摘要
目的运用生物信息学和网络药理学方法挖掘黄芪-山药药对治疗2型糖尿病的微小RNA(miRNA)-mRNA转录网络,探讨其作用机制。方法通过GEO数据库挖掘2型糖尿病miRNA和mRNA芯片集,并通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)挖掘黄芪-山药药对活性成分及预测靶点,使用R语言及Perl软件筛选黄芪-山药药对治疗2型糖尿病的关键miRNAs及mRNAs,借助Cytoscape3.8.2软件与STRING数据库构建活性成分-靶点网络、miRNA-mRNA转录网络及蛋白互作(PPI)网络,并进行基因本体(GO)功能及京都基因和基因组百科全书(KEGG)通路富集分析,并借助cytoNCA完成PPI网络的拓扑分析。结果2型糖尿病中存在64个差异miRNA和6143个差异mRNA构成的605组miRNA-mRNA互作关系;黄芪-山药药对存在56个有效成分和538个药物靶点,如PGR、PTGS1、AR、SCN5A、NCOA2等。2型糖尿病-miRNA-mRNA-有效成分-中药调控网络图得到miR-1307-3p-PTPN1、miR-1307-3p-SCN5A、miR-1307-3p-BCL2、miR-1307-3p-CHEK2、miR-1307-3p-E2F2、miR-1307-3p-IL10RB、miR-1307-3p-IRF1、miR-1307-3p-MAPK1、miR-491-5p-PTGS 1共9条miRNA-mRNA相互关系。PTPN1、SCN5A、BCL2、CHEK2、E2F2、IL10RB、IRF1、MAPK1、PTGS1共9个靶点作为miRNA调控黄芪-山药药对治疗2型糖尿病的重要桥梁。GO结果富集在对类固醇激素的反应、对金属离子的反应、对药物的反应、内在凋亡信号通路、RNA聚合酶Ⅱ启动子的转录起始等,KEGG结果富集在脂质和动脉粥样硬化、IL-17信号通路、糖尿病并发症中的AGE-RAGE信号通路、TNF信号通路、p53信号通路等。结论2型糖尿病中存在多个miRNA-mRNA调控网络,黄芪-山药药对以多组分、多功能、多途径的形式,介导IL-17、TNF、p53、HIF-1等信号通路,miRNA-mRNA网络在黄芪-山药药对治疗2型糖尿病中发挥重要作用。
出处
《中国老年学杂志》
CAS
北大核心
2023年第20期4895-4903,共9页
Chinese Journal of Gerontology
作者简介
第一作者:李敏(1987-),女,医学博士,主治中医师,主要从事中医治未病研究;通信作者:朱根福(1982-),男,医学博士,副主任中医师,主要从事中医药防治老年慢性病研究。
