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一种新型ATP-依赖型ClpP家族蛋白质水解酶PlclpP基因的克隆、表达和酶学特性
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作者 龚丽 李云霞 《江苏农业学报》 CSCD 北大核心 2015年第6期1424-1429,共6页
运用基因克隆技术,以分离鉴定获得的蛋白质水解酶高活性类芽孢杆菌(Paenibacillus lautus)CHN26菌株基因组DNA为模板,克隆鉴定了该菌株一种新型ATP-依赖型Clp P家族蛋白质水解酶Plclp P基因(585 bp),编码194个氨基酸,蛋白质分子量约为2.... 运用基因克隆技术,以分离鉴定获得的蛋白质水解酶高活性类芽孢杆菌(Paenibacillus lautus)CHN26菌株基因组DNA为模板,克隆鉴定了该菌株一种新型ATP-依赖型Clp P家族蛋白质水解酶Plclp P基因(585 bp),编码194个氨基酸,蛋白质分子量约为2.1×104。采用大肠杆菌(Eschericia coli)p ET表达系统,构建了Plclp P基因表达质粒p ET-28-Plclp P,并在大肠杆菌BL21中实现了重组Pl Clp P蛋白质的表达。利用组氨酸标签(His-tag)亲和纯化法,获得了Pl Clp P纯化蛋白质,发现Pl Clp P可能与宿主菌未知伴侣分子形成蛋白质复合物。Pl Clp P复合物具有ATP-依赖型酪蛋白水解酶活性,最适反应条件为40℃、p H7.0。表面活性剂强烈抑制Pl Clp P复合物的酶活,而常规丝氨酸蛋白酶抑制剂对其活性无抑制作用。 展开更多
关键词 ClpP家族蛋白质水解酶 芽孢杆菌 基因克隆 基因表达 酶学特性
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TRIM家族蛋白质在自噬调控中的作用 被引量:3
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作者 李玉琴 胡嘉 王琳 《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第10期1305-1313,共9页
自噬是一种常见的细胞代谢过程,其特征是形成具有双层膜结构的自噬体将胞内物质或外来异物包裹,进而与溶酶体融合进行降解。自噬对于维持细胞的稳态至关重要,自噬功能异常与多种疾病的发生发展密切相关。例如肿瘤、神经退行性疾病、病... 自噬是一种常见的细胞代谢过程,其特征是形成具有双层膜结构的自噬体将胞内物质或外来异物包裹,进而与溶酶体融合进行降解。自噬对于维持细胞的稳态至关重要,自噬功能异常与多种疾病的发生发展密切相关。例如肿瘤、神经退行性疾病、病毒感染和免疫疾病等,其可能成为这些疾病潜在的治疗靶点,因此研究自噬的调控是生命科学及医学领域的热点。三结构域蛋白质(tripartite motif-containing proteins,TRIMs)家族是一类具有E3泛素连接酶活性的蛋白质,通常包含3个保守的结构域,即RING锌指结构域、B-box结构域和卷曲螺旋结构域。近年的研究发现,多个TRIM家族成员参与自噬的调控,其作用机制包括调控自噬相关的信号通路、调节自噬核心分子、作为自噬底物识别受体等。TRIM家族通过调控自噬发挥多种生物学效应,例如调节免疫、病毒防御和影响肿瘤发生发展等。本文将对TRIM家族在调控自噬过程中发挥的作用、分子机制以及通过自噬影响的生物学作用进行综述。 展开更多
关键词 自噬 三结构域蛋白质家族 E3泛素连接酶 肿瘤
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赖氨酰氧化酶蛋白家族作为恶性肿瘤治疗靶点的研究进展
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作者 贺锦涛 普元倩(综述) 熊伟(审校) 《医学研究与战创伤救治》 北大核心 2025年第5期532-538,共7页
