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DNA计算机原理、进展及难点(Ⅰ):生物计算系统及其在图论中的应用 被引量:48
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作者 许进 张雷 《计算机学报》 EI CSCD 北大核心 2003年第1期1-11,共11页
基于生化反应机理的DNA计算机模型受到科学领域内许多不同学科学者们的关注与兴趣 .DNA计算已经形成国际科学前沿领域内研究的一个新的热点 .DNA计算机的研制需要诸如生物工程、计算机科学、数学、物理、化学、信息科学、微电子技术、... 基于生化反应机理的DNA计算机模型受到科学领域内许多不同学科学者们的关注与兴趣 .DNA计算已经形成国际科学前沿领域内研究的一个新的热点 .DNA计算机的研制需要诸如生物工程、计算机科学、数学、物理、化学、信息科学、微电子技术、激光技术以及控制科学等许多学科的共同协作攻关 .该系列文章拟对DNA计算机的基本原理、研究进展、DNA计算的模型以及当前研究中的难点给予研讨 .该文属首篇 ,重点讨论了DNA计算机的基本原理 ,引入了生物计算系统的概念 。 展开更多
关键词 DNA计算 原理 生物计算机系统 图论 应用
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活体生物计算模型的研究进展及展望(英文)
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作者 刘向荣 赵东明 +1 位作者 郗方 李菲 《计算机学报》 EI CSCD 北大核心 2008年第12期2103-2108,共6页
活体生物计算模型是基于生物体内各种生化分子以特定的形式互相协作、处理信息的能力而出现的一种新的计算模型.由于其计算组成部件是直接镶嵌在生物活体里面,并且显示具有一定的计算能力,这可以使人们深入研究生物体信息处理能力以及... 活体生物计算模型是基于生物体内各种生化分子以特定的形式互相协作、处理信息的能力而出现的一种新的计算模型.由于其计算组成部件是直接镶嵌在生物活体里面,并且显示具有一定的计算能力,这可以使人们深入研究生物体信息处理能力以及获得对这种能力的有效控制.该文介绍了近几年几类体内生物计算模型,用于求解NP完全问题、基因逻辑电路、分子自动机研究状况,并对未来的发展方向进行了展望. 展开更多
关键词 生物计算 体内 NP问题 基因电路 分子自动机
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生物计算机的兴起与研究动态
3
作者 徐要学 刘秉刚 《计算机工程与应用》 CSCD 北大核心 1992年第2期25-27,共3页
本文简要说明了生物计算机的兴起及其生物芯片的研究动态。
关键词 生物计算 计算
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生物计算机与蛋白质
4
作者 曹来发 《兵工自动化》 2000年第3期5-5,共1页
关键词 生物计算 蛋白质 脱氧核糖核酸
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一个生物计算网格的设计与实现
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作者 肖国荣 骆志刚 +2 位作者 朱伟林 郭华源 刘志芳 《计算机应用研究》 CSCD 北大核心 2006年第11期226-229,共4页
提出一种基于OGSA的生物计算网格体系结构,分析研究了生物应用标准化、资源描述、作业描述和作业调度等,对序列拼接应用Phrap在该网格环境下的运行情况进行了讨论。
关键词 生物计算网格 序列拼接 体系结构
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酵母细胞“生物电路”研制成功为生物计算机的研究提供重要启示
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作者 化信 《化工新型材料》 CAS CSCD 北大核心 2011年第1期130-130,共1页
据报道,瑞典和西班牙科学家使用转基因酵母细胞制造出了能够互相交流的“生物电路”,未来,科学家有望使用人体细胞构建出更复杂的系统,来检测人体健康状况。
关键词 生物计算 酵母细胞 电路 人体细胞 健康状况 科学家 转基因 西班牙
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美利用基因工程技术研制生物计算机
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《计算机研究与发展》 EI CSCD 北大核心 2008年第7期1278-1278,共1页
