-160,共6页
N6-甲基腺苷(N6-methyladenosine,m6A)是一种可逆的表观遗传修饰,是真核细胞中最丰富的修饰物之一,在信使RNA和非编码RNA中被普遍报道。m6A修饰可调节RNA的转录、加工、剪接、降解和翻译等,在肿瘤生物学行为中发挥重要作用。缺乏5’帽... N6-甲基腺苷(N6-methyladenosine,m6A)是一种可逆的表观遗传修饰,是真核细胞中最丰富的修饰物之一,在信使RNA和非编码RNA中被普遍报道。m6A修饰可调节RNA的转录、加工、剪接、降解和翻译等,在肿瘤生物学行为中发挥重要作用。缺乏5’帽子结构的circ RNA(circular RNA)一直被误认为是转录过程中偶然剪切生成的“垃圾序列”,然而研究发现,circ RNA可以通过micro RNA、结合蛋白、翻译多肽和m6A修饰等多种方式参与肿瘤侵袭和转移。本文就m6A修饰在circ RNA调控作用及其在肝细胞癌中的功能作一综述,并讨论其在该领域的潜在临床应用和可能的未来发展方向。 展开更多
关键词 n6-甲基 环状RnA 修饰 肝细胞癌
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WTAP对博来霉素诱导的肺纤维化胶原沉积的影响
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作者 张云森 刘震宇 +4 位作者 刘芷言 林丽婵 沙纪名 陶辉 陈齐 《安徽医科大学学报》 北大核心 2025年第2期266-271,共6页
目的探讨Wilms肿瘤1相关蛋白(WTAP)对博来霉素所致的肺纤维化组织胶原沉积的影响。方法60只小鼠随机分为4组:对照组(Control组)、博来霉素诱导肺纤维化组(BLM组)、肺纤维化慢病毒空载体对照组(BLM+LV-NC组)、肺纤维化WTAP慢病毒组(BLM+L... 目的探讨Wilms肿瘤1相关蛋白(WTAP)对博来霉素所致的肺纤维化组织胶原沉积的影响。方法60只小鼠随机分为4组:对照组(Control组)、博来霉素诱导肺纤维化组(BLM组)、肺纤维化慢病毒空载体对照组(BLM+LV-NC组)、肺纤维化WTAP慢病毒组(BLM+LV-WTAP组)。采用腹部皮下注射博来霉素(35 mg/kg)建立实验性肺纤维化小鼠模型,每周2次,共8次。造模结束后,使用Western blot检测纤维化相关标志物α-平滑肌肌动蛋白(α-SMA)、Ⅰ型胶原(CollagenⅠ)、纤维连接蛋白(Fibronectin)的蛋白表达情况以及WTAP蛋白表达情况;使用Masson染色和Sirius Red染色检测胶原沉积情况;采用RT-qPCR检测WTAP mRNA表达情况、WTAP慢病毒侵染效果及CollagenⅠmRNA表达情况。结果与Control组比较,BLM组肺组织α-SMA(P<0.001)、CollagenⅠ(P<0.001)、Fibronectin(P<0.01)蛋白表达均升高;Masson染色(P<0.001)和Sirius Red染色(P<0.001)证实BLM组肺组织出现明显胶原沉积;且BLM组肺组织中WTAP蛋白表达升高(P<0.01)。与Control组比较,BLM组肺组织中WTAP mRNA表达升高(P<0.001);与BLM+LV-NC组比较,BLM+LV-WTAP组肺组织中WTAP mRNA表达下降(P<0.001),证明病毒侵染有效。WTAP慢病毒侵染后,BLM+LV-WTAP组胶原纤维沉积减少(P<0.001)、CollagenⅠmRNA水平降低(P<0.001)及蛋白表达下降(P<0.001)。结论敲低WTAP表达可减少博来霉素所致的小鼠肺纤维化组织的胶原沉积,改善实验性肺纤维化。 展开更多
关键词 Wilms肿瘤1相关蛋白 肺纤维 博来霉素 表观转录组 胶原 n6-甲基
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O-GlcNAc修饰的YTHDF2通过m^(6)A修饰调节抑癌基因PER1促进膀胱癌的发展
