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羊毛尾线虫线粒体rrnL基因部分序列的克隆和进化分析
被引量：
5
1
作者
张悦文
徐颖
+2 位作者
王燕
朱兴全
刘国华
《湖南农业大学学报（自然科学版）》
CAS
CSCD
北大核心
2013年第1期69-72,共4页
为探明中国羊毛尾线虫(Trichuris ovis)广东分离株线粒体核糖体大亚基基因(rrnL)的部分序列(prrnL)的遗传变异情况,用prrnL序列构建其与其他毛尾线虫的进化关系;应用聚合酶链反应(PCR)扩增羊毛尾线虫虫株的prrnL,将所获得的序列用Clusta...
为探明中国羊毛尾线虫(Trichuris ovis)广东分离株线粒体核糖体大亚基基因(rrnL)的部分序列(prrnL)的遗传变异情况,用prrnL序列构建其与其他毛尾线虫的进化关系;应用聚合酶链反应(PCR)扩增羊毛尾线虫虫株的prrnL,将所获得的序列用ClustalX 1.81程序进行比对,然后用PAUP 4.0 Beta 10程序MP法绘制种系发育树。结果表明:所获得的prrnL序列长度为849～850 bp,种内变异在0～0.8%;13个羊毛尾线虫分离株位于同一分支,羊毛尾线虫prrnL序列种内很保守,种间差异较大(33.4%～36.1%),可作为种间遗传变异研究的标记。
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关键词
羊毛尾线虫
线粒体DNA
rrnL基因
种系发育关系
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职称材料
高通量RNA甲基化测序数据处理与分析研究进展
被引量：
2
2
作者
刘恋
张绍武
+1 位作者
孟佳
陈润生
《生物化学与生物物理进展》
SCIE
CAS
CSCD
北大核心
2015年第10期891-899,共9页
随着高通量测序技术快速发展,Me RIP-seq(methylated RNA immunoprecipitation sequencing)测序技术开启了RNA表观遗传学研究新局面,能够在全基因组范围内描述RNA甲基化.从Me RIP-seq高通量数据中挖掘RNA甲基化模式,有助于揭示m RNA甲...
随着高通量测序技术快速发展,Me RIP-seq(methylated RNA immunoprecipitation sequencing)测序技术开启了RNA表观遗传学研究新局面,能够在全基因组范围内描述RNA甲基化.从Me RIP-seq高通量数据中挖掘RNA甲基化模式,有助于揭示m RNA甲基化在调控基因表达、剪切等方面所发挥的潜在功能,有效指导癌症的干预治疗.本文从Me RIP-seq测序原理出发,较全面地综述Me RIP-seq数据处理和分析方法研究现状,并对其所面临的计算问题进行讨论和展望.
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关键词
ME
RIP-seq测序
数据处理与分析
RNA甲基化
表观遗传
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职称材料
三种不同灭活方法对新城疫病毒血凝和RT-PCR试验结果的影响
被引量：
2
3
作者
陈羽琪
南文龙
+3 位作者
秦立得
巩明霞
张悦勇
陈义平
《中国兽药杂志》
北大核心
2016年第9期11-14,共4页
为研究热灭活、甲醛、β-丙内酯（BPL）三种不同灭活方法对新城疫病毒（NDV）血凝和RT-PCR试验结果的影响,将收获的NDV鸡胚尿囊液分别用浓度为0.1%-0.5%的甲醛37℃灭活24 h或4℃灭活48 h、浓度为0.02%-0.2%的BPL 37℃灭活9 h、60℃热灭...
