基于Illumina MiSeq的海南近岸海湾浮游植物群落组成及其物种多样性分析

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作者 李智杰 费小雯 +4 位作者 田冶 张秀霞 何丽敏 伍丽娴 邓晓东 《南方农业学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第9期2798-2812,共15页

【目的】调查研究海南近岸海湾浮游植物群落组成及其物种多样性,探索导致浮游植物多样性差异的原因,为预测赤潮发生及改善水体质量提供参考依据。【方法】在陵水湾、海尾湾、清澜湾和三亚湾各设4个采样站位采集水环境样本,PCR扩增18S r... 【目的】调查研究海南近岸海湾浮游植物群落组成及其物种多样性,探索导致浮游植物多样性差异的原因,为预测赤潮发生及改善水体质量提供参考依据。【方法】在陵水湾、海尾湾、清澜湾和三亚湾各设4个采样站位采集水环境样本,PCR扩增18S rRNA序列V4可变区,基于Illumina MiSeq高通量测序分析4个近岸海湾浮游植物群落组成及其物种多样性,并通过典型对应分析(CCA)、Mantel检验及Spearman相关分析探索浮游植物群落组成与环境因子的相关性。【结果】测序获得的542个浮游植物OTUs共注释到8门24纲147个属246种,角毛藻属、菱形藻属、近囊胞藻属、Ciliophrys、骨条藻属、海链藻属、斜纹藻属、原多甲藻属等为优势浮游植物属。硅藻门为陵水湾和三亚湾的优势物种,浮游植物群落多样性最高的属均为角毛藻属;清澜湾的优势物种为绿藻门,优势多样性最高的属为菱形藻属;海尾湾的优势物种为褐藻门,优势多样性最高的属为近囊胞藻属。陵水湾浮游植物群落的Shannon指数和Simpson指数与其他3个海湾间存在显著(P<0.05)或极显著(P<0.01)差异,而海尾湾、清澜湾与三亚湾间的多样性指数均无显著差异(P>0.05)。4个海湾的浮游植物群落组成均受到不同环境因子的影响,其中总氮、总磷、电导率、盐度和水温是影响浮游植物组成的主要环境因子。【结论】海南近岸海湾浮游植物群落中硅藻门物种丰度最高,三亚湾的浮游植物群落多样性最高,陵水湾的浮游植物群落多样性最低且存在赤潮发生的风险。总氮、总磷、电导率、盐度和水温是影响海南近岸海湾浮游植物群落组成的主要环境因子,因此,在海洋资源开发利用过程中要实时监控水质污染及环境因子的变化,确保浮游植物等关键生态组分的健康与多样性,避免浮游植物群落失衡和赤潮等生态灾害发生,以保持海洋生态系统的稳定性。 展开更多

关键词 浮游植物 群落结构 物种多样性 环境因子 Illumina MiSeq 海南近岸海湾

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基于高通量测序和纯培养技术解析海南东寨港红树植物老鼠簕根际放线菌多样性及其潜在的功能 被引量：1

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作者 刘顺卿 何小稳 +4 位作者 吴金燕 易国辉 陈芊芊 谢欣宜 隋金蕾 《热带作物学报》 CSCD 北大核心 2024年第7期1498-1510,共13页

根际是土壤-植物根系-微生物进行物质交换的活跃地带。根际放线菌是根系放线菌的重要组成部分,是生物活性物质的主要来源之一。本研究从海南东寨港红树林自然保护区采集了5份红树植物老鼠簕根际土壤样品,采用高通量测序和传统纯培养相... 根际是土壤-植物根系-微生物进行物质交换的活跃地带。根际放线菌是根系放线菌的重要组成部分,是生物活性物质的主要来源之一。本研究从海南东寨港红树林自然保护区采集了5份红树植物老鼠簕根际土壤样品,采用高通量测序和传统纯培养相结合的策略探究样品中根际放线菌的多样性和产生生物活性物质的潜力。利用Illumina Novaseq6000测序平台对老鼠簕根际样品细菌的16SrRNA基因的V3~V4区域进行测序与分析,结果显示:(1)老鼠簕根际细菌共注释到32个门(包括25个有效鉴定的门),其中优势门是变形菌门;α多样性分析表明老鼠簕根际细菌群落多样性非常丰富;(2)对放线菌门的微生物群落进行分析,注释到33个有效鉴定的属、4个暂定的属和28个未培养的新放线菌属,KEGG功能预测分析显示老鼠簕根际放线菌主要参与次级代谢产物的生物合成。同时,利用传统纯培养方法分离放线菌,经形态特征分群和排重,通过PCR扩增、测序并比对16SrRNA基因序列后进行放线菌多样性分析,利用琼脂扩散法筛选抑菌活性,通过基于PCR的基因筛选技术检测代表菌株可能存在的PKS-Ⅰ、PKS-Ⅱ和NRPS抗生素生物合成基因,结果显示:(1)共得到4个属的33株放线菌代表菌株,其中链霉菌属为优势菌属,有2个属未被高通量测序分析结果注释到;(2)代表菌株的NRPS和PKS-Ⅱ基因阳性率很高(90%以上),24.24%根际放线菌具有抗1种及以上指示菌的活性。本研究利用高通量测序和纯培养方法得出东寨港红树植物老鼠簕的根际放线菌多样性非常丰富,并具有较好的合成次生代谢产物的潜力,因此,该研究结果可为具有生物活性化合物的筛选提供丰富的菌种资源,同时也为后续新药的开发提供重要参考依据。 展开更多

关键词 老鼠簕 根际 放线菌多样性 高通量测序 纯培养

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海南鼠戊型肝炎病毒基因遗传进化分析

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作者 汤婷 田秀颖 +6 位作者 邓宛心 李子涵 杨聘 雷胜 杜江 尹飞飞 崔秀吉 《海南医学院学报》 CAS 北大核心 2024年第20期1521-1526,共6页

