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MYB调控靶基因参与植物应答重金属胁迫的研究进展
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作者 何锐 兴旺 +1 位作者 刘大丽 鲁振强 《植物遗传资源学报》 北大核心 2025年第3期419-430,共12页
镉、铅等重金属对土壤的污染越来越严重,它们不仅干扰植物的生命周期,而且降低作物产量,甚至导致植物死亡。因此,植物自身进化出一系列防御机制来抵抗重金属胁迫。植物的转录因子MYB是逆境胁迫的关键调控因子,它可与下游靶基因共调控来... 镉、铅等重金属对土壤的污染越来越严重,它们不仅干扰植物的生命周期,而且降低作物产量,甚至导致植物死亡。因此,植物自身进化出一系列防御机制来抵抗重金属胁迫。植物的转录因子MYB是逆境胁迫的关键调控因子,它可与下游靶基因共调控来应对重金属胁迫,从而赋予植物对重金属的耐受性,减少重金属对植物的危害。了解植物应对重金属胁迫(尤其是镉胁迫)的分子机制是植物生物技术研究和农业育种的首要目标。本文主要从MYB家族成员的鉴定和特征、MYB的功能及调控靶基因的机制、MYB如何通过光合、激素等调控靶基因参与重金属胁迫应答等方面进行综述;深入探讨在植物对重金属胁迫的适应机制中,MYB转录因子通过信号通路(活性氧稳态、脱落酸、赤霉素信号转导、光合作用等)结合靶基因或启动子元件,参与植物对重金属的吸收调节、运输和螯合的机理。本文为进一步开发和利用MYB转录因子以增强植物对重金属胁迫耐受性提供了理论基础。 展开更多
关键词 MYB 转录因子 靶基因 调控 重金属胁迫 功能
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甜菜小G蛋白BvRab基因家族的全基因组鉴定及生物信息学分析
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作者 付荻 刘赫 +1 位作者 于冰 李海英 《中国糖料》 2024年第1期1-12,共12页
【目的】在全基因组范围内鉴定甜菜小G蛋白BvRab基因家族成员,为研究甜菜小G蛋白BvRab基因家族功能奠定基础。【方法】本研究利用生物信息学手段对甜菜小G蛋白BvRab基因家族成员进行筛选鉴定并进行理化性质、基因结构、蛋白保守基序、... 【目的】在全基因组范围内鉴定甜菜小G蛋白BvRab基因家族成员,为研究甜菜小G蛋白BvRab基因家族功能奠定基础。【方法】本研究利用生物信息学手段对甜菜小G蛋白BvRab基因家族成员进行筛选鉴定并进行理化性质、基因结构、蛋白保守基序、系统进化、染色体定位及共线性、启动子顺式作用元件和蛋白质互作预测分析。【结果】共鉴定到58个甜菜小G蛋白BvRab基因家族成员。同一类型中的不同基因具有较为一致的外显子和内含子结构,家族成员共有5个蛋白保守基序;甜菜小G蛋白BvRab基因家族包含8个亚家族;家族成员不均匀地分布在甜菜的9条染色体上;BvRab基因家族成员与番茄、拟南芥中的小G蛋白Rab基因家族亲缘关系较近,与水稻中的小G蛋白Rab基因家族亲缘关系较远;BvRab基因家族成员启动子中含有多个激素应答元件和逆境应答元件;BvRab蛋白与参与植物生长发育及逆境应答相关的多种转录因子相互作用。【结论】本研究鉴定出58个BvRab基因家族成员,该基因家族成员可能在植物生长发育及逆境应答方面发挥重要作用。 展开更多
关键词 甜菜 小G蛋白 Rab基因家族 生物信息学分析
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甜菜BvMT2基因的生物信息学及镉应答特性分析
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作者 黄烁淇 赵桂龙 +2 位作者 赵晓鑫 刘大丽 鲁振强 《中国糖料》 2025年第4期1-10,共10页
【目的】金属硫蛋白(Metallothionein,MT)作为生物体内广泛存在的金属结合蛋白,在植物抵抗重金属胁迫中发挥着重要作用。为探究甜菜金属硫蛋白2(BvMT2)对重金属镉(Cd)胁迫的应答特性。【方法】利用RT-PCR技术克隆了BvMT2基因,并通过生... 【目的】金属硫蛋白(Metallothionein,MT)作为生物体内广泛存在的金属结合蛋白,在植物抵抗重金属胁迫中发挥着重要作用。为探究甜菜金属硫蛋白2(BvMT2)对重金属镉(Cd)胁迫的应答特性。【方法】利用RT-PCR技术克隆了BvMT2基因,并通过生物信息学方法预测了该基因的顺式作用元件、上游转录因子、理化性质等,分析了其在不同浓度Cd胁迫下的转录表达特性。【结果】该基因编码区全长225 bp,生信分析结果表明其相对分子质量为1909.91 Da,理论等电点为4.55,半胱氨酸(Cys)和甘氨酸(Gly)含量较高,属于定位于细胞核或叶绿体中的不稳定非分泌性亲水蛋白。BvMT2含有CGTCA-motif、生长素类、光响应、具有保守序列的部分光响应元件、MYB结合、厌氧诱导和调节等7个相关的顺式作用元件,并且转录因子BVRB_7g177640和BVRB_3g048050可能参与BvMT2的转录调控过程。转录组数据表明BvMT2在1、3和5 mmol/L Cd浓度胁迫下均显著上调。【结论】综上所述,BvMT2参与甜菜Cd逆境应答过程。本研究为BvMT2应对重金属胁迫的功能研究奠定了基础,为进一步解析甜菜应对重金属污染的响应机制提供依据。 展开更多
关键词 甜菜 金属硫蛋白(MT) 镉胁迫 生物信息学 转录表达特性
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甜菜镉胁迫应答基因ZAT10的克隆与功能预测 被引量:1
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作者 姚琦 石俊婷 +1 位作者 鲁振强 刘大丽 《中国糖料》 2024年第3期1-9,共9页
【目的】为了预测甜菜锌指蛋白BvZAT10(LOC 104901462)的结构特点和功能。【方法】以甜菜‘780016B/12优’为试验材料,对BvZAT10基因进行了克隆及生物信息学分析,并利用甜菜响应镉胁迫的转录表达谱数据探究了该基因在镉胁迫下的应答特... 【目的】为了预测甜菜锌指蛋白BvZAT10(LOC 104901462)的结构特点和功能。【方法】以甜菜‘780016B/12优’为试验材料,对BvZAT10基因进行了克隆及生物信息学分析,并利用甜菜响应镉胁迫的转录表达谱数据探究了该基因在镉胁迫下的应答特性。【结果】BvZAT10编码区全长729 bp,编码242个氨基酸,是一种碱性不稳定亲水性蛋白,具有2个C2H2型锌指结构域。该基因编码蛋白共有36处磷酸化修饰位点,蛋白结构以无规则卷曲为主,系统发育分析发现BvZAT10与菠菜和藜麦的ZAT10亲缘关系最近。BvZAT10启动子序列包含植物激素响应、光响应及抗逆相关的多种作用元件。在1、3、5 mmol/L CdCl_(2)处理下,BvZAT10及其预测调控的大部分靶基因,如金属耐受蛋白11(BVRB_2g037080)和ABCG家族成员22(BVRB_5g109050)等,均受到了镉胁迫的正向调控。【结论】推测BvZAT10可能直接或间接地在甜菜应答镉胁迫中发挥重要作用,可将其作为潜在优势抗逆基因深入开展后续研究。 展开更多
关键词 甜菜 镉胁迫 ZAT10 基因克隆 功能预测
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