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题名香蕉NINV基因家族鉴定及分析
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作者
吴建阳
陈妹
唐路平
胡会刚
武爱龙
张秀梅
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机构
湛江幼儿师范专科学校
中国热带农业科学院南亚热带作物研究所/农业农村部热带果树生物学重点实验室
湛江市第二十五中学
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出处
《热带农业科学》
2024年第11期50-56,共7页
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基金
国家香蕉产业技术体系湛江试验站项目(No.CARS-31-17)
广东省普通高校特色创新项目(No.2023KTS CX377)。
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文摘
碱性/中性转化酶(Alkaline/neutralinvertase,NINV)能专一性地催化蔗糖水解成葡萄糖和果糖,NINV由基因家族编码。在多个物种中已鉴定出NINV基因家族所有成员,但香蕉中至今尚未有NINV基因家族的报道。本研究借助于香蕉基因组,共分离到12个NINV基因,分别命名为MaNINV1~12,分布于chr2、chr3、chr5、chr6、chr7、chr8、chr9、chr11等8条染色体上,氨基酸序列长度为531~701 aa,分子量为60.62~79.22 kD,理论等电点为5.91~7.19。进化树分析发现,有5个NINV基因属于α亚族,即MaNINV1、MaNINV2、MaNINV6、MaNINV9、MaNINV10;7个NINV基因属于β亚族,即MaNINV3、MaNINV4、MaNINV5、MaNINV7、MaNINV8、MaNINV11、MaNINV12。香蕉NINV基因家族成员外显子数量为4~8,内含子数量为3~7。香蕉NINV基因家族启动子顺式作用元件中,激素响应元件最多,其次为光响应元件,胁迫响应元件最少;与激素相关的元件有6类,分别为脱落酸、生长素、茉莉酸甲酯、赤霉素、玉米素、水杨酸。本研究可为后续阐明NINV与蔗糖的关系提供基础。
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关键词
香蕉
碱性/中性转化酶
基因家族
生物信息学
鉴定
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Keywords
banana
alkaline/neutral invertase
gene family
bioinformatics
identification
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分类号
S668.1
[农业科学—果树学]
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