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基于转录因子的生物传感器研究进展 被引量：1
1
作者 赵梅 罗佳璐 +4 位作者 王震 周海星 杨爽黎 商洁 齐向辉 《食品与发酵工业》 CAS CSCD 北大核心 2024年第12期362-369,共8页
转录因子的生物传感器(transcription-factor-based biosensors,TFBBs)作为一种重要的合成生物学工具,在高通量筛选、适应性进化、动态调控等方面具有重要作用。然而,天然的TFBBs由于灵敏度低、专一性差、响应慢等无法满足当前的应用需... 转录因子的生物传感器(transcription-factor-based biosensors,TFBBs)作为一种重要的合成生物学工具,在高通量筛选、适应性进化、动态调控等方面具有重要作用。然而,天然的TFBBs由于灵敏度低、专一性差、响应慢等无法满足当前的应用需求。为应对上述挑战,该文简述了TFBBs的分类及其原理,重点介绍了TFBBs的性能调节策略,包括利用定向进化、蛋白质工程等策略优化生物传感器的灵敏度、特异性、检测范围和动态范围;总结了TFBBs在高通量筛选、适应性进化及动态调控方面的应用,讨论了TFBBs在实际应用中可能面临的机遇和挑战,并对其发展趋势进行了展望,指出了合成生物学的高速发展将促进生物传感器应用于更广泛的领域。 展开更多
关键词 转录因子的生物传感器 性能调节 高通量筛选 适应性进化 动态调控
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花生疮痂病菌次生代谢基因簇特异性转录因子挖掘及EaPSTF1生物信息学分析
2
作者 张凌萱 朴静子 +3 位作者 刘丹 郝婧文 李自博 周如军 《中国油料作物学报》 北大核心 2025年第2期356-362,共7页
痂囊腔菌素(Elsinchrome,ESC)是花生疮痂病菌产生的一种具有光敏活性的苝醌类真菌毒素,为病菌的毒力因子。为了进一步揭示ESC生物合成的调控网络,在全基因组测序分析基础上,开展了病菌次生代谢基因簇特异性转录因子的挖掘、EaPSTF1基因... 痂囊腔菌素(Elsinchrome,ESC)是花生疮痂病菌产生的一种具有光敏活性的苝醌类真菌毒素,为病菌的毒力因子。为了进一步揭示ESC生物合成的调控网络,在全基因组测序分析基础上,开展了病菌次生代谢基因簇特异性转录因子的挖掘、EaPSTF1基因克隆、生物信息学和表达分析。结果表明,病菌次生代谢基因簇上共有3个特异性转录因子,其中EaPSTF1全长1305 bp,含有一个完整的开放阅读框,编码长度为434个氨基酸的蛋白质,分子量110.58 kD,理论等电点4.94,亚细胞定位细胞核中,是一个以α-螺旋为主的亲水性蛋白,含有GAL4和AFLR两个Zn(II)2Cys6型结构域。RT-qPCR定量分析表明,EaPSTF1表达模式与毒素累积趋势基本一致,EaPSTF1可能参与ESC毒素的生物合成调控。 展开更多
关键词 花生疮痂病菌 特异性转录因子 基因克隆 生物信息学分析 次生代谢基因簇
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NST转录因子对木质素生物合成调控的研究进展
3
作者 杨梦情 李新艺 吴培清 《南方农业》 2025年第3期85-89,共5页
木质素是高等陆生植物细胞壁的主要结构成分,除了加强细胞壁,还对植物直立生长、水分运输十分重要,并起着天然物理屏障作用,可以抵御生物和非生物胁迫。植物木质素的合成是一个复杂的生化过程。主要介绍了木质素生物合成途径中转录因子... 木质素是高等陆生植物细胞壁的主要结构成分,除了加强细胞壁,还对植物直立生长、水分运输十分重要,并起着天然物理屏障作用,可以抵御生物和非生物胁迫。植物木质素的合成是一个复杂的生化过程。主要介绍了木质素生物合成途径中转录因子NST对木质素生物合成的功能及研究进展。通过对NST转录因子进行梳理,以期能更好地理解NST转录因子在植物木质素生物合成过程中的作用,为今后木质素的研究及应用奠定理论基础。 展开更多
