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基于DNA提取方法优化转基因小鼠基因分型研究
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作者 夏雨 余静 +3 位作者 康露 张欣 马娓 严军 《重庆医科大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第4期415-420,共6页
目的:探讨DNA提取方法优化后对转基因小鼠基因分型结果的影响,并比较分析与业内常用试剂盒基因型鉴定结果的差异。方法:在团队前期专利基础上,改进了DNA裂解液的配方和实验流程,并以新型转录因子Musculin和增强型绿色荧光蛋白(enhanced ... 目的:探讨DNA提取方法优化后对转基因小鼠基因分型结果的影响,并比较分析与业内常用试剂盒基因型鉴定结果的差异。方法:在团队前期专利基础上,改进了DNA裂解液的配方和实验流程,并以新型转录因子Musculin和增强型绿色荧光蛋白(enhanced green fluorescent protein,EGFP)转基因小鼠为例,对基因分型结果进行了比较研究和验证。结果:DNA提取时现配裂解液配方为100μL 0.025 N NaOH工作液、160μL 0.5 M EDTA工作液和40 mL超纯水;每个样本加入180μL裂解液,100℃30 min。与相关领域常用的基因分型试剂盒相比,该DNA提取优化方案能够在确保鉴定准确的前提下有效缩短基因分型时间,而且裂解液配置方法简单,反应次数多,步骤更简便,可大幅降低试剂成本和工作量。结论:本研究提供1种适用于转基因小鼠基因分型的经济、简单、可靠的DNA提取技术,具有较好的应用和推广价值。 展开更多
关键词 转基因小鼠 dna提取 基因分型 优化
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食用植物油DNA提取方法比较及优化研究
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作者 甘生睿 王进英 +2 位作者 王淑珍 杨芙蓉 董国鑫 《中国粮油学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第8期157-164,共8页
以油菜籽、芝麻和亚麻籽为原料,螺旋压榨法制油,采用乳化法、富集法、十六烷基三甲基溴化胺(CTAB)法、树脂试剂盒法和冷冻干燥法提取植物油DNA,并通过超微量可见分光光度计、实时聚合酶链式反应(PCR)、微卫星(SSR)分子标记评价DNA质量... 以油菜籽、芝麻和亚麻籽为原料,螺旋压榨法制油,采用乳化法、富集法、十六烷基三甲基溴化胺(CTAB)法、树脂试剂盒法和冷冻干燥法提取植物油DNA,并通过超微量可见分光光度计、实时聚合酶链式反应(PCR)、微卫星(SSR)分子标记评价DNA质量。结果表明CTAB法提取的DNA质量浓度高、纯度好、耗时短、起始油量低、费用低、适合分子分析。选择CTAB法,考察起始油量、有机化合物添加、裂解缓冲液组成、裂解和沉淀时间的提取效率。优化条件为最低起始油量100μL,有机化合物添加CTAB-氯仿∶异戊醇(CTAB-C∶I),裂解缓冲液组成为CTAB-β巯基乙醇-蛋白酶K(CTAB-βME-PK),裂解20 min,沉淀9 h。该方法在7种精炼植物油中提取到适合分子溯源的DNA,为植物油可追溯性和真实性检测提供了技术支撑。 展开更多
关键词 食用植物油 dna提取 方法优化 SSR分子标记
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白鲢和鳙鱼的随机扩增多态DNA分析 被引量:28
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作者 张锡元 杨建琪 +3 位作者 张德春 邓凤姣 余来宁 方耀林 《生物化学与生物物理进展》 SCIE CAS CSCD 北大核心 1999年第5期469-472,共4页
