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茄子SmMYB13基因在干旱胁迫响应中的功能
1
作者 李宇静 黄倩茹 +3 位作者 张爱冬 吴雪霞 朱栋幸 肖凯 《浙江农业学报》 北大核心 2025年第8期1666-1679,共14页
为探究茄子(Solanum melongena L.)SmMYB 13基因在干旱胁迫中的功能,从茄子中克隆转录因子SmMYB 13,进行生物信息学分析并检测干旱胁迫下该基因的表达情况。采用花序浸染法在拟南芥(Arabidopsis thaliana)中异源过表达SmMYB 13基因,分... 为探究茄子(Solanum melongena L.)SmMYB 13基因在干旱胁迫中的功能,从茄子中克隆转录因子SmMYB 13,进行生物信息学分析并检测干旱胁迫下该基因的表达情况。采用花序浸染法在拟南芥(Arabidopsis thaliana)中异源过表达SmMYB 13基因,分析转基因植株的抗旱性和脱落酸(abscisic acid,ABA)相关基因的表达。结果表明,SmMYB 13基因全长777 bp,编码258个氨基酸,属于亲水性不稳定蛋白,无信号肽和跨膜结构,主要定位于细胞核和线粒体。系统进化树分析表明,SmMYB13蛋白与马铃薯和番茄MYB13蛋白的亲缘关系较近。qRT-PCR分析显示,SmMYB 13基因在茄子根、茎、叶、果皮、花和果肉中均有表达,在果皮中的表达水平最高。干旱胁迫下,与野生型拟南芥相比,SmMYB 13基因过表达拟南芥的叶片细胞膜通透性降低,不易被甲苯胺蓝(toluidine blue,TB)染色,失水率显著下降,超氧化物歧化酶(superoxide dismutase,SOD)、过氧化物酶(peroxidase,POD)和过氧化氢酶(catalase,CAT)活性显著升高,MDA含量降低,抗旱能力增强。ABA处理下,与野生型拟南芥相比,SmMYB 13基因过表达拟南芥的ABA负调节基因表达水平上调,正调节基因表达水平下调,对ABA的敏感性降低。上述结果说明,茄子SmMYB 13基因是干旱胁迫响应因子,在茄子干旱胁迫中起正调控作用。 展开更多
关键词 茄子 转录因子 SmMYB 13基因 干旱胁迫 拟南芥
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凡纳滨对虾ATG13基因克隆及其功能分析 被引量：1
2
作者 黎国建 袁韵昊 +2 位作者 钟键 骆俊良 杨世平 《南方农业学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第5期1471-1479,共9页
【目的】克隆凡纳滨对虾(Litopenaeus vannamei)自噬相关基因13(ATG13),并分析凡纳滨对虾ATG13基因的组织表达特征及其在外源刺激后的表达变化,为探究ATG13基因在凡纳滨对虾抗病原感染过程中的作用机制提供理论依据。【方法】采用PCR扩... 【目的】克隆凡纳滨对虾(Litopenaeus vannamei)自噬相关基因13(ATG13),并分析凡纳滨对虾ATG13基因的组织表达特征及其在外源刺激后的表达变化,为探究ATG13基因在凡纳滨对虾抗病原感染过程中的作用机制提供理论依据。【方法】采用PCR扩增凡纳滨对虾ATG13基因,通过ProtParam、Softberry、SMART、InterProScan等在线软件进行生物信息学分析,并以实时荧光定量PCR检测凡纳滨对虾ATG13基因的组织表达特征及其在哈维氏弧菌(Vibrio harveyi)和Poly(I:C)刺激后的表达变化。【结果】凡纳滨对虾ATG13基因开放阅读框(ORF)为1431 bp,共编码476个氨基酸残基;凡纳滨对虾ATG13蛋白相对分子量为52.4 kD,理论等电点(pI)为5.40,属于疏水性蛋白,不存在信号肽,但其N末端存在1个ATG13功能域(第94~167位氨基酸处)。凡纳滨对虾ATG13氨基酸序列与果蝇(Drosophila melanogaster)ATG13氨基酸序列的相似性高达97%,基于ATG13氨基酸序列相似性构建的系统发育进化树也显示凡纳滨对虾与果蝇的亲缘关系最近。ATG13基因在凡纳滨对虾肝胰腺、肌肉、鳃、中肠、血细胞、心脏、脑和皮肤等组织中均有不同程度的表达,以肝胰腺中的相对表达量最高,其次是肌肉和中肠,在皮肤和血细胞中的相对表达量较低。经哈维氏弧菌和poly(I:C)刺激后,凡纳滨对虾ATG13基因在肝胰腺、中肠和鳃组织中的相对表达量整体上呈先上升后下降的变化趋势,且在刺激后12、24或48 h达最高值,极显著高于对照组(PBS)(P<0.01)。【结论】受哈维氏弧菌或poly(I:C)等外源刺激后,凡纳滨对虾通过上调自噬相关基因ATG13表达以调控机体清除受损的细胞器和维持细胞稳态,即ATG13基因参与凡纳滨对虾抗病原感染的响应过程。 展开更多
关键词 凡纳滨对虾 ATG13基因 自噬 哈维氏弧菌 Poly(I:C)
