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低温弱光胁迫下茄子幼苗实时荧光定量PCR内参基因的筛选与评价
1
作者
林珲
裘波音
+1 位作者
朱海生
温庆放
《福建农业科技》
CAS
2024年第8期1-15,共15页
为了探索茄子Solanum melongena L.的基因表达模式,利用qRT-PCR方法分析了茄子ACT、EF1α、TUA、TUB、GAPDH、eIF、UBQ、UBI3、PP2A、CYP、RPL28、L25、SAND、TBP、DNAJ、APRT、EXP、CAC、HSP20和CysPro 20个候选内参基因mRNA的表达差...
为了探索茄子Solanum melongena L.的基因表达模式,利用qRT-PCR方法分析了茄子ACT、EF1α、TUA、TUB、GAPDH、eIF、UBQ、UBI3、PP2A、CYP、RPL28、L25、SAND、TBP、DNAJ、APRT、EXP、CAC、HSP20和CysPro 20个候选内参基因mRNA的表达差异情况,并运用GeNorm、NormFinder和BestKeeper 3种计算方法评价茄子20个候选内参基因在低温、弱光、低温弱光叶片样品中的表达稳定性。结果表明:茄子20个候选内参基因荧光定量引物扩增效率(E)数值在96.8%~117.6%,相关系数(R^(2))介于0.9688~0.9999,扩增效率良好,扩增反应具有高度的专一性,引物能特异性扩增,特异性好,均为单峰,样品间扩增曲线重复性强,可用于qRT-PCR扩增。茄子20个候选内参基因C_(T)值表达丰度分析,发现茄子20个候选内参基因平均CT值在19.76~31.20。3种计算方法的综合评价分析结果显示,TBP基因在所有样本中为最稳定的内参基因。研究可为茄子低温、弱光和低温弱光胁迫下基因特异性表达研究提供了合适的内参基因。
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关键词
茄子
内参基因
实时荧光定量PCR
标准化
基因表达
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题名
低温弱光胁迫下茄子幼苗实时荧光定量PCR内参基因的筛选与评价
1
作者
林珲
裘波音
朱海生
温庆放
机构
福建省农业科学院作物研究所/福建省蔬菜遗传育种重点实验室/福建省蔬菜工程技术研究中心
出处
《福建农业科技》
CAS
2024年第8期1-15,共15页
基金
福建省科技计划省属公益类项目(2021R1031003)
国家大宗蔬菜产业技术体系福州综合试验站项目(CARS-23-G-53)
+2 种基金
福建省种业创新与产业化工程项目(zycxny2021009)
福建省农业科学院科技创新平台专项(CXPT202001)
福建省农业科学院蔬菜遗传育种科技创新团队(CXTD2021038)。
文摘
为了探索茄子Solanum melongena L.的基因表达模式,利用qRT-PCR方法分析了茄子ACT、EF1α、TUA、TUB、GAPDH、eIF、UBQ、UBI3、PP2A、CYP、RPL28、L25、SAND、TBP、DNAJ、APRT、EXP、CAC、HSP20和CysPro 20个候选内参基因mRNA的表达差异情况,并运用GeNorm、NormFinder和BestKeeper 3种计算方法评价茄子20个候选内参基因在低温、弱光、低温弱光叶片样品中的表达稳定性。结果表明:茄子20个候选内参基因荧光定量引物扩增效率(E)数值在96.8%~117.6%,相关系数(R^(2))介于0.9688~0.9999,扩增效率良好,扩增反应具有高度的专一性,引物能特异性扩增,特异性好,均为单峰,样品间扩增曲线重复性强,可用于qRT-PCR扩增。茄子20个候选内参基因C_(T)值表达丰度分析,发现茄子20个候选内参基因平均CT值在19.76~31.20。3种计算方法的综合评价分析结果显示,TBP基因在所有样本中为最稳定的内参基因。研究可为茄子低温、弱光和低温弱光胁迫下基因特异性表达研究提供了合适的内参基因。
关键词
茄子
内参基因
实时荧光定量PCR
标准化
基因表达
Keywords
Eggplant(Solanum melongena L.)
Reference gene
Quantitative real-time PCR
Standardization
Gene expression
分类号
S641.1 [农业科学—蔬菜学]
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1
低温弱光胁迫下茄子幼苗实时荧光定量PCR内参基因的筛选与评价
林珲
裘波音
朱海生
温庆放
《福建农业科技》
CAS
2024
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