目的:戊型肝炎病毒(hepatitis E virus,HEV)属于戊型肝炎病毒科(Hepeviridae),包括四个属,即HEV-A、-B、-C和-D。HEV是一种正单链,长约7 kb的裸露RNA病毒,可以引起急、慢性戊型肝炎,特别是孕妇感染HEV后死亡率较高。目前,普遍认为只有HE... 目的:戊型肝炎病毒(hepatitis E virus,HEV)属于戊型肝炎病毒科(Hepeviridae),包括四个属,即HEV-A、-B、-C和-D。HEV是一种正单链,长约7 kb的裸露RNA病毒,可以引起急、慢性戊型肝炎,特别是孕妇感染HEV后死亡率较高。目前,普遍认为只有HEV-A对人类具有致病性。然而,近期在中国香港、西班牙和中非等地区陆续报告由HEV-C,即鼠戊型肝炎病毒感染引起的戊型肝炎病例,说明HEV-C也是一种人兽共患病毒,可传染于人类。在前期工作中,课题组从海南省澄迈县捕获的褐家鼠粪便中检测到了HEV-C基因部分片段。为进一步了解海南HEV-C基因分子特征,本研究中扩增了HEV-C全长基因,并对其进行了系统发育分析。方法:使用Trizol试剂从海南省澄迈县捕获的褐家鼠粪便中分离HEV RNA,并利用Oligo dT引物进一步转录合成cDNA。接着用PCR方法扩增HEV的四个ORF区,并用Sanger法测序,拼接全长HEV基因。利用MEGA X软件的Clustal W方法与参考序列进行比对,并构建系统进化树。结果:通过系统进化树分析发现本研究中扩增的HEV-C为C1型,与广东省湛江市褐家鼠中发现的HEV-C1(基因号:LC549184)的同源性是93.1%,但与我国云南省、香港特别行政区和湖北省等地区的同源性比较远,分别为65.7%、65.9%、85.4%。结论:本研究首次针对海南省褐家鼠携带HEV-C1全长基因进行了系统进化分析。该研究结果提示海南省存在HEV-C的鼠-人传播的潜在风险。因此,应继续控制鼠类的同时,也应预防鼠HEV传染人类的风险。 展开更多

关键词 肝炎 啮齿类动物 鼠戊型肝炎病毒 海南

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2019—2020年海南海尾湾浮游植物与环境因子的调查分析 被引量：4

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作者 贺长皓 李亚军 +4 位作者 张秀霞 曾茹 黄晓晴 费小雯 邓晓东 《南方农业学报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第10期2766-2777,共12页

【目的】明确海南海尾湾海域浮游植物群落组成及其与环境因子的相关性,为保护海尾湾海域浮游植物多样性和水体环境提供参考依据。【方法】于2019年7月(夏季)和9月(秋季)及2020年7月(夏季),对海南岛海尾湾近岸海域的12个固定采样点(站点... 【目的】明确海南海尾湾海域浮游植物群落组成及其与环境因子的相关性,为保护海尾湾海域浮游植物多样性和水体环境提供参考依据。【方法】于2019年7月(夏季)和9月(秋季)及2020年7月(夏季),对海南岛海尾湾近岸海域的12个固定采样点(站点)进行3个航次的水样采集调查,返航后对浮游植物的群落结构、水质及周边环境等进行鉴定和记录,并通过冗余分析(RDA)探究浮游植物群落结构与环境因子的相关性。【结果】2019—2020年的夏季航次采集水样共鉴定出浮游植物4门147种,以硅藻门种类(121种)为主,其次是甲藻门(18种);优势种包括旋链角毛藻(Chaetoceros curvisetus)、菱形海线藻(Thalassionema nitzschioides)、佛氏海毛藻(Thalassiothrix frauenfeldii)、并基角毛藻(C.decipiens)、奇异棍形藻(Bacillaria paradoxa Gmelin.)、冰河星杆藻(Alexandrum catenclla)及拟旋链角毛藻(C.pseudocurvisetus)等;各调查站位浮游植物的平均细胞密度为17.50×104cells/m3,Shannon-Wiener多样性指数(H’)介于3.07~4.33,Pielou均匀度指数(J’)介于0.58~0.85,丰富度指数(D)介于1.34~5.12。2019年秋季航次共鉴定出浮游植物3门86种,其优势种包括旋链角毛藻、拟旋链角毛藻、覆瓦根管藻(Rhizosolehia imbricata var.Schrubsolei)、细弱海链藻(Thalassiosira subtilis)、中华根管藻(Rhizosolenia sinensis)及菱形海线藻等;各调查站点浮游植物的平均细胞密度为53.80×104cells/m3,H’介于1.80~3.35,J’介于0.33~0.63,D介于1.66~3.39。影响海尾湾海域浮游植物的重要环境影响因子是水温、SiO4和NH4-N;RDA分析结果表明,旋链角毛藻群落结构与SiO4和COD呈正相关,而拟旋链角毛藻群落结构与水温、化学需氧量(COD)和pH呈正相关。【结论】2019年夏季—2020年夏季海南海尾湾海域的水生环境良好,浮游植物物种丰富度高,影响海尾湾海域浮游植物的重要环境影响因子是水温、SiO4和NH4-N。因此,在掌握海尾湾海域内环境因子与浮游植物种群结构间的相互关系后,应定期重点监测海尾湾海的SiO4和NH4-N变化,避免赤潮发生,同时更需要有针对性地对海水养殖业废水及生活污水进行检测和治理。 展开更多

关键词 海尾湾 浮游植物 群落结构 优势种 环境因子 冗余分析

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维生素D结合蛋白基因多态性与海南慢性变应性鼻炎的关联性研究 被引量：4

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作者 陈赛明 黄静 +4 位作者 周小柳 李智群 陆菁菁 祝芙蓉 周利民 《海南医学院学报》 CAS 2018年第22期2019-2022,共4页

