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LncRNA 18850对猪流行性腹泻病毒复制的影响
1
作者 余昕雅 何海健 +5 位作者 王磊 倪语晨 杜静 周莹珊 董婉玉 王晓杜 《畜牧兽医学报》 北大核心 2025年第3期1366-1375,共10页
长链非编码RNA(lncRNA)是一类长度超过200 bp且缺乏蛋白质编码能力的RNA,已有研究表明lncRNA在病毒复制过程中具有重要的生物学作用。本研究分析了猪流行性腹泻病毒(PEDV)感染细胞的lncRNA表达变化及其对PEDV复制的影响。转录组测序PED... 长链非编码RNA(lncRNA)是一类长度超过200 bp且缺乏蛋白质编码能力的RNA,已有研究表明lncRNA在病毒复制过程中具有重要的生物学作用。本研究分析了猪流行性腹泻病毒(PEDV)感染细胞的lncRNA表达变化及其对PEDV复制的影响。转录组测序PEDV感染Vero-E6细胞24h的样品中lncRNA,构建lncRNA 18850过表达质粒,Western blot、qPCR以及TCID 50等方法分析lncRNA 18850过表达对PEDV复制的影响,转录组测序分析lncRNA 18850过表达的Vero-E6细胞差异基因表达,生物信息学分析lncRNA 18850靶向基因及差异蛋白互作关系。结果显示,PEDV感染Vero-E6细胞24和48 h lncRNA 18850的表达量均呈极显著上升(P<0.01);lncRNA 18850的过表达可显著促进PEDV的复制(P<0.05);LIF、IL11、EPHA2、CCND1、DUSP5、CCN 2基因与lncRNA 18850存在靶向关系。PEDV感染可上调Vero-E6细胞内lncRNA 18850的表达,lncRNA 18850可能通过靶向调控多个基因而促进病毒的复制,本研究为深入探析PEDV的复制机制及潜在靶向治疗策略提供了新的视角。 展开更多
关键词 长链非编码rna 猪流行性腹泻病毒 转录组测序 Apelin信号通路
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非编码RNA在传染性法氏囊病病毒感染中的研究进展 被引量：1
2
作者 刘伟烨 黄雪伟 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第4期1488-1498,共11页
传染性法氏囊病(infectious bursal disease, IBD)是由传染性法氏囊病病毒(IBD virus, IBDV)引起的急性、高度传染性和免疫抑制性禽类疾病。近年来,随着新型变异毒株的出现,IBDV仍然威胁着全球家禽养殖业的健康发展,宿主和IBDV之间的“... 传染性法氏囊病(infectious bursal disease, IBD)是由传染性法氏囊病病毒(IBD virus, IBDV)引起的急性、高度传染性和免疫抑制性禽类疾病。近年来,随着新型变异毒株的出现,IBDV仍然威胁着全球家禽养殖业的健康发展,宿主和IBDV之间的“战役”似乎永不停息。因此,迫切需要制定一种更全面和更有效的策略来控制该疾病,而深入了解IBDV与宿主之间的相互作用,将有助于开发新型疫苗。非编码RNA(non-coding RNA,ncRNAs)是一类丰富的不编码蛋白质的RNA分子,其中包括微小RNA(microRNAs, miRNAs)、长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNAs)和环状RNA(circular RNA,circRNAs)。近年来,研究发现ncRNAs广泛参与IBDV与宿主的相互作用过程,在IBDV感染中发挥重要的调控作用。本文阐述了宿主miRNAs、lncRNAs和circRNAs在IBDV感染中的作用,以期为IBDV的感染与致病机制研究提供理论参考和新思路。 展开更多
关键词 传染性法氏囊病病毒 非编码rna MIrna lncrna circrna
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lncRNA EBLN3P调节miR-369-3p/CCND1轴对甲状腺癌B-CPAP细胞增殖、迁移和EMT进程的影响
