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蕹菜新纪录害虫——筒小卷蛾的生物学特性及形态学特征研究
1
作者
粟明珠
张杨
+1 位作者
钟婉玲
王星
《长江蔬菜》
2015年第22期165-167,共3页
对蕹菜上新发现的害虫筒小卷蛾的生物学特性及形态学特征进行了系统的观察和研究。研究结果表明,卵粒淡黄色,较扁平;幼虫体绿色,头壳黑色;蛹为被蛹,初化蛹为墨绿色,羽化前颜色为黄褐色;成虫褐色黄色相间,翅面中央一条明显浅黄色横带。...
对蕹菜上新发现的害虫筒小卷蛾的生物学特性及形态学特征进行了系统的观察和研究。研究结果表明,卵粒淡黄色,较扁平;幼虫体绿色,头壳黑色;蛹为被蛹,初化蛹为墨绿色,羽化前颜色为黄褐色;成虫褐色黄色相间,翅面中央一条明显浅黄色横带。筒小卷蛾的一个世代为(34.714±1.074)d,其中卵、幼虫、蛹和成虫的发育历期分别为(4.250±0.125)d、(12.167±0.259)d、(5.917±0.130)d和(12.429±1.025)d。幼虫共5龄,1-5龄的发育历期分别为(1.583±0.142)d、(1.750±0.125)d、(1.833±0.108)d、(2.333±0.136)d和(4.667±0.245)d。低龄幼虫取食叶脉附近的叶肉,高龄幼虫卷叶取食,常伴有咬断叶柄行为。成虫羽化高峰在8:00-10:00,交配高峰在5:00-10:00。成虫羽化1-2 d后进行交配,交配1-2 d后即可产卵,每雌产卵量为58-133粒。
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关键词
筒小卷蛾
形态学特性
生物学特征
生活习性
蕹菜
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职称材料
辣椒轻斑驳病毒湖南分离物的全基因序列测定及结构分析
被引量:
4
2
作者
刘湘宁
戴良英
+2 位作者
李魏
董铮
唐前君
《植物保护》
CAS
CSCD
北大核心
2017年第2期88-94,共7页
采自湖南地区的辣椒轻斑驳病毒Pepper mild mottle virus(PMMoV)样品经单斑分离后,根据已经报道的PMMoV序列基因保守区设计6对简并引物,采用片段重叠法和RACE方法扩增、克隆获得一个全长为6 356bp的湖南分离物(PMMoV-HN1,登录号:KP3458...
采自湖南地区的辣椒轻斑驳病毒Pepper mild mottle virus(PMMoV)样品经单斑分离后,根据已经报道的PMMoV序列基因保守区设计6对简并引物,采用片段重叠法和RACE方法扩增、克隆获得一个全长为6 356bp的湖南分离物(PMMoV-HN1,登录号:KP345899)全基因组序列,编码4个蛋白,分别为126kD蛋白(70~3 423nt)、183kD蛋白(70~4 908nt)、28kD蛋白(4 909~5 682nt)和17.5kD蛋白(5 685~6 158nt),5′-非编码区(5′-UTR)和3′-非编码区(3′-UTR)分别含有69和198个碱基,其中5′-UTR存在一个序列为m7G5′pppG的甲基化核苷酸帽子结构。一致性分析发现PMMoV-HN1与PMMoV其他分离物的核酸一致性为94%~99%,编码的氨基酸一致性为94%~99%。全基因组序列系统进化分析表明PMMoV-HN1分离物与中国首次报道的PMMoV-CN分离物亲缘关系最近。本研究是国内报道的第二例PMMoV全基因组序列。
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关键词
辣椒
辣椒轻斑驳病毒
全基因序列
序列分析
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职称材料
基于岭回归和SVM的高维特征选择与肽QSAR建模
被引量:
2
3
作者
王志明
韩娜
+1 位作者
袁哲明
伍朝华
《物理化学学报》
SCIE
CAS
CSCD
北大核心
2013年第3期498-507,共10页
岭回归估计权重绝对值在一定程度上体现了对应特征作用大小,据此发展了基于岭回归(RR)和支持向量机(SVM)的高维特征选择算法.对苦味二肽(BTT)和细胞毒性T淋巴细胞(CTL)表位9肽两个肽体系,以氨基酸的531个物理化学性质参数直接表征肽结构...
