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北京地区流行性腮腺炎病毒流行株基因型分析 被引量:7

Analysis on genotype of mumps virus strain circulating in Beijing city
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摘要 目的了解北京地区流行性腮腺炎病毒流行株基因型分布和变异情况。方法通过SH基因的序列分析,与其他基因型参考株进行同源性比较,构建亲缘进化树。结果17株病毒均属于F基因型,VAC-S79属于A基因型,各流行株间核苷酸最大差异为5.4%,与F基因型代表株Z77158(兰州)、Z77160(上海)核苷酸最大差异分别为4.8%和7.0%;与疫苗株的核苷酸差异为14.6%~15.9%。结论近2年北京地区流行的优势株为F基因型,未发现基因型间变异,但存在较大的型内差异,有变异增大趋势,需进行持续的分子流行病学监测。 Objective To understand geographic distribution of mumps virus genotypes and variation of circulating mumps virus strains in Beijing. Methods SH genes were analyzed. Genetic homology between the Beijing strains and other reference mumps strains were analyzed. Results 17 strains were all genotype F, and VAC-S79 was genotype A. The circulating viruses showed 5.4 % sequence divergence, and 4.8 % sequence divergence from Z77158 (Lanzhou);7.0 % from Z77160 (Shanghai) ; 14.6 % - 15.9 % from VAC-s79. Conclusion Genotype F is the main genotype of circulating strains in Beijing. Although all the circulating strains have genotype F, there are some variations between them. As the rate of variation is tend to increase, it seems necessary to follow up the molecular epidemiology.
出处 《中国公共卫生》 CAS CSCD 北大核心 2006年第9期1105-1106,共2页 Chinese Journal of Public Health
关键词 流行性腮腺炎病毒 基因型 分子流行病学 变异 mumps virus genotype molecular epidemiology variation
作者简介 陈萌(1975-),女,北京人,主管技师,硕士在读,主要从事病毒分子生物学研究工作。
  • 相关文献

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二级参考文献2

共引文献118

同被引文献67

引证文献7

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