关键词 木质素 生物合成 NST转录因子
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双孢蘑菇中一种4R型MYB转录因子的基因克隆和生物信息学分析
4
作者 刘翔 赵紫璇 +5 位作者 赵月盈 赵诗睿 贾子怡 姜含越 袁帅 孟德梅 《食品研究与开发》 CAS 2024年第2期185-194,共10页
MYB转录因子广泛存在于真核生物中,在植物的生长发育、逆境胁迫等过程中发挥重要作用。与植物相比,对食用菌中MYB转录因子的研究有限。为探究MYB转录因子在食用菌中的生物学功能,对前期转录组发现的一个编码双孢蘑菇(Agaricus bisporus)... MYB转录因子广泛存在于真核生物中,在植物的生长发育、逆境胁迫等过程中发挥重要作用。与植物相比,对食用菌中MYB转录因子的研究有限。为探究MYB转录因子在食用菌中的生物学功能,对前期转录组发现的一个编码双孢蘑菇(Agaricus bisporus)MYB转录因子的基因进行克隆和生物信息学分析。结果表明,该基因编码区长1209 bp,翻译402个氨基酸;编码的蛋白分子量为45.95 kDa,等电点9.17,是一种不存在跨膜结构、不含信号肽的亲水性蛋白,具有4个高度保守的SANT结构域,属于4R型MYB转录因子,与白环蘑(Leucoagaricus)中的4RMYB转录因子亲缘关系最近;二级结构预测显示以无规则卷曲和α-螺旋结构为主;亚细胞定位分析显示该转录因子位于细胞核中;此外启动子序列分析表明,该基因启动子区域含有多个与生物抗逆应答、激素响应等相关的顺式作用元件。 展开更多
关键词 双孢蘑菇 MYB转录因子 基因克隆 生物信息学分析 保守结构域
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黄瓜WIP转录因子家族基因的鉴定及表达分析
5
作者 韩瑞月 刘晓林 +3 位作者 辛同旭 李森 杨学勇 孙进京 《中国蔬菜》 北大核心 2025年第2期44-55,共12页
WIP蛋白属于C2H2锌指蛋白的A1d亚组,目前研究发现CsWIP1在黄瓜中参与性别决定,但WIP基因在黄瓜生长发育过程中仍存在未知的功能。在黄瓜、甜瓜、西瓜、冬瓜、葫芦和美洲南瓜中鉴定出40个WIP基因家族成员。利用在线网站对葫芦科WIP蛋白... WIP蛋白属于C2H2锌指蛋白的A1d亚组,目前研究发现CsWIP1在黄瓜中参与性别决定,但WIP基因在黄瓜生长发育过程中仍存在未知的功能。在黄瓜、甜瓜、西瓜、冬瓜、葫芦和美洲南瓜中鉴定出40个WIP基因家族成员。利用在线网站对葫芦科WIP蛋白进行理化性质分析,通过生物信息学进行染色体定位、基因结构等分析。对黄瓜WIP基因的顺式元件进一步分析表明,WIP家族基因具有空间表达、植物激素、光响应元件等顺式作用元件。黄瓜不同组织的实时荧光定量PCR分析发现,CsaV3_1G014730和CsaV3_4G031370可能在黄瓜的顶芽发育中发挥重要作用;CsaV3_4G024150(CsWIP1)、CsaV3_3G039140、CsaV3_7G031140和CsaV3_5G023030则可能参与雌花、雄花、传输通道以及雄配子的生长发育,推测WIP基因可能在黄瓜传输通道发育、叶脉模式调控等过程中起着重要的作用。 展开更多
关键词 黄瓜 WIP基因家族 转录因子 生物信息学分析 组织表达模式
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利用压电生物传感器研究核因子NF-κB与其特异结合DNA的相互作用
6
