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广西砂糖橘黄龙病亚洲种的Nested-PCR检测 被引量:8
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作者 黄宏明 王茜 +2 位作者 徐宁 韦宗便 廖惠红 《南方农业学报》 CAS CSCD 北大核心 2013年第12期1997-2000,共4页
【目的】利用柑橘黄龙病病原亚洲种16S rDNA序列的特异引物检测疑似黄龙病的砂糖橘叶片样品,为砂糖橘黄龙病的综合防控提供理论依据。【方法】选取采自广西9市17个采样点的214份疑似黄龙病及无症状砂糖橘叶片样品,用试剂盒法提取叶脉基... 【目的】利用柑橘黄龙病病原亚洲种16S rDNA序列的特异引物检测疑似黄龙病的砂糖橘叶片样品,为砂糖橘黄龙病的综合防控提供理论依据。【方法】选取采自广西9市17个采样点的214份疑似黄龙病及无症状砂糖橘叶片样品,用试剂盒法提取叶脉基因组DNA,采用柑橘黄龙病亚洲种16S rDNA特异引物进行PCR扩增,扩增结果在1%琼脂糖凝胶电泳上检测,统计待检样品柑橘黄龙病病原菌亚洲种的带菌率。【结果】对214份样品的Nested-PCR扩增结果,部分样品可得到1160 bp左右的特异条带,与预期大小相符但条带明暗不同。来自广西9市17个采样点的砂糖橘叶片样品均检测出黄龙病亚洲种病原,平均检出率均在66.0%以上,其中检出率最高的是来自东兴市的样品,检出率为100.0%,检出率最低的是来自南宁市的样品,检出率为66.9%;斑驳、缺素型黄化、叶脉黄化、小叶和无症状叶片样品中均可检测出黄龙病亚洲种。【结论】Nested-PCR技术具有灵敏度高、特异性强的特点,能够快速、准确检测出各种症状样品的黄龙病病原,可用于柑橘黄龙病的早期诊断。 展开更多
关键词 砂糖橘 黄龙病病原 检测率 nestedpcr 广西
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禽弱毒疫苗中鸡传染性贫血病病毒nested-PCR检测方法的建立 被引量:3
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作者 李晓晗 房立春 +3 位作者 李阳 崔治中 常爽 赵鹏 《中国家禽》 北大核心 2017年第10期18-22,共5页
疫苗中污染鸡传染性贫血病毒(CIAV)是造成CIAV感染的途径之一,而通常疫苗中CIAV污染剂量较低,应用一般的技术难以检测到。为了更灵敏地检测禽弱毒疫苗中CIAV的污染,根据Gen Bank已发表的CIAV基因序列,针对其保守区设计了外用引物和内用... 疫苗中污染鸡传染性贫血病毒(CIAV)是造成CIAV感染的途径之一,而通常疫苗中CIAV污染剂量较低,应用一般的技术难以检测到。为了更灵敏地检测禽弱毒疫苗中CIAV的污染,根据Gen Bank已发表的CIAV基因序列,针对其保守区设计了外用引物和内用引物,通过优化反应体系和反应条件建立了检测CIAV的nested-PCR检测方法。结果显示,所建立的检测方法灵敏度比常规PCR高100倍,该方法可以检测到1 000羽份弱毒疫苗中1 EID_(50)的低剂量CIAV污染,应用该方法从送检的50个疫苗样品中检测出4个样品为CIAV阳性。该方法与禽白血病病毒、禽网状内皮组织增生症病毒以及马立克氏病病毒等的基因均无交叉反应,具有很好的特异性。提示所建立的nested-PCR灵敏度高、特异性强,可用于检测禽弱毒疫苗中CIAV低剂量的污染。 展开更多
关键词 CIAV nestedpcr 灵敏性 特异性 污染
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One tube nested-PCR在SNP基因型分型中的应用
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作者 张羽 张晓娟 +2 位作者 王胜宝 宋晓利 李小刚 《湖南农业大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2015年第2期136-142,共7页
nested–PCR是一种在普通PCR基础上发展起来的专门用于检测单核苷酸多态性(SNP)的技术。结合nested–PCR技术在水稻中检测SNP的研究,以1个水稻香味基因Fgr和3个稻瘟病基因Pi–ta、Pi9、Pigm为例,把nested–PCR的4条引物同时加在一管PCR... nested–PCR是一种在普通PCR基础上发展起来的专门用于检测单核苷酸多态性(SNP)的技术。结合nested–PCR技术在水稻中检测SNP的研究,以1个水稻香味基因Fgr和3个稻瘟病基因Pi–ta、Pi9、Pigm为例,把nested–PCR的4条引物同时加在一管PCR反应中进行扩增,在其序列内针对SNP位点设计功能标记,用来扩增含有突变位点的DNA片段。通过优化引物浓度梯度和改良反应程序,达到了一步快速检测SNP基因型的目的。 展开更多