赖氨酰氧化酶(LOX)家族由LOX和LOX样蛋白1-4(LOXL1-4)组成,负责胶原蛋白和弹性蛋白的共价交联,从而维持细胞外基质和维持结缔组织的功能,促进胚胎发育和伤口愈合。最近的研究发现,LOX蛋白家族成员在各种类型的恶性肿瘤中均呈异常表达。... 赖氨酰氧化酶(LOX)家族由LOX和LOX样蛋白1-4(LOXL1-4)组成,负责胶原蛋白和弹性蛋白的共价交联,从而维持细胞外基质和维持结缔组织的功能,促进胚胎发育和伤口愈合。最近的研究发现,LOX蛋白家族成员在各种类型的恶性肿瘤中均呈异常表达。LOX蛋白家族主要执行肿瘤微环境重塑功能,广泛参与肿瘤侵袭转移、免疫调节、增殖、凋亡等生物学过程。随着研究的深入,LOX蛋白家族有望成为恶性肿瘤靶向治疗、免疫治疗、化疗和放疗的有效靶点。文章主要针对LOX蛋白家族的结构、功能及其在肿瘤治疗中的研究进展等方面进行综述。 展开更多
关键词 赖氨酰氧化酶 家族蛋白质 细胞外基质 恶性肿瘤 治疗靶点
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ProFaM:一个蛋白质序列家族挖掘算法 被引量:2
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作者 熊赟 陈越 朱扬勇 《计算机研究与发展》 EI CSCD 北大核心 2007年第7期1160-1168,共9页
有效分析蛋白质家族是生物信息学的一项重要挑战,聚类成为解决这一问题的主要途径之一.基于传统序列比对方法定义蛋白质序列间相似关系时,假设了同源片断间的邻接保守性,与遗传重组相冲突.为更好地识别蛋白质家族,提出了一种蛋白质序列... 有效分析蛋白质家族是生物信息学的一项重要挑战,聚类成为解决这一问题的主要途径之一.基于传统序列比对方法定义蛋白质序列间相似关系时,假设了同源片断间的邻接保守性,与遗传重组相冲突.为更好地识别蛋白质家族,提出了一种蛋白质序列家族挖掘算法ProFaM.ProFaM首先采用前缀投影策略挖掘表征蛋白质序列的模式,然后基于模式及其权重信息构造相似度度量函数,并采用共享最近邻方法,实现了蛋白质序列家族聚类.解决了以往方法在蛋白质模式挖掘及相似度设计中的不足.在蛋白质家族数据库Pfam上的实验结果证实了ProFaM算法在蛋白质家族分析上有良好的结果. 展开更多
关键词 蛋白质序列 蛋白质家族 序列模式 聚类 数据挖掘 生物信息学
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恶性疟原虫ApiAP2蛋白质家族研究进展 被引量:2
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作者 郑雨昕 张义伟 姜宁 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第5期1354-1363,共10页
疟疾是由顶复门寄生虫——疟原虫引起的一种人畜共患病。疟原虫不仅可以感染人,还能够感染家禽、鼠、食蟹猴等多种动物,其中,鸡疟原虫病、鼠疟原虫病对畜牧业影响较大。为完成其复杂的生命周期,疟原虫需要严格的基因调控,而转录因子对... 疟疾是由顶复门寄生虫——疟原虫引起的一种人畜共患病。疟原虫不仅可以感染人,还能够感染家禽、鼠、食蟹猴等多种动物,其中,鸡疟原虫病、鼠疟原虫病对畜牧业影响较大。为完成其复杂的生命周期,疟原虫需要严格的基因调控,而转录因子对基因表达的调控作用十分关键。截至目前,ApiAP2蛋白质家族是在所有顶复门原虫中作为候选转录因子出现的唯一蛋白质家族。论文在总结已有研究的基础上,预测恶性疟原虫ApiAP2蛋白质家族中未知功能蛋白质的调控机制,并开展对ApiAP2蛋白质家族发生蛋白质翻译后修饰功能的展望,为畜牧业研发原虫病疫苗提供借鉴与参考。 展开更多
关键词 疟疾 恶性疟原虫 ApiAP2蛋白质家族 基因调控 转录因子 蛋白质翻译后修饰
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常染色体显性钙化不全型釉质发育不全相关基因序列相似性83蛋白质家族成员H及其突变的研究进展 被引量:1
6
作者 郭思敏 陈婷 《国际口腔医学杂志》 CAS CSCD 2022年第5期600-606,共7页