作者 张波 闫慧慧 +2 位作者 蒋滢 罗阳 府伟灵 《分析测试学报》 CAS CSCD 北大核心 2009年第4期385-388,393,共5页
设计并合成了核因子NF—κB的特异结合DNA序列探针，在其5’端巯基化修饰后固定在基频10MHz的石英晶体金膜表面，构建压电DNA-蛋白质相互作用生物传感器，研究了传感器的响应特性及NF-κB的p65蛋白亚基与其特异DNA结合的亲和常数Ka。DN... 设计并合成了核因子NF—κB的特异结合DNA序列探针，在其5’端巯基化修饰后固定在基频10MHz的石英晶体金膜表面，构建压电DNA-蛋白质相互作用生物传感器，研究了传感器的响应特性及NF-κB的p65蛋白亚基与其特异DNA结合的亲和常数Ka。DNA探针浓度在0．25—2．0μmol／L范围内，随着探针浓度的增加，传感器的响应频率逐渐增大，当探针浓度超过2．0μmol／L时，传感器的响应频率反而降低；反应缓冲液镁离子浓度、pH对p65蛋白亚基与其特异DNA结合有影响，当MgCl2浓度为50mmol／L、pH7．5时，p65蛋白亚基与其特异DNA结合引起的传感器响应频率最大；在p65质量浓度为10—40mg／L时，结合反应引起的频率变化与p65质量浓度呈线性相关，检测批内相对标准偏差（RSD）小于5％，批间RSD小于10％，最大结合量和结合常数Ka分别为（49．6±1．5）ng和（3．92±0．14）×10^6L·mol^-1。构建的压电DNA-蛋白质相互作用生物传感器具有结构简单、操作方便、不需标记、实时检测等优点，可直接用于核因子NF—κB与DNA的相互作用研究。 展开更多
关键词 压电生物传感器 核因子NF—κB 脱氧核糖核酸 相互作用
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小麦NAC转录因子响应逆境胁迫的研究进展
7
作者 周济龙 姚鲲鹏 +7 位作者 杨金鹏 徐茜 彭诗阳 郑世琳 马儒贤 韩猛 张玉梅 李夕梅 《广东农业科学》 2025年第2期31-43,共13页
作物抗逆性是多基因控制的复杂数量性状,各基因相互协调构成复杂的调控网络。其中,转录因子能特异性结合下游基因启动子区域的顺式作用元件进而调控其表达,在作物逆境应答中发挥重要作用。NAC(NAM,ATAF1/2和CUC2)转录因子是植物特有的... 作物抗逆性是多基因控制的复杂数量性状,各基因相互协调构成复杂的调控网络。其中,转录因子能特异性结合下游基因启动子区域的顺式作用元件进而调控其表达,在作物逆境应答中发挥重要作用。NAC(NAM,ATAF1/2和CUC2)转录因子是植物特有的、具有多种生物学功能的、最大的转录因子家族之一。该文旨在总结国内外相关研究进展,首先简要综述NAC转录因子的结构特征,然后重点阐述小麦NAC转录因子响应条锈病、白粉病、赤霉病等生物逆境和干旱、高盐等非生物逆境的功能和机制研究进展。研究者目前克隆并研究了较多参与小麦条锈病抗性、干旱胁迫应答的NAC转录因子家族成员基因,而参与白粉病、赤霉病等其他病害抗性和盐胁迫等其他非生物胁迫应答的家族成员基因的研究还相对较少。较多基因的功能鉴定仅通过拟南芥遗传转化得以初步验证,其参与逆境胁迫的分子调控机制研究也相对浅显。最后,展望小麦NAC转录因子的研究方向和应用前景。该文可为更便捷高效地开展小麦抗逆性遗传改良提供参考。 展开更多
关键词 小麦 NAC转录因子 生物逆境 非生物逆境 功能鉴定 调控机制
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高州油茶NAC转录因子家族鉴定及生物信息学分析
8
作者 沈红建 邓锦清 +3 位作者 廖柏勇 张碧佩 李永泉 王溢 《湖南农业科学》 2024年第7期7-14,共8页