岭回归估计权重绝对值在一定程度上体现了对应特征作用大小,据此发展了基于岭回归(RR)和支持向量机(SVM)的高维特征选择算法.对苦味二肽(BTT)和细胞毒性T淋巴细胞(CTL)表位9肽两个肽体系,以氨基酸的531个物理化学性质参数直接表征肽结构,各获得1062、4779个初始特征;对训练集,初始特征以岭回归排序后序贯引入,当SVM留一法交叉测试(LOOCV)的均方误差(MSE)显著上扬时终止,最后以多轮末尾淘汰进一步精筛,分别获得7、18个物理化学意义明确的保留特征.基于保留特征与支持向量回归(SVR),对训练集建立定量构效关系(QSAR)模型,预测独立测试集,其拟合精度、留一法交叉测试精度、独立预测精度均优于现有文献报道结果.新方法运行速度快,选取的特征物理化学意义明确,解释性强,在肽、蛋白质定量构效关系建模等高维数据回归预测领域有较广泛应用前景.
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关键词
定量构效关系
岭回归
支持向量机
特征选择
高维特征
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职称材料
运用PDB中的同源信息提高NetTurnP的蛋白质β转角预测精度(英文)
被引量:
1
4
作者
钱刚
王海燕
袁哲明
《生物化学与生物物理进展》
SCIE
CAS
CSCD
北大核心
2012年第5期472-482,共11页
β转角作为一种蛋白质二级结构类型在蛋白质折叠、蛋白质稳定性、分子识别等方面具有重要作用.现有的β转角预测方法,没有将PDB等结构数据库中先前存在的同源序列的结构信息映射到待预测的蛋白质序列上.PDB存储的结构已超过70 000,因此...
β转角作为一种蛋白质二级结构类型在蛋白质折叠、蛋白质稳定性、分子识别等方面具有重要作用.现有的β转角预测方法,没有将PDB等结构数据库中先前存在的同源序列的结构信息映射到待预测的蛋白质序列上.PDB存储的结构已超过70 000,因此对一条新确定的序列,有较大可能性从PDB中找到其同源序列.本文融合PDB中提取的同源结构信息(对每一待测序列,仅使用先于该序列存储于PDB中的同源信息)与NetTurnP预测,提出了一种新的β转角预测方法BTMapping,在经典的BT426数据集和本文构建的数据集EVA937上,以马修斯相关系数表示的预测精度分别为0.56、0.52,而仅使用NetTurnP的为0.50、0.46,以Qtotal表示的预测精度分别为81.4%、80.4%,而仅使用NetTurnP的为78.2%、77.3%.结果证实同源结构信息结合先进的β转角预测器如NetTurnP有助于改进β转角识别.BTMapping程序及相关数据集可从http://www.bio530.weebly.com获得.
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关键词
β转角预测
同源信息
PDB
NetTurnP
BTMapping
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职称材料
冰核细菌Erwinia ananas 110冰核基因iceA的原核表达及冰核活性分析
被引量:
1
5
作者
姚润贤
袁哲明
《湖南农业大学学报(自然科学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2013年第4期354-358,共5页
为获得具有高冰核活性的基因工程菌,从冰核细菌Erwinia ananas 110扩增冰核基因iceA,将其克隆到pMD19–T载体上,转化大肠杆菌DH5α,单、双酶切鉴定并测序;阳性克隆目的片段亚克隆到表达载体pET–23a(+)上,转化大肠杆菌DH5α,单、双酶切...