关键词 nestedpcr 单核苷酸多态性 基因型分型
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湛江农垦红江橙主产区2个果园黄龙病的巢式PCR检测分析 被引量:1
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作者 赵丽宏 刘建荣 +3 位作者 张曼其 刘伟清 吴凡 冯学娟 《热带农业科学》 2020年第1期67-71,共5页
柑橘黄龙病(HLB)是柑橘生产上的一种毁灭性病害,对柑橘生产为害较重。为了明确柑橘黄龙病在红江橙果园中的分布及危害情况,进一步为柑橘黄龙病的综合防控提供有价值的参考,采用Nested PCR分子检测技术,于2016~2018年对湛江农垦红江橙主... 柑橘黄龙病(HLB)是柑橘生产上的一种毁灭性病害,对柑橘生产为害较重。为了明确柑橘黄龙病在红江橙果园中的分布及危害情况,进一步为柑橘黄龙病的综合防控提供有价值的参考,采用Nested PCR分子检测技术,于2016~2018年对湛江农垦红江橙主产区具有黄化、斑驳等症状的305个红江橙样本进行检测。结果表明,305个红江橙叶片样本中,HLB的阳性检出率为53.1%;其中红江农场38队红江橙果园黄龙病的阳性检出率为55.6%,广垦(湛江)红江橙农业科技有限公司横江红江橙果园黄龙病的阳性检出率为48.6%。柑橘黄龙病已在湛江农垦红江橙果园普遍发生,生产上应引起重视。 展开更多
关键词 红江橙 黄龙病 nested pcr
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传染性法氏囊病快速诊断技术的建立及其应用 被引量:13
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作者 龙进学 韦平 阳秀英 《广西大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 2003年第2期103-108,共6页
根据已发表的IBDV各致病型毒株的序列,在病毒结构蛋白VP2编码基因的高变区(VP2variabledo-main,vVP2)两端外侧的保守序列内设计合成了2条寡核苷酸引物,对各种不同致病型的12株参考毒株进行逆转录酶—聚合酶链式反应(RT-PCR)的检测.结果1... 根据已发表的IBDV各致病型毒株的序列,在病毒结构蛋白VP2编码基因的高变区(VP2variabledo-main,vVP2)两端外侧的保守序列内设计合成了2条寡核苷酸引物,对各种不同致病型的12株参考毒株进行逆转录酶—聚合酶链式反应(RT-PCR)的检测.结果12个参考毒株均能扩增出约679bp的目的片段,而对作为阴性对照的常见5种鸡病病原NDV、IBV、CAIV、E.coli、pM均没有扩增出任何片段;应用建立的技术对疑似IBD的34份临床病料进行检测,并同时在基础RT-PCR扩增的片段内设计另一对引物进行Nested-PCR检测.结果基础RT-PCR方法检测到11份阳性,Nested-PCR检测到23份阳性.研究的结果表明建立的IBD的RT-PCR诊断技术具有特异、快捷、敏感的特点.在此基础上设计的Nested-PCR则大大提高了阳性检出率(提高52.1%). 展开更多
关键词 IBDV vVP2 RT—pcr nestedpcr 快速诊断
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大豆根围丛枝菌根真菌鉴定 被引量:5
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作者 蔡柏岩 接伟光 《大豆科学》 CAS CSCD 北大核心 2009年第3期483-486,共4页
通过对大豆根围丛枝菌根(arbuscular mycorrhiza,AM)真菌鉴定和分子检测,为大豆菌根深入研究奠定基础。采集大豆根系和根围土壤,采用湿筛倾析法分离大豆根围土壤AM真菌孢子。依据AM真菌孢子形态特征及25S rDNA D1/D2区域序列分析对其进... 通过对大豆根围丛枝菌根(arbuscular mycorrhiza,AM)真菌鉴定和分子检测,为大豆菌根深入研究奠定基础。采集大豆根系和根围土壤,采用湿筛倾析法分离大豆根围土壤AM真菌孢子。依据AM真菌孢子形态特征及25S rDNA D1/D2区域序列分析对其进行分类鉴定,并应用Nested-PCR技术检测根围土壤AM真菌侵染大豆根系情况。结果表明:大豆根围土壤中存在2种AM真菌:根内球囊霉(Glomus intraradices)、摩西球囊霉(Glomus mosse-ae),并且两者均侵染大豆根系。 展开更多
