一种新的蛋白酪氨酸磷酸酶基因的克隆、定位和组织表达谱研究 被引量：1

1

作者 瞿祥虎 翟云 +2 位作者 魏汉东 鱼咏涛 贺福初 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2001年第6期503-510,共8页

从人胎肝cDNA文库分离出一长度为 5 2 48bp的cDNA克隆 ,该基因包含 2 6个外显子和 2 5个内含子 ,染色体定位于在某些肿瘤细胞中易缺失的 3p2 1.1- 2 1.33。其可读框编码 16 36个氨基酸 ,该蛋白属于蛋白酪氨酸磷酸酶(PTP)家族 ,其C端有... 从人胎肝cDNA文库分离出一长度为 5 2 48bp的cDNA克隆 ,该基因包含 2 6个外显子和 2 5个内含子 ,染色体定位于在某些肿瘤细胞中易缺失的 3p2 1.1- 2 1.33。其可读框编码 16 36个氨基酸 ,该蛋白属于蛋白酪氨酸磷酸酶(PTP)家族 ,其C端有一个典型的PTP结构域 ,N端含有约 80 0氨基酸残基的BRO1样结构域及随后 2个可能的SH3结构域结合位点 ,在这两个结构域之间及C末端还各有一个脯氨酸富集区。Northern杂交和点杂交分析显示 ,该基因以大约 5 .4kb的单一转录物广泛表达于人体各种组织 ,而且在人部分肿瘤细胞中高表达。结果提示 ,人源PTP -TD14是一个新的蛋白酪氨酸磷酸酶。 展开更多

关键词 蛋白酪氨酸磷酸酶 CDNA克隆 人染色体3p21 PTP结构域 BRO1样结构域 组织表达谱 基因克隆 基因定位

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人分化相关基因Ndr2的克隆与组织表达谱研究 被引量：5

2

作者 翟芸 魏汉东 +2 位作者 瞿祥虎 周钢桥 贺福初 《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2002年第2期139-144,共6页

人Ndr1基因参与细胞终末分化 ,并且对肿瘤细胞增殖和肿瘤转移具有抑制作用 .从人 2 2周孕龄胎肝cDNA文库中获得与人Ndr1基因同源的一段表达性序列标签 ,继而从成人脑cDNA文库分离出其全长cDNA(2 12 1bp) ,并将该基因命名为Ndr2 .其染色... 人Ndr1基因参与细胞终末分化 ,并且对肿瘤细胞增殖和肿瘤转移具有抑制作用 .从人 2 2周孕龄胎肝cDNA文库中获得与人Ndr1基因同源的一段表达性序列标签 ,继而从成人脑cDNA文库分离出其全长cDNA(2 12 1bp) ,并将该基因命名为Ndr2 .其染色体定位为 14q11 1- 11 2 ,开放阅读框编码 371个氨基酸 ,且与NDR1蛋白一样 ,含有一个典型的α β水解酶折叠类结构域 (α βhydrolasefold) .Northern杂交和点杂交分析显示 ,该基因与Ndr1一样 ,在脑中高表达 ,在胚胎组织的表达较低 ,在 8种人肿瘤细胞中的表达极低 .然而 ,Ndr2基因的组织表达谱与Ndr1又有鲜明的差异 :其在成人骨骼肌和脑等神经组织中表达最高 ,在唾液腺、肝、肾、心肌和气管中的表达次之 .结果提示 ,NDR2具有与NDR1相似或相关的重要功能 . 展开更多

关键词 人分化相关基因 Ndr2 克隆 组织表达谱 细胞分化 染色体定位α/β水解酶折叠类结构域

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新型人转录因子hBKLF对K562细胞增殖、分化及血红蛋白合成作用的研究 被引量：1