目的:探讨维生素D结合蛋白基因(GC)遗传多态性与海南变应性鼻炎发病的关联性。方法:选择在某医院就诊变应性鼻炎患者94例及健康对照标本113例进行病例比对研究,以质谱分型技术进行GC基因多态性位点识别,利用SNPStats网络分析软件进行基... 目的:探讨维生素D结合蛋白基因(GC)遗传多态性与海南变应性鼻炎发病的关联性。方法:选择在某医院就诊变应性鼻炎患者94例及健康对照标本113例进行病例比对研究,以质谱分型技术进行GC基因多态性位点识别,利用SNPStats网络分析软件进行基因型的共显性、显性、隐性、超显性四种模型的验证,统计学软件SPSS25.0进行等位基因的组间差异分析。结果:rs7041多态性位点的三种基因型TT、GT、GG在实验组和对照组中的分布频率分别为40.4%/42.5%、44.7%/42.5%、14.9%/15%,统计学分析结果显示组间差异性不显著(P>0.05)。rs222016位点的三种基因型AG、GG、AA在实验组和对照组中的分布频率分别为44.8%/40.7%、12.8%/25.7%、40.4%/33.6%,统计学分析结果显示基因型GG在对照组中的分布频率接近显著差异(P=0.062),而等位基因G在健康对照组中的发生频率显著高于变应性鼻炎组(P<0.05)。结论:GC多态性位点rs7041多态性与海南人群变应性鼻炎的发病无显著关联,rs222016位点基因型GG及等位基因G可能对海南变应性鼻炎的发生具有抵抗作用。 展开更多

关键词 变应性鼻炎 维生素D 蛋白基因

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几条热点DNA条形码序列对海南大戟科植物鉴定能力比较 被引量：2

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作者 徐腊红 陆籽豪 +1 位作者 唐历波 李栎 《广东农业科学》 CAS 2019年第9期27-33,共7页

【目的】比较ITS2、ITS、psbA-trnH、rbcL、matK序列对海南大戟科植物的鉴定能力。【方法】利用PCR测序法对供试样本目的片段进行双向测序,所得序列经Codon Code Aligner拼接后,利用MEGA 6.0进行相关数据分析,利用TAXON DNA软件分析序... 【目的】比较ITS2、ITS、psbA-trnH、rbcL、matK序列对海南大戟科植物的鉴定能力。【方法】利用PCR测序法对供试样本目的片段进行双向测序,所得序列经Codon Code Aligner拼接后,利用MEGA 6.0进行相关数据分析,利用TAXON DNA软件分析序列种内、种间变异并作barcoding gap分析。【结果】5条候选序列的序列获得率分别为86.96%、76.81%、89.86%、79.71%、49.28%;ITS2序列的变异系数和信息位点系数最大;ITS2序列存在明显的barcoding gap,种间与种内变异分布呈两边分开的趋势。ITS序列虽存在barcoding gap,但种内变异和种间变异有较多的重叠区;psbA-trnH和matK序列barcoding gap均不明显,同时种内变异和种间变异有较多的重叠区;rbcL序列虽barcoding gap不明显,但种内变异和种间变异重叠比例较小。【结论】ITS2条形码序列对海南大戟科植物鉴定能力强,rbcL序列不能作为单独的条形码鉴定物种,但可以作为ITS2的补充条形码。 展开更多

关键词 大戟科 DNA条形码 ITS2 RBCL 鉴定

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基于GEPIA数据库分析胃癌和正常组织的差异表达基因及对预后影响 被引量：3

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作者 张紫涵 陈明明 +2 位作者 刘君 桑圣刚 张荣光 《海南医学院学报》 CAS 北大核心 2024年第8期591-596,共6页

目的:基于GEPIA数据库分析正常胃组织与胃癌组织差异表达基因及其对胃癌患者生存预后的影响。方法:利用GEPIA数据库来获取胃癌组织和正常组织的差异基因,然后在GEPIA平台上确认筛选出的基因并对其进行生存预后分析。结果:通过GEPIA数据... 目的:基于GEPIA数据库分析正常胃组织与胃癌组织差异表达基因及其对胃癌患者生存预后的影响。方法:利用GEPIA数据库来获取胃癌组织和正常组织的差异基因,然后在GEPIA平台上确认筛选出的基因并对其进行生存预后分析。结果:通过GEPIA数据库分析得到差异表达基因4644个,其中排在前10位的基因分别为:PRR11、CLDN7、TPX2、GNL3L、SKA3、ADHFE1、MTDH、CEP55、KIF11、KIF20B。其中ADHFE1基因与胃癌患者生存预后呈负相关,CEP55基因与胃癌患者生存预后呈正相关。结论:胃癌组织与正常组织之间存在差异表达基因,其中ADHFE1基因和CEP55基因对胃癌患者的生存预后推断具有重要价值。 展开更多

关键词 GEPIA数据库 胃癌 生存预后

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抑制NLRP3炎症小体激活可调节自噬改善多囊卵巢综合征颗粒细胞凋亡 被引量：5

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作者 符山花 包利利 +3 位作者 赵达 李俊 林芳婷 胡荣 《中国免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2024年第8期1646-1652,共7页