来自美国戴维森学院、北卡罗来那大学和密苏里西部大学等多个高校生物和数学专业的研究人员,通过对埃希氏菌属大肠杆菌添加基因,成功创造出细菌计算机.这一经基因改造后的细菌是名副其实可以进行计算的“微生物”.与传统计算机相比... 来自美国戴维森学院、北卡罗来那大学和密苏里西部大学等多个高校生物和数学专业的研究人员,通过对埃希氏菌属大肠杆菌添加基因,成功创造出细菌计算机.这一经基因改造后的细菌是名副其实可以进行计算的“微生物”.与传统计算机相比,这种生物计算机有更多潜在的优势,一个小摇瓶就可以培养上百亿的细菌,每一个都能包含多个拷贝的DNA片段用来计算; 展开更多
关键词 生物计算 基因工程技术 埃希氏菌属大肠杆菌 DNA片段 研究人员 数学专业 基因改造 戴维森
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山东省中学生物计算机多媒体课件制作交流评比活动
8
作者 王立亭 《生物学教学》 北大核心 2001年第5期4-4,共1页
关键词 山东 中学生物计算机多媒体课件制作交流评比活动 生物教学 教学方法 电化教学
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计算机技术的巨大飞跃:——生物计算机
9
作者 管象钧 《现代科技译丛(哈尔滨)》 2000年第1期19-21,共3页
关键词 生物计算 性能 原理
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基于离体神经网络的生物智能计算:关键技术与研究现状(特邀)
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作者 杜金帅 邓寅 +7 位作者 曹世阳 陆泽营 李杰 韩卓 周晋民 王棵 桂丽丽 徐坤 《红外与激光工程》 北大核心 2025年第3期93-113,I0001,共22页
随着人工智能(AI)的快速发展,其高能耗、低解释性和灵活性不足等问题日益凸显。生物神经网络(Biological Neural Networks,BNN)因其基于真实生物神经元的动态可塑性和自适应性,成为突破AI瓶颈的重要研究方向。离体培养的BNN通过精确的... 随着人工智能(AI)的快速发展,其高能耗、低解释性和灵活性不足等问题日益凸显。生物神经网络(Biological Neural Networks,BNN)因其基于真实生物神经元的动态可塑性和自适应性,成为突破AI瓶颈的重要研究方向。离体培养的BNN通过精确的培养技术和先进的调控手段,为理解生物大脑的信息处理机制以及开发新型智能系统提供了实验平台。文中系统地综述了离体BNN的培养方法及功能优化技术,包括二维和三维培养方式,以及模块化网络构建与连接调控方法。详细探讨了电学刺激、光学刺激和化学刺激等信号输入技术,以及细胞内外动作电位记录、钙荧光成像等信号输出技术。此外,还分析了BNN在静态任务(如语音识别)和实时交互任务(如神经机器人控制)中的应用实例,展示了其在动态学习、复杂模式识别和实时任务适应中的潜力。最后,总结了当前基于BNN的生物智能计算研究的主要挑战,提出了未来研究的方向,希望为未来生物智能计算的研究与发展提供一定启示。 展开更多
关键词 生物神经网络 离体培养 双向通信技术 生物智能计算
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对生物学计算题复习的探讨
11
作者 刘原平 《生物学教学》 2013年第3期58-59,共2页
摘要本文统计分析了近年高考生物计算题的考点分布和基本题型。结合实例指出了高三生物计算题复习中的“计算难度过大”、“公式推导过多”和“方法对比过少”三个误区,并提出了规避误区,达到复习目标的办法。
关键词 生物计算 复习 误区
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生物科学计算平台冷冻电镜结构解析实验室管理 被引量:9
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作者 杨涛 贾安宝 +2 位作者 阮华斌 王亚坤 刘燕 《实验技术与管理》 CAS 北大核心 2017年第2期227-230,234,共5页
以清华大学生命科学院生物计算平台冷冻电镜结构解析实验室管理为案例,介绍了实验室现状、制度体系、平台运行和成果4个部分,阐述了实验室管理和运行过程中经常出现的问题,提出了有效的改进措施,以便进一步提高设备的完好率和利用率,切... 以清华大学生命科学院生物计算平台冷冻电镜结构解析实验室管理为案例,介绍了实验室现状、制度体系、平台运行和成果4个部分,阐述了实验室管理和运行过程中经常出现的问题,提出了有效的改进措施,以便进一步提高设备的完好率和利用率,切实有效地为科研和教学服务,为建立高效有序的实验管理提供理论依据。 展开更多
关键词 生物科学计算平台 冷冻电镜结构解析实验室 实验室管理及运行
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TP-Miner:基于生物启发计算的警用流动人口分析系统 被引量:1
13
作者 彭京 唐常杰 +3 位作者 程温泉 叶尚玉 方全心 石葆梅 《四川大学学报(工程科学版)》 EI CAS CSCD 北大核心 2006年第5期128-135,共8页