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基于ARMS-PCR技术检测SLC39A13基因核苷酸多态性方法的建立
3
作者 郭冰茜 李萌钰 +3 位作者 王瑞 王树松 冯惠勇 李天明 《河北科技大学学报》 CAS 北大核心 2024年第5期497-507,共11页
为了实现核苷酸多态性(SNP)的精准分型,针对SLC39A13基因rs755555位点,建立基于荧光定量PCR的分子诊断技术。首先,分别设计rs755555位点及内参基因peptidylprolyl isomerase A(PPIA)的Taqman荧光ARMS-PCR检测引物和探针;其次,构建阳性... 为了实现核苷酸多态性(SNP)的精准分型,针对SLC39A13基因rs755555位点,建立基于荧光定量PCR的分子诊断技术。首先,分别设计rs755555位点及内参基因peptidylprolyl isomerase A(PPIA)的Taqman荧光ARMS-PCR检测引物和探针;其次,构建阳性对照质粒;最后,以基因分型精确度为指标,优化引物探针组合,以及检测试剂的PCR反应体系和反应条件。结果表明:野生型最优引物探针组合为WF1、R1、FP1、PIRF5、PIRR5、PIRP5,突变型最优引物探针组合为FMF3、R1、FP1、PIRF5、PIRR5、PIRP5;每个检测样品的最优反应体系为SLC39A13基因上下游引物探针各0.1μL,内标上下游引物探针各0.1μL,10μL PerfectStart^(■)ⅡProbe qPCR SuperMix UDG,5.4μL纯水,4μL样品基因组。重复性实验和70个样品的检测验证,确认了检测体系的可行性,为研发SLC39A13基因rs755555位点多态性检测试剂盒提供了技术基础。 展开更多
关键词 分子生物学 人SLC39A13基因 ARMS-PCR 核苷酸多态性检测 实时荧光定量PCR
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拟南芥WRKY13基因表达载体构建及鉴定分析
4
作者 胡敏 宋慧 +3 位作者 叶敏 陈逸凡 于鑫 樊婷婷 《合肥工业大学学报（自然科学版）》 CAS 北大核心 2024年第10期1368-1371,共4页
铁是植物生长所必需的微量元素,目前植物受到缺铁胁迫的现象广泛存在,严重影响了植物的生长,减少了作物的产量。因此筛选和克隆植物缺铁胁迫耐受基因对解决农业生产问题具有极大的科学价值和现实意义。文章以拟南芥为实验材料,通过聚合... 铁是植物生长所必需的微量元素,目前植物受到缺铁胁迫的现象广泛存在,严重影响了植物的生长,减少了作物的产量。因此筛选和克隆植物缺铁胁迫耐受基因对解决农业生产问题具有极大的科学价值和现实意义。文章以拟南芥为实验材料,通过聚合酶链式反应(polymerase chain reaction,PCR)技术克隆WRKY13基因的启动子区域,成功构建了ProWRKY13∶GUS融合表达载体;利用浸花法将ProWRKY13∶GUS载体转化拟南芥,经鉴定分析后可知,获得了阳性转基因植株。对转基因植株进行缺铁诱导的GUS组织染色,实验结果为研究缺铁胁迫下WRKY13基因的功能及转录水平变化提供了重要依据。 展开更多
关键词 拟南芥 逆境胁迫 WRKY13基因 载体构建 GUS染色
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西藏绒山羊WNT4和HOXC13基因对绒毛纤维直径性状的遗传效应分析 被引量：8
5
作者 吴玉江 付雪峰 +5 位作者 索朗达 巴贵 德吉 次仁德吉 宋天增 田可川 《中国畜牧兽医》 CAS 北大核心 2020年第2期497-505,共9页
试验旨在探索WNT 4和HOXC13基因多态性及其对西藏绒山羊绒毛纤维直径性状的影响,寻找与西藏绒山羊绒毛纤维直径性状相关的分子标记。以380只1岁西藏绒山羊群体为研究对象,利用混池DNA直接测序法检测WNT 4和HOXC 13基因的SNP,利用飞行时... 试验旨在探索WNT 4和HOXC13基因多态性及其对西藏绒山羊绒毛纤维直径性状的影响,寻找与西藏绒山羊绒毛纤维直径性状相关的分子标记。以380只1岁西藏绒山羊群体为研究对象,利用混池DNA直接测序法检测WNT 4和HOXC 13基因的SNP,利用飞行时间质谱技术对SNP分型,利用SAS 9.1软件中最小二乘方差模型对SNP位点与绒毛平均纤维直径、纤维直径标准差、纤维直径变异系数进行关联分析。结果表明,WNT 4基因第3外显子区域检测到2个SNPs位点(SNP1和SNP2),HOXC 13基因第2外显子区域检测到2个SNPs位点(SNP3和SNP4),均处于中度多态(0.25<PIC<0.50)。χ2检验表明,群体中WNT 4基因的SNP1和SNP2位点均处于Hardy-Weinberg不平衡状态(P<0.05)。关联分析结果表明,4个SNPs位点均与平均纤维直径呈极显著相关(P<0.01),SNP2和SNP3与纤维直径标准差呈极显著相关(P<0.01),SNP2与纤维直径变异系数呈极显著相关(P<0.01)。综上,WNT 4和HOXC 13基因对西藏绒山羊绒毛纤维直径有显著影响,可以尝试将其SNPs位点作为影响西藏绒山羊绒毛纤维直径的分子标记之一,为超细型西藏绒山羊选育工作提供理论依据。 展开更多