NAC转录因子是植物中特有的转录因子,其在N端含有一段高度保守的特异结构域,对植物生长发育、胁迫反应和次生代谢产物生物合成等过程具有重要功能。研究基于高州油茶第三代全长转录组数据信息,通过生物信息学的方法筛选获得51个NAC转录... NAC转录因子是植物中特有的转录因子,其在N端含有一段高度保守的特异结构域,对植物生长发育、胁迫反应和次生代谢产物生物合成等过程具有重要功能。研究基于高州油茶第三代全长转录组数据信息,通过生物信息学的方法筛选获得51个NAC转录因子,为深入研究基因家族特征,对其进行理化性质分析、多列比对分析、蛋白系统进化树、保守基序和基因结构分析、亚细胞定位,以及二级蛋白域结构预测、蛋白磷酸化位点分析。结果表明:NAC蛋白存在氨基酸数量差异,且氨基酸序列间疏水性呈现为亲水性蛋白,其蛋白结构中具有5个保守的亚结构域。NAC转录因子系统进化树分析表明116个基因可划分为10个亚族群,部分高州油茶NAC蛋白具有特异性聚为单一亚族群,其他与拟南芥和水稻融合为不同亚族群。同时NAC蛋白均具有NAM超家族结构。亚细胞定位表明51个高州油茶NAC蛋白均位于细胞核,且二级结构中随机卷曲结构为主,同时含有α-螺旋和β-转角结构等。蛋白磷酸化位点都具有丝氨酸(Ser)、苏氨酸(Thr)和酪氨酸(Tyr)。 展开更多
关键词 高州油茶 NAC转录因子 生物信息学分析
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真核生物转录因子及其研究方法进展 被引量：9
9
作者 张娜 尹继刚 +1 位作者 孙高超 陈启军 《动物医学进展》 CSCD 北大核心 2009年第1期75-79,共5页
真核生物基因的表达调控是当前分子生物学最前沿的研究领域之一,而转录水平的调控是基因表达过程中最重要的第一步,由于蛋白质-蛋白质、蛋白质-DNA之间的相互作用,以及一些复杂大分子复合物的形成,导致真核生物转录水平的调控是一个多... 真核生物基因的表达调控是当前分子生物学最前沿的研究领域之一,而转录水平的调控是基因表达过程中最重要的第一步,由于蛋白质-蛋白质、蛋白质-DNA之间的相互作用,以及一些复杂大分子复合物的形成,导致真核生物转录水平的调控是一个多级的复杂过程。转录因子即反式作用因子在转录调控中可以直接或间接的识别或结合在顺式作用元件8 bp^112 bp核心序列上,参与调控靶基因的转录效率。因此,转录因子与调控序列的相互作用在决定某个基因是否表达中占据核心位置。随着对转录因子及其研究方法的深入研究,尤其是近几年染色质免疫沉淀及生物信息学的发展,人们将会进一步研究转录调控的机制及细胞行为和疾病的发生机理。 展开更多
关键词 真核生物 转录因子 方法
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油菜AP2／ERF家族转录因子的分离及其生物学功能 被引量：3
10
作者 庄静 熊爱生 +6 位作者 彭日荷 陈建民 Jian Zhang 朱波 高峰 付晓燕 姚泉洪 《中国油料作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2009年第3期391-400,共10页
油菜的生长发育受病害、干旱、高盐和低温等逆境胁迫的影响较大。油菜植株中很多被上述胁迫诱导而表达的基因,如产物能直接增强油菜对逆境抗性的功能基因,和产物为转录因子而作为信号转导调控其它基因的表达而间接提高抗性的调控基因。... 油菜的生长发育受病害、干旱、高盐和低温等逆境胁迫的影响较大。油菜植株中很多被上述胁迫诱导而表达的基因,如产物能直接增强油菜对逆境抗性的功能基因,和产物为转录因子而作为信号转导调控其它基因的表达而间接提高抗性的调控基因。很多转录因子涉及到油菜逆境抗性,AP2/ERF是其中重要的一个家族。目前通过不同方法从不同种类的油菜中共克隆了24个AP2/ERF家族转录因子,属于ERF和DREB/CBF亚族。这些基因分别能够被低温、干旱、高盐、乙烯、ABA和茉莉酮酸酯诱导,并启动油菜中一些相关下游基因的表达,从而增强油菜的抗逆性能。本文综述了油菜中AP2/ERF家族转录因子的克隆、进化关系分析、空间结构及生物学功能。 展开更多
