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锚蛋白重复序列介导的蛋白质-蛋白质相互作用 被引量:14
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作者 杜海宁 胡红雨 《生物化学与生物物理进展》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2002年第1期6-9,共4页
锚蛋白重复序列 (ANK)是生物体中广泛利用的一种序列模体 .ANK模体在ANK结构域中折叠成 β2 α2结构 ,在空间上则形成 L 型结构 .数目不等的ANK串联起来 ,依靠氢键和疏水相互作用 ,组成紧密、稳定的结构域 ,并且形成了种类众多但功能各... 锚蛋白重复序列 (ANK)是生物体中广泛利用的一种序列模体 .ANK模体在ANK结构域中折叠成 β2 α2结构 ,在空间上则形成 L 型结构 .数目不等的ANK串联起来 ,依靠氢键和疏水相互作用 ,组成紧密、稳定的结构域 ,并且形成了种类众多但功能各异的ANK蛋白质分子 .ANK结构域介导蛋白质与蛋白质的相互作用 ,它能够和多种配体结合 ,实现纷繁复杂的生物功能 .着重介绍几类结构已知的ANK家族蛋白质分子及复合物的结构特征、生理功能及与疾病的关系 . 展开更多
关键词 锚蛋白重复序列 ANK结构域 蛋白质相互作用 疾病
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痘病毒锚蛋白重复序列蛋白对NF-кB信号通路的影响 被引量:3
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作者 陈轶霞 龙玲 骆学农 《中国免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2017年第5期765-768,772,共5页
痘病毒科(Poxviridae)病毒是在细胞质中复制的双链DNA病毒,拥有130 kb~〉350 kb的基因组。分为两个亚科:脊椎动物痘病毒亚科(Chordopoxvirinae)和昆虫痘病毒亚科(Entomopo-xvirinae)。脊椎动物痘病毒亚科包含10个属。痘病毒间... 痘病毒科(Poxviridae)病毒是在细胞质中复制的双链DNA病毒,拥有130 kb~〉350 kb的基因组。分为两个亚科:脊椎动物痘病毒亚科(Chordopoxvirinae)和昆虫痘病毒亚科(Entomopo-xvirinae)。脊椎动物痘病毒亚科包含10个属。痘病毒间的基因组结构有很高的相似性,病毒DNA复制和转录所必需的基因以及涉及病毒粒子形态和结构的基因位于基因组高度保守的中间区域。基因组的末端区域在不同的属间呈现很大的多样性,包括一些属或种特异性基因以及感染和毒力相关基因。 展开更多
关键词 痘病毒科 锚蛋白重复序列 信号通路 基因组结构 双链DNA病毒 DNA复制 毒力相关基因 脊椎动物
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丹参锚蛋白重复序列家族基因的克隆和表达分析 被引量:2
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作者 张璇 库里满·恰里甫 +1 位作者 武玉翠 王喆之 《陕西师范大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2013年第4期63-66,共4页
用降落PCR的方法获得了丹参锚蛋白重复序列家族基因(SmARP).生物信息学显示,SmARP所编码蛋白的分子质量为19,064kD,理论等电点为8.4,是一种不稳定而且无信号肽和无跨膜区域的蛋白.该蛋白的二级结构中主要存在α螺旋(39.64%)和无规卷曲(4... 用降落PCR的方法获得了丹参锚蛋白重复序列家族基因(SmARP).生物信息学显示,SmARP所编码蛋白的分子质量为19,064kD,理论等电点为8.4,是一种不稳定而且无信号肽和无跨膜区域的蛋白.该蛋白的二级结构中主要存在α螺旋(39.64%)和无规卷曲(42.01%),其三维结构模型中每个锚蛋白重复序列折叠成两个反向平行的α-螺旋,每两个α-螺旋中间形成一个长环.实时荧光定量PCR结果显示,该基因在丹参的根、茎、叶、花中均有表达. 展开更多
关键词 丹参 锚蛋白重复序列家族基因 生物信息学分析
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锚蛋白重复序列3基因在早发性精神分裂症发生过程中的作用 被引量:4