为获得具有高冰核活性的基因工程菌,从冰核细菌Erwinia ananas 110扩增冰核基因iceA,将其克隆到pMD19–T载体上,转化大肠杆菌DH5α,单、双酶切鉴定并测序;阳性克隆目的片段亚克隆到表达载体pET–23a(+)上,转化大肠杆菌DH5α,单、双酶切鉴定重组质粒;阳性重组质粒转化大肠杆菌BL21(DE3)pLysS,并经IPTG诱导表达。SDS–PAGE电泳检测表明,冰核基因iceA能够并以包涵体形式表达,相对分子质量约为180 000。冰核活性测定结果表明,重组菌BL21(DE3)pLysS/pET–ice的冰核活性与野生冰核细菌Erwinia ananas 110在–5、–4、–3、–2℃下无明显差别。
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关键词
冰核细菌
原核表达
冰核蛋白
冰核活性
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职称材料
水稻稻瘟病的发病症状与防治措施研究进展
被引量:
12
6
作者
王亚波
唐前君
《湖南农业科学》
2019年第2期120-122,共3页
稻瘟病,作为水稻三大病害之一,极大程度上影响了水稻的产量。综述了水稻稻瘟病在各个时期发病时的症状和发病条件,以及水稻稻瘟病防治的主要方法。提出选育抗病品种为主、化学防治为辅的防治策略。可为水稻稻瘟病的预防及防治提供参考。
关键词
水稻
稻瘟病
症状
防治
综述
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职称材料
蕹菜害虫白斑烦夜蛾形态学特征及习性研究
被引量:
1
7
作者
刘艳
袁巾贺
+1 位作者
王庆
王星
《长江蔬菜》
2015年第22期171-174,共4页
以蕹菜为寄主,室内详细观察了白斑烦夜蛾各虫态的形态学特征和行为习性。观察结果表明,卵,半球形、初产时淡黄色略透明,逐渐变成红褐色。幼虫共7龄,身体灰色,密布黑色斑纹。从前胸至腹末具7条纵带,其中背线和气门下线较宽,背侧4条较细,...
以蕹菜为寄主,室内详细观察了白斑烦夜蛾各虫态的形态学特征和行为习性。观察结果表明,卵,半球形、初产时淡黄色略透明,逐渐变成红褐色。幼虫共7龄,身体灰色,密布黑色斑纹。从前胸至腹末具7条纵带,其中背线和气门下线较宽,背侧4条较细,纵带颜色随着龄期的变化由白逐渐变黄。高龄幼虫前三腹节各具6个圆形黑斑,背部2个,侧面4个,平行排列;第8腹节背部有1个圆形白斑,周围具6个小黑斑。蛹初时为绿色,随后变为红褐色。成虫触角丝状,身体灰黑色,翅面似长满苔藓的树干。低龄幼虫取食叶肉,静息于叶背,受惊扰时迅速吐丝逃跑;高龄幼虫取食叶片及嫩茎,静息于叶背或叶茎,行动缓慢,遇刺激身体蜷缩;成虫静息于根部土壤或叶面。
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关键词
白斑烦夜蛾
形态学特征
行为习性
蕹菜
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职称材料
基于支持向量回归的非线性变量筛选用于酚类化合物QSAR建模的研究
被引量:
1
8
作者
徐镜善
王凯
袁哲明
《安徽农业科学》
CAS
2014年第13期3799-3801,共3页
首先基于支持向量回归(SVR)依均方根误差最小原则确定最优核函数,再以最优核函数为基础,进行SVR非线性自变量筛选,最后以所选自变量进行建模预测。将该方法应用于酚类化合物的QSAR研究,最优核函数确定为径向基核,最终保留自变量为疏水...