目前对流动人口的管理仅停留在数据查询比对和简单统计上,缺少对数据的深层次分析,难以对决策指挥提供支持。针对流动人口的分析问题,提出了构建一个基于生物启发计算的智能分析系统,用于发现流动人口中各类人员的流动模式以及流动人口... 目前对流动人口的管理仅停留在数据查询比对和简单统计上,缺少对数据的深层次分析,难以对决策指挥提供支持。针对流动人口的分析问题,提出了构建一个基于生物启发计算的智能分析系统,用于发现流动人口中各类人员的流动模式以及流动人口的趋势性问题,找出异常的流动信息和模式。该系统综合运用了前沿的生物启发计算技术———基于多层染色体基因表达式编程算法、重叠基因表达进化算法、基于概念相似度神经网络分类模型和层次距离计算的聚类算法搭建了一个警用流动人口的分析平台。同时根据实际需求,提出了一种新的基于智能分析结果的分级报警模型。实验表明系统具有较高的性能和实用性。 展开更多
关键词 生物启发计算 流动人口 概念相似度 人工神经网络 数据挖掘
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复杂疾病基因鉴定的计算生物学方法 被引量:1
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作者 王敏 章双 黄青阳 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2009年第6期581-586,共6页
过去20多年复杂疾病易感基因鉴定的主要方法是连锁分析和关联研究。因为连锁分析确定的数量性状位点通常很宽,加之对区域内大部分基因的功能以及基因功能和疾病之间联系的认识十分有限,所以从数量性状位点到基因的识别是一个挑战。近年... 过去20多年复杂疾病易感基因鉴定的主要方法是连锁分析和关联研究。因为连锁分析确定的数量性状位点通常很宽,加之对区域内大部分基因的功能以及基因功能和疾病之间联系的认识十分有限,所以从数量性状位点到基因的识别是一个挑战。近年来发展了一些利用公共数据库的信息预测疾病易感基因的计算生物学方法。文章简要介绍了DGP、GeneSeeker、Prioritizer、PROSPECTR and SUSPECTS及Endeavor5种计算生物学方法的基本原理,以2型糖尿病/肥胖和骨质疏松症易感基因的预测为例说明它们的应用方法,并讨论了这些方法的局限及应用前景。 展开更多
关键词 计算生物学方法 数量性状位点 候选基因 复杂疾病
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中医药计算系统生物学与寒热证候研究 被引量:30
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作者 李梢 《世界科学技术-中医药现代化》 2007年第1期105-111,共7页
中医学是传统的系统生物医学,只有在系统层面上研究传统中医药,才能更为合理地使之得到继承、阐释与发扬。本文阐述了项目组开展的“中医药计算系统生物学”研究内容,发现基于生物网络及其调控,可以较为有效地理解中医证候宏观与微观特... 中医学是传统的系统生物医学,只有在系统层面上研究传统中医药,才能更为合理地使之得到继承、阐释与发扬。本文阐述了项目组开展的“中医药计算系统生物学”研究内容,发现基于生物网络及其调控,可以较为有效地理解中医证候宏观与微观特征、方剂多靶点整合调节作用等重要问题,表明中医药计算系统生物学可望成为符合中医特色,又与当今科学前沿协调发展的中医药现代研究方法。 展开更多
关键词 中医药 寒热证候 计算系统生物 生物信息学 生物网络
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计算生物学中的高性能计算(Ⅰ)—分子动力学 被引量:1
16
作者 王涛 《计算机工程与科学》 CSCD 北大核心 2014年第12期2242-2250,共9页
分子动力学是高性能计算应用的重要领域,大量的高性能计算资源或机时被用于分子动力学模拟。描述了分子动力学的计算方法和特点,包括常用并行算法、性能改进方式等,介绍了常用的分子动力学大规模并行计算软件及其功能特性,最后展望了分... 分子动力学是高性能计算应用的重要领域,大量的高性能计算资源或机时被用于分子动力学模拟。描述了分子动力学的计算方法和特点,包括常用并行算法、性能改进方式等,介绍了常用的分子动力学大规模并行计算软件及其功能特性,最后展望了分子动力学模拟的发展与挑战。 展开更多
关键词 高性能计算应用 分子动力学 计算生物
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计算生物学本科教学探讨 被引量:2
17
作者 李兰芝 《现代农业科技》 2010年第10期28-29,共2页
介绍了生物信息学专业学生《计算生物学》本科教学现状,从教学的不同环节总结了教学中的经验,并就如何提高教学效果、培养跨学科的生物信息学人才做了积极的探索,以促进《计算机生物学》的教学改革。
关键词 计算生物 教学现状 体会
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计算生物学中有关基因组翻转距离的NPC问题
18