关键词 西藏绒山羊 WNT4基因 HOXC13基因 纤维直径 SNP 遗传效应
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婴儿肝内胆汁淤积症SLC25A13基因突变分析 被引量：21
6
作者 张绍仁 王晓红 +2 位作者 朱启镕 刘丽艳 王建设 《中国循证儿科杂志》 CSCD 2008年第3期190-195,共6页
目的探讨SLC25A13基因突变在中国婴儿肝内胆汁淤积症患儿中的检出率,初步了解突变患儿血生化及氨基酸谱特征,肝脏活组织病理变化。方法2003年12月至2006年12月就诊于复旦大学附属儿科医院的婴儿肝内胆汁淤积症患儿,满足本研究入选条件者... 目的探讨SLC25A13基因突变在中国婴儿肝内胆汁淤积症患儿中的检出率,初步了解突变患儿血生化及氨基酸谱特征,肝脏活组织病理变化。方法2003年12月至2006年12月就诊于复旦大学附属儿科医院的婴儿肝内胆汁淤积症患儿,满足本研究入选条件者共115例进行了血氨基酸质谱分析,伴血浆瓜氨酸明显升高的患儿进行SLC25A13基因全部外显子及邻近序列测序,不伴血浆瓜氨酸明显升高的患儿进行SLC25A13基因常见突变851del4(突变Ⅰ)及突变1638ins23(突变Ⅲ)筛查,突变851del4采用实时荧光定量PCR双标记探针法检测,突变1638ins23采用PCR产物直接电泳法检测,对仅检出单个位点突变的筛查对象,继续进行其余已报道的10种突变位点检测。检测结果仍为单个杂合突变的对象进行SLC25A13基因所有外显子区及其邻近序列分析。对确诊突变患儿的临床表现、血生化及血氨基酸特征等进行分析。结果5例伴血瓜氨酸明显升高的患儿共检出突变4例,其中纯合突变851del4/851del41例,复合杂合突变851del4/1638ins231例,杂合突变851del42例;110例不伴血浆瓜氨酸明显升高患儿共检出突变6例,其中纯合突变851del4/851del41例,复合杂合突变851del4/1638ins231例,杂合突变851del44例。115例婴儿肝内胆汁淤积症患儿共检出SLC25A13基因突变10例,占8.7%。突变患儿血生化改变包括胆红素、γ-谷氨酰转移酶以及碱性磷酸酶等明显升高,AST升高较ALT明显。血串联质谱发现5例突变患儿有特征性氨基酸瓜氨酸、苏氨酸及蛋氨酸升高,另5例突变患儿并无血氨基酸改变。10例患儿中有7例行肝脏活组织病理学检查,4例有显著的脂肪变性。结论SLC25A13基因突变是中国婴儿肝内胆汁淤积症的重要原因之一。肝脏活组织病理、血生化及氨基酸谱等检查对诊断SLC25A13基因突变患儿有重要意义,但最终仍需通过基因检测确诊。 展开更多
关键词 肝内胆汁淤积 SLC25A13基因 婴儿 突变 柠檬素缺乏导致的新生儿肝内胆汁淤积症
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水稻OsDHHC13基因参与氧化胁迫响应的初步研究 被引量：4
7
作者 刘选明 王文文 +4 位作者 杨远柱 夏妙林 李夏 左栋梁 林建中 《湖南大学学报（自然科学版）》 EI CAS CSCD 北大核心 2016年第12期110-117,共8页
DHHC型锌指蛋白参与细胞内蛋白质的棕榈酰化修饰,对细胞和个体的生长发育起着重要的调控作用.OsDHHC13是典型的DHHC型锌指蛋白基因.生物信息学分析发现,OsDHHC13的启动子区域含有胁迫及光响应元件,而且其编码蛋白是具有4个跨膜结构域的... DHHC型锌指蛋白参与细胞内蛋白质的棕榈酰化修饰,对细胞和个体的生长发育起着重要的调控作用.OsDHHC13是典型的DHHC型锌指蛋白基因.生物信息学分析发现,OsDHHC13的启动子区域含有胁迫及光响应元件,而且其编码蛋白是具有4个跨膜结构域的典型膜蛋白.对OsDHHC13过表达株系进行H2O2的氧化胁迫处理发现,过表达株系幼苗的根显著长于野生型,说明OsDHHC13能解除H2O2对根生长的抑制,提高了抗氧化胁迫的能力.随后H2O2含量测定发现,OsDHHC13过表达株系幼苗根部的H2O2含量显著低于野生型.进一步的qRT-PCR分析发现,与清除H2O2相关的酶基因的转录水平在过表达株系中显著升高,说明OsDHHC13能促进清除H2O2的相关酶基因的表达,调节内源性H2O2的动态平衡.总之,本研究结果初步证明锌指蛋白基因OsDHHC13正调控水稻的抗氧化胁迫能力. 展开更多
关键词 OsDHHC13基因 H2O2含量 根长 锌指蛋白
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Citrin缺陷所致新生儿肝内胆汁淤积症SLC25A13基因突变的分子诊断 被引量：5
8
作者 乐鑫 熊小丽 +4 位作者 赵培伟 周诗琼 鄢素琪 梅红 何学莲 《临床儿科杂志》 CAS CSCD 北大核心 2014年第4期312-315,共4页