首先基于支持向量回归(SVR)依均方根误差最小原则确定最优核函数,再以最优核函数为基础,进行SVR非线性自变量筛选,最后以所选自变量进行建模预测。将该方法应用于酚类化合物的QSAR研究,最优核函数确定为径向基核,最终保留自变量为疏水性参数(lgP)与拓扑指数(Am3)。结果表明:基于SVR进行变量筛选能有效地剔除无关自变量,进一步改进SVR对小样本数据的建模预测能力。该方法在农业环境毒性污染物的QSAR研究领域有较广泛的应用前景。
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关键词
支持向量回归
自变量筛选
定量构效关系
酚类化合物
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职称材料
题名
蕹菜新纪录害虫——筒小卷蛾的生物学特性及形态学特征研究
1
作者
粟明珠
张杨
钟婉玲
王星
机构
湖南
农业大学
植物
保护学院
湖南省植物病虫害生物学与防控重点实验室
出处
《长江蔬菜》
2015年第22期165-167,共3页
基金
国家科技支撑计划课题(2012BAD27B02)
湖南农业大学创新性实验项目(XCX1592)
文摘
对蕹菜上新发现的害虫筒小卷蛾的生物学特性及形态学特征进行了系统的观察和研究。研究结果表明,卵粒淡黄色,较扁平;幼虫体绿色,头壳黑色;蛹为被蛹,初化蛹为墨绿色,羽化前颜色为黄褐色;成虫褐色黄色相间,翅面中央一条明显浅黄色横带。筒小卷蛾的一个世代为(34.714±1.074)d,其中卵、幼虫、蛹和成虫的发育历期分别为(4.250±0.125)d、(12.167±0.259)d、(5.917±0.130)d和(12.429±1.025)d。幼虫共5龄,1-5龄的发育历期分别为(1.583±0.142)d、(1.750±0.125)d、(1.833±0.108)d、(2.333±0.136)d和(4.667±0.245)d。低龄幼虫取食叶脉附近的叶肉,高龄幼虫卷叶取食,常伴有咬断叶柄行为。成虫羽化高峰在8:00-10:00,交配高峰在5:00-10:00。成虫羽化1-2 d后进行交配,交配1-2 d后即可产卵,每雌产卵量为58-133粒。
关键词
筒小卷蛾
形态学特性
生物学特征
生活习性
蕹菜
Keywords
Rhopalovalva grapholitana(Caradja
1916)
Morphological characteristics
Biological characteristics
Ipomoea aquatica Forsk
分类号
S436.45 [农业科学—农业昆虫与害虫防治]
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职称材料
题名
辣椒轻斑驳病毒湖南分离物的全基因序列测定及结构分析
被引量:
4
2
作者
刘湘宁
戴良英
李魏
董铮
唐前君
机构
湖南
农业大学
植物
保护学院
湖南省植物病虫害生物学与防控重点实验室
湖南
农业大学病毒研究所
出处
《植物保护》
CAS
CSCD
北大核心
2017年第2期88-94,共7页
基金
公益性行业(农业)科研专项(201303028)
国家自然科学基金(31101413)
+1 种基金
湖南省烟草公司科技计划项目(13-14ZDAa04
14-16ZDAa02)
文摘
采自湖南地区的辣椒轻斑驳病毒Pepper mild mottle virus(PMMoV)样品经单斑分离后,根据已经报道的PMMoV序列基因保守区设计6对简并引物,采用片段重叠法和RACE方法扩增、克隆获得一个全长为6 356bp的湖南分离物(PMMoV-HN1,登录号:KP345899)全基因组序列,编码4个蛋白,分别为126kD蛋白(70~3 423nt)、183kD蛋白(70~4 908nt)、28kD蛋白(4 909~5 682nt)和17.5kD蛋白(5 685~6 158nt),5′-非编码区(5′-UTR)和3′-非编码区(3′-UTR)分别含有69和198个碱基,其中5′-UTR存在一个序列为m7G5′pppG的甲基化核苷酸帽子结构。一致性分析发现PMMoV-HN1与PMMoV其他分离物的核酸一致性为94%~99%,编码的氨基酸一致性为94%~99%。全基因组序列系统进化分析表明PMMoV-HN1分离物与中国首次报道的PMMoV-CN分离物亲缘关系最近。本研究是国内报道的第二例PMMoV全基因组序列。
关键词
辣椒
辣椒轻斑驳病毒
全基因序列
序列分析
Keywords
pepper
PMMoV
whole-genome sequence
sequence analysis
分类号
S432.41 [农业科学—植物病理学]
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职称材料
题名
基于岭回归和SVM的高维特征选择与肽QSAR建模
被引量:
2
3
作者
王志明
韩娜
袁哲明
伍朝华
机构
湖南省
作物种质创新与资源利用
重点
实验室
湖南省植物病虫害生物学与防控重点实验室
湖南
农业大学理学院
出处
《物理化学学报》
SCIE
CAS
CSCD
北大核心
2013年第3期498-507,共10页
基金
湖南省杰出青年科学基金(10JJ1005)
教育部博士点基金(20124320110002)资助项目~~
文摘
岭回归估计权重绝对值在一定程度上体现了对应特征作用大小,据此发展了基于岭回归(RR)和支持向量机(SVM)的高维特征选择算法.对苦味二肽(BTT)和细胞毒性T淋巴细胞(CTL)表位9肽两个肽体系,以氨基酸的531个物理化学性质参数直接表征肽结构,各获得1062、4779个初始特征;对训练集,初始特征以岭回归排序后序贯引入,当SVM留一法交叉测试(LOOCV)的均方误差(MSE)显著上扬时终止,最后以多轮末尾淘汰进一步精筛,分别获得7、18个物理化学意义明确的保留特征.基于保留特征与支持向量回归(SVR),对训练集建立定量构效关系(QSAR)模型,预测独立测试集,其拟合精度、留一法交叉测试精度、独立预测精度均优于现有文献报道结果.新方法运行速度快,选取的特征物理化学意义明确,解释性强,在肽、蛋白质定量构效关系建模等高维数据回归预测领域有较广泛应用前景.