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作者 王理 任达 +3 位作者 蔡泽强 胡文涛 陈禹廷 朱煊 《中南大学学报(医学版)》 2025年第5期827-839,共13页
目的:膀胱癌是一种常见恶性肿瘤,发病率高且预后较差。N^(6)-甲基腺苷(N^(6)-methyladenosine,m^(6)A)修饰广泛参与各种生理过程,其中m^(6)A识别蛋白YTH N^(6)-甲基腺嘌呤RNA结合蛋白F2(YTH N^(6)-methyladenosine RNA binding protein ... 目的:膀胱癌是一种常见恶性肿瘤,发病率高且预后较差。N^(6)-甲基腺苷(N^(6)-methyladenosine,m^(6)A)修饰广泛参与各种生理过程,其中m^(6)A识别蛋白YTH N^(6)-甲基腺嘌呤RNA结合蛋白F2(YTH N^(6)-methyladenosine RNA binding protein F2,YTHDF2)在膀胱癌进展中发挥重要作用。本研究深入探究O-连接N-乙酰氨基葡萄糖(O-linked N-acetylglucosamine,O-GlcNAc)修饰的YTHDF2调控下游靶基因周期昼夜节律调节器1(period circadian regulator 1,PER1)进而影响膀胱癌细胞增殖的分子机制。方法:采用癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)预测YTHDF2在膀胱癌的表达。采用实时荧光定量PCR(quantitative real-time polymerase chain reaction,RT-qPCR)、蛋白质印迹法或免疫组织化学染色检测YTHDF2、PER1和增殖相关蛋白质[增殖细胞核抗原(proliferating cell nuclear antigen,PCNA)、微小染色体维持复合体组分2(minichromosome maintenance complex component 2,MCM2)、细胞周期蛋白D1(cyclin D1,CCND1)]在临床水平(20对膀胱癌和癌旁正常组织)和细胞水平[正常膀胱上皮细胞(SV-HUC-1)和膀胱癌细胞(T24、5637、EJ-1、SW780、BIU-87)]的表达。敲低5637和SW780细胞中的YTHDF2,采用细胞计数试剂盒-8(Cell Counting Kit-8,CCK-8)、平板克隆和EdU检测细胞增殖情况。采用生物信息学预测YTHDF2的糖基化修饰位点,免疫沉淀(immunoprecipitation,IP)检测临床组织及细胞中YTHDF2蛋白的O-GlcNAc修饰水平。采用DMSO、OSMI-1(抑制糖基化)、Thiamet G(促进糖基化)处理膀胱癌细胞并加入放线菌酮(cycloheximide,CHX),IP检测YTHDF2泛素化水平。对膀胱癌细胞进行YTHDF2的敲低及Thiamet G处理,检测PER1 mRNA稳定性、PER1 m^(6)A修饰及细胞增殖情况。TCGA网站预测组织中PER1的表达水平;SRAMP网站预测PER1可能存在的m^(6)A修饰位点。甲基化RNA免疫沉淀(methylated RNA immunoprecipitation,MeRIP)检测PER1 m^(6)A修饰水平;最后检测敲低YTHDF2和PER1对5637和SW780细胞增殖的影响。结果:与癌旁正常组织比较,YTHDF2在膀胱癌组织中的mRNA表达水平上调2.5倍,蛋白质水平升高2倍,且O-GlcNAc修饰水平增加3.5倍(均P<0.01)。YTHDF2在膀胱癌细胞系中上调,且敲低YTHDF2抑制膀胱癌细胞活力(P<0.001),下调增殖相关蛋白PCNA、MCM2、CCND1的表达(均P<0.05),细胞克隆数较正常组降低3倍(P<0.01),抑制细胞增殖。YTHDF2在膀胱癌细胞中O-GlcNAc修饰水平升高。OSMI-1显著降低YTHDF2蛋白稳定性(P<0.01),促进其泛素化;Thiamet G则发挥相反作用(P<0.001)。