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作者 袁爱花 易正辉 +8 位作者 孙锦华 杜亚松 张晨 李则挚 张燕霞 汪东祥 刘漪 范娟 禹顺英 《中国神经精神疾病杂志》 CAS CSCD 北大核心 2012年第6期354-357,共4页
目的探讨锚蛋白重复序列3(Ankyrin repeat 3,ANK3)基因在早发性精神分裂症发生过程中的作用。方法采用TaqMan探针等位基因分型技术检测310例早发性精神分裂症患者和399例健康对照ANK3基因rs10761482位点多态性,分析该位点与早发性精神... 目的探讨锚蛋白重复序列3(Ankyrin repeat 3,ANK3)基因在早发性精神分裂症发生过程中的作用。方法采用TaqMan探针等位基因分型技术检测310例早发性精神分裂症患者和399例健康对照ANK3基因rs10761482位点多态性,分析该位点与早发性精神分裂症的关联及其与发病年龄的关系,并调查患者母亲怀孕早期的环境因素,进一步分析ANK3基因与环境因素的交互作用。结果患者组与对照组ANK3基因rs10761482位点的基因型频率组间差异无统计学意义(x2=5.410,P=0.067),而患者组rs10761482 C等位基因频率高于对照组,有统计学意义(83.06%vs.78.07%,P=0.019);携带rs10761482 C等位基因患者发病年龄(13.7±0.1岁)明显早于不携带C等位基因患者发病年龄(16.1±0.3岁)(P=0.028);未发现ANK3基因与环境因素间之间存在交互作用(P>0.05)。结论 ANK3基因与早发性精神分裂症存在关联,其rs10761482多态位点可能是导致患者发病年龄提前的重要因素。 展开更多
关键词 早发性精神分裂症 锚蛋白重复序列3基因 发病年龄 交互作用
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精神分裂症锚蛋白重复序列3基因多态性及表达研究 被引量:1
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作者 冉柳毅 程宇琪 +4 位作者 董成龙 姜红燕 吴桂霞 杨舒然 许秀峰 《中国神经精神疾病杂志》 CAS CSCD 北大核心 2016年第9期542-546,共5页
目的探讨锚蛋白重复序列3(ankyrin repeat 3,ANK3)基因多态性和基因表达与精神分裂症的关系。方法采用Taq Man探针等位基因分型技术对456例中国汉族精神分裂症患者(患者组)和495名正常对照者(对照组)ANK3基因多态性位点rs10994336、rs10... 目的探讨锚蛋白重复序列3(ankyrin repeat 3,ANK3)基因多态性和基因表达与精神分裂症的关系。方法采用Taq Man探针等位基因分型技术对456例中国汉族精神分裂症患者(患者组)和495名正常对照者(对照组)ANK3基因多态性位点rs10994336、rs10994359进行基因分型,并对基因型、等位基因、单体型频率进行比较;然后采用Taq Man探针及实时荧光定量PCR方法检测另外30例急性期精神分裂症患者和26名正常对照外周血ANK3基因m RNA的表达水平。结果患者组与对照组rs10994336和rs10994359基因型、等位基因频率分布的差异无统计学意义(P>0.05)。单体型分析显示,由rs10994336-rs10994359组成单体型C-C、C-T、T-C的频率分布在患者组与对照组间差异无统计学意义(P>0.05)。与对照组相比,急性期精神分裂症患者外周血ANK3基因的m RNA表达水平略高,但差异无统计学意义(P>0.05)。结论本研究未发现ANK3基因位点rs10994336、rs10994359多态性与精神分裂症的关联,急性期精神分裂症患者外周血中ANK3基因的表达水平未见异常。 展开更多
关键词 精神分裂症 锚蛋白重复序列3基因 多态性 基因表达
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猪锚蛋白重复序列和SOCS盒蛋白基因4与生长因子受体结合蛋白基因10的克隆及印迹状态分析
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作者 周洋 朱江 +3 位作者 焦明霞 王加强 孔庆然 刘忠华 《中国畜牧兽医》 CAS 北大核心 2013年第8期1-7,共7页