作者 栾峻峰 朱大铭 马绍汉 《计算机科学》 CSCD 北大核心 2002年第11期59-64,共6页
Problems of computing the reversal distance between genomes are discussed. Problems of computing the reversal distance between genomes are fundamental problems of Computational Biology, these problems have important m... Problems of computing the reversal distance between genomes are discussed. Problems of computing the reversal distance between genomes are fundamental problems of Computational Biology, these problems have important meanings in studying the biological race evolution and the bio-pharmaceuticals etc. The problem of evolutionary trees based on reversal distance between genomes and it's NPC property are especially discussed. 展开更多
关键词 计算生物 基因组翻转距离 NPC问题 基因序列
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可计算生物医学知识视角下诊疗规范知识计算化模式研究 被引量:2
19
作者 牟冬梅 琚沅红 +1 位作者 于海涛 王书童 《现代情报》 CSSCI 2023年第12期73-87,共15页
[目的/意义]构建可计算生物医学知识视角下的诊疗规范知识计算化模式,推动“数据—知识—实践”循环进程,促进临床诊疗过程各环节决策制定协同发展。[方法/过程]通过文献调研,明晰诊疗规范知识计算化的必要性及应用价值,并在厘清诊疗规... [目的/意义]构建可计算生物医学知识视角下的诊疗规范知识计算化模式,推动“数据—知识—实践”循环进程,促进临床诊疗过程各环节决策制定协同发展。[方法/过程]通过文献调研,明晰诊疗规范知识计算化的必要性及应用价值,并在厘清诊疗规范概念、内涵,归纳诊疗规范数据来源、数据特征,提炼诊疗规范知识可计算化特征的基础上,遵循可计算生物医学知识核心思想和DIKW层级模型内涵,构建诊疗规范知识计算化模式并探索其实现路径。[结果/结论]构建“1-336”诊疗规范知识计算化模式立方体,包含1个核心目标、3个知识层级、3条实现子路径、6个关键环节,为各领域知识计算化研究提供理论支撑以及方法学参考和依据。 展开更多
关键词 计算生物医学知识 知识计算 诊疗规范 知识组织 模式构建
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人精子特异性乳酸脱氢酶结构和功能的计算生物学分析
20
作者 汤莹 颜水堤 +3 位作者 郑德柱 张朵 林宇翔 兰风华 《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2013年第11期1088-1096,共9页
精子特异性乳酸脱氢酶(lactate dehydrogenase,LDH),又称乳酸脱氢酶C4(lactate dehydrogenase C4,LDH-C4),特异性地存在于哺乳动物发育成熟的睾丸组织中,与精子的生成、代谢、获能等有密切关系.根据GenBank数据库中人LDH-C4氨基酸序列(P... 精子特异性乳酸脱氢酶(lactate dehydrogenase,LDH),又称乳酸脱氢酶C4(lactate dehydrogenase C4,LDH-C4),特异性地存在于哺乳动物发育成熟的睾丸组织中,与精子的生成、代谢、获能等有密切关系.根据GenBank数据库中人LDH-C4氨基酸序列(P07864),利用PROSITE数据库预测人LDH-C4的功能基序;利用Clustalw2、TreeView1.6.6进行LDH-C4进化树的构建;利用I-TASSER软件预测人LDH-C4的二、三、四级结构以及功能位点.结果表明:在190!196位有1个LDH活性位点,该位点为脊椎动物各亚型乳酸脱氢酶共有的催化位点,为进化中的1个保守序列;从进化树来看,LDHC和LDHB的亲缘关系比较近;人LDH-C4与小鼠LDH-C4的二级、三级结构具有很高的相似性;LDH-C4属乳酸脱氢酶-苹果酸脱氢酶(LDH-MDH)超家族中的LDH-1(cd05293)家族的成员,属于NAD依赖性酶,拥有LDH-1家族具备的基本结构特点.以上结果为研究LDH-C4基因突变对其功能的影响打下基础. 展开更多
关键词 乳酸脱氢酶C4 精子特异性乳酸脱氢酶 计算生物
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