关键词 转录因子 基因克隆 系统进化 空间结构 生物学功能 油菜
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7个桑树AP2/ERF转录因子的生物信息学及表达分析 被引量：4
11
作者 董亚茹 李茹霞 +4 位作者 赵东晓 耿兵 孙景诗 李云芝 王照红 《山东农业科学》 北大核心 2022年第1期7-13,共7页
AP2/ERF类转录因子是植物所特有的一类转录因子家族,在植物的生长发育及响应非生物胁迫中发挥着重要作用。为发掘桑树AP2/ERF类转录因子的成员及其功能,从桂桑优12中克隆到7个AP2/ERF转录因子,命名为MnAP2/ERF1~MnAP2/ERF7。生物信息学... AP2/ERF类转录因子是植物所特有的一类转录因子家族,在植物的生长发育及响应非生物胁迫中发挥着重要作用。为发掘桑树AP2/ERF类转录因子的成员及其功能,从桂桑优12中克隆到7个AP2/ERF转录因子,命名为MnAP2/ERF1~MnAP2/ERF7。生物信息学分析结果表明,这7个AP2/ERF蛋白都属于不稳定蛋白,且均属于亲水性蛋白,二级结构以无规则卷曲为主,亚细胞定位显示主要位于细胞核中。氨基酸序列比对及进化树分析发现,这7个AP2/ERF转录因子均含有1个保守AP2结构域,其中MnAP2/ERF1~MnAP2/ERF4属于ERF亚家族,MnAP2/ERF5~MnAP2/ERF7属于DREB亚家族。荧光定量分析显示,NaCl、PEG_(6000)、水淹胁迫可诱导7个桑树AP2/ERF基因上调表达,其中MnAP2/ERF3、MnAP2/ERF5、MnAP2/ERF6分别响应水淹、干旱和盐胁迫,说明桑树AP2/ERF转录因子的表达与逆境胁迫响应之间有密切的联系。本研究结果可为进一步揭示AP2/ERF转录因子调控桑树生长发育及逆境胁迫的机理奠定基础。 展开更多
关键词 桑树 AP2/ERF转录因子 生物信息学分析 基因表达 非生物胁迫
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花生DREB类转录因子基因AhDREB3的序列及非生物胁迫下表达分析 被引量：2
12
作者 陈娜 潘丽娟 +10 位作者 陈明娜 王通 许静 王子强 杨珍 谢宏峰 邹宗峰 黄翔 黄会文 禹山林 迟晓元 《中国油料作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第5期816-824,共9页
DREB类蛋白属于AP2/ERF转录因子家族的一个亚家族,在植物非生物胁迫抗性调控中具有重要功能。为了挖掘花生逆境胁迫相关功能基因AhDREB3,从已公布的花生基因中找到干旱应答元件结合蛋白3(AhDREB3)的编码基因全序列,做编码蛋白的进化分... DREB类蛋白属于AP2/ERF转录因子家族的一个亚家族,在植物非生物胁迫抗性调控中具有重要功能。为了挖掘花生逆境胁迫相关功能基因AhDREB3,从已公布的花生基因中找到干旱应答元件结合蛋白3(AhDREB3)的编码基因全序列,做编码蛋白的进化分析。根据已知序列设计引物,通过荧光定量PCR检测了该基因在低温、高盐和干旱胁迫下及对外源ABA响应和表达。荧光定量PCR结果显示,AhDREB3基因在花生的叶片和根中对低温没有响应,对高盐(叶片和根)和干旱(根)胁迫有较大响应,说明它可能参与了花生对高盐和干旱胁迫的适应性调控。此外,AhDREB3基因的表达在花生叶片和根中对外源ABA响应变化小,暗示了该基因在花生中可能通过不依赖于ABA的方式起作用。 展开更多
关键词 花生 DREB转录因子 表达分析 非生物胁迫