常染色体显性钙化不全型釉质发育不全(ADHCAI)是一种影响釉质结构的遗传性疾病,基本病变为釉质基质形成正常但无明显的矿化。该疾病具有明显的临床和遗传异质性,临床表现为患牙的釉质厚度正常而硬度降低,影响功能和美观。序列相似性83... 常染色体显性钙化不全型釉质发育不全(ADHCAI)是一种影响釉质结构的遗传性疾病,基本病变为釉质基质形成正常但无明显的矿化。该疾病具有明显的临床和遗传异质性,临床表现为患牙的釉质厚度正常而硬度降低,影响功能和美观。序列相似性83蛋白质家族成员H(FAM83H)在人体的多种组织和细胞中普遍表达,包括成釉细胞、成牙本质细胞和牙槽骨。该基因编码的细胞内蛋白质被认为与角蛋白细胞骨架和桥粒相关,在细胞内分子运输、细胞骨架网络调节和釉质形成中发挥作用。FAM83H基因中的许多突变已被证实可在不同人群中导致ADHCAI。近年来一些研究从囊泡运输、细胞骨架等多角度入手,探究FAM83H突变与AD‐HCAI发生发展之间的关系,本文就ADHCAI相关基因FAM83H及其突变的研究进展进行综述。 展开更多
关键词 常染色体显性钙化不全型釉质发育不全 序列相似性83蛋白质家族成员H 截断突变
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泛素连接酶E4B介导PM20D2、PABPC1和TACO1蛋白质的泛素化验证 被引量:2
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作者 刘香男 范宇宸 +3 位作者 王亚楠 陆瑶 赵博 武正华 《生物学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2021年第3期31-36,共6页
泛素连接酶E4B通过U-box基序可将经泛素活化酶(Ubiquitin-activating enzyme, E1)和泛素结合酶(Ubiquitin-conjugating enzyme, E2)传递的泛素(Ubiquitin, UB)标记至底物蛋白质。探究3个蛋白质:金属蛋白酶M20家族蛋白质2(Peptidase M20 ... 泛素连接酶E4B通过U-box基序可将经泛素活化酶(Ubiquitin-activating enzyme, E1)和泛素结合酶(Ubiquitin-conjugating enzyme, E2)传递的泛素(Ubiquitin, UB)标记至底物蛋白质。探究3个蛋白质:金属蛋白酶M20家族蛋白质2(Peptidase M20 domain-containing protein 2,PM20D2)、多腺苷酸结合蛋白质1(Polyadenylate-binding protein 1,PABPC1)、细胞色素C氧化酶Ⅰ翻译激活剂(Translational activator of cytochrome C oxidase Ⅰ,TACO1)是否可被E4B介导泛素化。从HEK293细胞中提取总RNA,反转录为cDNA,以其为模板调取底物基因并构建重组质粒,利用大肠杆菌表达系统表达并纯化泛素化过程所需的各个相关蛋白质,通过蛋白质体外泛素化实验,对3个蛋白质进行泛素化验证。结果表明3个蛋白质均可以在蛋白质水平被E4B泛素化,证明3个蛋白质都是E4B的底物,为进一步在细胞中研究其泛素化的机理奠定基础。 展开更多
关键词 泛素化 泛素连接酶E4B 金属蛋白酶M20家族蛋白质2 多腺苷酸结合蛋白质1 细胞色素C氧化酶Ⅰ翻译激活剂
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致命蛋白质可以作为新的天然杀虫制
8
《食品科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2007年第8期486-486,共1页
英国沃里克大学网站消息,线虫可以借助寄生在它体内的细菌传染并杀死害虫。近日,英国沃尔克大学的研究人员和考文垂大学及诺丁汉大学的合作伙伴们发现了这些细菌是如何用一种蛋白质来杀死这些害虫的。这种蛋白质叫XptAl,研究人员发... 英国沃里克大学网站消息,线虫可以借助寄生在它体内的细菌传染并杀死害虫。近日,英国沃尔克大学的研究人员和考文垂大学及诺丁汉大学的合作伙伴们发现了这些细菌是如何用一种蛋白质来杀死这些害虫的。这种蛋白质叫XptAl,研究人员发现这种蛋白质家族的其他变量也能杀死其它昆虫。 展开更多