3

作者 王茫桔 马晓芸 +2 位作者 石永进 武淑兰 贺福初 《中国实验血液学杂志》 CAS CSCD 2006年第6期1083-1088,共6页

孕22周的胎肝是胎儿的主要造血器官,其中含有大量与造血相关的调控因子。人碱性Krüppel样因子(humanbasicKrüppel-likefactor,hBKLF)是本研究室从这一时期胎肝cDNA文库中新克隆的转录因子。对其C端的结构分析发现,它含有3个... 孕22周的胎肝是胎儿的主要造血器官,其中含有大量与造血相关的调控因子。人碱性Krüppel样因子(humanbasicKrüppel-likefactor,hBKLF)是本研究室从这一时期胎肝cDNA文库中新克隆的转录因子。对其C端的结构分析发现,它含有3个特征性C2H2锌指结构,因此属于KLF转录因子家族。前期的表达谱研究工作显示,hBKLF在成人外周血白细胞、骨髓和胎肝中表达量高,在红系中有表达,这提示它可能与造血相关。本研究以K562细胞为模型,研究hBKLF与造血细胞增殖、分化及血红蛋白合成的关系。构建hBKLF正义及反义真核表达载体,转染K562细胞,经G418筛选4周,得到稳定细胞株;用RT-PCR、Westernblot方法测定转染后K562细胞hBKLF表达水平的变化;以转染空质粒的K562细胞为对照组,在显微镜下直接观察转染正义质粒和反义质粒的两组细胞形态的改变;用MTT法比较增殖速率的变化;用甲基纤维素半固体培养法比较集落形成率的差别;用苯息丁法观察氯高铁血红素(hemin)诱导K562细胞分化后血红蛋白合成水平的差异。结果表明正义质粒和反义质粒经NcoI酶切鉴定构建正确。转染正义质粒的K562细胞(正义组)中hBKLF的mRNA及蛋白质表达水平增加,转染反义质粒的K562细胞(反义组)中hBKLF的mRNA水平降低。增殖活性在反义组、正义组、对照组分别为1.335±0.022、1.067±0.010、1.118±0.014,反义组K562细胞的增殖速率加快,正义组细胞增殖速率减慢(P<0.001)。细胞形态在各组间无明显区别。集落形成率在反义组、正义组、对照组分别为148±13、136±10、141±10,各组间无显著差异(P>0.05)。3组细胞血红蛋白合成水平在hemin诱导后均升高,诱导后血红蛋白升高倍数在对照组、反义组、正义组分别为9.064±1.637、14.360±2.185、4.820±0.404,反义组K562细胞合成血红蛋白能力增加,正义组合成血红蛋白能力下降(P<0.05)。结论hBKLF可以抑制K562细胞的增殖,对血红蛋白合成有负调控作用。 展开更多

关键词 hBKLF 血红蛋白 K562 细胞增殖 细胞分化

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基因组学与人类疾病 被引量：2

4

作者 周钢桥 张学 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2011年第8期807-808,共2页

近年来,以高密度基因芯片和高通量测序为核心的基因组学技术迅速发展,已广泛应用到生物医学的各个领域并取得突出进展,使我们对于疾病的分子与遗传学基础的认识达到了一个新的水平。

关键词 基因组学技术 人类疾病 高密度基因芯片 遗传学基础 生物医学 高通量 领域并 测序

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兔肝金属硫蛋白亚型异构体的高效液相色谱分离与ESI-MS,MALDI-TOF-MS鉴定 被引量：8

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作者 赵锐 纪建国 +2 位作者 袁洪生 管华诗 茹炳根 《高等学校化学学报》 SCIE EI CAS CSCD 北大核心 2002年第6期1086-1090,共5页

由于金属硫蛋白 (MT)基因的多态性 ,决定不同亚型的 MT异构体的存在 ,MT亚型异构体的结构是MT功能研究的基础 .通过离子交换柱可将 MT分成 MT-1和 MT-2两个异构体 ,用不同条件的反相高效液相色谱 (RP-HPLC)可将 MT-1和 MT-2分成不同的... 由于金属硫蛋白 (MT)基因的多态性 ,决定不同亚型的 MT异构体的存在 ,MT亚型异构体的结构是MT功能研究的基础 .通过离子交换柱可将 MT分成 MT-1和 MT-2两个异构体 ,用不同条件的反相高效液相色谱 (RP-HPLC)可将 MT-1和 MT-2分成不同的亚型异构体 ,并利用 MALDI-TOF MS和 LC-ESI-MS对比确定了它们的分子量 .结果表明 ,兔肝 MT在不同的 p H条件下分离得到不同分子量的亚型异构体 .在酸性条件下 ,MT-1可分为 2个主要亚型异构体 ,分子量分别为 61 49.0和 62 44.5 ,而 MT-2主要分为 3个亚型异构体 ,分子量分别为 61 49.0 ,62 44.0和 61 2 7.0 . MT-1和 MT-2有 2个亚型异构体分子量相同的异构体存在 .在酸性条件下 ,MT-1的 2个异构体及 MT-2分子量为 61 2 7的亚型异构体可稳定存在 . 展开更多