3
作者 赵方腾 孙琪 钱永 《中国肿瘤生物治疗杂志》 北大核心 2025年第4期398-404,共7页
目的:探究长链非编码RNA(lncRNA)内源性博尔纳病毒样核蛋白3假基因(EBLN3P)调控miR-369-3p/CCND1轴对甲状腺癌B-CPAP细胞增殖、迁移和EMT进程的影响。方法:收集2020年5月至2021年5月间在海南省肿瘤医院手术切除的20例甲状腺癌及相应癌... 目的:探究长链非编码RNA(lncRNA)内源性博尔纳病毒样核蛋白3假基因(EBLN3P)调控miR-369-3p/CCND1轴对甲状腺癌B-CPAP细胞增殖、迁移和EMT进程的影响。方法:收集2020年5月至2021年5月间在海南省肿瘤医院手术切除的20例甲状腺癌及相应癌旁组织标本,以及甲状腺癌B-CPAP细胞,qPCR法和WB法检测癌组织和细胞中EBLN3P、miR-369-3p、CCND1 mRNA水平,双萤光素酶报告基因实验验证lncRNA EBLN3P、CCND1与miR-369-3p之间的靶向关系。随机将B-CPAP细胞分为对照组、sh-NC组、sh-EBLN3P组、sh-EBLN3P+anti-NC组、sh-EBLN3P+anti-miR-369-3p组,通过克隆形成实验、划痕愈合实验、Transwell实验分别检测各组细胞的增殖和迁移能力,WB法检测各组细胞中EMT相关蛋白的表达。构建B-CPAP细胞裸鼠移植瘤模型,观察沉默EBLN3P对移植瘤生长的影响。结果:在甲状腺癌组织和B-CPAP细胞中EBLN3P、CCND1 mRNA表达上调,miR-369-3p表达下调(均P<0.05);EBLN3P与miR-369-3p、CCND1与miR-369-3p之间有结合位点,存在靶向关系。与sh-NC组比较,sh-EBLN3P组克隆形成数、划痕愈合率、细胞迁移数降低(均P<0.05),EBLN3P、CCND1、Ki67、MMP-2、N-cadherin、vimentin表达下调,miR-369-3p、E-cadherin表达上调(均P<0.05);与sh-EBLN3P+anti-NC组比较,sh-EBLN3P+anti-miR-369-3p组miR-369-3p表达下调,克隆形成数、划痕愈合率、细胞迁移数均升高(均P<0.05),CCND1、Ki67、MMP-2、N-cadherin、vimentin表达均上调,E-cadherin表达下调(均P<0.05)。与sh-NC组比较,sh-EBLN3P组B-CPAP细胞裸鼠移植瘤的体积和质量均显著降低(均P<0.05)。结论:在甲状腺癌组织和B-CPAP细胞中lncRNA EBLN3P表达上调,沉默EBLN3P可靶向调控miR-369-3p/CCND1轴抑制甲状腺癌B-CPAP细胞的增殖、迁移、EMT进程。 展开更多
关键词 甲状腺癌 B-CPAP细胞 长链非编码rna 内源性博尔纳病毒样核蛋白3假基因 miR-369-3p 细胞周期蛋白D1 增殖 迁移 上皮间质转化
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猪圆环病毒2型诱发肠炎与非编码RNA的研究
4
作者 张莉 方满新 +2 位作者 钟可欣 谭思敏 邓治邦 《上海畜牧兽医通讯》 2024年第1期1-5,共5页
本文综述了PCV 2诱发肠炎的研究现状,阐述了miRNA、circRNA和lncRNA等作用机制及在炎症性疾病中的作用,进一步介绍了PCV 2感染对非编码RNA表达影响的相关研究,以期为探索PCV 2相关性肠炎的发病机制提供思路。
关键词 猪圆环病毒2型 非编码rna 肠炎
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EB病毒编码的小mRNA阴性结外NK/T细胞淋巴瘤的临床特征及预后分析 被引量：4
5
作者 贾思思 南飞飞 +4 位作者 李素彩 曹婧语 王冠男 张明智 张蕾 《中国癌症杂志》 CAS CSCD 北大核心 2016年第6期533-537,共5页