目的探讨citrin缺陷导致的新生儿肝内胆汁淤积症(NICCD)患儿的SLC25A13基因突变情况。方法选取17例确诊NICCD患儿,应用PCR-RFLP方法检测其SLC25A13基因中8种中国人最常见的突变,并结合常规实验室检查结果进行分析。结果 17例患儿中,6例... 目的探讨citrin缺陷导致的新生儿肝内胆汁淤积症(NICCD)患儿的SLC25A13基因突变情况。方法选取17例确诊NICCD患儿,应用PCR-RFLP方法检测其SLC25A13基因中8种中国人最常见的突变,并结合常规实验室检查结果进行分析。结果 17例患儿中,6例为SLC25A13基因纯合突变、3例为SLC25A13基因复合杂合突变,8例为SLC25A13基因单杂合突变。共检测出3种突变类型,分别为851del4(73.1%)、1638ins23(11.5%)和IVS6+5G>A(15.4%)。17例患儿的出生体质量偏低,存在病理性黄疸,实验室检查改变包括肝功能异常、高胆红素血症、高胆汁酸血症、低蛋白血症、低血糖、凝血功能障碍、高血乳酸和高血氨等,符合NICCD患儿的典型症状。结论 851del4、1638ins23和IVS6+5G>A为中国人SLC25A13基因的突变热点。对于检测SLC25A13基因突变PCR-RFLP方法是一项便捷可靠的NICCD分子诊断技术。 展开更多
关键词 肝内胆汁淤积症 SLC25A13基因 新生儿
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环江香猪黏附素13基因多态性及其与仔猪腹泻的相关性分析 被引量：4
9
作者 李俊 许钟峯 +4 位作者 张海航 尚月丽 孔祥峰 石德顺 刘庆友 《中国畜牧兽医》 CAS 北大核心 2016年第7期1818-1825,共8页
试验旨在对环江香猪仔猪腹泻抗性/易感的黏附素13基因(MUC13)单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)/单倍型与仔猪腹泻的相关性进行分析。试验采用高分辨率熔解曲线(high resolution melting,HRM)技术对93头环江香猪腹泻... 试验旨在对环江香猪仔猪腹泻抗性/易感的黏附素13基因(MUC13)单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)/单倍型与仔猪腹泻的相关性进行分析。试验采用高分辨率熔解曲线(high resolution melting,HRM)技术对93头环江香猪腹泻仔猪和95头健康对照仔猪进行基因分型,结合DNA测序对HRM检测结果进行验证,并通过SHEsis在线平台确定其单倍型。结果显示,环江香猪MUC13基因的G224A位等位基因分布频率在腹泻组和对照组间差异显著(P<0.05),GG、GA和GG+GA基因型分别与AA基因型相比差异均显著(P<0.05)。A112G、T170C和G164C位点各基因型频率和等位基因频率在腹泻组和对照组之间差异均不显著(P>0.05),腹泻组与对照组E位点均为野生纯合基因型。单倍型Ⅹ(GTAC)在腹泻组的分布极显著高于对照组(P<0.01)。因此,MUC13基因G224A位点和单倍型Ⅹ(GTAC)与环江香猪仔猪断奶前腹泻相关。 展开更多
关键词 环江香猪 黏附素13基因 单核苷酸多态性 单倍型 仔猪腹泻
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白介素13基因多态性与湖北汉族人群哮喘的关系 被引量：3
10
作者 习东 潘世秀 +1 位作者 崔天盆 吴健民 《中国免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2003年第11期757-760,764,共5页
目的 :为了探讨IL 13基因编码区精氨酸 (Arg) 110谷氨酰胺 (Gln)多态性是否与湖北地区汉族人群哮喘及血浆总IgE水平升高相关。方法 :采用PCR RFLP方法 ,检测湖北地区 4 3名哮喘患儿、4 5名成人哮喘患者、31名非哮喘儿童和 4 6名体检健... 目的 :为了探讨IL 13基因编码区精氨酸 (Arg) 110谷氨酰胺 (Gln)多态性是否与湖北地区汉族人群哮喘及血浆总IgE水平升高相关。方法 :采用PCR RFLP方法 ,检测湖北地区 4 3名哮喘患儿、4 5名成人哮喘患者、31名非哮喘儿童和 4 6名体检健康成人的IL 13外显子 4Arg110Gln的等位基因频率和基因型频率。用化学发光法测定血浆总IgE。结果 :IL 13基因4 2 5 7位等位基因a在儿童、成人中的频率分别为 0 39、0 32。IL 13基因Arg110Gln多态性的GlnGln型与儿童哮喘和血浆总IgE升高相关 (P分别为 0 0 30、0 0 0 0 9) ,但与成人哮喘、血浆总IgE水平之间无统计学意义 (P分别为 0 2 19、0 174 )。结论 :研究显示IL 13外显子 4Arg110Glng a单核苷酸多态性与湖北汉族儿童哮喘和血浆总IgE水平相关 ,但与成人哮喘、血浆总IgE水平之间无统计学意义。 展开更多