目的:在多囊卵巢综合征(PCOS)患者中探讨NOD样受体蛋白3(NLRP3)炎症小体的表达及其与颗粒细胞凋亡的关系。方法:收集17例PCOS患者(PCOS组)和20例非PCOS患者(对照组)的卵泡液与卵巢颗粒细胞,ELISA检测卵泡液中促炎因子TNF-α、IL-1β和IL... 目的:在多囊卵巢综合征(PCOS)患者中探讨NOD样受体蛋白3(NLRP3)炎症小体的表达及其与颗粒细胞凋亡的关系。方法:收集17例PCOS患者(PCOS组)和20例非PCOS患者(对照组)的卵泡液与卵巢颗粒细胞,ELISA检测卵泡液中促炎因子TNF-α、IL-1β和IL-18等表达水平,RT-PCR和Western blot检测颗粒细胞中NLRP3 mRNA和NLRP3炎症小体相关蛋白NLRP3、含CARD的凋亡相关斑点样蛋白(ASC)及裂解型天冬氨酸蛋白水解酶1(cleaved caspase-1)和自噬相关蛋白LC3-Ⅱ/LC3-Ⅰ与p62的表达水平;TUNEL法检测两组受试者颗粒细胞的凋亡水平;体外培养人卵巢癌颗粒细胞系KGN细胞,siRNA干扰技术将沉默NLRP3的siRNA(si-NLRP3)和阴性对照序列(si-NC)转染入细胞中,并采用TNF-α进行刺激以模拟PCOS相关的细胞损伤;将KGN细胞按处理方式的不同分为4组:Ctrl组、TNF-α组、TNF-α+si-NLRP3组和TNF-α+si-NC组;ELISA检测各组细胞上清液中脱氢表雄酮(DHEA)、睾酮和IL-1β与IL-18水平;TUNEL法检测各组KGN细胞的凋亡水平;Western blot检测各组KGN细胞中LC3-Ⅱ/LC3-Ⅰ、p62、NLRP3、ASC与cleaved caspase-1蛋白表达水平和NF-κB信号通路中NF-κB p-p65的水平(NF-κB p-p65/NF-κB p65)。结果:与对照组相比,PCOS患者卵泡液中TNF-α、IL-1β和IL-18的表达和颗粒细胞中LC3-Ⅱ/LC3-Ⅰ、NLRP3的mRNA与NLRP3、ASC和cleaved caspase-1的蛋白表达和细胞的凋亡水平均明显升高(P<0.05或P<0.01),而p62的蛋白表达显著降低(P<0.01);与Ctrl组相比,TNF-α组、TNF-α+si-NC组和TNF-α+si-NLRP3组细胞上清液中DHEA、睾酮和IL-1β与IL-18水平和细胞中LC3-Ⅱ/LC3-Ⅰ、ASC与cleaved caspase-1蛋白表达及NF-κB p-p65的水平和细胞凋亡率均明显升高(P<0.05或P<0.01),而p62蛋白却显著降低(P<0.01),NLRP3除在TNF-α+si-NLRP3组明显降低外(P<0.01),在TNF-α组、TNF-α+si-NC组中的表达均明显升高(P<0.01);但与TNF-α组相比,TNF-α+si-NLRP3组的上述检测指标变化趋势均明显降低(P<0.05),TNF-α+si-NC组无显著变化(P>0.05)。结论:颗粒细胞中过度激活的NLRP3炎症小体可能通过NF-κB途径参与促进PCOS患者的细胞炎症损伤与自噬性凋亡。 展开更多

关键词 多囊卵巢综合征 NOD样受体蛋白3(NLRP3)炎症小体 颗粒细胞 自噬 凋亡

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线粒体质量调控在甲基苯丙胺诱导神经毒性损害中的作用研究进展 被引量：1

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作者 聂倩云 董文娟 +4 位作者 杨根梦 秦理想 宋春辉 李利华 洪仕君 《中国药理学通报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第7期1201-1205,共5页

目前,甲基苯丙胺滥用已是全球重大的公共卫生问题,甲基苯丙胺也是我国近年滥用人数最多的合成毒品。甲基苯丙胺的神经毒性损害或成瘾机制尚未完全阐明,且缺乏特异性的戒断治疗方法与药物。线粒体是甲基苯丙胺直接产生毒性作用的靶向细... 目前,甲基苯丙胺滥用已是全球重大的公共卫生问题,甲基苯丙胺也是我国近年滥用人数最多的合成毒品。甲基苯丙胺的神经毒性损害或成瘾机制尚未完全阐明,且缺乏特异性的戒断治疗方法与药物。线粒体是甲基苯丙胺直接产生毒性作用的靶向细胞器之一,同时线粒体也可通过多条途径参与调控甲基苯丙胺神经毒性损害过程。线粒体质量是维持线粒体稳态及功能的调控基础,主要受线粒体生物发生、动力学及自噬3种机制调控。该文围绕线粒体质量调控在甲基苯丙胺诱导神经毒性损害中的作用相关研究进展进行综述,为进一步研究甲基苯丙胺神经毒性损害的机制及研发线粒体的靶向干预药物提供理论支撑。 展开更多

关键词 甲基苯丙胺 线粒体质量调控 线粒体生物发生 线粒体动力学 线粒体自噬 神经毒性

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IgG受体FcγRⅡB调节实验性自身免疫性脑脊髓炎致神经元损伤及Th17/Treg免疫平衡的作用研究 被引量：1

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作者 肖林婷 周少珑 +3 位作者 周辉 蔡奕秋 陈薇 李鹏 《中国免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2024年第5期1030-1035,1041,共7页