添加Thiamet G可以逆转敲低YTHDF2引起的细胞功能变化,促进膀胱癌细胞增殖(P<0.01),上调PCNA、MCM2、CCND1的表达(均P<0.05)。YTHDF2靶向识别PER1 m^(6)A修饰进而促进PER1 mRNA的降解。回复实验结果显示敲低PER1逆转敲低YTHDF2对膀胱癌细胞增殖的抑制,促进膀胱癌细胞增殖(P<0.001),上调PCNA、MCM2、CCND1的表达(均P<0.05),提示YTHDF2通过调节PER1促进膀胱癌细胞的增殖。结论:O-GlcNAc修饰的YTHDF2通过m^(6)A修饰下调抑癌基因PER1,进而促进膀胱癌的发展。 展开更多
关键词 膀胱癌 O-连接n-乙酰葡萄糖糖基 n^(6)-甲基修饰 YTH n^(6)-甲基嘌呤RnA结合蛋白F2 周期昼夜节律调节器1
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表观遗传修饰与环状RNA在结直肠癌中相互作用的研究进展 被引量:6
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作者 彭恬 徐雷鸣 《上海交通大学学报(医学版)》 CAS CSCD 北大核心 2023年第2期237-243,共7页
结直肠癌(colorectal cancer,CRC)是全球第三大常见的恶性肿瘤,目前针对该病的诊断和治疗方法都存在局限性。既往的研究表明,表观遗传修饰在结直肠癌的进展中发挥了重要作用。表观遗传修饰是指基因功能在DNA序列不变的情况下发生了可遗... 结直肠癌(colorectal cancer,CRC)是全球第三大常见的恶性肿瘤,目前针对该病的诊断和治疗方法都存在局限性。既往的研究表明,表观遗传修饰在结直肠癌的进展中发挥了重要作用。表观遗传修饰是指基因功能在DNA序列不变的情况下发生了可遗传的变化,导致相似DNA的细胞最终发育成具有不同功能的细胞,其中主要包括DNA/RNA甲基化修饰、组蛋白修饰、非编码RNA转录后调控等。环状RNA(circular RNA,circRNA)是非编码RNA中的一种具有稳定环状结构的RNA分子,广泛存在于多种细胞中,且可以通过多种通路影响肿瘤的进展。目前许多研究表明表观遗传修饰可以影响circRNA的生物学功能,而circRNA也能通过靶向表观遗传修饰相关分子参与结直肠癌的进展。其中,研究发现一方面N^(6)-甲基腺苷(N^(6)-methyladenosine,m^(6)A)可以直接影响circRNA的生成、翻译及功能,另一方面circRNA也可以调控m^(6)A修饰及其调节因子,从而影响疾病的发生发展及转移。DNA甲基化和组蛋白修饰也与circRNA有潜在的相互作用。该文描述了表观遗传修饰与circRNA在结直肠癌中的相互作用,以及它们在癌症发展中的作用,并提出了它们在诊断与治疗中的潜在应用和未来研究方向。 展开更多
关键词 环状RnA 结直肠癌 n^(6)-甲基 DnA甲基 组蛋白修饰
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西方蜜蜂m 6A甲基转移酶的基因克隆、多克隆抗体制备及表达模式 被引量:9
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作者 吴鹰 刘治滩 +9 位作者 赵浩东 郭思佳 刘小玉 张艺琼 冯佩林 赵红霞 徐细建 陈大福 付中民 郭睿 《昆虫学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第7期885-895,共11页