根据鱼类外周血细胞都有核的特点, 采用从冷冻和低渗双重处理分离的细胞核提取基因组DNA. 以此法获得的白鲢和鳙鱼的基因组DNA为模板, 和Operon 公司生产的OPN 和OPM 两个组共40 个随机引物, 对这两种鱼进行了... 根据鱼类外周血细胞都有核的特点, 采用从冷冻和低渗双重处理分离的细胞核提取基因组DNA. 以此法获得的白鲢和鳙鱼的基因组DNA为模板, 和Operon 公司生产的OPN 和OPM 两个组共40 个随机引物, 对这两种鱼进行了随机扩增多态DNA (RAPD) 分析; 确定了对这两种鱼基因组相关区域可进行随机PCR扩增的有效引物, 特别是哪些可产生种群内或群体的RAPD 遗传标记, 即可产生个体特异性和群体特异性RAPD带谱的引物. 讨论了RAPD遗传分子标记在鱼类遗传, 特别是遗传多样性研究, 和鱼类种质资源评估和管理中的应用前景问题. 展开更多
关键词 鱼类 基因组 RAPD分析 遗传多样性 dna 提取
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一种优化的植物总DNA提取方法 被引量:39
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作者 黄萱 高丽美 +1 位作者 张永彦 徐子勤 《西北植物学报》 CAS CSCD 2004年第6期1103-1106,共4页
根据自己提取植物基因组DNA的实际经验,改进了Clark利用CTAB提取植物基因组DNA的方法.在试验过程中发现,通过在研磨材料时加入液氮、用剪去端部的吸头转移含有DNA的溶液,并且将加入RNaseA消化RNA的步骤改在最后进行等一系列改进,可以获... 根据自己提取植物基因组DNA的实际经验,改进了Clark利用CTAB提取植物基因组DNA的方法.在试验过程中发现,通过在研磨材料时加入液氮、用剪去端部的吸头转移含有DNA的溶液,并且将加入RNaseA消化RNA的步骤改在最后进行等一系列改进,可以获得高质量的DNA.本文同时就主要提取步骤进行了分析. 展开更多
关键词 植物总dna 提取 方法优化
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榉属植物总DNA提取方法研究 被引量:31
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作者 金晓玲 乌云塔娜 +1 位作者 张智俊 何平 《植物研究》 CAS CSCD 北大核心 2004年第1期107-110,共4页
榉属植物体内酚类、多糖等次生物质含量较高 ,严重影响从中提取总DNA的产量和质量。针对这一问题探索出一种适合榉属植物总DNA的提取方法 ,并对提取的总DNA进行了纯度和浓度的鉴定。结果表明此方法可有效去除次生物质对DNA的干扰 ,样品... 榉属植物体内酚类、多糖等次生物质含量较高 ,严重影响从中提取总DNA的产量和质量。针对这一问题探索出一种适合榉属植物总DNA的提取方法 ,并对提取的总DNA进行了纯度和浓度的鉴定。结果表明此方法可有效去除次生物质对DNA的干扰 ,样品DNA的质量和纯度较高 。 展开更多
关键词 榉属 dna提取 RAPD 木本植物 榆科
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沙门氏菌DNA提取及PCR反应条件的优化 被引量:29
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作者 邵碧英 陈彬 +2 位作者 汤敏英 吴谦 张体银 《食品科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2007年第7期331-334,共4页
分别采用煮沸法和CTAB/NaCl法提取沙门氏菌及对照菌株的基因组DNA,紫外测定和电泳结果表明CTAB/NaCl法提取到的DNA的浓度和纯度较煮沸法理想。合成分别扩增沙门氏菌属特异基因hut基因(495bp)、hilA基因(490bp)、invA基因(284bp)和hns基... 分别采用煮沸法和CTAB/NaCl法提取沙门氏菌及对照菌株的基因组DNA,紫外测定和电泳结果表明CTAB/NaCl法提取到的DNA的浓度和纯度较煮沸法理想。合成分别扩增沙门氏菌属特异基因hut基因(495bp)、hilA基因(490bp)、invA基因(284bp)和hns基因(152bp)的引物,对PCR反应条件进行了优化。结果表明可同时用于这四种基因检测的PCR反应条件为:94℃预变性5min;94℃变性40s,60℃退火40s,72℃延伸50s,40个循环;72℃延伸5min。 展开更多
关键词 沙门氏菌 基因组dna PCR 优化