背景与目的:结外NK/T细胞淋巴瘤(extranodal natural killer/T-cell lymphoma,ENKTL)为非霍奇金淋巴瘤的一个亚型,中国发病率远高于西方国家。该病恶性程度高,对化疗不敏感,生存期短,预后差,EB病毒(Epstein-Barr virus,EBV)感染与该病... 背景与目的:结外NK/T细胞淋巴瘤(extranodal natural killer/T-cell lymphoma,ENKTL)为非霍奇金淋巴瘤的一个亚型,中国发病率远高于西方国家。该病恶性程度高,对化疗不敏感,生存期短,预后差,EB病毒(Epstein-Barr virus,EBV)感染与该病的发生、发展有密切关系,但仍有少数患者无EBV感染。本研究探讨EBV编码的小m RNA(EBV-encoded small RNA,EBER)原位杂交阴性患者的临床特征及预后相关因素。方法:选取2011年8月—2015年10月郑州大学第一附属医院病理科诊断为ENKTL的326例标本,采用原位杂交技术检测其EBER表达,回顾性分析8例EBER阴性患者临床特征及预后相关因素。结果:326例ENKTL中,EBER表达阴性率为2.45%(8/326),8例EBER表达阴性患者的中位生存期为17个月。EBER阴性与EBER阳性患者的生存率log-rank检验,两条生存曲线差异有统计学意义(χ2=6.407,P=0.011)。多变量Cox比例风险回归分析表明,乳酸脱氢酶(lactate dehydrogenase,LDH)与EBER阴性ENKTL患者预后有关(P=0.008),血浆中EBV-DNA拷贝数与EBER阴性患者的预后无关(P>0.05)。结论:EBER表达阴性ENKTL发病率低,预后较EBER阳性患者差,LDH升高可能是其预后不良因素。 展开更多
关键词 结外NK/T细胞淋巴瘤 eb病毒编码的小m rna阴性 临床特征 预后
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长链非编码RNA-RNU12在EB病毒相关胃癌中的表达及其意义 被引量：4
6
作者 刘芬 邹长棪 +4 位作者 胡丹 王晓宁 郑雄伟 苏颖 林贤东 《临床与实验病理学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2020年第11期1290-1295,共6页
目的探讨EB病毒(Epstein-Barr virus,EBV)感染与胃癌的相关性及长链非编码RNA-RNU12表达与胃癌临床病理特征、EBV感染的关系,为EBV相关胃癌(Epstein-Barr virus-associated gastric carcinoma,EBVaGC)的治疗、控制和预防提供理论依据。... 目的探讨EB病毒(Epstein-Barr virus,EBV)感染与胃癌的相关性及长链非编码RNA-RNU12表达与胃癌临床病理特征、EBV感染的关系,为EBV相关胃癌(Epstein-Barr virus-associated gastric carcinoma,EBVaGC)的治疗、控制和预防提供理论依据。方法收集胃腺癌患者113例,分析EBV感染与临床病理特征的关系。采用原位杂交技术检测胃癌组织标本EBV感染。应用qRT-PCR检测胃癌及癌旁组织中RNU12的表达水平及其与临床病理特征的关系。结果EBV感染与患者年龄、组织分化、Lauren分型及肿瘤大小有关(P<0.05);与患者性别、浸润深度、淋巴结转移、TNM分期、脉管癌栓及神经侵犯无关(P>0.05)。RNU12在胃癌组织中的表达量为(0.01±0.004),在癌旁组织中的表达量为(0.179±0.001),下调3.35倍(P=0.001)。RNU12表达与淋巴结转移和EBV感染有关(P<0.05)。在EBVaGC中RNU12的表达量为(0.130±0.090),而相应癌旁组织的表达量为(0.393±0.093),下调3.0倍(P=0.023)。RNU12表达与EBVaGC的TNM分期、淋巴结转移及浸润深度密切相关(P<0.05)。Kaplan-Meier分析结果显示:在EBVaGC中RNU12高表达组总生存率优于高表达组(P=0.008)。结论RNU12可能是EBVaGC潜在的肿瘤生物学标志物。 展开更多
关键词 胃肿瘤 疱疹病毒4型 长链非编码rna RNU12 预后
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调控PRRSV复制的功能性长链非编码RNA的筛选与鉴定
7