目的:探究IgG受体FcγRⅡB对实验性自身免疫性脑脊髓炎(EAE)模型小鼠神经元损伤与Th17/Treg失衡的作用。方法:C57BL/6小鼠随机分组为对照组、EAE组、FcγRⅡB组、EAE+FcγRⅡB组,每组15只,皮下注射MOG35-55肽诱导EAE模型,并给予FcγRⅡ... 目的:探究IgG受体FcγRⅡB对实验性自身免疫性脑脊髓炎(EAE)模型小鼠神经元损伤与Th17/Treg失衡的作用。方法:C57BL/6小鼠随机分组为对照组、EAE组、FcγRⅡB组、EAE+FcγRⅡB组,每组15只,皮下注射MOG35-55肽诱导EAE模型,并给予FcγRⅡB慢病毒液处理;造模后每日称量小鼠体质量,进行神经功能评分,持续30 d;30 d后处死小鼠,HE染色观察脑组织病理形态学变化,LFB染色评估脊髓髓鞘结构变化,免疫荧光染色检测脊髓大脑皮质神经元核抗原(NeuN)和Caspase-3表达,TUNEL染色检测神经元细胞凋亡,ELISA检测血清IL-6、IL-17、IL-10及TGF-β水平,流式细胞术分析脾脏Th17、Treg细胞比例分布,Western blot测定脊髓组织维甲酸相关孤儿受体γt(RORγt)与Forkhead家族转录因子3(Foxp3)蛋白表达。结果:与对照组比较,EAE组小鼠体质量下降,神经功能评分升高,脑组织内炎症细胞浸润明显,脊髓中出现脱髓鞘迹象,NeuN荧光表达强度减弱而Caspase-3荧光表达强度增强,TUNEL阳性着色细胞多,细胞凋亡数增加,血清中IL-6和IL-17水平升高,IL-10和TGF-β水平降低,脾脏内Th17细胞比例升高,Treg比例降低,脊髓组织内RORγt蛋白表达上调,Foxp3蛋白表达下调(P<0.05);与EAE组比较,EAE+FcγRⅡB组小鼠体质量增加,神经功能评分降低,脑组织内炎症细胞浸润减轻,脊髓脱髓鞘现象得到改善,NeuN荧光表达强度增强,Caspase-3荧光表达强度减弱,TUNEL阳性着色细胞较少,细胞凋亡数减少,血清中IL-6和IL-17水平降低,而IL-10和TGF-β水平升高,同时脾脏内Th17细胞比例降低,Treg比例升高,脊髓组织内RORγt蛋白表达下调而Foxp3蛋白表达上调(P<0.05)。结论:FcγRⅡB对EAE小鼠具有神经保护作用,可减轻其脑组织炎症细胞浸润及脱髓鞘现象,作用机制可能与调节细胞因子水平及Th17/Treg细胞免疫平衡有关。 展开更多

关键词 实验性自身免疫性脑脊髓炎 FcγRⅡB 神经元损伤 TH17/TREG 免疫

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流行性乙型脑炎病毒、西尼罗病毒、黄热病毒和寨卡病毒四重LuminexxTAG检测方法的建立与应用 被引量：1

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作者 孙俊颖 伍绮文 +4 位作者 李吉初 李春红 郭鹏举 黄艺 尹飞飞 《广东农业科学》 CAS 2024年第10期78-87,共10页

【目的】黄病毒科虫媒病毒引起的人畜共患传染病对我国畜牧业及公共卫生造成严重影响。虫媒病毒种类多且感染症状相似,临床监测工作繁重,建立4种危害严重的黄病毒科虫媒病毒快速、高通量检测技术为其诊断和流行病学监测提供技术支撑。... 【目的】黄病毒科虫媒病毒引起的人畜共患传染病对我国畜牧业及公共卫生造成严重影响。虫媒病毒种类多且感染症状相似,临床监测工作繁重,建立4种危害严重的黄病毒科虫媒病毒快速、高通量检测技术为其诊断和流行病学监测提供技术支撑。【方法】利用Luminex xTAG技术,针对流行性乙型脑炎病毒(JEV)5'UTR、西尼罗病毒(WNV)5'UTR及部分C基因、黄热病毒(YFV)5'UTR和寨卡病毒(ZIKV)NS5基因保守区,设计4对特异性引物并对引物进行TAG和Biotin修饰,以标准毒株为模板,进行多重PCR扩增;将扩增产物与带有反向TAG序列的不同编号荧光MagTAG磁珠、链霉亲和素R-藻红蛋白进行核酸杂交反应,利用Luminex 200系统检测磁珠荧光信号和藻红蛋白荧光信号,对病原进行分类和定量检测。【结果】建立了能特异性检测JEV、WNV、YFV和ZIKV的四重Luminex xTAG方法,其最优引物工作浓度为0.5、0.5、0.75、0.5µmol/L;杂交工作体系为磁珠工作液20μL、PCR扩增产物5μL、SAPE报告缓冲液75μL;杂交温度为37℃,杂交时间为30 min,pH值为8.0;该检测方法特异性好且不与登革病毒等其他虫媒病毒发生交叉反应。重复性试验结果表明,Luminex xTAG方法的批内变异系数为2.50%~5.63%,批间变异系数为3.61%~12.50%。四重Luminex xTAG方法对JEV和ZIKV的检测限为1×10^(4) copies/μL,对WNV和YFV的检测限为1×10^(3)copies/μL,其检测WNV、YFV和ZIKV的灵敏度较常规PCR高10~100倍。用Luminex xTAG方法和RT-qPCR方法检测209份临床样品和模拟样品,JEV、WNV、YFV、ZIKV符合率为100%。【结论】建立的四重Luminex xTAG方法具有高通量、高特异性和灵敏度、成本效益高的优点,可为虫媒病毒临床诊断和流行病学监测提供一种高通量技术手段。 展开更多

关键词 虫媒病毒 流行性乙型脑炎病毒 西尼罗病毒 黄热病毒 寨卡病毒 液相芯片 LuminexxTAG技术

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黎药天然产物调控AMPK抗MAFLD作用的研究进展

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作者 陈咪咪 卢文蕾 +4 位作者 于晏苏 周媛媛 张小坡 张勇 张寿文 《海南医学院学报》 CAS 北大核心 2024年第8期623-633,共11页

代谢相关性脂肪性肝病(MAFLD)是代谢综合征的肝脏表现,世界成人发病率高达25%,在我国已取代病毒性肝炎成为慢性肝病之首。单磷酸腺苷激活的蛋白激酶(AMPK)是体内重要的糖脂代谢调控关键酶,激活AMPK被认为能改善糖脂代谢紊乱、减轻氧化... 代谢相关性脂肪性肝病(MAFLD)是代谢综合征的肝脏表现,世界成人发病率高达25%,在我国已取代病毒性肝炎成为慢性肝病之首。单磷酸腺苷激活的蛋白激酶(AMPK)是体内重要的糖脂代谢调控关键酶,激活AMPK被认为能改善糖脂代谢紊乱、减轻氧化应激、抗炎、调节自噬及保护线粒体等功能发挥治疗MAFLD作用。黎药是我国中药药用资源的重要宝库,黎药天然产物被广泛发现具有激活AMPK的作用,且表现出显著的改善MAFLD效果。本文将归纳总结黎药及黎药天然产物改善MAFLD的作用和激活AMPK的关联机制,以期为黎药及黎药天然产物药物的挖掘与开发提供思路和参考,助力黎药现代化产业发展。 展开更多