关键词 高效液相色谱 分离 鉴定 金属硫蛋白 亚型异构体 电喷雾离子化质谱 基质辅助激光解析飞行时间质谱

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人类复杂疾病关联研究中群体分层的检出和校正 被引量：6

6

作者 智联腾 周钢桥 贺福初 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2007年第1期3-7,共5页

病例对照研究是鉴定多基因疾病易感位点重要的遗传流行病学方法,而群体分层是导致病例对照研究关联研究结果出现偏倚甚至是假关联的重要原因之一。文章对人群分层的检出及校正的方法和原理进行了阐述,包括基于核心家系的传递/不平衡检验... 病例对照研究是鉴定多基因疾病易感位点重要的遗传流行病学方法,而群体分层是导致病例对照研究关联研究结果出现偏倚甚至是假关联的重要原因之一。文章对人群分层的检出及校正的方法和原理进行了阐述,包括基于核心家系的传递/不平衡检验(TDT)以及基于不相关基因组遗传标记的基因组对照(GC)和结构化关联(SA)等,并且对这几种方法进行了比较。 展开更多

关键词 关联研究 人群分层 传递不平衡检验 基因组对照 结构化关联

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基于PC/Linux的核酸序列分析系统的构建及其应用 被引量：15

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作者 张成岗 欧阳曙光 +5 位作者 张绍文 瞿祥虎 鱼咏涛 周钢桥 吴松锋 贺福初 《生物化学与生物物理进展》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2001年第2期263-266,共4页

基于PC机和Linux操作系统 ,利用Phred/Phrap/Consed软件和Blast软件 ,构建了核酸序列大规模自动分析系统 .该套系统可自动完成从测序峰图向核酸序列的转化、载体序列去除、序列自动拼接、重复序列鉴定以及序列的相似性分析 ,可加速对大... 基于PC机和Linux操作系统 ,利用Phred/Phrap/Consed软件和Blast软件 ,构建了核酸序列大规模自动分析系统 .该套系统可自动完成从测序峰图向核酸序列的转化、载体序列去除、序列自动拼接、重复序列鉴定以及序列的相似性分析 ,可加速对大规模测序数据的分析和利用 . 展开更多

关键词 PC机 LINUX操作系统 软件 生物信息学 大规模测序 核酸序列

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序列同源性分析软件Blast的WEB界面构建及其应用 被引量：8

8

作者 张成岗 张利达 +2 位作者 欧阳曙光 张启发 贺福初 《生物化学与生物物理进展》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2001年第6期916-918,共3页

基于局域网 (Intranet)内的PC/Linux服务器 ,构建了序列同源性分析软件Blast的WEB界面 .局域网内的所有计算机均可通过WEB方式访问该服务器进行公共数据库和自建数据库的查询 ,具有保密、高效、免费的优点 ,能够满足实验室和研究院所的... 基于局域网 (Intranet)内的PC/Linux服务器 ,构建了序列同源性分析软件Blast的WEB界面 .局域网内的所有计算机均可通过WEB方式访问该服务器进行公共数据库和自建数据库的查询 ,具有保密、高效、免费的优点 ,能够满足实验室和研究院所的大规模。 展开更多

关键词 微机 LINUX操作系统 局域网 Blast软件 WEB界面 生物信息学 序列同源性 分析软件

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应用RH技术定位人胎肝的7个新基因 被引量：6

9

作者 翟芸 刘孟珉 +3 位作者 张成岗 瞿祥虎 周钢桥 贺福初 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2001年第2期93-96,共4页