作者 刘宇明 许大伟 +1 位作者 马鸣潇 李明 《现代畜牧兽医》 2025年第6期28-33,共6页
为了筛选可以调控猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)复制的宿主长链非编码RNA(lncRNA),研究通过PRRSV感染Marc145细胞后24、48 h收集样品,利用华大基因第二代测序平台进行全转录组测序分析,筛选出病毒感染后显著变化的lncRNA候选分子。经... 为了筛选可以调控猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)复制的宿主长链非编码RNA(lncRNA),研究通过PRRSV感染Marc145细胞后24、48 h收集样品,利用华大基因第二代测序平台进行全转录组测序分析,筛选出病毒感染后显著变化的lncRNA候选分子。经初步验证后选择LTCONS_00092659(命名为NRPL),采用敲低和过表达NRPL的方法观察其对PRRSV复制的影响。结果显示,敲低NRPL可明显抑制PRRSV复制,而过表达NRPL则明显促进病毒复制。研究表明,lncRNA-NRPL在PRRSV感染过程中发挥重要的促进作用,提示NRPL可能成为开发抗PRRSV感染疗法的新宿主靶标,为猪繁殖与呼吸综合征的防治提供了潜在的治疗靶点。 展开更多
关键词 猪繁殖与呼吸综合征病毒 长链非编码rna 转录组学 Ⅰ型干扰素
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EBV编码miRNAs在病毒感染和肿瘤发生中的功能和意义 被引量：4
8
作者 彭秋 刘良专 甘润良 《生物化学与生物物理进展》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2019年第8期787-795,共9页
EB病毒(Epstein-Barr virus,EBV)是一种172 kb大小的线性双链DNA病毒,与鼻咽癌、淋巴瘤、胃癌等恶性肿瘤的发生密切相关. EBV编码的微小RNAs (miRNAs)可以调节病毒和宿主细胞基因的表达,并且在癌症发生发展中起着多种作用.本文综述了EB... EB病毒(Epstein-Barr virus,EBV)是一种172 kb大小的线性双链DNA病毒,与鼻咽癌、淋巴瘤、胃癌等恶性肿瘤的发生密切相关. EBV编码的微小RNAs (miRNAs)可以调节病毒和宿主细胞基因的表达,并且在癌症发生发展中起着多种作用.本文综述了EBV编码的miRNAs (EBV-encoded miRNA,EBV miRNAs)在病毒感染和肿瘤发生、侵袭转移、抗凋亡、信号通路等方面的生物学功能,以及对于EBV相关肿瘤诊断标志物的潜在意义. EB病毒编码的miRNAs也可能成为进一步研究EBV相关肿瘤治疗的一个候选靶点. 展开更多
关键词 eb病毒(ebV) 肿瘤 微小rna(mirnas)
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EB病毒编码的microRNAs参与肿瘤的发生和发展 被引量：3
9
作者 李巍明 易伟宏 +1 位作者 杨大志 李桂源 《中南大学学报（医学版）》 CAS CSCD 北大核心 2021年第3期300-308,共9页
EB病毒(Epstein-Barr virus,EBV)是一种明确的致瘤性病毒,与鼻咽癌、胃癌、淋巴瘤等多种肿瘤的发生和发展密切相关。EBV共编码44种成熟的微RNA(microRNAs,miRNAs),可调节病毒自身和宿主基因的表达。EBV编码的miRNAs(Epstein-Barr virus-... EB病毒(Epstein-Barr virus,EBV)是一种明确的致瘤性病毒,与鼻咽癌、胃癌、淋巴瘤等多种肿瘤的发生和发展密切相关。EBV共编码44种成熟的微RNA(microRNAs,miRNAs),可调节病毒自身和宿主基因的表达。EBV编码的miRNAs(Epstein-Barr virus-encoded microRNAs,EBV miRNAs)及其所调控的靶分子参与肿瘤细胞的凋亡、增殖、侵袭和转移等方面的生物学功能,在肿瘤发生和发展过程中发挥重要作用。 展开更多
关键词 eb病毒编码的micrornas 潜伏感染 肿瘤 上皮间质转化