关键词 哮喘 免疫球蛋白E 白细胞介素13 Arg110Gln多态性 IL-13基因
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兰州大尾羊MAPK13基因cDNA克隆及生物信息学分析 被引量：2
11
作者 金方园 徐红伟 +6 位作者 达小强 臧荣鑫 柏家林 曹忻 蔡勇 冯玉兰 杨具田 《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第8期94-101,共8页
克隆兰州大尾羊促分裂素原活化蛋白激酶MAPK13基因,并分析其序列及其编码蛋白的生物学特性,为研究绵羊MAPK13基因的功能和生产应用提供参考。根据绵羊MAPK13基因CDS序列设计特异引物,利用RACE和RT-PCR技术克隆获得兰州大尾羊MAPK13基因... 克隆兰州大尾羊促分裂素原活化蛋白激酶MAPK13基因,并分析其序列及其编码蛋白的生物学特性,为研究绵羊MAPK13基因的功能和生产应用提供参考。根据绵羊MAPK13基因CDS序列设计特异引物,利用RACE和RT-PCR技术克隆获得兰州大尾羊MAPK13基因全长序列,并结合生物信息学方法分析其生物学特性。克隆获得兰州大尾羊MAPK13基因cDNA序列全长1 397 bp,其CDS区片段长1 102 bp,编码367个氨基酸。预测兰州大尾羊MAPK13蛋白分子量为42.29 kD,理论等电点为8.82,为非跨膜的疏水性蛋白,亚细胞定位主要在细胞质中,无信号肽,不属于分泌蛋白。预测其氨基酸序列有19个磷酸化位点,3个糖基化位点,3个磷酸化功能结构域,4个其他结构域,1个LCR片段,二级结构以α-螺旋为主。同源性分析显示兰州大尾羊MAPK13基因序列与已发布的绵羊MAPK13 mRNA序列(登录号:NM_001139455.1)相比,其第852位发生碱基转换(CA),导致编码蛋白第265位氨基酸发生碱基转换(ST),同时,第951位发生碱基转换(TG),但其所编码氨基酸不变。构建的基因进化树分析结果显示兰州大尾羊与牛亲缘关系最近。兰州大尾羊与其他物种MAPK13基因在结构上相似性较高,说明该基因具有高度的保守性,其序列包含的S_TKc结构域可将ATP的γ磷酰基转移到蛋白质丝氨酸/苏氨酸残基上,导致一系列肥胖相关基因的功能失调和表达变化,为进一步研究MAPK13基因与成脂分化过程的相关性提供了参考。 展开更多
关键词 兰州大尾羊 MAPK13基因 CDNA 末端快速扩增 生物信息学
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非小细胞肺癌患者血清CDH13基因甲基化检测及意义 被引量：2
12
作者 鲁德玕 刘伟 +1 位作者 姬晓青 刘姝梅 《中国癌症杂志》 CAS CSCD 北大核心 2011年第8期657-660,共4页
肺癌是全世界范围内首位肿瘤死因。由启动子异常甲基化造成的特定基因的沉默在肺癌发病机制中起重要作用。钙黏附素（cadherin）是调整上皮表型和肿瘤侵袭力的细胞黏附分子[1]。CDH13是cadherin家族的成员之一，是一个候选抑癌基因，在... 肺癌是全世界范围内首位肿瘤死因。由启动子异常甲基化造成的特定基因的沉默在肺癌发病机制中起重要作用。钙黏附素（cadherin）是调整上皮表型和肿瘤侵袭力的细胞黏附分子[1]。CDH13是cadherin家族的成员之一，是一个候选抑癌基因，在人类多种肿瘤中因启动子甲基化而沉默。 展开更多
关键词 非小细胞肺癌 CDH13基因 DNA甲基化 聚合酶链反应 血清
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大豆核因子GmNF-YA13基因的克隆及功能分析 被引量：1
13
作者 翟莹 李铭杨 +5 位作者 张军 于海伟 李珊珊 孙天国 赵艳 兰红宇 《西北农林科技大学学报（自然科学版）》 CSCD 北大核心 2023年第11期46-54,共9页
【目的】探究大豆核因子GmNF-YA13基因在大豆应对非生物胁迫中的生物学功能,为GmNF-YA13基因在抗逆育种中的应用奠定基础。【方法】以大豆北豆9号和烟草NC89的种子为供试材料,将大豆培养至第一片三出复叶展开后,分别进行干旱、高盐、低... 【目的】探究大豆核因子GmNF-YA13基因在大豆应对非生物胁迫中的生物学功能,为GmNF-YA13基因在抗逆育种中的应用奠定基础。【方法】以大豆北豆9号和烟草NC89的种子为供试材料,将大豆培养至第一片三出复叶展开后,分别进行干旱、高盐、低温和脱落酸(ABA)处理,通过实时荧光定量RT-PCR(qRT-PCR)对GmNF-YA13在以上4种非生物胁迫下的相对表达量进行检测,并对GmNF-YA13进行克隆及生物信息学分析,将GmNF-YA13转化烟草,并对转基因烟草中抗逆相关基因(NtABA2、NtOsmotin、NtAPX2、NtSOD、NtCAT1和NtCaMK3)的表达量进行qRT-PCR检测。【结果】干旱、高盐、低温和ABA处理均能不同程度诱导GmNF-YA13的表达,其中干旱胁迫和ABA处理对GmNF-YA13的诱导效果尤为显著。