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HLA-G基因转录因子的生物信息学分析 被引量：2
13
作者 廖贵益 钟金彪 +1 位作者 赵飞 丁汉东 《山东医药》 CAS 北大核心 2016年第30期37-39,共3页
目的分析人白细胞抗原-G(HLA-G)基因的转录调控因子。方法利用生物信息学技术,从UCSC基因组数据库获取HLA-G基因的启动子区序列,登陆JASPAR数据库,在线预测HLA-G基因的转录调控因子,将得分阈值设定为≥95%并对涉及的转录因子进行分析。... 目的分析人白细胞抗原-G(HLA-G)基因的转录调控因子。方法利用生物信息学技术,从UCSC基因组数据库获取HLA-G基因的启动子区序列,登陆JASPAR数据库,在线预测HLA-G基因的转录调控因子,将得分阈值设定为≥95%并对涉及的转录因子进行分析。结果成功获得了长度为2 kb的HLA-G基因启动子区序列。该启动子区涉及11个家族22种转录因子,其中8个转录因子家族的生物学功能涉及胚胎发育,4个转录因子家族的生物学功能涉及免疫阻遏、免疫耐受。结论 HLA-G基因的表达调控是多种转录因子作用的复杂网络过程。HLA-G转录因子在调控胚胎发育、诱导免疫耐受等过程中具有重要作用。 展开更多
关键词 白细胞抗原-G 启动子 转录因子 生物信息学技术
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美洲黑杨木质素生物合成转录因子PdLim1基因的克隆、表达及植物表达载体构建 被引量：1
14
作者 王璐 李百炼 +1 位作者 张金凤 张德强 《北京林业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2009年第6期1-8,共8页
在植物体内,Lim1基因与木质素生物合成酶基因启动子区域富含AC的Pal盒结合,转录调控木质素的生物合成过程。该研究组合利用生物信息学和realtime PCR方法,首次从美洲黑杨形成层cDNA中分离出PdLim1cDNA全长,并进行了测序和序列分析。结... 在植物体内,Lim1基因与木质素生物合成酶基因启动子区域富含AC的Pal盒结合,转录调控木质素的生物合成过程。该研究组合利用生物信息学和realtime PCR方法,首次从美洲黑杨形成层cDNA中分离出PdLim1cDNA全长,并进行了测序和序列分析。结果表明,克隆的美洲黑杨PdLim1cDNA片段总长为952bp,基因内部含有完整的开放阅读框架,大小为594bp,可编码长度为197个氨基酸残基的蛋白质,所推导的蛋白质氨基酸序列与拟南芥AtLim1和水稻OsLim1蛋白的同源性分别为82.1%和78.2%。组织特异性realtime PCR结果显示,PdLim1基因在杨树根、茎、叶片和顶端分生组织中均有表达,但其表达模式却不同:PdLim1在成熟叶片和成熟木质部中表达丰度最高,在树皮、根部、韧皮部和形成层表达丰度较高,在未成熟木质部有少量表达,在顶端分生组织中表达丰度最低。在此基础上,以pBI121为表达载体,构建了在CaMV35S启动子驱动下,PdLim1基因的正义(pBI121-CaMV35S-sense PdLim1)和反义(pBI121-CaMV35S-antisense PdLim1)类型的双元植物表达载体。该研究为杨树PdLim1的基因工程改良木材纤维品质性状提供了重要的理论依据,具有潜在的应用价值。 展开更多
关键词 杨树 Lim1转录因子 木质素生物合成 REALTIME PCR 植物表达载体
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茶树儿茶素合成相关MYB转录因子生物信息学分析 被引量：2
15
作者 张玥 胡雲飞 +2 位作者 王树茂 柯子星 林金科 《茶叶科学》 CAS CSCD 北大核心 2018年第2期162-173,共12页