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石榴DNA提取方法的比较及抗氧化剂对DNA质量的影响 被引量:14
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作者 杨荣萍 李文祥 +1 位作者 龙雯虹 杨正安 《云南农业大学学报》 CAS CSCD 2005年第5期624-626,共3页
比较了SDS-CTAB微量提取法和改进的SDS微量提取法提取的石榴叶片DNA质量,结果认为两种方法提取的DNA均可用于RAPD分析,但SDS微量提取法较适合于石榴叶片DNA的提取。试验中还研究了抗氧化剂PVP,α-巯基乙醇和抗坏血酸3种试剂单独使用及PV... 比较了SDS-CTAB微量提取法和改进的SDS微量提取法提取的石榴叶片DNA质量,结果认为两种方法提取的DNA均可用于RAPD分析,但SDS微量提取法较适合于石榴叶片DNA的提取。试验中还研究了抗氧化剂PVP,α-巯基乙醇和抗坏血酸3种试剂单独使用及PVP与α-巯基乙醇混合使用对SDS-CTAB微量提取法的影响,发现与对照相比,单独加抗坏血酸及PVP与α-巯基乙醇混合使用能很好地防止DNA在提取过程中的褐化。 展开更多
关键词 石榴 dna提取 抗氧化剂 dna提取方法 质量 叶片dna RAPD分析 巯基乙醇 混合使用 抗坏血酸
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水稻玉米基因组DNA提取方法的改进 被引量:11
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作者 陶刚 刘作易 +3 位作者 朱英 宋吉轩 陈泽辉 阮仁超 《贵州农业科学》 CAS 2004年第6期21-23,共3页
以水稻、玉米为材料 ,对其基因组DNA的提取方法进行改进 ,通过减少饱和酚和氯仿等有机试剂处理次数 ,适当延长有机试剂的抽提时间 ,提高提取DNA的得率和纯度 ,并且能更有效地避免干扰物质的污染 ,得到均一的大片段的DNA。检测结果表明 ... 以水稻、玉米为材料 ,对其基因组DNA的提取方法进行改进 ,通过减少饱和酚和氯仿等有机试剂处理次数 ,适当延长有机试剂的抽提时间 ,提高提取DNA的得率和纯度 ,并且能更有效地避免干扰物质的污染 ,得到均一的大片段的DNA。检测结果表明 ,该方法普遍适合玉米、水稻作物材料的DNA提取 。 展开更多
关键词 玉米 水稻 作物 稻作 dna提取 纯度 次数 检测结果 处理 干扰物质
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几种中药DNA提取方法的比较研究 被引量:22
9
作者 陈莉 魏莉 +3 位作者 周童 李敏瑜 覃玉斌 吴耀生 《广西植物》 CAS CSCD 北大核心 2007年第1期137-139,136,共4页
以丹参、绞股蓝、三七为材料,分别采取CTAB法和SDS法提取基因组DNA,并通过紫外分光光度法和琼脂糖凝胶电泳对所提取的DNA样品进行检测,将它们在DNA产量、质量等方面的优缺点进行总结。结果表明,CTAB法能从丹参、绞股蓝中提取高质量的DNA... 以丹参、绞股蓝、三七为材料,分别采取CTAB法和SDS法提取基因组DNA,并通过紫外分光光度法和琼脂糖凝胶电泳对所提取的DNA样品进行检测,将它们在DNA产量、质量等方面的优缺点进行总结。结果表明,CTAB法能从丹参、绞股蓝中提取高质量的DNA,而三七的DNA更适合用SDS法提取。 展开更多
关键词 丹参 绞股蓝 三七 基因组dna dna提取
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棕榈藤基因组DNA提取及RAPD反应条件探索 被引量:9
10
作者 李发根 杨华 +2 位作者 尹光天 许煌灿 甘四明 《林业科学研究》 CSCD 北大核心 2004年第6期824-828,共5页