关键词 蛋白质家族 杀虫 天然 研究人员 合作伙伴 大学 英国 害虫
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序列相似性网络聚类与蛋白质家族划分
9
作者 时逢宽 李炜疆 《食品与生物技术学报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第1期98-103,共6页
图聚类法是利用蛋白质序列信息推断其家族分类的有力手段。对于蛋白质数据集中家族内外存在着如同许多超家族一样的复杂关系,图聚类法达到较好表现必须两因素,1)输入的相似性图需要包含有足够的用于分类的信息;2)需要稳健的算法以识别... 图聚类法是利用蛋白质序列信息推断其家族分类的有力手段。对于蛋白质数据集中家族内外存在着如同许多超家族一样的复杂关系,图聚类法达到较好表现必须两因素,1)输入的相似性图需要包含有足够的用于分类的信息;2)需要稳健的算法以识别被隐藏在相似性图中的模糊集团。作者测试模块度最优算法Contraction-Dilation(CD)算法,采用来自于Pfam中的具有高度序列差异的烯醇酶宗族作为测试数据集。结果表明使用CD算法在相关参数与相似性图比较恰当的情况下,得到聚类结果与Pfam中高度一致。该算法能在一般情况下,使用最佳参数附近较宽范围仍能表现出较好性能。 展开更多
关键词 图聚类 蛋白质家族 网络聚类
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凋亡抑制蛋白在胶质瘤治疗中的应用研究进展 被引量:3
10
作者 刘磊 陈维平 黄玮 《实用医学杂志》 CAS 北大核心 2012年第21期3668-3670,共3页
作为细胞内细胞凋亡抑制作用最强的蛋白质家族之一,凋亡抑制蛋白(inhibitor of apoptosis proteins,IAPs)被认为参与了肿瘤的发生发展.并在肿瘤抵抗放化疗过程中扮演重要角色。
关键词 凋亡抑制蛋白 胶质瘤 APOPTOSIS 应用 治疗 蛋白质家族 抑制作用 细胞凋亡
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WASP家族在肿瘤发生发展中作用的研究进展 被引量:1
11
作者 谢馨 陈艳 +2 位作者 何志旭 黄佩 陈青华 《中国全科医学》 CAS 北大核心 2022年第14期1779-1789,共11页
恶性肿瘤的发生、发展是一个不断演进的过程,其具有侵袭、浸润和转移的基本生物学特征。WASP家族作为一类新型的肌动蛋白调节蛋白,是参与维持肌动蛋白细胞骨架的基本形态的关键成分,在维持细胞基础结构、细胞运动、细胞信号传导等在内... 恶性肿瘤的发生、发展是一个不断演进的过程,其具有侵袭、浸润和转移的基本生物学特征。WASP家族作为一类新型的肌动蛋白调节蛋白,是参与维持肌动蛋白细胞骨架的基本形态的关键成分,在维持细胞基础结构、细胞运动、细胞信号传导等在内的各种细胞过程中发挥着重要作用,同时也可介导肿瘤细胞的增殖、侵袭和转移。本文综述了WASP家族在肿瘤发生、发展中的作用,以及在不同肿瘤中的表达情况及其相关信号通路,提示WASP家族在肿瘤的发生及进展中存在广阔的研究空间,对于WASP家族在各种肿瘤中的机制研究、预后预测、甚至治疗等方面均有着重要意义。 展开更多
关键词 WASP家族 Wiskott-Aldrich综合征蛋白质家族 肿瘤 侵袭 肿瘤转移 综述
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治疗代谢性疾病新的靶分子——脂肪酸结合蛋白aP2
12
作者 冯娟 《生理科学进展》 CAS CSCD 北大核心 2007年第4期335-335,共1页
关键词 脂肪酸结合蛋白 代谢性疾病 靶分子 治疗 动脉粥样硬化 2型糖尿病 蛋白质家族 长链脂肪酸
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趋化因子RANTES及其受体CCR5与炎性疾病 被引量:5
13
作者 袁景 刘微 任汉云 《中国免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2015年第7期977-980,共4页