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EB病毒编码的潜伏膜蛋白1参与鼻咽癌恶性演进的转录调控实验研究 被引量：9
10
作者 罗非君 胡智 +4 位作者 曾亮 唐发清 顾焕华 唐敏 曹亚 《生物化学与生物物理进展》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2002年第4期567-571,共5页
探讨EB病毒潜伏膜蛋白 1(LMP1)激活激活蛋白 1(AP1) ,和核转录因子 (NF κB)在鼻咽癌细胞SUNE 1及亚细胞株恶性演进中的作用 .运用报告基因法和凝胶电泳迁移率法 (EMSA)分析AP1和NF κB反式激活活性和DNA结合活性 ,蛋白质印迹检测蛋白... 探讨EB病毒潜伏膜蛋白 1(LMP1)激活激活蛋白 1(AP1) ,和核转录因子 (NF κB)在鼻咽癌细胞SUNE 1及亚细胞株恶性演进中的作用 .运用报告基因法和凝胶电泳迁移率法 (EMSA)分析AP1和NF κB反式激活活性和DNA结合活性 ,蛋白质印迹检测蛋白质表达 ;裸鼠致瘤实验结合组织制片研究瘤细胞的成瘤和转移能力 .结果显示恶性程度不同的SUNE 1亚细胞株的反式激活活性、DNA结合活性、LMP1蛋白表达及c Jun氨基端激酶 (JNK)活性均存在明显差异 ,且与细胞恶性程度正相关 .这些结果提示LMP1活化AP1和NF κB的信号通路参与了鼻咽癌细胞SUNE 1的恶性演进过程 . 展开更多
关键词 eb病毒 编码 潜伏膜蛋白1 鼻咽癌 恶性演进 转录调控 实验研究 转录因子 转移
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重组腺相关病毒介导RNA干扰抑制EB病毒潜伏膜蛋白1对鼻咽癌细胞影响的动物试验 被引量：4
11
作者 刘雄 李刚 +3 位作者 张宝 王路 李晓华 李湘平 《南方医科大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2009年第4期611-614,618,共5页
目的探讨EB病毒(EBV)潜伏膜蛋白1(LMP-1)对于鼻咽癌细胞在体内增殖及转移能力的影响。方法设计针对EBV-LMP-1的特异性发夹状RNA(shRNA)干扰序列,构建2种重组腺相关病毒(rAAV)载体:(增强型绿色荧光蛋白,EGFP)rAAV-EGFP和rAAV-shRNA-LMP-1... 目的探讨EB病毒(EBV)潜伏膜蛋白1(LMP-1)对于鼻咽癌细胞在体内增殖及转移能力的影响。方法设计针对EBV-LMP-1的特异性发夹状RNA(shRNA)干扰序列,构建2种重组腺相关病毒(rAAV)载体:(增强型绿色荧光蛋白,EGFP)rAAV-EGFP和rAAV-shRNA-LMP-1,以不同滴度rAAV-EGFP转染鼻咽癌C666-1细胞确定最佳转染复数(MOI),rAAV-shRNA-LMP-1按MOI转染C666-1,RT-PCR鉴定抑制效率,将体外转染RNA干扰后的C666-1细胞注入裸鼠肝脏包膜下制作鼻咽癌异位肝种植的肝肺转移模型,观察肝脏成瘤及肝内、肺转移情况,分析LMP-1基因沉默在动物水平对鼻咽癌细胞成瘤及转移能力的影响。结果rAAV-EGFP以5×104v.g(virus genome,病毒基因组数)/细胞转染C666-1细胞,转染效率大于95%,RT-PCR鉴定rAAV-shRNA-LMP-1以5×104v.g/细胞转染C666-1后目的基因抑制效率大于90%,动物试验结果显示rAAV-shRNA-LMP-1组肝脏成瘤体积与对照组rAAV-EGFP无显著差异,但显著减少了种植肿瘤的肝内及肺转移率。结论通过rAAV介导RNA干扰能有效抑制LMP-1基因表达,可在动物水平抑制鼻咽癌细胞转移,但对鼻咽癌细胞生长无显著影响。 展开更多
关键词 鼻咽癌 重组腺相关病毒 rna干扰 eb病毒潜伏膜蛋白1 转移
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SARS冠状病毒RNA聚合酶编码区分析 被引量：3
12
作者 芮伟 张其鹏 +4 位作者 石磊 卢铭 景霞 国强华 尚彤 《北京大学学报（医学版）》 CAS CSCD 北大核心 2003年第B05期137-138,共2页