辐射杂交细胞系（RH）技术是一种体细胞遗传学技术，是继荧光原位杂交技术（FISH）后新建立的染色体定位方法。本文应用该技术将发现于22周孕龄人胎肝的7个新基因进行了染色体定位：肝细胞生成素（hepatopoietin，HPO）定位于Chr.16q22.... 辐射杂交细胞系（RH）技术是一种体细胞遗传学技术，是继荧光原位杂交技术（FISH）后新建立的染色体定位方法。本文应用该技术将发现于22周孕龄人胎肝的7个新基因进行了染色体定位：肝细胞生成素（hepatopoietin，HPO）定位于Chr.16q22.1～22.3，HQ0508定位于Chr.22q13.31～13.32，HQ0750定位于Chr.11q24.3，HQ0915定位于Chr.16p13.3，HQ1880定位于Chr.11q13.2～13.4， HQ2180定位于Chr.19q13.2～13.3，HQ3091定位于Chr.12q21.33。 展开更多

关键词 染色体定位 辐射杂交细胞系 新基因 胎儿肝脏

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人microRNA相关的遗传变异与肿瘤 被引量：3

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作者 李佩尧 贺福初 周钢桥 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2011年第8期870-878,共9页

微RNA(microRNA,miRNA)是新发现的一类进化上高度保守的重要的转录后调控因子,通过调节基因的表达而参与调控细胞凋亡、增殖及分化等生理过程,同时与肿瘤等疾病的发生发展密切相关。近年来研究发现,miRNA、miRNA生物合成通路基因及miRN... 微RNA(microRNA,miRNA)是新发现的一类进化上高度保守的重要的转录后调控因子,通过调节基因的表达而参与调控细胞凋亡、增殖及分化等生理过程,同时与肿瘤等疾病的发生发展密切相关。近年来研究发现,miRNA、miRNA生物合成通路基因及miRNA的靶基因结合位点的遗传变异(例如单核苷酸多态性和拷贝数变异等)可影响miRNA调控功能的发挥,并产生显著的遗传学效应。文章主要综述了miRNA相关的遗传变异与肿瘤易感性和临床转归等的研究进展。 展开更多

关键词 MICRORNA 单核苷酸多态性 拷贝数变异 肿瘤

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肝癌细胞增殖受M-CSF胞内和胞外自分泌的双重调控 被引量：1

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作者 张蒙夏 罗红梅 +4 位作者 唐圣松 雷小勇 龙治锋 张晓红 汪煜华 《中国病理生理杂志》 CAS CSCD 北大核心 2005年第12期2382-2387,共6页

目的:研究胞内M-CSF及其受体在肝癌SMMC 7721细胞的表达与性质,探讨胞内M-CSF对SMMC 7721细胞增殖的影响及其机制。方法:以高表达M-CSF的人肝癌细胞系(SMMC 7721细胞)为模型,以免疫组化、流式细胞计数、反义技术与蛋白印迹等方法观测胞... 目的:研究胞内M-CSF及其受体在肝癌SMMC 7721细胞的表达与性质,探讨胞内M-CSF对SMMC 7721细胞增殖的影响及其机制。方法:以高表达M-CSF的人肝癌细胞系(SMMC 7721细胞)为模型,以免疫组化、流式细胞计数、反义技术与蛋白印迹等方法观测胞内M-CSF对SMMC 7721细胞增殖的影响及其机制。结果:M-CSF 及其受体主要在SMMC 7721细胞的胞质、胞核中表达,胞内的M-CSF 的相对分子量为20 000,M-CSFR的相对分子量为120 000;免疫共沉淀分析证明M-CSF在细胞内与M-CSFR以复合物的形式存在;M-CSF的单克隆抗体及其反义寡聚核苷酸能抑制SMMC 7721细胞的增殖、下调CYCLIND1/E的表达和上调P16的表达,且M-CSF的单克隆抗体及其反义寡聚核苷酸的联合使用能进一步加强对SMMC 7721细胞抑制作用和增加下调CYCLIND1／E和上调P16的表达幅度。结论:SMMC 7721细胞受M-CSF胞外自分泌和胞内自分泌的双重调控。 展开更多

关键词 巨噬细胞集落刺激闪子 SMMC 7721细胞 肝肿瘤

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GSTM1基因编码区SNP位点T1270533G与鼻咽癌的相关性 被引量：1

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作者 何英 周钢桥 +2 位作者 李欣 董晓佳 姚开泰 《南方医科大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2009年第1期36-39,共4页