关键词 黎药 黎药天然产物 AMPK MAFLD

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补心气口服液结合沙库巴曲缬沙坦钠对老年慢性心力哀竭心功能及心肌重构指标影响的研究 被引量：8

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作者 纪新博 符碧薇 +3 位作者 顾申红 麦华德 陈菊明 曾望远 《中华中医药学刊》 CAS 北大核心 2021年第10期177-180,共4页

目的探究补心气口服液结合沙库巴曲缬沙坦钠对老年慢性心力哀竭患者心功能及心肌重构指标影响。方法研究纳入126例老年慢性心力衰竭患者,均由医院2017年8月—2020年2月收治,以随机数字表法将纳入患者分成对照组和观察组,对照组患者(63例... 目的探究补心气口服液结合沙库巴曲缬沙坦钠对老年慢性心力哀竭患者心功能及心肌重构指标影响。方法研究纳入126例老年慢性心力衰竭患者,均由医院2017年8月—2020年2月收治,以随机数字表法将纳入患者分成对照组和观察组,对照组患者(63例)采取沙库巴曲缬沙坦钠治疗,观察组患者(63例)在对照组治疗基础上联合补心气口服液治疗,比较两组患者临床疗效、治疗前后中医症状(心悸气短、胸肋作痛、疲倦乏力、形寒肢冷、面浮肢肿、面色晦黯等)积分变化、治疗后患者呼吸困难改善时间、胸痛改善时间及肺部湿罗音改善时间、住院时间、治疗前后患者心功能参数变化及心肌重构指标变化、血清基质金属蛋白酶(MMP)相关指标变化、患者不良反应。结果观察组患者总有效率(93.65%,59/63)高于对照组(80.95%,51/63)(P<0.05);治疗前,两组患者心悸气短、胸肋作痛、疲倦乏力、形寒肢冷、面浮肢肿、面色晦黯等中医症状积分比较(P>0.05),治疗后各组患者心悸气短、胸肋作痛、疲倦乏力、形寒肢冷、面浮肢肿、面色晦黯等中医症状积分下降,观察组治疗后心悸气短、胸肋作痛、疲倦乏力、形寒肢冷、面浮肢肿、面色晦黯等积分低于对照组(P<0.05);观察组患者呼吸困难改善时间、胸痛改善时间及肺部湿罗音改善时间、住院时间均短于对照组(P<0.05);观察组患者治疗前,心功能参数及心肌重构指标、血清基质金属蛋白酶相关指标比较(P>0.05),治疗后各组患者心功能参数及心肌重构指标、血清基质金属蛋白酶相关指标均改善,观察组患者治疗后心功能参数及心肌重构指标、血清基质金属蛋白酶相关指标均优于对照组(P<0.05);观察组与对照组不良反应发生率均较低(P>0.05)。结论补心气口服液结合沙库巴曲缬沙坦钠治疗老年慢性心力衰竭效果显著,患者心功能改善,心机重构指标改善,患者恢复好、恢复快,不良反应少,安全性高,值得应用。 展开更多

关键词 老年慢性心力衰竭 补心气口服液 沙库巴曲缬沙坦钠 心功能 心机重构 不良反应 疗效

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Prdx1过表达通过Nrf2/HO-1信号通路抑制氧化应激减轻自发性高血压大鼠心肌肥厚和纤维化 被引量：12

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作者 纪新博 顾申红 +1 位作者 麦华德 符碧薇 《安徽医科大学学报》 CAS 北大核心 2023年第2期196-201,共6页

目的探讨过氧化物还原酶1(Prdx1)对自发性高血压大鼠心肌肥厚和纤维化的影响,并分析其作用机制。方法45只SHR大鼠随机分为模型组(SHR组)、AAV9-NC组和AAV9-Prdx1组,每组15只。另取15只Wistar Kyoto大鼠设为对照组(Control组)。各组大鼠... 目的探讨过氧化物还原酶1(Prdx1)对自发性高血压大鼠心肌肥厚和纤维化的影响,并分析其作用机制。方法45只SHR大鼠随机分为模型组(SHR组)、AAV9-NC组和AAV9-Prdx1组,每组15只。另取15只Wistar Kyoto大鼠设为对照组(Control组)。各组大鼠连续给药8周,超声心动图检测大鼠心功能指标;测定大鼠平均血压以及心肌肥厚指标;HE染色和Masson染色分别观察大鼠心肌组织形态学和纤维化情况;ELISA法检测大鼠血清中氧化应激指标;qRT-PCR法检测大鼠心肌组织中Prdx1 mRNA表达水平;Western blot法检测大鼠心肌组织中Prdx1蛋白和核因子E2相关因子2(Nrf2)/血红素氧合酶-1(HO-1)信号通路相关蛋白表达。结果与Control组比较,SHR组大鼠心肌组织中Prdx1 mRNA和蛋白表达量、左心室射血分数(EF)、左心室缩短率(FS)降低(P<0.05),大鼠平均血压、心脏质量指数(HMI)、左心室质量指数(LVMI)升高(P<0.05),心肌组织存在明显的病理损伤和胶原纤维沉积;大鼠血清中超氧化物歧化酶(SOD)和谷胱甘肽过氧化物酶(GSH-Px)活性降低,丙二醛(MDA)含量升高(P<0.05);心肌组织中Nrf2、HO-1、醌氧化还原酶1(NQO1)蛋白表达量降低(P<0.05)。与SHR组比较,AAV9-Prdx1组大鼠心肌组织中Prdx1 mRNA和蛋白表达量、EF和FS升高(P<0.05),大鼠平均血压、HMI和LVMI降低(P<0.05),心肌组织损伤和心肌纤维化有所改善;大鼠血清中SOD和GSH活性升高,MDA含量降低(P<0.05);心肌组织中Nrf2、HO-1、NQO1蛋白表达量升高(P<0.05)。结论Prdx1过表达可减轻SHR大鼠心肌肥厚和纤维化,改善SHR大鼠心功能,其作用机制可能与激活Nrf2/HO-1信号通路、抑制氧化应激反应有关。 展开更多

