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烟草丛顶病毒完整基因组上微卫星分布 被引量:4
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作者 杨纪青 袁磊 陈洪萍 《湖北农业科学》 北大核心 2011年第3期603-605,共3页
为了提取并展示NCBI数据库中烟草丛顶病毒完整基因组(NC-004366.1)上微卫星分布特性,采用MATLAB软件和最优完全子图算法自编了计算机程序进行。结果表明,烟草丛顶病毒完整基因组上n-碱基组(n=1~6)最大的重复出现次数随n增加而按指数函... 为了提取并展示NCBI数据库中烟草丛顶病毒完整基因组(NC-004366.1)上微卫星分布特性,采用MATLAB软件和最优完全子图算法自编了计算机程序进行。结果表明,烟草丛顶病毒完整基因组上n-碱基组(n=1~6)最大的重复出现次数随n增加而按指数函数减少。 展开更多
关键词 烟草丛顶病毒 完整基因组 微卫星 分布特性 最优完全子图算法
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烟草脉清病毒完整基因组上微卫星分布特性研究
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作者 杨纪青 《安徽农业科学》 CAS 北大核心 2010年第32期18082-18085,共4页
借助MATLAB软件和最优完全子图算法,提取并展示NCBI数据库中烟草脉清病毒完整基因组(NC-003 378.1)上微卫星分布特性。结果表明,计算出了各种1碱-基组~6-碱基组在完整基因组序列上重复出现次数和出现位置,并展示它们的分布规律(指数... 借助MATLAB软件和最优完全子图算法,提取并展示NCBI数据库中烟草脉清病毒完整基因组(NC-003 378.1)上微卫星分布特性。结果表明,计算出了各种1碱-基组~6-碱基组在完整基因组序列上重复出现次数和出现位置,并展示它们的分布规律(指数函数)。烟草脉清病毒完整基因组上各种N-碱基组最大的重复出现次数,随N按指数函数数减少;各种N-碱基组重复出现次数由少到多排序的结果,重复出现次数随序号增加。该研究方法可以系统地运用到其他病毒完整基因组序列微卫星分布特性的提取和展示,从而为有效利用微卫星分布特性研究完整基因组的结构和功能、遗传和变异规律提供依据。 展开更多
关键词 烟草脉清病毒 完整基因组 微卫星 分布特性 最优完全子图算法
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张国捷教授团队合作成果构建人类二倍体完整基因组
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《浙江大学学报(医学版)》 CAS CSCD 北大核心 2023年第4期416-416,共1页
2023年7月14日,浙江大学张国捷团队与深圳农业基因组研究所阮珏研究员团队和华大生命科学研究院合作在《细胞研究》(Cell Research)上发表了题为“The complete and fully-phased diploid genome of a male Han Chinese”(DOI:10.1038/s... 2023年7月14日,浙江大学张国捷团队与深圳农业基因组研究所阮珏研究员团队和华大生命科学研究院合作在《细胞研究》(Cell Research)上发表了题为“The complete and fully-phased diploid genome of a male Han Chinese”(DOI:10.1038/s41422-023-00849-5)的研究论文,攻关了二倍体完整基因组组装解决方案,完成了首个人类“端粒到端粒”二倍体完整参考基因组“CN1”,为我国精准医学研究及应用提供重要参考数据。 展开更多
关键词 精准医学 团队合作 生命科学 参考数据 端粒 基因组组装 完整基因组
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国际首例猪T2T全基因组组装成功
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《北方牧业》 2025年第4期2-2,共1页
