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硝酸甘油耐受大鼠主动脉差异microRNA筛选与生物信息学分析
被引量:
1
1
作者
曾振华
刘建新
+1 位作者
曹春芽
吴卫华
《中国临床药理学与治疗学》
CAS
CSCD
2018年第10期1081-1087,共7页
目的:筛选硝酸甘油耐受大鼠主动脉差异表达的microRNA (miRNA),并分析预测差异miRNA调控的靶基因及功能。方法:SD大鼠皮下注射给予硝酸甘油连续3 d造成硝酸甘油耐受模型,胸主动脉提取RNA后,应用miRNA测序技术筛选差异miRNA,并用qRT-PCR...
目的:筛选硝酸甘油耐受大鼠主动脉差异表达的microRNA (miRNA),并分析预测差异miRNA调控的靶基因及功能。方法:SD大鼠皮下注射给予硝酸甘油连续3 d造成硝酸甘油耐受模型,胸主动脉提取RNA后,应用miRNA测序技术筛选差异miRNA,并用qRT-PCR进行验证。利用生物信息学方法预测差异表达miRNA调控的靶基因,分析靶基因富集的基因功能(gene ontology,GO)和信号通路(pathway)。结果:与对照组比较,硝酸甘油耐受组共有28个miRNA表达发生显著变化,其中16个为已知miRNA,其中12个上调,4个下调(P <0. 05)。qRT-PCR检测了miR-487b-3p和miR-503-5p,变化趋势与测序结果一致。生物信息学分析显示,差异miRNA的靶基因主要富集于蛋白结合和代谢途径。结论:硝酸甘油耐受大鼠主动脉miRNA表达明显变化,这些差异miRNA通过调控靶基因参与硝酸甘油耐受发生。
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关键词
硝酸甘油
耐受
MICRORNA
生物信息学
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职称材料
胞质M-CSF诱导HeLa细胞侵袭和迁移
2
作者
张蒙夏
刘琪
+2 位作者
吴海燕
李响
唐圣松
《生物化学与生物物理进展》
SCIE
CAS
CSCD
北大核心
2017年第11期1007-1015,共9页
为探讨巨噬细胞集落刺激因子(M-CSF)对人宫颈癌细胞(He La细胞)侵袭和迁移的影响及机制,采用胞质定位空载体p CMV/cyto/myc与重组载体p CMV/cyto/myc-M-CSF稳定转染He La细胞株,建立稳定高表达胞质M-CSF的细胞系(He La-M细胞).经Transw...
为探讨巨噬细胞集落刺激因子(M-CSF)对人宫颈癌细胞(He La细胞)侵袭和迁移的影响及机制,采用胞质定位空载体p CMV/cyto/myc与重组载体p CMV/cyto/myc-M-CSF稳定转染He La细胞株,建立稳定高表达胞质M-CSF的细胞系(He La-M细胞).经Transwell实验观察胞质M-CSF对He La细胞侵袭和迁移能力的影响,逆转录-聚合酶链式反应及蛋白质印迹检测细胞Rho三磷酸鸟苷酶(Rho GTPases)及基质金属酶的表达,明胶酶谱法检测基质金属蛋白酶2的活性.结果显示,与转染空载体的He La细胞(He La-C细胞)和对照组He La细胞比较,胞质M-CSF的高表达可明显增强He La细胞在体外的侵袭和迁移能力,其机制与Rho GTPases的活化,以及MMP2表达上调及其活性增高密切相关.