GmNF-YA13位于大豆基因组13号染色体,开放阅读框915 bp,编码含有304个氨基酸的蛋白质,该蛋白质分子量75.14 ku,等电点5.10。GmNF-YA13蛋白序列包含一个保守的DNA结合结构域。蛋白系统进化分析结果表明,GmNF-YA13与GmNF-YA7和拟南芥AtNF-YA1亲缘关系较近。启动子顺式作用元件预测分析结果表明,GmNF-YA13启动子区含有3个ABA响应元件ABRE、1个厌氧诱导元件ARE、1个防御和胁迫反应元件TC-rich repeats及1个干旱诱导的MYB转录因子结合位点MBS。GmNF-YA13在大豆叶片中的相对表达量最高。同时构建GmNF-YA13植物表达载体,并将GmNF-YA13转化烟草,获得3株转基因烟草植株。转基因烟草中抗逆相关基因表达量检测结果显示,转基因烟草中的NtABA2、NtOsmotin和NtAPX2相对表达量均显著高于野生型烟草,转基因烟草中NtSOD、NtCAT1和NtCaMK3的相对表达量与野生型烟草差异不显著。【结论】GmNF-YA13与大豆干旱、高盐、低温等非生物胁迫之间关系密切,GmNF-YA13可能通过促进抗逆相关基因表达量的升高以提高转基因烟草的抗逆性。 展开更多
关键词 大豆 核因子Y GmNF-YA13基因 非生物胁迫 抗逆基因 转基因烟草
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转Hoxc13基因绵羊的羊毛氨基酸组成及含硫量和含氮量分析 被引量：1
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作者 杨华 周平 +4 位作者 杨永林 刘守仁 沈敏 王新华 姬勇 《西北农业学报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第5期37-40,共4页
为评估转Hoxc13基因绵羊的羊毛化学特性,以中国美利奴(新疆军垦型)超细毛品系为对照组,转Hoxc13基因绵羊为试验组,应用水解法测定羊毛17种氨基酸,质量法测定羊毛含硫量,凯氏定氮法测量羊毛含氮量。结果表明,转Hoxc13基因绵羊的羊毛中天... 为评估转Hoxc13基因绵羊的羊毛化学特性,以中国美利奴(新疆军垦型)超细毛品系为对照组,转Hoxc13基因绵羊为试验组,应用水解法测定羊毛17种氨基酸,质量法测定羊毛含硫量,凯氏定氮法测量羊毛含氮量。结果表明,转Hoxc13基因绵羊的羊毛中天门冬氨酸、苏氨酸、丝氨酸、谷氨酸、脯氨酸、甘氨酸、丙氨酸、胱氨酸、缬氨酸、异亮氨酸、亮氨酸、酪氨酸、赖氨酸、组氨酸、苯丙氨酸和精氨酸的含量与对照组差异不显著(P>0.05),蛋氨酸的含量显著低于对照组(P<0.05),羊毛含硫量与对照组差异不显著(P>0.05),羊毛含氮量显著高于对照组(P<0.05)。以上结果说明,转Hoxc13基因绵羊的羊毛化学成分没有明显改变。 展开更多
关键词 转基因绵羊 Hoxc13基因 羊毛 氨基酸含量 含硫量 含氮量
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5-氮-2’脱氧胞苷诱导肺癌细胞系CDH13基因去甲基化及其表达 被引量：4
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作者 廖完敏 汪道文 《医药导报》 CAS 北大核心 2012年第1期5-8,共4页
目的观察去甲基化制剂5-氮-2’脱氧胞苷(5-aza-2'-deoxycytidine,5-Aza-dC)对人肺癌细胞系A549和LTEP-a2中CDH13基因启动子区甲基化状态及表达的影响,探讨肺癌细胞CDH13基因失活的机制及去甲基化制剂对CDH13基因表达的调控作用。方... 目的观察去甲基化制剂5-氮-2’脱氧胞苷(5-aza-2'-deoxycytidine,5-Aza-dC)对人肺癌细胞系A549和LTEP-a2中CDH13基因启动子区甲基化状态及表达的影响,探讨肺癌细胞CDH13基因失活的机制及去甲基化制剂对CDH13基因表达的调控作用。方法 5-Aza-dC处理体外培养的肺癌细胞A549、LTEP-a2及正常肺细胞系HFL1后,用甲基化特异性PCR(MSP)法检测处理前后细胞中CDH13基因的甲基化状态,半定量逆转录-聚合酶链反应(RT-PCR)法检测用药前后细胞中CDH13 mRNA表达的变化。结果正常肺细胞中未见CDH13启动子甲基化,肺癌细胞A549、LTEP-a2均发现CDH13启动子甲基化现象;应用5-Aza-dC能使CDH13基因启动子区CpG岛发生去甲基化。肺癌细胞A549、LTEP-a2均可见CDH13 mRNA表达,但与正常肺细胞比较表达较弱,经药物处理癌细胞后其CDH13 mRNA的表达较前明显增强。结论启动子区异常甲基化是肺癌细胞CDH13基因失活的主要原因之一,去甲基化制剂5-Aza-dC能完全逆转CDH13基因甲基化状态,从而调控CDH13基因表达。 展开更多
关键词 5-氮-2’脱氧胞苷 CDH13基因 肺癌 DNA甲基化