关键词 SARS 冠状病毒 rna 聚合酶编码区分析
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EB病毒微小RNA在鼻咽癌中的表达及意义 被引量：2
13
作者 熊伟明 范才文 +5 位作者 黄辉 王建红 李璐 向秋 田晶 雷迅 《广西师范大学学报（自然科学版）》 CAS 北大核心 2015年第1期134-138,共5页
采用实时荧光定量PCR分析EB病毒微小RNA(ebv-miR)ebv-miR-BART19-5p和ebv-miRBART21-3p在鼻咽癌和鼻咽炎症组织中的表达,以便探明其表达在EB病毒(EBV)致鼻咽癌中的内在联系和意义。结果表明,鼻咽癌组织中ebv-miR-BART19-5p和ebv-miR-BAR... 采用实时荧光定量PCR分析EB病毒微小RNA(ebv-miR)ebv-miR-BART19-5p和ebv-miRBART21-3p在鼻咽癌和鼻咽炎症组织中的表达,以便探明其表达在EB病毒(EBV)致鼻咽癌中的内在联系和意义。结果表明,鼻咽癌组织中ebv-miR-BART19-5p和ebv-miR-BART21-3p的表达水平明显高于鼻咽黏膜炎症组织。EBV可能通过ebv-miR-BART19-5p和ebv-miR-BART21-3p的表达上调介导鼻咽组织癌变,它们可能是鼻咽癌治疗的分子靶点和鼻咽癌诊断的分子标志物。 展开更多
关键词 鼻咽癌 诊断标志物 eb病毒微小rna
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单股正链RNA病毒基因组非编码区结构与功能研究进展 被引量：3
14
作者 哲名家 陈宗艳 +1 位作者 李传峰 刘光清 《中国动物传染病学报》 CAS 2012年第4期79-86,共8页
单股正链RNA病毒基因组末端的非编码区(non-coding region,NCR)不仅参与RNA-RNA间相互作用,还可以通过与反式作用因子(trans-acting factor)结合,发挥对病毒基因组的复制、转录和组装等过程的调控作用。本文对近年来一些关于单股正链RN... 单股正链RNA病毒基因组末端的非编码区(non-coding region,NCR)不仅参与RNA-RNA间相互作用,还可以通过与反式作用因子(trans-acting factor)结合,发挥对病毒基因组的复制、转录和组装等过程的调控作用。本文对近年来一些关于单股正链RNA病毒基因组非编码区的结构与功能研究进展情况进行综述。 展开更多
关键词 单股正链rna病毒 非编码区 结构 功能
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茶尺蠖小RNA病毒5′端非编码区的克隆和测序及与哺乳动物小RNA病毒的比较分析 被引量：1
15
作者 王小纯 张珈敏 +3 位作者 蒋洪 俞海洋 谭莉 胡远扬 《昆虫学报》 CAS CSCD 北大核心 2004年第5期573-578,共6页
用Trizol从纯化的茶尺蠖Ectropisoblique小RNA病毒 (EoPV)中提取病毒基因组RNA ,逆转录后加poly(dT) ,然后进行两步PCR扩增基因组 5′端。克隆测序后 ,对其 5′端非编码区的核苷酸序列进行分析 ,发现具有哺乳动物小RNA病毒的 5′端非编... 用Trizol从纯化的茶尺蠖Ectropisoblique小RNA病毒 (EoPV)中提取病毒基因组RNA ,逆转录后加poly(dT) ,然后进行两步PCR扩增基因组 5′端。克隆测序后 ,对其 5′端非编码区的核苷酸序列进行分析 ,发现具有哺乳动物小RNA病毒的 5′端非编码区的一些特征 :A T含量丰富、起始密码子上游AUG和小顺反子多。利用mfold预测了EoPV 5′端非编码区的二级结构 ,存在4个茎环结构 ,有哺乳动物内部核糖体进入位点 (IRES)的保守区域 ,即含保守基序GNRA的茎环A和A C丰富的环B及多聚嘧啶区域。据此推测EoPV基因组翻译采用IRES起始机制。 展开更多
关键词 茶尺蠖小rna病毒 哺乳动物小rna病毒 5’端非编码区 结构分析
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用3'非编码区通用引物通过RT-PCR检测登革1～4型病毒RNA 被引量：1