趋化因子(Chemokines)是一类对不同靶细胞具有趋化效应的蛋白质家族,分子量多为8-12 k D,由机体多种细胞(尤其是活化免疫细胞)分泌,主要依赖与特异性受体的结合而发挥生物学作用,在细胞生长、分化、黏附及定向迁移等方面起重要作用。
关键词 RANTES CCR5 炎性疾病 趋化因子 蛋白质家族 趋化效应 CHEMOKINE 免疫细胞 细胞生长 靶细胞
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基于隐马尔可夫模型的多重序列分析
14
作者 罗泽举 朱思铭 何淼 《中山大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2005年第2期9-13,共5页
隐马尔可夫模型是最近几年在许多机器学习领域都得到成功应用的关于序列分析的重要统计模型,特别是在蛋白质家族的识别方面。这主要是由于生物数据的急剧增长导致2个领域(计算科学和生物学)走向结合引起的。探讨了多重序列比对和序列谱... 隐马尔可夫模型是最近几年在许多机器学习领域都得到成功应用的关于序列分析的重要统计模型,特别是在蛋白质家族的识别方面。这主要是由于生物数据的急剧增长导致2个领域(计算科学和生物学)走向结合引起的。探讨了多重序列比对和序列谱隐马尔可夫模型,讨论了隐马尔可夫模型的基本算法以及如何建立HMMs。根据E值和训练分数进行蛋白质家族的识别和分类。 展开更多
关键词 隐马尔可夫模型 多重序列比对 蛋白质家族的分类
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鱼皮胶原及多肽的特点和应用
15
作者 刘从力 任红梅 王彩理 《科学养鱼》 北大核心 2012年第5期75-76,共2页
胶原是一个蛋白质家族,目前为止人体内的胶原蛋白有二十多种,不同类型的胶原蛋白在分子结构及免疫学特征上有所不同,胶原蛋白是动物体内含量最丰富的蛋白质,占人体蛋白质总量的30%以上,
关键词 皮胶原 蛋白质家族 应用 多肽 胶原蛋白 动物体内 分子结构
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多肽寡肽与小肽及其在水产养殖业的应用 被引量:1
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作者 王玉堂 《中国水产》 2014年第12期61-63,共3页
一、鱼皮胶原及多肽的特点和应用 胶原是一个蛋白质家族,到目前为止的研究表明,人体内的胶原蛋白有二十多种。不同类型的胶原蛋白在分子结构及免疫学特征上有所不同。胶原蛋白是动物体内含量最丰富的蛋白质,占人体蛋白质总量的30%... 一、鱼皮胶原及多肽的特点和应用 胶原是一个蛋白质家族,到目前为止的研究表明,人体内的胶原蛋白有二十多种。不同类型的胶原蛋白在分子结构及免疫学特征上有所不同。胶原蛋白是动物体内含量最丰富的蛋白质,占人体蛋白质总量的30%以上,属于不溶性纤维型蛋白质,从动物中可提取不同组织中的不同类型的胶原蛋白,其功能和作用也各不相同。提取胶原蛋白能够溶解的一般是前胶原。 展开更多
关键词 水产养殖业 应用 多肽 蛋白质家族 胶原蛋白 小肽 寡肽 动物体内
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结构基因组学研究与核磁共振 被引量:3
17
作者 刘东升 王金凤 《生物化学与生物物理进展》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2001年第6期827-831,共5页
各种生物的基因组DNA测序计划的完成 ,将结构生物学带入了结构基因组学时代 .结构基因组学是对所有基因组产物结构的系统性测定 ,它运用高通量的选择、表达、纯化以及结构测定和计算分析手段 ,为基因组的每个蛋白质产物提供实验测定的... 各种生物的基因组DNA测序计划的完成 ,将结构生物学带入了结构基因组学时代 .结构基因组学是对所有基因组产物结构的系统性测定 ,它运用高通量的选择、表达、纯化以及结构测定和计算分析手段 ,为基因组的每个蛋白质产物提供实验测定的结构或较好的理论模型 ,这将加速生命科学各个领域的研究 .生物信息学、基因工程、结构测定技术等的发展为结构基因组学研究提供了保证 .近年来核磁共振在技术方法上的进展 。 展开更多