近日,记者从中国农业科学院北京畜牧兽医研究所获悉,国际首例猪T2T全基因组组装——民猪完整基因组构建成功完成,标志着猪基因组研究迈入“完整解析”新时代。据悉,该成果由中国农业科学院北京畜牧兽医研究所张龙超研究员团队,黑龙江省... 近日,记者从中国农业科学院北京畜牧兽医研究所获悉,国际首例猪T2T全基因组组装——民猪完整基因组构建成功完成,标志着猪基因组研究迈入“完整解析”新时代。据悉,该成果由中国农业科学院北京畜牧兽医研究所张龙超研究员团队,黑龙江省农业科学院畜牧研究所刘娣研究员团队,重庆市畜牧科学院王金勇研究员团队,岳麓山实验室印遇龙院士团队,四川农业大学李明洲教授团队联合攻关,基于三代测序、ONT、Hi-C等前沿技术,填补了猪T2T基因组组装领域的空白,为猪遗传育种和功能基因挖掘提供了高精度“蓝图”,成果达到国际领先水平。 展开更多
关键词 猪T2T全基因组 前沿技术 完整基因组
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DNA连接酶Ⅲ在线粒体基因组完整性保持中的作用
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作者 郭晓强 沈永青 +2 位作者 郭振清 常彦忠 段相林 《生物化学与生物物理进展》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2012年第1期31-34,共4页
真核DNA连接酶(DNA ligase)通过催化ATP依赖的双链DNA切口连接而在DNA复制、重组和修复过程中发挥了重要作用.DNA连接酶Ⅲ(Lig3)是一种独特性的连接酶,既可定位于细胞核,又可定位于线粒体.Lig3通过与DNA修复蛋白XRCC1作用而参与了碱基... 真核DNA连接酶(DNA ligase)通过催化ATP依赖的双链DNA切口连接而在DNA复制、重组和修复过程中发挥了重要作用.DNA连接酶Ⅲ(Lig3)是一种独特性的连接酶,既可定位于细胞核,又可定位于线粒体.Lig3通过与DNA修复蛋白XRCC1作用而参与了碱基切除修复和其他单链断裂修复.但Lig3以XRCC1不依赖方式在线粒体DNA完整性保持方面发挥了更为重要的作用.这些研究为Lig3功能和DNA修复研究提供了新的视野. 展开更多
关键词 DNA连接酶Ⅲ DNA修复 线粒体DNA 基因组完整
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转基因动物中癌基因的表达与染色体易位
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作者 王生 蔡有余 《中国比较医学杂志》 CAS 1991年第Z1期112-115,共4页
简介1980年出现了第一个转基因动物——转基因小鼠,从此科学界开拓了新的研究领域。转基因动物的研究不仅有助于基础理论工作,在应用领域中亦有广泛前景。转基因动物是在其受精卵完整基因组中插入一段外来DNA序列的动物。构建转基因动... 简介1980年出现了第一个转基因动物——转基因小鼠,从此科学界开拓了新的研究领域。转基因动物的研究不仅有助于基础理论工作,在应用领域中亦有广泛前景。转基因动物是在其受精卵完整基因组中插入一段外来DNA序列的动物。构建转基因动物有多种方法,其中最普遍的是将外源DNA注入单细胞胚胎的前核,使其整合入基因组中。将这种单细胞胚胎植入同种生物母体子宫,使其发育为变化了的个体——转基因动物。据报道,这种方法制造转基因动物约有25%的成功率。 展开更多
关键词 基因动物 染色体易位 基因表达调节 完整基因组 同种生物 胚胎植入 基因 外源 DNA 启动子
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华大:自主研发生物科技创新 实现基因科技造福人类 被引量:1
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《生物产业技术》 2016年第5期86-88,共3页
从参与人类基因组计划起步,到第一个中国人基因组图谱的绘制完成,再到最近推出的国产测序仪——桌面化测序系统BGISEQ-500,华大无创产前基因检测全临床应用突破100万例,华大农业集团成立,深圳华大正瞄准着打造世界基因测序航母的目标在... 从参与人类基因组计划起步,到第一个中国人基因组图谱的绘制完成,再到最近推出的国产测序仪——桌面化测序系统BGISEQ-500,华大无创产前基因检测全临床应用突破100万例,华大农业集团成立,深圳华大正瞄准着打造世界基因测序航母的目标在科技创新的道路上继续前进。 展开更多
关键词 人类基因组计划 测序仪 测序技术 继续前进 基因组 全球合作 GENOMICS 子里 完整基因组 亚洲人
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