从茶树(Camellia sinensis)转录组数据库中获得6个与儿茶素合成相关的MYB转录因子,对其进行蛋白理化性质与结构功能预测、核定位信号和蛋白保守结构域分析,通过同源分析构建系统发育树。结果表明,与儿茶素合成相关的6个MYB蛋白都属于亲... 从茶树(Camellia sinensis)转录组数据库中获得6个与儿茶素合成相关的MYB转录因子,对其进行蛋白理化性质与结构功能预测、核定位信号和蛋白保守结构域分析,通过同源分析构建系统发育树。结果表明,与儿茶素合成相关的6个MYB蛋白都属于亲水性的非分泌蛋白,定位在叶绿体、线粒体和细胞核上,其空间结构主要是α-螺旋和β-转角;保守结构域的分析发现除了comp159173_c0基因,其余5个都属于SANT超家族基因成员。系统进化树显示6个MYB蛋白形成4个分支,显示出各自间较远的亲缘关系。差异表达分析的结果进一步证实了6个MYB转录因子与儿茶素合成代谢的相关性。 展开更多
关键词 儿茶素 MYB转录因子 生物信息学
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ERF转录因子StERF1的生物信息学分析 被引量：2
16
作者 周金鑫 宁祖林 +1 位作者 田云 胡新文 《热带农业科学》 2007年第3期69-73,78,共6页
从生物信息资源中寻找有重要功能的新ERF基因,命名为StERF1,用生物信息学方法对其主要理化性质和功能进行分析预测,为下一步的试验策略提供参考。StERF1编码一个由247个氨基酸组成的相对分子质量为27203.9的蛋白质,该蛋白具有一个由58... 从生物信息资源中寻找有重要功能的新ERF基因,命名为StERF1,用生物信息学方法对其主要理化性质和功能进行分析预测,为下一步的试验策略提供参考。StERF1编码一个由247个氨基酸组成的相对分子质量为27203.9的蛋白质,该蛋白具有一个由58个氨基酸残基组成的保守ERF结构域(112～169),在N端有一个可能起激活作用的酸性结构域,在C端有一个可能作为核定位信号(NLS)的碱性结构域,它可以结合GCC-box顺式作用元件,推测StERF1是一个定位在核内发挥转录激活作用的ERF转录因子。它可能在调控植物乙烯信号途径、生物胁迫或非生物胁迫应答过程发挥重要作用。 展开更多
关键词 StERF1 转录因子 生物信息学
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ARF类转录因子GhARF3的生物信息学分析 被引量：5
17
作者 陈蔷 彭明 《热带农业科学》 2009年第7期5-12,共8页
运用生物信息学方法对棉花GhARF3基因序列进行BLAST分析、结构域分析、进化树分析、编码蛋白质的理化性质分析、疏水性分析、二硫键分析、磷酸化位点分析、二级结构以及三级结构的预测、亚细胞定位和蛋白质功能分类预测等分析。分析结... 运用生物信息学方法对棉花GhARF3基因序列进行BLAST分析、结构域分析、进化树分析、编码蛋白质的理化性质分析、疏水性分析、二硫键分析、磷酸化位点分析、二级结构以及三级结构的预测、亚细胞定位和蛋白质功能分类预测等分析。分析结果表明GhARF3具有ARF类转录因子的特性,可能参与棉花纤维发育的调控。为进一步研究GhARF3基因功能提供理论指导。 展开更多
关键词 GhARF3 转录因子 生物信息学分析
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植物非生物胁迫应答相关转录因子研究进展 被引量：6
18
作者 王景晨 陈信波 《湖南农业科学》 2011年第9期9-12,共4页