关键词 结构基因组学 基因组 蛋白质家族 三维结构 核磁共振
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VGLL4基因多态性与幽门螺杆菌感染的关系
18
作者 杨霞 董文杰 +4 位作者 武金宝 马立聪 孟宪梅 高芳 贾彦彬 《安徽医科大学学报》 CAS 北大核心 2023年第1期115-119,共5页
目的探讨残留样蛋白质家族成员4(VGLL4)基因单核苷酸多态性(SNP)与幽门螺杆菌(H.pylori)感染的关系。方法选取450例体检者的血液样本,采用ELISA法将样本分为幽门螺杆菌阴性组(n=220)和幽门螺杆菌阳性组(n=230)。采用聚合酶链式反应-限... 目的探讨残留样蛋白质家族成员4(VGLL4)基因单核苷酸多态性(SNP)与幽门螺杆菌(H.pylori)感染的关系。方法选取450例体检者的血液样本,采用ELISA法将样本分为幽门螺杆菌阴性组(n=220)和幽门螺杆菌阳性组(n=230)。采用聚合酶链式反应-限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)技术对VGLL4 SNP rs1803489、rs7617620、rs13078528位点进行基因分型。结果内蒙古包头地区汉族人群中VGLL4基因SNP rs1803489、rs7617620、rs13078528与幽门螺杆菌感染没有关联。结论在内蒙古包头地区的汉族人群中VGLL4基因SNP rs1803489、rs7617620、rs13078528在幽门螺杆菌感染中不起主要作用。 展开更多
关键词 残留样蛋白质家族成员4 单核苷酸多态性 幽门螺杆菌 遗传易感性
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信号转导及转录激活子1的研究进展
19
作者 邹丹 郑冬 《上海畜牧兽医通讯》 2011年第2期23-25,共3页
以细胞因子CK研究为基础发现的信号传导机制JAK—STAT途径,在免疫反应等许多生命现象中发挥重要作用。信号转导及转录激活子1(signal transducer and activator of transcription,STAT1)是具有信号转导和转录调节功能的蛋白质家族第... 以细胞因子CK研究为基础发现的信号传导机制JAK—STAT途径,在免疫反应等许多生命现象中发挥重要作用。信号转导及转录激活子1(signal transducer and activator of transcription,STAT1)是具有信号转导和转录调节功能的蛋白质家族第一成员, 展开更多
关键词 转录激活子 信号转导 信号传导机制 蛋白质家族 STAT 细胞因子 生命现象 免疫反应
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美国科学家开展《全球海洋取样考察(GOS)》计划,旨在解密海洋基因图谱
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《生物学教学》 北大核心 2008年第4期78-78,共1页
据2007年10月4日《参考消息》援引西班牙《世界报》文章报导,人类基因组计划的主要参与者——美国科学家克雷格·文特尔——提出并正在实施一项更加大胆的全新计划:利用他自己的研究室解密海洋基因图谱,并最终建立一份有关海洋... 据2007年10月4日《参考消息》援引西班牙《世界报》文章报导,人类基因组计划的主要参与者——美国科学家克雷格·文特尔——提出并正在实施一项更加大胆的全新计划:利用他自己的研究室解密海洋基因图谱,并最终建立一份有关海洋微生物的详细目录。迄今为止,这项被命名为全球海洋取样考察(GOS)计划的研究工作已经获得了600多万个新基因及数千个蛋白质家族。 展开更多
关键词 美国科学家 全球海洋 基因图谱 取样 解密 人类基因组计划 海洋微生物 蛋白质家族
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