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中国荷斯坦牛金黄色葡萄球菌诱导型乳房炎CDH13基因甲基化分析 被引量：1
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作者 王梦琦 倪炜 +5 位作者 唐程 郭佳禾 张慧敏 李明勋 杨章平 毛永江 《中国畜牧兽医》 CAS 北大核心 2018年第7期1926-1932,共7页
为探索钙黏蛋白13基因(cadherin 13,CDH13)甲基化在奶牛金黄色葡萄球菌乳房炎中的调控机制,本试验在已建立的金黄色葡萄球菌诱导型荷斯坦牛乳房炎模型的基础上利用重亚硫酸盐测序技术(bisulfite sequencing PCR,BSP)检测正常乳腺组织和... 为探索钙黏蛋白13基因(cadherin 13,CDH13)甲基化在奶牛金黄色葡萄球菌乳房炎中的调控机制,本试验在已建立的金黄色葡萄球菌诱导型荷斯坦牛乳房炎模型的基础上利用重亚硫酸盐测序技术(bisulfite sequencing PCR,BSP)检测正常乳腺组织和乳房炎乳腺组织候选基因CDH13的甲基化程度,并分析其甲基化程度与基因表达水平的关系。结果显示,除金黄色葡萄球菌致病组(试验组)第12个CpG岛外,其余所有CpG岛均呈现不同程度的甲基化:-259处甲基化水平最高(50%~60%),-144、-135和-126处甲基化均较低,为5%左右。试验组和对照组总体甲基化率分别为10.13%±1.81%和14.43%±0.55%,不同位点和总体甲基化率无显著差异(P>0.05)。与正常乳腺组织相比,乳房炎感染组乳腺组织CDH13基因表达上调,CDH13基因-162和-93两个CpG岛甲基化水平与其基因表达呈显著负相关(P<0.05)。本试验结果表明,CDH13基因甲基化影响其基因表达,从而影响乳房炎的发生,为进一步探索其在金黄色葡萄球菌致病型乳房炎中的发病机制提供了参考依据。 展开更多
关键词 CDH13基因 乳房炎 甲基化 中国荷斯坦牛
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白细胞介素-13基因错义突变rs20541C/T多态性在广西人群中的分布
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作者 王荣 陆玉兰 +5 位作者 黄华佗 覃海媚 蓝艳 王俊利 刘纯宏 韦叶生 《中国免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2017年第11期1682-1684,1688,共4页
目的:分析IL-13基因rs20541C/T位点多态性在广西人群中的分布特点,同时比较其在不同种群之间的分布差异。方法:采用多重单碱基延伸技术(SNa Pshot)和DNA直接测序法对275例广西人群IL-13基因rs20541C/T进行分型,并分析其基因型及等位基... 目的:分析IL-13基因rs20541C/T位点多态性在广西人群中的分布特点,同时比较其在不同种群之间的分布差异。方法:采用多重单碱基延伸技术(SNa Pshot)和DNA直接测序法对275例广西人群IL-13基因rs20541C/T进行分型,并分析其基因型及等位基因的分布频率。检测结果与NCBI中人类基因组国际单体图(Hap Map)公布的其他种群(欧洲人、北京人、日本人、非洲人)和文献报道的天津人的基因型及等位基因数据进行比较。结果:IL-13基因rs20541C/T在广西人群中具有多态性,CC、CT和TT基因型频率分别为40.0%、46.2%、13.8%,C和T等位基因频率分别为63.1%、36.9%。其基因型及等位基因的分布频率在男女性别之间差异无统计学意义(P>0.05),其基因型与欧洲、非洲、天津人群作比较,差异有统计学意义(P<0.05),等位基因分布频率与这5种人群相比,差异有统计学意义(P<0.05)。结论:IL-13基因rs20541C/T基因多态性在不同种族和地区间存在着不同程度差异。 展开更多
关键词 IL-13基因 多态性 错义突变 种族
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CDH13基因在食管癌细胞株EC1和EC109中的甲基化研究
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作者 景钊 邹长林 邓霞 《实用医学杂志》 CAS 北大核心 2011年第17期3097-3099,共3页
