摘要
2012年7～9月从来源于青海湖地区活禽市场的环境样本中分离到5株H9N2亚型禽流感病毒，为了了解其基因遗传进化情况，本研究通过RT—PCR技术扩增分离毒株的8个基因片段，并进行全基因序列测定。对其分子特征及全基因序列进行遗传进化分析。结果显示5株病毒的HA基因片段的核苷酸相似度为93．2％～99．1％。NA基因核苷酸的相似度为94．5％～99．8％。A／environment／qinghai／017／2012的裂解位点为PSKSSRGLF，其它4个毒株的HA裂解位点均为PSRSSRGLF。5个病毒的HA基因第226位受体结合位点均为L。M1基因片段中发生了N30D和T215A替换。遗传进化分析表明5株病毒同2005年湖南分离的A／chicken／Hunan／5260／2005（HgN2）毒株类似，为一种重配基因型禽流感病毒。其中HA、NA、NS基因片段属于Y280-like支系，MP基因片段属于G1-like支系，NP、PBl、PB2、PA四个基因片段属于F98-like支系。
Five H9N2 avian influenza virus strains were isolated from the environmental samples in live poultry market in Qinghai Lake region from July to September, 2012. To evaluate the phylogenetic charac- teristics of these H9N2 isolates, the eight gene segments were amplified by RT-PCR and sequenced. The phylogenetic and molecular characteristics of the five strains were analyzed. The results showed that the HA genes of five strains shared 93.2%-99.1% nucleotide identities with each other, and the NA genes shared 94.5 %-99.8% nucleotide identities. The HA cleavage site sequence of the A/environment/qinghai/ 017/2012 isolate was PSKSSRGLF, and the HA cleavage site sequences of the other four strains were all PSRSSRGLF. The HA receptor-binding site had the Q226L mutation. The M1 gene segment had the N30D and T215A mutations. The phylogenetic analysis showed that the five strains were similar to the vi- rus A/chieken/Hunan/5260/2005 （H9N2） isolated in Hunan Province, China and were reassortant geno- type viruses; the HA, NA, and NS genes belonged to the Y280-1ike lineage; the MP gene belonged to the Gl-like lineage; the NP, PB1, PB2, and PA genes belonged to the F98-1ike lineage.
出处
《病毒学报》
CAS
CSCD
北大核心
2014年第2期109-118,共10页
Chinese Journal of Virology
基金
WHO 2012/2013年度加强西部省份人禽流感监测能力项目
国家重点基础研究发展973计划课题(2011CB504704)
国家自然科学基金(81373107)
关键词
H9N2
禽流感病毒
基因组
分子特征
遗传进化分析
HgN2
Avian influenza virus
Genome
Molecular characteristics
Phylogenetic analysis
作者简介
刘琳玉（1986-），女，贵州铜仁人，硕士研究生，主要从事流感病毒的研究，Tel：010—58900853，E—mail：liulinyu@cnic．org．cn；
姜双应（1960-）男，青海西宁人，大学本科，主要从事病毒的研究，Tel：0971-8801768，E-mail：jiangsy81237@163．com
汪立杰（1983-），男，安徽歙县人，硕士研究生，研究实习员，主要从事流感流行病学研究，Tel：010-58900864，E-mail：wanglijie@cnic．org．cn
通讯作者：舒跃龙（1970-），研究员，博士生导师，中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所国家流感中心主任，Tel：010—58900850，Email：yshu@cnic．org．cn