关键词
定量构效关系
岭回归
支持向量机
特征选择
高维特征
Keywords
Quantitative structure-activity relationship
Support vector machine
Ridge regression
Feature selection
High-dimensional feature
分类号
Q51 [生物学—生物化学]
在线阅读
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职称材料
题名
运用PDB中的同源信息提高NetTurnP的蛋白质β转角预测精度(英文)
被引量:
1
4
作者
钱刚
王海燕
袁哲明
机构
湖南省
作物种质创新与资源利用
重点
实验室
湖南省植物病虫害生物学与防控重点实验室
Department of Statistics
出处
《生物化学与生物物理进展》
SCIE
CAS
CSCD
北大核心
2012年第5期472-482,共11页
基金
supported by grants from The Science Foundation for Distinguished Young Scholars of Hunan Province,China(10JJ1005)
The Research Fund for The Doctoral Program of Higher Education of China(200805370002)~~
文摘
β转角作为一种蛋白质二级结构类型在蛋白质折叠、蛋白质稳定性、分子识别等方面具有重要作用.现有的β转角预测方法,没有将PDB等结构数据库中先前存在的同源序列的结构信息映射到待预测的蛋白质序列上.PDB存储的结构已超过70 000,因此对一条新确定的序列,有较大可能性从PDB中找到其同源序列.本文融合PDB中提取的同源结构信息(对每一待测序列,仅使用先于该序列存储于PDB中的同源信息)与NetTurnP预测,提出了一种新的β转角预测方法BTMapping,在经典的BT426数据集和本文构建的数据集EVA937上,以马修斯相关系数表示的预测精度分别为0.56、0.52,而仅使用NetTurnP的为0.50、0.46,以Qtotal表示的预测精度分别为81.4%、80.4%,而仅使用NetTurnP的为78.2%、77.3%.结果证实同源结构信息结合先进的β转角预测器如NetTurnP有助于改进β转角识别.BTMapping程序及相关数据集可从http://www.bio530.weebly.com获得.
关键词
β转角预测
同源信息
PDB
NetTurnP
BTMapping
Keywords
β-turn prediction
homology information
PDB
NetTurnP
BTMapping
分类号
Q518.1 [生物学—生物化学]
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职称材料
题名
冰核细菌Erwinia ananas 110冰核基因iceA的原核表达及冰核活性分析
被引量:
1
5
作者
姚润贤
袁哲明
机构
湖南省
作物种质创新与资源利用
重点
实验室
湖南省植物病虫害生物学与防控重点实验室
出处
《湖南农业大学学报(自然科学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2013年第4期354-358,共5页
基金
湖南省杰出青年基金(10JJ1005)
文摘
为获得具有高冰核活性的基因工程菌,从冰核细菌Erwinia ananas 110扩增冰核基因iceA,将其克隆到pMD19–T载体上,转化大肠杆菌DH5α,单、双酶切鉴定并测序;阳性克隆目的片段亚克隆到表达载体pET–23a(+)上,转化大肠杆菌DH5α,单、双酶切鉴定重组质粒;阳性重组质粒转化大肠杆菌BL21(DE3)pLysS,并经IPTG诱导表达。SDS–PAGE电泳检测表明,冰核基因iceA能够并以包涵体形式表达,相对分子质量约为180 000。冰核活性测定结果表明,重组菌BL21(DE3)pLysS/pET–ice的冰核活性与野生冰核细菌Erwinia ananas 110在–5、–4、–3、–2℃下无明显差别。
关键词
冰核细菌
原核表达
冰核蛋白
冰核活性
Keywords
ice nucleation active bacteria