16
作者 段鸿元 杨佩英 +2 位作者 秦鄂德 于曼 欧武 《中国人兽共患病杂志》 CSCD 北大核心 2000年第3期5-8,共4页
目的 　根据登革病毒 (DEN) 3 端非编码区的一段高度保守序列 ,设计登革 1～ 4型通用引物 ,采用逆转录聚合酶链反应 (RT PCR)检测登革病毒 1～ 4型RNA。方法　用C6/ 3 6细胞培养登革病毒。用热酚法提取病毒RNA ,进行RT PCR扩增 ,并对... 目的 　根据登革病毒 (DEN) 3 端非编码区的一段高度保守序列 ,设计登革 1～ 4型通用引物 ,采用逆转录聚合酶链反应 (RT PCR)检测登革病毒 1～ 4型RNA。方法　用C6/ 3 6细胞培养登革病毒。用热酚法提取病毒RNA ,进行RT PCR扩增 ,并对扩增产物测序。结果　DEN 2 NGC株可扩增出至少 10TCID5 0 的病毒 ,测序结果与已知序列一致。DEN 1～ 4型标准株和DEN -2 -0 4与DEN 2 4 3株均能够扩增出唯一的一条特异条带。结论　应用通用引物RT PCR法可从病毒浓度少至 10TCID5 0 的感染细胞培养液中检出DEN 2 NGC株病毒 ,并且该对通用引物对于其他 3型登革病毒亦具有很好的通用性 ,其方法的特异性和敏感性亦较强。 展开更多
关键词 登革热病毒 RT-PCR rna 3'非编码区 序列分析
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病毒编码miRNA与宿主免疫 被引量：1
17
作者 李登云 张德礼 《中国免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2014年第4期558-561,569,共5页
MicroRNA（miRNA）是一类不编码的,长度为19～25nt的小RNA分子,通过与靶基因形成完全或者不完全互补的双链来抑制靶基因的翻译或者降解靶蛋白,也可通过调控促进蛋白表达.MiRNA首次于1993年由Ambros及其同事在模式生物线虫中发现[1],通... MicroRNA（miRNA）是一类不编码的,长度为19～25nt的小RNA分子,通过与靶基因形成完全或者不完全互补的双链来抑制靶基因的翻译或者降解靶蛋白,也可通过调控促进蛋白表达.MiRNA首次于1993年由Ambros及其同事在模式生物线虫中发现[1],通过基因组研究,证实miRNA为一种具有发卡结构的小RNA,通过与其靶标转录本3‘UTR结合抑制靶标的转录后翻译[2].本来miRNA被认为只在线虫特异性存在,后来证实这些线虫miRNA在其他的多细胞生物比如人体内保守存在[3]. 展开更多
关键词 MIrna 病毒编码 宿主免疫 rna分子 多细胞生物 模式生物 蛋白表达 小rna
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猪繁殖与呼吸综合征病毒感染Marc-145细胞的长链非编码RNA和mRNA转录组分析 被引量：2
18
作者 张小霞 杨艳青 +3 位作者 王秋云 杜俊阳 曹瀚文 梁振普 《河南农业科学》 北大核心 2023年第4期127-136,共10页
为了挖掘猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)感染Marc-145细胞后宿主细胞长链非编码RNA(lncRNA)和mRNA表达谱的变化,对PRRSV感染Marc-145细胞的lncRNA和mRNA进行转录组测序和分析。生物信息学分析结果显示,PRRSV感染后Marc-145细胞有39个差... 为了挖掘猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)感染Marc-145细胞后宿主细胞长链非编码RNA(lncRNA)和mRNA表达谱的变化,对PRRSV感染Marc-145细胞的lncRNA和mRNA进行转录组测序和分析。生物信息学分析结果显示,PRRSV感染后Marc-145细胞有39个差异表达lncRNA(DElncRNA)和1320个差异表达mRNA(DEG)。进一步的富集分析结果显示,这些DElncRNA和DEG主要富集在氧化磷酸化信号通路。DElncRNA和DEG的联合分析结果显示,与lncRNA共表达的mRNA主要富集在MAPK信号通路、胰岛素信号通路、神经营养素信号通路、AMPK信号通路、HIF-1信号通路、内质网中的蛋白质加工和碳代谢相关的信号通路,这些通路主要与宿主免疫有关。综上,PRRSV感染导致Marc-145细胞的lncRNA和mRNA表达谱均发生了改变,经生物信息学分析,推测差异表达产物可能在宿主对PRRSV感染的先天免疫反应中发挥重要作用。 展开更多