关键词 过氧化物还原酶1 自发性高血压 心肌肥厚 心肌纤维化 氧化应激 Nrf2/HO-1信号通路

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基于RNAi抗PRSV番木瓜株系的培育及其分子特征验证 被引量：5

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作者 黄静 贾瑞宗 +3 位作者 孔华 郭静远 王绪朋 郭安平 《热带作物学报》 CSCD 北大核心 2017年第3期513-520,共8页

根据RNAi原理构建的抗海南番木瓜环斑病毒(PRSV)植物表达载体p CAMBIA2300-35S-CP-RNAi-OCS,通过基因枪法将载体导入番木瓜的愈伤组织中,经卡那霉素抗性筛选后再分化成为植株。描述转化植株的分子特征同时进行抗病毒试验分析其抗病性。... 根据RNAi原理构建的抗海南番木瓜环斑病毒(PRSV)植物表达载体p CAMBIA2300-35S-CP-RNAi-OCS,通过基因枪法将载体导入番木瓜的愈伤组织中,经卡那霉素抗性筛选后再分化成为植株。描述转化植株的分子特征同时进行抗病毒试验分析其抗病性。实验结果显示:转基因株系474为单拷贝插入的杂合子,插入位点在第7号染色体supercontig_61的717 141位置;抗病毒试验中,在接种病毒后28 d内非转基因株系1280有高浓度的病毒积累并很快表现出明显的病症,而转基因株系474基本无病毒积累且无发病症状。表明转基因株系474具有较好的PRSV抗性,有待于进一步田间试验。 展开更多

关键词 番木瓜环斑病毒 番木瓜 RNAI

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鼠源TTV病毒海口株的基因组分析及real-time PCR检测方法的建立 被引量：1

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作者 吴悦 王珊珊 +12 位作者 王文琪 周换换 陈锦龙 易玉芳 马天明 崔秀吉 黄艺 王高玉 彭箬岩 胡小媛 何昌华 吕刚 尹飞飞 《海南医学院学报》 CAS 2019年第4期241-246,共6页

目的:对海南省海口市褐家鼠体内发现的鼠源torque teno virus(RoTTV)地方流行株RoTTV3-HMU1进行全基因组扩增测序及遗传进化分析,并建立一种基于SYBR GreenⅠ荧光染料检测RoTTV3病毒的real-time PCR检测方法。方法:基于高通量宏病毒组... 目的:对海南省海口市褐家鼠体内发现的鼠源torque teno virus(RoTTV)地方流行株RoTTV3-HMU1进行全基因组扩增测序及遗传进化分析,并建立一种基于SYBR GreenⅠ荧光染料检测RoTTV3病毒的real-time PCR检测方法。方法:基于高通量宏病毒组测序分析结果设计特异性扩增引物,采用PCR方法进行全基因组序列拼接。并根据RoTTV3保守序列通过生物信息学分析设计特异性引物,以构建的含ddrp基因的重组质粒为标准品,优化实验条件,建立RoTTV的real-time PCR检测方法。结果:成功拼接获得一株海南省海口市褐家鼠携带的RoTTV的基因组序列,遗传进化分析表明该病毒属于RoTTV3基因型。本实验建立RoTTV3 real-time PCR检测方法,标准曲线在1×10~2～1×10~8拷贝/μL浓度时呈现良好线性关系,其扩增系数为1.000,溶解曲线只出现1特异性峰,检测灵敏度达到10~2个拷贝。结论:本实验首次获得海口地区RoTTV基因组序列,并对其进行遗传进化分析,对RoTTV的起源及进化研究具有重要的意义。本实验建立的RoTTV3 real-time PCR检测方法灵敏度高、特异性好,为RoTTV3的流行病学调查奠定技术基础。 展开更多

关键词 鼠源Torque teno VIRUS 基因组扩增测序 real-time PCR检测

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冷冻切片后甲醛固定石蜡包埋组织DNA质量分析 被引量：2

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作者 郑晶 蒙秋萍 翁阳 《临床与实验病理学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2020年第4期475-477,共3页

目的分析冷冻切片后再行甲醛固定、石蜡包埋组织的DNA质量,探讨其在分子病理检测中的应用价值。方法收集已行术中快速冷冻病理诊断的肺腺癌14例,分别提取同一病例冷冻切片后剩余组织蜡块及常规包埋组织蜡块DNA,检测DNA浓度及OD260/OD280... 目的分析冷冻切片后再行甲醛固定、石蜡包埋组织的DNA质量,探讨其在分子病理检测中的应用价值。方法收集已行术中快速冷冻病理诊断的肺腺癌14例,分别提取同一病例冷冻切片后剩余组织蜡块及常规包埋组织蜡块DNA,检测DNA浓度及OD260/OD280值,行内参基因PCR扩增以检测DNA完整性,并以ARMS法行EGFR基因突变检测。结果冷冻切片后固定包埋组织提取DNA浓度及OD260/OD280均值,分别为157.33 ng/μL及1.96,均较常规包埋组织低;所有冷冻后包埋组织提取的DNA均具有100 bp及200 bp的PCR产物,但仅部分能扩增出300 bp及400 bp的PCR产物,DNA完整性稍逊于常规固定包埋组织;冷冻后包埋组织与常规包埋组织EGFR基因突变检测结果完全一致。结论组织冷冻后再行甲醛固定及石蜡包埋,会使得组织DNA进一步降解及片段化,但仍适用于ARMS法的分子病理学检测。 展开更多