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关键词
巨噬细胞集落刺激因子
宫颈癌
基质金属蛋白酶2
侵袭
迁移
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职称材料
题名
硝酸甘油耐受大鼠主动脉差异microRNA筛选与生物信息学分析
被引量:
1
1
作者
曾振华
刘建新
曹春芽
吴卫华
机构
湖南医药学院生物医学研究中心
湖南
医药
学院
药
学院
出处
《中国临床药理学与治疗学》
CAS
CSCD
2018年第10期1081-1087,共7页
基金
湖南省教育厅科学研究项目(17B188)
湖南医药学院青年优秀科研人才支持计划(2013-85)
文摘
目的:筛选硝酸甘油耐受大鼠主动脉差异表达的microRNA (miRNA),并分析预测差异miRNA调控的靶基因及功能。方法:SD大鼠皮下注射给予硝酸甘油连续3 d造成硝酸甘油耐受模型,胸主动脉提取RNA后,应用miRNA测序技术筛选差异miRNA,并用qRT-PCR进行验证。利用生物信息学方法预测差异表达miRNA调控的靶基因,分析靶基因富集的基因功能(gene ontology,GO)和信号通路(pathway)。结果:与对照组比较,硝酸甘油耐受组共有28个miRNA表达发生显著变化,其中16个为已知miRNA,其中12个上调,4个下调(P <0. 05)。qRT-PCR检测了miR-487b-3p和miR-503-5p,变化趋势与测序结果一致。生物信息学分析显示,差异miRNA的靶基因主要富集于蛋白结合和代谢途径。结论:硝酸甘油耐受大鼠主动脉miRNA表达明显变化,这些差异miRNA通过调控靶基因参与硝酸甘油耐受发生。
关键词
硝酸甘油
耐受
MICRORNA
生物信息学
Keywords
nitroglycerin
tolerance
microRNA
bioinformatics
分类号
R965.2 [医药卫生—药理学]
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职称材料
题名
胞质M-CSF诱导HeLa细胞侵袭和迁移
2
作者
张蒙夏
刘琪
吴海燕
李响
唐圣松
机构
湖南
中
医药
大学组织胚胎学教研室
南华大学组织学与胚胎学教研室
南华大学药物药理
研究
所药物蛋白质组学
湖南
省高等学校重点实验室
湖南医药学院生物医学研究中心
出处
《生物化学与生物物理进展》
SCIE
CAS
CSCD
北大核心
2017年第11期1007-1015,共9页
基金
湖南省高校创新平台开放基金项目(09K072
12K120)
湖南省教育厅青年项目(11B110)资助~~
文摘
为探讨巨噬细胞集落刺激因子(M-CSF)对人宫颈癌细胞(He La细胞)侵袭和迁移的影响及机制,采用胞质定位空载体p CMV/cyto/myc与重组载体p CMV/cyto/myc-M-CSF稳定转染He La细胞株,建立稳定高表达胞质M-CSF的细胞系(He La-M细胞).经Transwell实验观察胞质M-CSF对He La细胞侵袭和迁移能力的影响,逆转录-聚合酶链式反应及蛋白质印迹检测细胞Rho三磷酸鸟苷酶(Rho GTPases)及基质金属酶的表达,明胶酶谱法检测基质金属蛋白酶2的活性.结果显示,与转染空载体的He La细胞(He La-C细胞)和对照组He La细胞比较,胞质M-CSF的高表达可明显增强He La细胞在体外的侵袭和迁移能力,其机制与Rho GTPases的活化,以及MMP2表达上调及其活性增高密切相关.
关键词
巨噬细胞集落刺激因子
宫颈癌
基质金属蛋白酶2
侵袭
迁移
Keywords
macrophage colony stimulating factor, cervical carcinoma, matrix metalloproteinase-2, invasion,migration
分类号
R737.33 [医药卫生—肿瘤]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
硝酸甘油耐受大鼠主动脉差异microRNA筛选与生物信息学分析
曾振华
刘建新
曹春芽
吴卫华
《中国临床药理学与治疗学》
CAS
CSCD
2018
1
在线阅读
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职称材料
2
胞质M-CSF诱导HeLa细胞侵袭和迁移
张蒙夏
刘琪
吴海燕
李响
唐圣松
《生物化学与生物物理进展》
SCIE
CAS
CSCD
北大核心
2017
0
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职称材料
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0
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