Genomic DNA was successfully extracted from leaf tissues of two rattan species,Calamus simplificifolius and Daemonorops margaritae,using a modified CTAB method.This method could remove phenolic compounds,polysaccharid... Genomic DNA was successfully extracted from leaf tissues of two rattan species,Calamus simplificifolius and Daemonorops margaritae,using a modified CTAB method.This method could remove phenolic compounds,polysaccharides and proteins,and the quality and quantity of DNA extracted were reliably characterized.In addition,the reaction composition and amplification program for RAPD analysis were developed with GeneAmp PCR System 2700 (Applied Biosystem Co.).This study provided a technological basis for future molecular studies in rattan and the related species. 展开更多
关键词 棕榈藤 基因组 dna 提取 RAPD 反应条件
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中国榛属植物DNA提取与SSR初步分析 被引量:16
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作者 王艳梅 程丽莉 +2 位作者 翟明普 马天晓 黄武刚 《河南师范大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2007年第2期129-132,共4页
为了探讨适合中国榛属植物基因组DNA的提取方法,分析榛属植物的遗传多样性,本实验以榛属植物的叶片为试材,通过对Doyle和Doyle方法的改良,摸索出适于中国榛属植物基因组DNA提取的方法,并以核酸产量、纯度、片断分布情况等指标来评... 为了探讨适合中国榛属植物基因组DNA的提取方法,分析榛属植物的遗传多样性,本实验以榛属植物的叶片为试材,通过对Doyle和Doyle方法的改良,摸索出适于中国榛属植物基因组DNA提取的方法,并以核酸产量、纯度、片断分布情况等指标来评价,获得高质量基因组DNA;同时应用4对欧榛SSR引物对中国榛属植物进行了跨种转移,并对具有商业潜力的平榛、毛榛和川榛3个种的遗传多样性进行了初步评价,4对引物从3个种的29个样本中扩增出33个等位基因,位点拥有的等位基因数量在6~12个之间,位点平均等位基因数为8.38.上述结果表明SSR是用于榛属种间育种、品种鉴定以及种间遗传图构建的有力工具. 展开更多
关键词 榛子 dna提取 SSR
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漾濞核桃叶片基因组DNA的两种提取方法效果比较 被引量:25
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作者 杨恩 陈少瑜 +2 位作者 张雨 范志远 习学良 《西部林业科学》 CAS 2005年第4期72-75,共4页
以漾濞核桃不同生长期的叶片为材料,采用高盐低pH法和改良CTAB法作提取其基因组DNA的效果比较实验。通过琼脂糖凝胶电泳、紫外分光光度计和RAPD扩增对所提取的DNA样品进行检测,比较所得DNA的产量、质量,认为从漾濞核桃不同发育时期叶片... 以漾濞核桃不同生长期的叶片为材料,采用高盐低pH法和改良CTAB法作提取其基因组DNA的效果比较实验。通过琼脂糖凝胶电泳、紫外分光光度计和RAPD扩增对所提取的DNA样品进行检测,比较所得DNA的产量、质量,认为从漾濞核桃不同发育时期叶片中获得DNA的提取效果不同。4种叶样以冬芽和新叶的效果为好,老叶最差;用两种提取方法从叶片中得到的DNA产量和质量有所不同,高盐低pH法提取的DNA纯度高,但是产量较低;而改良CTAB法则相反,产量高,纯度低。 展开更多
关键词 漾濞核桃 叶片 基因组dna dna提取方法