本试验采用单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)直接测序法检测猪锚蛋白重复序列和SOCS盒蛋白基因4(ankyrin repeat and SOCS box containing protein 4,Asb4)与生长因子受体结合蛋白基因10(growth factor recep-tor-bo... 本试验采用单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)直接测序法检测猪锚蛋白重复序列和SOCS盒蛋白基因4(ankyrin repeat and SOCS box containing protein 4,Asb4)与生长因子受体结合蛋白基因10(growth factor recep-tor-bound protein 10,Grb10)在不同组织器官中的印迹状态。首先,克隆得到了1350bp的Asb4基因cDNA序列及1811bp的Grb10基因cDNA序列,然后进行了SNP直接测序法检测。结果发现,Asb4在1月龄仔猪所有检测组织器官中均为双等位基因表达,而Grb10在1月龄仔猪的舌、肾脏、胃、小肠和脑中为父源等位基因表达,在其他组织器官中为双等位基因表达。实时定量PCR结果表明,Grb10在10种组织器官中的表达量存在显著性差异(P<0.05),其中在肺脏组织中的表达量最高,在小肠和脑中表达量最低。上述结果表明,Grb10可能是猪父源表达的印迹基因,而Asb4则属于猪非印迹基因。 展开更多
关键词 锚蛋白重复序列和SOCS盒蛋白基因4 生长因子受体结合蛋白基因10 单核苷酸多态性 印迹基因
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烟草富含锚蛋白重复结构域基因Nbar的克隆及序列分析 被引量:1
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作者 吴田 谢从华 《西南林学院学报》 2010年第1期38-41,共4页
根据1个已报道的马铃薯富含锚蛋白重复结构域基因Star的全长cDNA序列,分别在含有起始密码子和终止密码子处设计基因特异引物,从感染了晚疫病原菌的本氏烟草叶片cDNA中克隆得到1个新的基因Nbar。此基因包含1个最大为1 539 bp的阅读框,与S... 根据1个已报道的马铃薯富含锚蛋白重复结构域基因Star的全长cDNA序列,分别在含有起始密码子和终止密码子处设计基因特异引物,从感染了晚疫病原菌的本氏烟草叶片cDNA中克隆得到1个新的基因Nbar。此基因包含1个最大为1 539 bp的阅读框,与Star的碱基一致性达到90%。该基因编码513个氨基酸,序列中存在6个锚蛋白重复结构域和1个环指结构域。Nbar已提交GenBank,登录号为1231763。 展开更多
关键词 Nbar 本氏烟草 锚蛋白重复序列模体 环指 同源基因
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植物锚蛋白研究进展 被引量:4
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作者 吴利民 李东屏 《生物技术通报》 CAS CSCD 2005年第6期7-11,共5页
锚蛋白重复序列模体是生物体内最普遍的蛋白质序列模体之一,在多种细胞活动中主要介导蛋白质-蛋白质的相互作用。综述了近年来有关锚蛋白参与植物信号传导的研究进展。
关键词 锚蛋白重复序列模体 结构城 蛋白质相互作用 防卫反应
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辅助蛋白基因的剪接对磷脂酶A1酶活的影响
9
作者 杨蒙 薛正莲 +3 位作者 甘玉飞 周杰 王洲 刘艳 《食品科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2021年第6期104-110,共7页