关键词 大豆 丛枝菌根真菌 25S RDNA nestedpcr
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甜菜根际土壤AM真菌分离与分子鉴定 被引量:2
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作者 接伟光 蔡柏岩 白莉 《中国糖料》 2010年第2期12-14,共3页
为了揭示丛枝菌根(arbuscular mycorrhiza,AM)真菌与甜菜的共生关系,收集甜菜根系及根际土壤,采用湿筛倾析-蔗糖离心法分离甜菜根围土壤AM真菌孢子。利用形态学和分子生物学方法对分离得到的AM真菌孢子进行分类鉴定,并应用Nested-PCR技... 为了揭示丛枝菌根(arbuscular mycorrhiza,AM)真菌与甜菜的共生关系,收集甜菜根系及根际土壤,采用湿筛倾析-蔗糖离心法分离甜菜根围土壤AM真菌孢子。利用形态学和分子生物学方法对分离得到的AM真菌孢子进行分类鉴定,并应用Nested-PCR技术检测甜菜根际土壤AM真菌侵染甜菜根系情况。依据AM真菌孢子形态特征及25S rDNA D1/D2区域序列分析,鉴定出甜菜根围土壤中具有摩西球囊霉(Glomus mosseae),并且应用Nested-PCR技术从甜菜根内检测到了G.mosseae,表明G.mosseae侵染甜菜根系。 展开更多
关键词 甜菜 丛枝菌根真菌 根际土壤 25S RDNA nestedpcr
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番茄溃疡病一步法快速检测技术研究 被引量:4
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作者 王欢 刘箐 +7 位作者 刘芳 王军平 赵生国 陈洁 黄国银 朱蕴智 刘志杰 侯建雄 《甘肃农业科技》 2006年第5期12-15,共4页
对番茄细菌性溃疡病菌进行种子带菌的模拟检测试验。对用菌液处理过的种子进行简单抽提和纯化,不经过DNA提取而以抽提和纯化的病原菌为模板直接进行一步法PCR检测,对纯菌液D irect-PCR最低检出限为2 600个细菌/m l,而N ested-PCR最低检... 对番茄细菌性溃疡病菌进行种子带菌的模拟检测试验。对用菌液处理过的种子进行简单抽提和纯化,不经过DNA提取而以抽提和纯化的病原菌为模板直接进行一步法PCR检测,对纯菌液D irect-PCR最低检出限为2 600个细菌/m l,而N ested-PCR最低检出限可达到13个细菌/m l;对种子提取液,D irect-PCR不能检出,而N ested-PCR最低检出限可达到3×105个细菌/m l。一步法N ested-PCR可在12 h内对番茄种子携带的番茄溃疡病菌进行准确的定性鉴定。并且方法方便快速,成本低,灵敏度高,适用于种子携带番茄溃疡病菌的快速鉴定。 展开更多
关键词 番茄溃疡病 nestedpcr 快速检测
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从发病仔猪呼吸道检测出猪腺病毒 被引量:5
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作者 李瑞江 黄伟坚 +4 位作者 陈琼 罗廷荣 温荣辉 陆芹章 廖素环 《广西畜牧兽医》 2006年第5期204-206,共3页
根据猪腺病毒六邻体保守区域设计两对引物,用Nested-PCR的方法从送检的发病仔猪的呼吸道分泌物中扩增出两个核酸片段。通过基因克隆、序列测定和序列比较,发现这两个核酸片段与猪腺病毒5型和3型的相应片段同源性最高,分别为97.4%和95.3... 根据猪腺病毒六邻体保守区域设计两对引物,用Nested-PCR的方法从送检的发病仔猪的呼吸道分泌物中扩增出两个核酸片段。通过基因克隆、序列测定和序列比较,发现这两个核酸片段与猪腺病毒5型和3型的相应片段同源性最高,分别为97.4%和95.3%。证实发病仔猪呼吸道存在猪腺病毒的感染。为下一步猪腺病毒的分离及猪腺病毒表达载体的构建打下基础。 展开更多
关键词 猪腺病毒 六邻体基因 nestedpcr 表达载体
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