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羊角槭基因组DNA提取及SRAP-PCR体系优化 被引量:13
13
作者 李倩中 刘晓宏 +1 位作者 苏家乐 丛郁 《江苏农业学报》 CSCD 北大核心 2009年第3期538-541,共4页
采用CTAB法、SDS法、偏重亚硫酸钠法提取槭属中羊角槭基因组DNA,通过DNA含量测定、琼脂糖凝胶电泳检测对所提DNA质量进行分析。结果表明,3种提取方法中CTAB法最适合提取羊角槭基因组DNA,所得DNA的质量和纯度较高。以CTAB法提取的DNA为... 采用CTAB法、SDS法、偏重亚硫酸钠法提取槭属中羊角槭基因组DNA,通过DNA含量测定、琼脂糖凝胶电泳检测对所提DNA质量进行分析。结果表明,3种提取方法中CTAB法最适合提取羊角槭基因组DNA,所得DNA的质量和纯度较高。以CTAB法提取的DNA为模板进行SRAP扩增反应,对SRAP反应体系的dNTPs浓度、Mg2+浓度、引物浓度3个主要影响因子进行筛选。获得羊角槭SRAP最优反应体系为:50μl的PCR体系中含有DNA模板100 ng、10×PCR Buffer(不含Mg2+)、Mg2+2.5 mmol/L、dNTPs 0.2 mmol/L、引物0.5μmol/L、TaqDNA聚合酶1.0 U。 展开更多
关键词 羊角槭 基因组dna 提取 SRAP 体系优化
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苎麻总DNA提取的CTAB法优化方案 被引量:27
14
作者 侯思名 段继强 +3 位作者 梁雪妮 丁小维 肖伏 刘飞虎 《西北植物学报》 CAS CSCD 北大核心 2005年第11期2193-2197,共5页
根据苎麻组织自身含有较多的酚类、粘状物及黄酮类等次生代谢物质的特点,对CTAB法进行优化后用于提取苎麻组织总DNA.在研磨过程中加入抗氧化剂PVP,提取缓冲液中加入终浓度6%的PVP和4%的β-巯基乙醇,可防止整个提取过程中溶液变褐;在第2... 根据苎麻组织自身含有较多的酚类、粘状物及黄酮类等次生代谢物质的特点,对CTAB法进行优化后用于提取苎麻组织总DNA.在研磨过程中加入抗氧化剂PVP,提取缓冲液中加入终浓度6%的PVP和4%的β-巯基乙醇,可防止整个提取过程中溶液变褐;在第2次用氯仿/异戊醇抽提时,加入10%的CTAB和4%的N aC l高盐溶液,以除去多糖.经几种改良方案提取总DNA的ISSR-PCR扩增结果验证,以同时加入抗氧化剂和高盐溶液的CTAB-4法效果最好. 展开更多
关键词 苎麻 dna提取 CTAB法 优化
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一种简便实用的玉米干种子基因组DNA提取方法 被引量:14
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作者 魏琦超 畅丽萍 +2 位作者 周岩 宫俊丽 王慧娟 《广东农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2009年第6期165-167,共3页
利用改良的CTAB法提取玉米干种子基因组DNA,DNA样品经紫外光谱吸收、琼脂糖凝胶电泳、PCR和酶切检测,表明获得的DNA样品纯度较好、无明显降解,DNA质量可满足下游分子生物学实验要求,证实该方法是提取玉米基因组DNA的一种有效方法。
关键词 玉米 干种子 基因组dna 提取
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美花石斛基因组DNA提取方法的比较 被引量:14
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作者 包英华 白音 +2 位作者 谭庆辉 彭凌 阙生全 《热带亚热带植物学报》 CAS CSCD 北大核心 2007年第2期147-151,共5页
采用CTAB法、尿素法、高盐低pH法、SDS法和陈大明法等5种方法提取美花石斛(Dendrobium loddigesii Rolfe)基因组总DNA,通过电泳、紫外光谱分析和RAPD-PCR扩增等检测手段,比较分析了DNA质量。DNA条带显示改良CTAB法和改良尿素法较好。
关键词 美花石斛 基因组dna dna提取方法
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植物总基因组DNA提取纯化方法综述 被引量:69