为探究磷脂酶A1辅助蛋白(phospholipase A1 accessory protein,PlaS)对磷脂酶A1(phospholipase A1,PlaA1)酶活关键调控区域,根据PlaS的结构特点,设计出截短突变体,利用聚合酶链式反应技术将PlaA1与PlaS共表达基因plaB中编码辅助蛋白的基... 为探究磷脂酶A1辅助蛋白(phospholipase A1 accessory protein,PlaS)对磷脂酶A1(phospholipase A1,PlaA1)酶活关键调控区域,根据PlaS的结构特点,设计出截短突变体,利用聚合酶链式反应技术将PlaA1与PlaS共表达基因plaB中编码辅助蛋白的基因plaS进行了剪接,并对各截短菌株进行酶活检测和酶学性质分析。结果表明:PlaS属于锚蛋白(ankyrin,ANK)家族,主要由N端域、ANK结构域、C端域三部分组成,其中ANK结构域包含4个典型的ANK重复序列(ANK repeat)。从构建的5株截短菌株中筛选出了2株胞外酶活相对较高的菌株AN-3与AN-4,与未截短菌株BP28相比,比酶活分别提高了73%和78%,催化效率(K_(cat)/K_(m))分别提高了216%和211%,而最适温度(45℃)和最适pH值(6.0)没有发生变化。K_(cat)/K_(m)的结果显示,在所有的截短菌株中AN菌株的催化效率最低。plaS剪接结果表明,PlaS的ANK结构域至少需要3个ANK repeat才会对PlaA1酶活表现为胞外促进作用,PlaS的C端域对维持PlaA1的结构稳定性起到重要的作用,研究为揭示PlaS对PlaA1的调控机制提供了理论基础。 展开更多
关键词 磷脂酶A1 磷脂酶A1辅助蛋白 锚蛋白重复序列 基因剪接 酶学性质 分子截短
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茶树EGCG合成过程相关的Ankyrin基因的克隆与表达分析 被引量:1
10
作者 郑世仲 林玉玲 +2 位作者 孙平 赖钟雄 林金科 《热带作物学报》 CSCD 北大核心 2016年第7期1332-1340,共9页
运用RACE技术,从茶树新品系"1005"嫩芽中克隆出Ankyrin基因全长c DNA(2 034 bp),5′UTR和3′UTR分别为353 bp和55 bp,编码541个氨基酸,命名为CS-Ankyrin。基因全长序列在线blast比对分析结果表明,该基因与葡萄、蓖麻、可可和... 运用RACE技术,从茶树新品系"1005"嫩芽中克隆出Ankyrin基因全长c DNA(2 034 bp),5′UTR和3′UTR分别为353 bp和55 bp,编码541个氨基酸,命名为CS-Ankyrin。基因全长序列在线blast比对分析结果表明,该基因与葡萄、蓖麻、可可和杨树的Ankyrin序列的一致性分别为78%、78%、77%和77%。生物信息学分析显示,CS-Ankyrin锚蛋白重复序列是由5个ANK单元组成,该蛋白是定位在质膜上起作用的跨膜疏水蛋白,但疏水性较差;系统进化树分析表明,该基因编码的氨基酸与芝麻的亲缘关系最为接近。比较CS-Ankyrin在不同发育阶段叶片的表达和EGCG含量变化结果表明,CS-Ankyrin基因在3个品系不同样品的表达趋势与其EGCG含量变化趋势一致,芽头>二叶>四叶;亚细胞定位试验结果表明,CS-Ankyrin蛋白定位在细胞膜上起作用。推测该蛋白可能参与EGCG的储存和跨膜运输。 展开更多
关键词 茶树 锚蛋白重复序列 生物信息学 EGCG 亚细胞定位
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敲低ASAP1降低结核分枝杆菌感染小鼠RAW264.7细胞的迁移能力
11
作者 崔佳 温炟 +1 位作者 王玉环 吴长新 《细胞与分子免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2019年第12期1064-1068,共5页
目的观察含SH3结构域-ADP-核糖基化因子(Arf)GTP酶激活蛋白-锚蛋白重复序列和PH结构域1(ASAP1)介导小鼠RAW264.7巨噬细胞对结核分枝杆菌感染过程的影响以及ASAP1对巨噬细胞迁移能力的影响。方法建立ASAP1敲低的RAW264.7细胞系,感染结核... 目的观察含SH3结构域-ADP-核糖基化因子(Arf)GTP酶激活蛋白-锚蛋白重复序列和PH结构域1(ASAP1)介导小鼠RAW264.7巨噬细胞对结核分枝杆菌感染过程的影响以及ASAP1对巨噬细胞迁移能力的影响。方法建立ASAP1敲低的RAW264.7细胞系,感染结核分枝杆菌H37Ra后,利用荧光共聚焦显微镜和平板计数方法对胞内细菌的载量进行检测,采用TranswellTM法检测ASAP1敲低细胞的迁移能力。结果与对照组细胞相比,ASAP1敲低的RAW264.7细胞感染H37Ra后胞内细菌载量增多,且细胞迁移能力降低。结论敲低ASAP1降低RAW264.7细胞的迁移能力。 展开更多
关键词 含SH3结构域-Arf GTP酶激活蛋白-锚蛋白重复序列和PH结构域1(ASAP1) 敲低 RAW264.7细胞 结核分枝杆菌 细胞迁移
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