关键词 猪繁殖与呼吸综合征病毒 长链非编码rna Mrna MARC-145细胞 转录组
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反义CD40 RNA对EB病毒转化的B细胞CD40分子表达和增殖能力的影响
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作者 郑祥雄 李和军 +1 位作者 李频 周小玲 《细胞与分子免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2003年第5期506-507,510,共3页
目的 :探讨瞬时表达的反义CD4 0RNA ,对EB病毒转化的健康人B细胞膜表面CD4 0分子表达和增殖能力的影响。方法 :应用T A克隆技术和亚克隆技术 ,构建人反义CD4 0RNA的真核表达载体pcDNA3/CD4 0 ,并以其转染本室建立的EB病毒转化的健康人B... 目的 :探讨瞬时表达的反义CD4 0RNA ,对EB病毒转化的健康人B细胞膜表面CD4 0分子表达和增殖能力的影响。方法 :应用T A克隆技术和亚克隆技术 ,构建人反义CD4 0RNA的真核表达载体pcDNA3/CD4 0 ,并以其转染本室建立的EB病毒转化的健康人B细胞。应用流式细胞仪 (FACS) ,检测B细胞膜上CD4 0分子表达的变化。应用MTT比色法检测反义CD4 0RNA对B细胞增殖能力的影响。结果 :与转染空载体pcDNA3组相比 ,转染pcDNA3/CD4 0细胞上CD4 0分子的表达降低 (P<0 .0 1) ,其增殖能力明显降低 (P <0 .0 1)。结论 :反义CD4 0RNA技术 ,可作为有效的免疫调控手段。CD4 展开更多
关键词 反义rna B淋巴细胞 CD40 表达 细胞增殖 eb病毒转化
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长链非编码RNA AK005183干扰载体构建及慢病毒包装
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作者 张晓明 安俊辉 +3 位作者 万一 胡源 覃金洲 曾文先 《家畜生态学报》 北大核心 2017年第10期15-19,共5页
为研究长链非编码RNA AK005183在精子发生中的功能,设计、合成了干扰AK005183表达的shRNA序列,并构建其干扰表达重组慢病毒载体CD513B-U6-AK005183,将干扰表达质粒及对照质粒分别转染NIH3T3细胞系,实时定量PCR检测CD513B-U6-AK005183质... 为研究长链非编码RNA AK005183在精子发生中的功能,设计、合成了干扰AK005183表达的shRNA序列,并构建其干扰表达重组慢病毒载体CD513B-U6-AK005183,将干扰表达质粒及对照质粒分别转染NIH3T3细胞系,实时定量PCR检测CD513B-U6-AK005183质粒对AK005183的表达具有较好的干扰效果。利用第三代慢病毒包装系统,将CD513B-U6-AK005183、pGag-Pol、pRsv-rev、pVSV-G质粒共转染293T细胞系,包装得到滴度为5×106 TU/mL的干扰表达重组慢病毒。用CD513B-U6-AK005183慢病毒转导GC-1spg细胞系,检测到AK005183的表达下调64%。表明本研究成功构建并包装得到高效干扰长链非编码RNA AK005183表达的重组慢病毒,将为深入研究长链非编码RNA在精子发生过程中的功能奠定了基础。 展开更多
关键词 长链非编码rna AK005183 精原干细胞 rna干扰 慢病毒
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