prokaryotic expression
ice nucleation active protein
ice nucleation activity
分类号
S433 [农业科学—农业昆虫与害虫防治]
Q81 [生物学—生物工程]
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职称材料
题名
水稻稻瘟病的发病症状与防治措施研究进展
被引量:
12
6
作者
王亚波
唐前君
机构
湖南
农业大学
植物
保护学院
祁东县种子管理局
湖南省植物病虫害生物学与防控重点实验室
出处
《湖南农业科学》
2019年第2期120-122,共3页
文摘
稻瘟病,作为水稻三大病害之一,极大程度上影响了水稻的产量。综述了水稻稻瘟病在各个时期发病时的症状和发病条件,以及水稻稻瘟病防治的主要方法。提出选育抗病品种为主、化学防治为辅的防治策略。可为水稻稻瘟病的预防及防治提供参考。
关键词
水稻
稻瘟病
症状
防治
综述
Keywords
rice
rice blast
symptoms
control
review
分类号
S435.111 [农业科学—农业昆虫与害虫防治]
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职称材料
题名
蕹菜害虫白斑烦夜蛾形态学特征及习性研究
被引量:
1
7
作者
刘艳
袁巾贺
王庆
王星
机构
湖南
农业大学
植物
保护学院
湖南
农业大学东方科技学院
湖南省植物病虫害生物学与防控重点实验室
出处
《长江蔬菜》
2015年第22期171-174,共4页
基金
国家科技支撑计划课题(2012BAD27B02)
湖南农业大学创新性实验项目(DFCXY201453)
文摘
以蕹菜为寄主,室内详细观察了白斑烦夜蛾各虫态的形态学特征和行为习性。观察结果表明,卵,半球形、初产时淡黄色略透明,逐渐变成红褐色。幼虫共7龄,身体灰色,密布黑色斑纹。从前胸至腹末具7条纵带,其中背线和气门下线较宽,背侧4条较细,纵带颜色随着龄期的变化由白逐渐变黄。高龄幼虫前三腹节各具6个圆形黑斑,背部2个,侧面4个,平行排列;第8腹节背部有1个圆形白斑,周围具6个小黑斑。蛹初时为绿色,随后变为红褐色。成虫触角丝状,身体灰黑色,翅面似长满苔藓的树干。低龄幼虫取食叶肉,静息于叶背,受惊扰时迅速吐丝逃跑;高龄幼虫取食叶片及嫩茎,静息于叶背或叶茎,行动缓慢,遇刺激身体蜷缩;成虫静息于根部土壤或叶面。
关键词
白斑烦夜蛾
形态学特征
行为习性
蕹菜
Keywords
Aedia leucomelas
Morphological characteristics
Habits
Ipomoea aquatica Forsk
分类号
S436.45 [农业科学—农业昆虫与害虫防治]
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职称材料
题名
基于支持向量回归的非线性变量筛选用于酚类化合物QSAR建模的研究
被引量:
1
8
作者
徐镜善
王凯
袁哲明
机构
湖南省植物病虫害生物学与防控重点实验室
湖南
大众传媒职业技术学院
湖南省
作物种质创新与资源利用国家
重点
实验室
培育基地
出处
《安徽农业科学》
CAS
2014年第13期3799-3801,共3页
基金
教育部高等学校博士点专项基金(200805370002)
文摘
首先基于支持向量回归(SVR)依均方根误差最小原则确定最优核函数,再以最优核函数为基础,进行SVR非线性自变量筛选,最后以所选自变量进行建模预测。将该方法应用于酚类化合物的QSAR研究,最优核函数确定为径向基核,最终保留自变量为疏水性参数(lgP)与拓扑指数(Am3)。结果表明:基于SVR进行变量筛选能有效地剔除无关自变量,进一步改进SVR对小样本数据的建模预测能力。该方法在农业环境毒性污染物的QSAR研究领域有较广泛的应用前景。
关键词
支持向量回归
自变量筛选
定量构效关系
酚类化合物
Keywords
Support vector regression
Independent variable screening
Quantitative structure-activity relationships
Phenol compounds
分类号
S111 [农业科学—农业基础科学]
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