【目的】本研究旨在克隆西方蜜蜂Apis mellifera RNA m 6A甲基转移酶14(methyltransferase 14,METTL14)基因AmMETTL14,分析AmMETTL14的理化性质和分子特性以及AmMETTL14在工蜂不同发育阶段和不同组织中的表达模式,并制备AmMETTL14多克... 【目的】本研究旨在克隆西方蜜蜂Apis mellifera RNA m 6A甲基转移酶14(methyltransferase 14,METTL14)基因AmMETTL14,分析AmMETTL14的理化性质和分子特性以及AmMETTL14在工蜂不同发育阶段和不同组织中的表达模式,并制备AmMETTL14多克隆抗体,为持续深入开展AmMETTL14的功能研究提供参考和基础。【方法】通过PCR扩增西方蜜蜂AmMETTL14的CDS并进行Sanger测序验证。使用相关生物信息学软件对AmMETTL14进行生物信息学分析,并构建系统进化树。通过原核表达系统诱导表达AmMETTL14融合蛋白,免疫新西兰白兔以制备多克隆抗体,利用ELISA和Western blot分别检测抗体的效价及特异性。采用RT-qPCR检测AmMETTL14在卵、幼虫、预蛹、蛹及工蜂成虫中以及刚出房工蜂成虫的触角、毒腺、脑、中肠、咽下腺、脂肪体和表皮7种组织中的相对表达量。【结果】成功克隆到西方蜜蜂AmMETTL14的CDS;AmMETTL14的分子式为C 1957 H 3113 N 567 O 589 S 15,分子量约为44.49 kD,脂溶系数为79.97,理论等电点为8.58,平均亲水系数为-0.59,不含典型的跨膜结构域和信号肽,可同时定位于细胞核、线粒体和细胞质;西方蜜蜂、中华蜜蜂A.cerana cerana、黑大蜜蜂A.laboriosa、东方蜜蜂A.cerana、大蜜蜂A.dorsata、小蜜蜂A.florea、欧洲熊蜂Bombus terrestris、金环胡蜂Vespa mandarinia、美洲东部熊蜂B.impatiens和黑腹果蝇Drosophila melanogaster的METTL14均含有MT-A70结构域和3个相同的保守基序;AmMETTL14与黑大蜜蜂的METTL14的氨基酸序列一致性最高(65.60%)且亲缘关系最近。制备的AmMETTL14多克隆抗体效价较高(大于512 K)且特异性较强。AmMETTL14在7和8日龄预蛹与卵中的表达量相近且均显著高于在3日龄幼虫中的表达量,在12日龄蛹中的表达量显著高于卵、幼虫和预蛹中的表达量,在6,12和15日龄工蜂成虫体内的表达量显著高于1日龄工蜂成虫体内的表达量;AmMETTL14在刚出房工蜂成虫脑和咽下腺中的表达量与触角中的表达量相近且均显著高于在毒腺、中肠、脂肪体和表皮中的表达量。【结论】研究结果表明,AmMETTL14可能为亲水性、非跨膜和胞内蛋白,AmMETTL14在幼虫生长发育中发挥潜在的调控作用,制备得到的AmMETTL14的多克隆抗体效价高、灵敏度高和特异性强,为进一步探究AmMETTL14的功能及其参与的表观调控机制打下了基础。 展开更多
关键词 西方蜜蜂 n 6-甲基 甲基转移酶14 时空表达模式 MT-A70 抗体
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RNA m^(6)A修饰在肺部疾病中的研究进展 被引量:6
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作者 张哲明 吴艳 卞涛 《中国病理生理杂志》 CAS CSCD 北大核心 2021年第9期1719-1723,共5页
N^(6)-甲基腺苷(N^(6)-methyladenosine,m^(6)A)修饰是指RNA中腺苷的第6位氮原子处发生的甲基化修饰。在已发现的RNA修饰中,m^(6)A修饰被认为是真核生物mRNA中最常见的修饰类型。此外,这种甲基化修饰也可发生在rRNA、tRNA、miRNA、circ... N^(6)-甲基腺苷(N^(6)-methyladenosine,m^(6)A)修饰是指RNA中腺苷的第6位氮原子处发生的甲基化修饰。在已发现的RNA修饰中,m^(6)A修饰被认为是真核生物mRNA中最常见的修饰类型。此外,这种甲基化修饰也可发生在rRNA、tRNA、miRNA、circRNA和lncRNA[1]。 展开更多
关键词 n^(6)-甲基修饰 RnA甲基 肺部疾病
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