非生物逆境胁迫严重危害农作物的生产,并且转录因子在调节植物生长发育以及对外界环境胁迫方面起重要作用,而利用基因工程手段过量表达植物中与抗逆相关的转录因子,可提高下游多个植物抗逆基因的表达,从而提高植物的抗逆能力,因而转录... 非生物逆境胁迫严重危害农作物的生产,并且转录因子在调节植物生长发育以及对外界环境胁迫方面起重要作用,而利用基因工程手段过量表达植物中与抗逆相关的转录因子,可提高下游多个植物抗逆基因的表达,从而提高植物的抗逆能力,因而转录因子受到广泛的关注,由此综述乙烯应答元件结合因子(AP2/EREBP)、MYB、WRKY、碱性亮氨酸拉链家族(bZIP)和HSFs五种植物应答非生物胁迫相关转录因子的结构特点、功能,以及它们在植物应答非生物胁迫方面的研究成果。 展开更多
关键词 转录因子 非生物胁迫 抗逆性
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烟草bZIP转录因子BZI-4的生物信息分析
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作者 李炳泽 王德勋 +1 位作者 徐成龙 苏家恩 《安徽农业科学》 CAS 2016年第31期156-157,159,共3页
[目的]探讨烟草在采收前的生理期和烘烤过程中的变黄阶段抗逆机制。[方法]利用生物信息学方法对烟草b ZIP转录因子BZI-4的理化特性、信号肽、跨膜、系统进化和亚细胞定位进行分析。[结果]烟草b ZIP转录因子BZI-4为碱性、水溶性、耐高温... [目的]探讨烟草在采收前的生理期和烘烤过程中的变黄阶段抗逆机制。[方法]利用生物信息学方法对烟草b ZIP转录因子BZI-4的理化特性、信号肽、跨膜、系统进化和亚细胞定位进行分析。[结果]烟草b ZIP转录因子BZI-4为碱性、水溶性、耐高温和非分泌型的游离蛋白,该蛋白为叶绿体中的转运肽,仅剪切修复后才具有活性,对环境适应能力强。[结论]通过烟草b ZIP转录因子BZI-4研究,为烟草抗逆境胁迫研究提供理论基础。 展开更多
关键词 生物信息 转录因子 b ZIP 烟草
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全基因组水平紫花苜蓿WRKY转录因子家族鉴定与表达模式分析 被引量：1
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作者 李显炀 刘昊 +6 位作者 何飞 王雪 李明娜 龙瑞才 康俊梅 杨青川 陈林 《草业学报》 CSCD 北大核心 2024年第4期154-170,共17页
WRKY转录因子是植物中最大的基因家族之一,在植物生长发育以及非生物胁迫过程中发挥重要的作用。目前,WRKY基因家族成员已经在多个植物物种中进行了广泛的研究和分析。然而,WRKY转录因子尚未在四倍体紫花苜蓿全基因组水平上进行鉴定与... WRKY转录因子是植物中最大的基因家族之一,在植物生长发育以及非生物胁迫过程中发挥重要的作用。目前,WRKY基因家族成员已经在多个植物物种中进行了广泛的研究和分析。然而,WRKY转录因子尚未在四倍体紫花苜蓿全基因组水平上进行鉴定与分析。本研究系统鉴定了紫花苜蓿WRKY基因家族成员,并对其在不同胁迫处理下的表达模式进行了分析。结果显示,共有198个WRKY转录因子不均匀分布在紫花苜蓿的32条染色体上,其中7号染色体的数量最多。系统进化树结果显示,WRKY基因家族成员可以分为3个组。在这些WRKY转录因子中,有42个响应盐胁迫,7个响应碱胁迫,19个响应冷胁迫和37个响应干旱胁迫,同时发现MsWRKY154和MsWRKY166可以同时响应盐、干旱、冷以及碱胁迫。本研究的结果可为紫花苜蓿WRKY转录因子的生物学功能深入研究奠定基础,同时可为紫花苜蓿分子育种提供有价值的信息。 展开更多
关键词 WRKY转录因子 紫花苜蓿 表达模式 非生物胁迫
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