目的通过筛查GSTM1基因SNPs位点,研究该基因编码区单核苷酸多态位点T1270533G与鼻咽癌易感性和临床表型的关系。方法用PCR方法对中国人群27个个体DNA标本进行扩增、纯化及测序,从中获得GSTM1编码区、调控区和侧翼区及部分内含子区SNP位... 目的通过筛查GSTM1基因SNPs位点,研究该基因编码区单核苷酸多态位点T1270533G与鼻咽癌易感性和临床表型的关系。方法用PCR方法对中国人群27个个体DNA标本进行扩增、纯化及测序,从中获得GSTM1编码区、调控区和侧翼区及部分内含子区SNP位点,所获数据进行LD分析。选择编码区多态性位点T1270533G(该位点在中国人群罕见等位基因频率为22.2%),用tetra-Primer ARMS-PCR结合测序方法对鼻咽癌患者和对照人群进行相关性分析。结果通过测序共获取29个SNPs;其中13个SNPs位点之间均呈高度连锁不平衡;编码区多态性位点T1270533G的变异与鼻咽癌临床表型之间无明显关联(RR=0.170,95%CI=0.95-0.306 for homozygoteTT)。结论编码区多态位点T1270533G虽然发生了碱基顛换,产生了错义突变,导致了氨基酸的改变,但并没有影响其解毒功能。该位点在鼻咽癌患者和对照人群中等位基因型频率差别很小,与中国广东地区鼻咽癌易感性无明显关联。 展开更多

关键词 GSTM1基因 单核苷酸多态性 连锁不平衡 基因分型

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好风如水,真水无香——纪念林风眠先生诞辰110周年 被引量：1

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作者 王晓明 《艺术百家》 CSSCI 北大核心 2010年第A02期248-250,共3页

林风眠先生既是一位极具个性与开拓性的画家,也是一位卓越的艺术教育家。在毕生不懈的探索中,他开创出了享誉中外的"林风眠格体",也在大型主题绘画上做了富于智慧的尝试。在兴办艺术教育的过程中,他坚持以人为本,以民族文化... 林风眠先生既是一位极具个性与开拓性的画家,也是一位卓越的艺术教育家。在毕生不懈的探索中,他开创出了享誉中外的"林风眠格体",也在大型主题绘画上做了富于智慧的尝试。在兴办艺术教育的过程中,他坚持以人为本,以民族文化为根基,创多元环境,育新艺术人才,并提出"以艺术代宗教"的主张。他在百年艺术人生中创作出了真、善、美融为一体的人生的艺术,他的艺术教育思想也结出了丰硕的果实。在"为艺术战"的一生中,林先生在中国现代美术史和艺术教育史上为世人树立了光辉的典范。 展开更多

关键词 林凤眠 艺术创作 艺术教育 艺术美学

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BCR3/ABL2核酶的设计、构建及对K562细胞增殖与集落形成的抑制作用和凋亡诱导作用 被引量：2

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作者 李满文 贺福初 《中国生物化学与分子生物学报》 CSCD 2000年第1期10-16,共7页

利用计算机模拟设计合成了针对 K5 62细胞致癌融合 bcr3/abl2 m RNA的锤头状核酶 .该核酶以融合点附近 UUC为识别切割三联体 ,在核酶的 3′端增加一段 T7噬菌体终止子序列 .用基因克隆结合体外转录的方法 ,肯定了核酶的体外切割活性 .... 利用计算机模拟设计合成了针对 K5 62细胞致癌融合 bcr3/abl2 m RNA的锤头状核酶 .该核酶以融合点附近 UUC为识别切割三联体 ,在核酶的 3′端增加一段 T7噬菌体终止子序列 .用基因克隆结合体外转录的方法 ,肯定了核酶的体外切割活性 .进而将核酶基因克隆到 p CEP4真核细胞高效表达载体上 ,利用脂质体 Lipofectin AMINE介导的转染技术将核酶与核酶基因导入靶细胞 ,从抑制靶细胞 K5 62的增殖与集落形成及引起靶细胞凋亡等方面验证了核酶在细胞水平上对融合基因 bcr3/abl2 m RNA的特异切割作用 ,并观察到了 T7噬菌体终止子序列对核酶切割效率的增强影响 . 展开更多

关键词 锤头状核酶 bcr3/abl2 CML K562细胞 细胞凋亡

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