目的:探讨食管癌细胞中CDH13基因启动子区甲基化状态,以及5-杂氮-2′-脱氧胞苷(5-Aza-CdR)作用对CDH13基因甲基化状态及其表达的影响。方法:5-Aza-CdR处理前后分别采用甲基化特异性PCR(MSP)检测食管癌细胞EC1和EC109中CDH13基因启动子... 目的:探讨食管癌细胞中CDH13基因启动子区甲基化状态,以及5-杂氮-2′-脱氧胞苷(5-Aza-CdR)作用对CDH13基因甲基化状态及其表达的影响。方法:5-Aza-CdR处理前后分别采用甲基化特异性PCR(MSP)检测食管癌细胞EC1和EC109中CDH13基因启动子区甲基化状态,Western blot检测CDH13蛋白表达水平的变化。结果:CDH13基因在EC1中呈半甲基化,在EC109中呈完全甲基化。5-Aza-CdR可逆转食管癌细胞中CDH13基因甲基化,恢复其蛋白的表达。结论:CDH13基因异常甲基化可能是其在食管癌中失活的重要方式,应用5-Aza-CdR可逆转甲基化状态,并恢复CDH13表达。 展开更多
关键词 食管肿瘤 CDH13基因 甲基化
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Hoxc13基因在苏博美利奴羊胎羔生长发育期不同组织中的表达分析 被引量：5
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作者 杜建文 何军敏 +8 位作者 陈春艳 田月珍 徐新明 付雪峰 哈尼克孜·吐拉甫 赵冰茹 朱桦 黄锡霞 田可川 《新疆农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2019年第5期936-944,共9页
【目的】分析苏博美利奴羊不同组织中Hoxc13基因mRNA的表达量差异,为分子标记辅助育种以及,研究细毛羊主要经济性状,奠定理论基础。【方法】使用RT-PCR技术检测Hoxc13基因在苏博美利奴羊65和135d皮肤、肌肉和不同内脏组织(心脏、脾脏、... 【目的】分析苏博美利奴羊不同组织中Hoxc13基因mRNA的表达量差异,为分子标记辅助育种以及,研究细毛羊主要经济性状,奠定理论基础。【方法】使用RT-PCR技术检测Hoxc13基因在苏博美利奴羊65和135d皮肤、肌肉和不同内脏组织(心脏、脾脏、肝脏、肺脏、肾脏)中mRNA的表达量,并采用相对定量法对其表达量进行统计分析。【结果】在苏博美利奴羊皮肤、肌肉和不同内脏组织中均有Hoxc13基因的表达,并且在皮肤中的表达量显著高于其它组织(P<0.05),毛囊的形成和毛发生长与Hoxc13基因密切相关。【结论】建立了胎龄分别在65和135d的苏博美利奴羊,其不同组织中适于定量检测的Hoxc13基因表达量的RT-PCR方法,从分子水平探讨了苏博美利奴羊的组织器官与Hoxc13基因表达之间的内在联系。 展开更多
关键词 苏博美利奴羊 RT-PCR 组织 Hoxc13基因
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IL-13基因+2044G/A多态性与儿童哮喘风险和血清IL-13水平的相关性研究 被引量：9
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作者 丁宝栋 王明伟 +2 位作者 赵月华 李海波 魏守刚 《临床儿科杂志》 CAS CSCD 北大核心 2016年第11期838-841,共4页
目的：探讨IL-13基因＋2044 G/A多态性与儿童哮喘发病风险及哮喘儿童血清IL-13水平的关系。方法采用PCR-RFLP和ELISA方法，对90例支气管哮喘患儿（哮喘组）和82例健康儿童（对照组）IL-13基因＋2044 G/A多态性和血清IL-13水平进行检测... 目的：探讨IL-13基因＋2044 G/A多态性与儿童哮喘发病风险及哮喘儿童血清IL-13水平的关系。方法采用PCR-RFLP和ELISA方法，对90例支气管哮喘患儿（哮喘组）和82例健康儿童（对照组）IL-13基因＋2044 G/A多态性和血清IL-13水平进行检测，计算基因型、等位基因频率及其所对应的血清IL-13水平。结果哮喘组和对照组IL-13＋2044G/A多态性3种基因型的分布差异有统计学意义（P＜0.001）；与GG基因型比较，GA基因型儿童哮喘风险增加3.52倍（95%CI：1.82-6.82），AA基因哮喘风险增加3.71倍（95%CI：1.06-12.97）。哮喘组A等位基因频率为36.1%，高于对照组的18.3%，差异有统计学意义（P＜0.001）。与G等位基因比较，A等位基因携带儿童哮喘风险增加2.53倍（95%CI：1.53-4.16）。哮喘组患儿血清IL-13水平为151.82（134.33-166.68）ng/L，对照组为79.00（58.74-111.09）ng/L，两组差异有统计学意义（P＜0.001）。哮喘组GG、GA和AA基因型的血清IL-13水平均分别高于对照组，差异有统计学意义（P均＜0.01）。哮喘组GG、GA和AA 3种基因型之间血清IL-13水平的差异也有统计学意义（P＜0.01），其中GA和AA基因型血清IL-13水平高于GG基因型。结论 IL-13基因＋2044 G/A多态性与支气管哮喘儿童血清IL-13水平具有关联性，且A等位基因可能造成了哮喘儿童血清高IL-13水平，携带A等位基因的儿童哮喘风险增加。 展开更多
关键词 IL-13基因多态性 血清IL-13 哮喘 儿童
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