为研究热灭活、甲醛、β-丙内酯（BPL）三种不同灭活方法对新城疫病毒（NDV）血凝和RT-PCR试验结果的影响,将收获的NDV鸡胚尿囊液分别用浓度为0.1%-0.5%的甲醛37℃灭活24 h或4℃灭活48 h、浓度为0.02%-0.2%的BPL 37℃灭活9 h、60℃热灭活30-90 min,并于灭活前后进行血凝试验和RT-PCR检测。结果表明,用0.02%的BPL 37℃灭活9 h或0.1%的甲醛4℃灭活48 h,不影响NDV的血凝价;采用热灭活30 min或0.02%的BPL 37℃灭活9 h,不影响NDV核酸检测。本研究可为相关病原检测以及诊断制品制备过程中灭活方法的选择提供参考。
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关键词
新城疫病毒
灭活
血凝
RT-PCR
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职称材料
题名
羊毛尾线虫线粒体rrnL基因部分序列的克隆和进化分析
被引量：
5
1
作者
张悦文
徐颖
王燕
朱兴全
刘国华
机构
西交利物浦大学生物科学系
中国农业
科学
院兰州兽医研究所/家畜疫病病原
生物
学国家重点实验室
安徽农业
大学
动物科技学院
华南农业
大学
兽医学院
湖南农业
大学
动物医学院
出处
《湖南农业大学学报（自然科学版）》
CAS
CSCD
北大核心
2013年第1期69-72,共4页
基金
家畜疫病病原生物学国家重点实验室开放基金(SKLVEB2010KFKT010、SKLVEB2011KFKT004)
国家肉牛牦牛产业技术体系项目(CARS 38)
文摘
为探明中国羊毛尾线虫(Trichuris ovis)广东分离株线粒体核糖体大亚基基因(rrnL)的部分序列(prrnL)的遗传变异情况,用prrnL序列构建其与其他毛尾线虫的进化关系;应用聚合酶链反应(PCR)扩增羊毛尾线虫虫株的prrnL,将所获得的序列用ClustalX 1.81程序进行比对,然后用PAUP 4.0 Beta 10程序MP法绘制种系发育树。结果表明:所获得的prrnL序列长度为849～850 bp,种内变异在0～0.8%;13个羊毛尾线虫分离株位于同一分支,羊毛尾线虫prrnL序列种内很保守,种间差异较大(33.4%～36.1%),可作为种间遗传变异研究的标记。
关键词
羊毛尾线虫
线粒体DNA
rrnL基因
种系发育关系
Keywords
Trichuris ovis
mitochondrial DNA
ribosomal large subunit gene （rrnL）
phylogenetic relationship
分类号
S855.9 [农业科学—临床兽医学]
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职称材料
题名
高通量RNA甲基化测序数据处理与分析研究进展
被引量：
2
2
作者
刘恋
张绍武
孟佳
陈润生
机构
西北工业
大学
自动化学院
西交利物浦大学生物科学系
中国
科学
院
生物
物理研究所
出处
《生物化学与生物物理进展》
SCIE
CAS
CSCD
北大核心
2015年第10期891-899,共9页
基金
国家自然科学基金资助项目(91430111
61473232
+1 种基金
61401370
61170134)~~
文摘
随着高通量测序技术快速发展,Me RIP-seq(methylated RNA immunoprecipitation sequencing)测序技术开启了RNA表观遗传学研究新局面,能够在全基因组范围内描述RNA甲基化.从Me RIP-seq高通量数据中挖掘RNA甲基化模式,有助于揭示m RNA甲基化在调控基因表达、剪切等方面所发挥的潜在功能,有效指导癌症的干预治疗.本文从Me RIP-seq测序原理出发,较全面地综述Me RIP-seq数据处理和分析方法研究现状,并对其所面临的计算问题进行讨论和展望.
关键词
ME
RIP-seq测序
数据处理与分析
RNA甲基化
表观遗传
Keywords
MeRIP-seq sequencing
data processing and analysis
RNA methylation
epigenetics
分类号
Q5 [生物学—生物化学]
Q6 [生物学—生物物理学]
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职称材料
题名
三种不同灭活方法对新城疫病毒血凝和RT-PCR试验结果的影响
被引量：
2
3
作者
陈羽琪
南文龙
秦立得
巩明霞
张悦勇
陈义平
机构
中国动物卫生与流行病学中心诊断试剂研究室
西交利物浦大学生物科学系
出处
《中国兽药杂志》
北大核心
2016年第9期11-14,共4页
基金
国家重点研发计划项目(2016YFD0501609)
文摘
为研究热灭活、甲醛、β-丙内酯（BPL）三种不同灭活方法对新城疫病毒（NDV）血凝和RT-PCR试验结果的影响,将收获的NDV鸡胚尿囊液分别用浓度为0.1%-0.5%的甲醛37℃灭活24 h或4℃灭活48 h、浓度为0.02%-0.2%的BPL 37℃灭活9 h、60℃热灭活30-90 min,并于灭活前后进行血凝试验和RT-PCR检测。结果表明,用0.02%的BPL 37℃灭活9 h或0.1%的甲醛4℃灭活48 h,不影响NDV的血凝价;采用热灭活30 min或0.02%的BPL 37℃灭活9 h,不影响NDV核酸检测。本研究可为相关病原检测以及诊断制品制备过程中灭活方法的选择提供参考。
关键词
新城疫病毒
灭活
血凝
RT-PCR
Keywords
Newcastle disease virus
inactivation
hemagglutinin
RT - PCR
分类号
S852.65 [农业科学—基础兽医学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
羊毛尾线虫线粒体rrnL基因部分序列的克隆和进化分析
张悦文
徐颖
王燕
朱兴全
刘国华
《湖南农业大学学报（自然科学版）》
CAS
CSCD
北大核心
2013
5
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
高通量RNA甲基化测序数据处理与分析研究进展
刘恋
张绍武
孟佳
陈润生
《生物化学与生物物理进展》
SCIE
CAS
CSCD
北大核心
2015
2
在线阅读
下载PDF
职称材料
3
三种不同灭活方法对新城疫病毒血凝和RT-PCR试验结果的影响
陈羽琪
南文龙
秦立得
巩明霞
张悦勇
陈义平
《中国兽药杂志》
北大核心
2016
2
在线阅读
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职称材料
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