17
作者 易庆平 罗正荣 张青林 《安徽农业科学》 CAS 北大核心 2007年第25期7789-7791,共3页
归纳植物DNA提取各个环节,同时对DNA提取过程中的常见问题、原因及应对策略作简要的分析。
关键词 植物 总基因组dna 提取 纯化 进展
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木本植物基因组DNA提取及鉴定 被引量:28
18
作者 王军 杨传平 刘桂丰 《植物研究》 CAS CSCD 北大核心 2006年第5期589-594,共6页
采用改良后的CTAB法,对山葡萄、软枣猕猴桃、蒙古栎、核桃楸、西伯利亚红松和偃松基因组DNA进行提取。结果表明,所提基因组DNA分子量与XDNA(48kb)接近,其紫外吸收比在1.66~1.89之间。第3次和第4次上清提取的DNA质量优于第1次和... 采用改良后的CTAB法,对山葡萄、软枣猕猴桃、蒙古栎、核桃楸、西伯利亚红松和偃松基因组DNA进行提取。结果表明,所提基因组DNA分子量与XDNA(48kb)接近,其紫外吸收比在1.66~1.89之间。第3次和第4次上清提取的DNA质量优于第1次和第2次。从提取产量看,每克鲜重提取DNA量最小为15μg·g^-1(核桃楸第4次上清),最高的为272μg·g^-1(山葡萄第3次上清)。西伯利亚红松和偃松第1次和第2次上清基本未提出DNA,第3次和第4次上清中得到了较高质量的DNA。经酶切鉴定和PCR扩增,所提的基因组DNA可以用于进一步研究。 展开更多
关键词 木本植物 基因组dna 提取
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一种适合枣和酸枣基因组DNA的提取方法 被引量:48
19
作者 彭建营 束怀瑞 彭士琪 《河北农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2000年第4期46-48,52,共4页
研究比较了CTAB法和SDS法在枣和酸枣基因组DNA提取中的效果 ,并分析了取样时间、部位、样品状况、抗氧化剂和不同纯化处理等对所提DNA质和量及其RAPD扩增效果的影响。结果表明 :用改良后的CTAB法优于SDS法 ,可有效地去除多糖 ,所提DNA... 研究比较了CTAB法和SDS法在枣和酸枣基因组DNA提取中的效果 ,并分析了取样时间、部位、样品状况、抗氧化剂和不同纯化处理等对所提DNA质和量及其RAPD扩增效果的影响。结果表明 :用改良后的CTAB法优于SDS法 ,可有效地去除多糖 ,所提DNA的质和量均能满足PCR扩增要求。取样时间与部位对所提基因组DNA的质量无影响 ,但与产量有关 ,以旺盛生长期的幼叶或嫩梢尖为佳。样品采后液氮处理 - 70℃低温保存 ,与新鲜材料所提DNA差异不大。抗氧化剂可有效地阻止多酚类物质氧化变褐 ,1%的 β 巯基乙醇即可满足要求。 展开更多
关键词 酸枣 基因组 dna制备
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鸡基因组DNA不同提取方法的比较研究 被引量:13
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作者 马新红 亢娟娟 +6 位作者 康相涛 韩瑞丽 孙桂荣 潘军 黄煌 刘凯 张立恒 《江西农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2010年第1期181-184,共4页
实验用优化煮沸法提取鸡血液基因组DNA,经核酸蛋白定量仪检测,DNA的OD260/OD280达1.77±0.06,证明所提DNA质量较好,用于PCR扩增,可以得到满意的扩增效果。与酚-氯仿法相比,优化煮沸法避免了用氯仿、酚等剧毒试剂,且节约了时间和成本... 实验用优化煮沸法提取鸡血液基因组DNA,经核酸蛋白定量仪检测,DNA的OD260/OD280达1.77±0.06,证明所提DNA质量较好,用于PCR扩增,可以得到满意的扩增效果。与酚-氯仿法相比,优化煮沸法避免了用氯仿、酚等剧毒试剂,且节约了时间和成本,是一种较好的提取基因组DNA的方法。 展开更多
关键词 基因组dna PCR扩增 提取方法
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