关键词 冷冻切片 石蜡包埋 DNA 分子病理 ARMS法

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翅茎白粉藤乙醇浸膏体内抗氧化活性研究 被引量：2

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作者 姚瑰玮 刘辰鹏 +2 位作者 杨永兆 李娟 林明琴 《热带农业科学》 2020年第11期85-89,共5页

为寻找天然抗氧化剂,对翅茎白粉藤乙醇浸膏体内抗氧化活性进行研究并探讨其作用机制。将昆明种小鼠随机分为空白组、模型组、低剂量组、中剂量组和高剂量组,以灌胃给药的方式喂养15 d,末次灌胃后采用乙醇氧化损伤的方法造模后分离血清,... 为寻找天然抗氧化剂,对翅茎白粉藤乙醇浸膏体内抗氧化活性进行研究并探讨其作用机制。将昆明种小鼠随机分为空白组、模型组、低剂量组、中剂量组和高剂量组,以灌胃给药的方式喂养15 d,末次灌胃后采用乙醇氧化损伤的方法造模后分离血清,摘取肝脏和肾脏,比较各组小鼠血清中MDA(丙二醛)含量、GSH(还原型谷胱甘肽)含量、SOD(超氧化物歧化酶)活力、GSH-Px(谷胱甘肽过氧化物酶)活力以及肝脏系数和肾脏系数。结果表明:与空白组比较,模型组小鼠血清中MDA含量显著高于空白组(p<0.01),而血清中GSH含量、SOD活力、GSH-Px活力均低于空白组,差异具有统计学意义(p<0.01),并且模型组肾脏系数和肝脏系数均显著下降(p<0.05);与模型组比较,低、中、高剂量组小鼠血清中MDA含量均显著降低(p<0.05),GSH含量、SOD活力、GSH-Px活力均显著升高(p<0.05),肾脏系数和肝脏系数无显著差异(p>0.05)。翅茎白粉藤乙醇浸膏具有明显的体内抗氧化活性,其作用机制可能与降低体内脂质过氧化产物、清除自由基和增强抗氧化酶活性有关。 展开更多

关键词 翅茎白粉藤 丙二醛 还原型谷胱甘肽 超氧化物歧化酶 谷胱甘肽过氧化物酶 抗氧化活性

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凝血相关基因多态性与下肢深静脉血栓形成的相关性 被引量：12

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作者 姜垚如 牛蕾蕾 +6 位作者 冯娜 范浩亮 靳茜茜 杜秋香 曹洁 王英元 孙俊红 《法医学杂志》 CAS CSCD 2021年第2期145-150,157,共7页

目的探讨rs1799963(凝血因子V基因Leiden)、rs6025(凝血酶原基因G20210A)、rs1042579(血栓调节蛋白基因c.1418C>T)及rs1801131(亚甲基四氢叶酸还原酶基因)4个凝血相关基因的多态性与下肢深静脉血栓形成的相关性。方法采用竞争性等位... 目的探讨rs1799963(凝血因子V基因Leiden)、rs6025(凝血酶原基因G20210A)、rs1042579(血栓调节蛋白基因c.1418C>T)及rs1801131(亚甲基四氢叶酸还原酶基因)4个凝血相关基因的多态性与下肢深静脉血栓形成的相关性。方法采用竞争性等位基因特异性聚合酶链反应(kompetitive allele specific polymerase chain reaction,KASP)技术检测150例下肢深静脉血栓患者及153例健康对照者上述4个基因分型,采集相关血液生物化学指标,建立二元Logistic回归筛选下肢深静脉血栓形成的独立危险因素,校正混杂因素后在不同遗传模式下分析下肢深静脉血栓与各指标及4种凝血相关基因多态性的相关性。结果D-二聚体、纤维蛋白原降解产物、同型半胱氨酸、性别、年龄这5个变量可能是下肢深静脉血栓形成的危险因素。将这些变量引入4种基因遗传模式,在二元Logistic回归环境下进行校正,结果显示,rs1042579突变在显性遗传模式下与下肢深静脉血栓形成具有相关性。结论rs1799963、rs6025、rs1801131的基因多态性与下肢深静脉血栓形成无明显相关性,rs1042579的基因多态性在显性遗传模式下发挥作用,可能是下肢深静脉血栓形成的独立危险因素。 展开更多

关键词 法医病理学 法医遗传学 深静脉血栓形成 基因多态性 凝血 肺栓塞 竞争性等位基因特异性聚合酶链反应

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沉香样品中曲霉属真菌菌株HNWSW-20的分离鉴定及其次生代谢产物的研究 被引量：5

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作者 邓加艾 戴好富 +3 位作者 王宇光 陈惠琴 谭志琼 梅文莉 《热带作物学报》 CSCD 北大核心 2018年第8期1618-1624,共7页

本文采用平板分离法从沉香样品中分离得到一株真菌HNWSW-20,从形态学和分子生物学上鉴定其为曲霉菌(Aspergillus sp.),并利用多种色谱技术对其次生代谢产物进行分离纯化,根据波谱数据和理化性质鉴定其化合物结构为:2?,3?-dihydrosorbici... 本文采用平板分离法从沉香样品中分离得到一株真菌HNWSW-20,从形态学和分子生物学上鉴定其为曲霉菌(Aspergillus sp.),并利用多种色谱技术对其次生代谢产物进行分离纯化,根据波谱数据和理化性质鉴定其化合物结构为:2?,3?-dihydrosorbicillin(1),sorbicillin(2),2,3-二氢-2-(1-丙烯)-6,8-二甲基-7-羟基-色酮(3),邻苯二甲酸二丁酯(4),7-羟基-异苯并呋喃-1(3H)-酮(5)二十烷酸甲酯(6);分别采用Ellman比色法和pNPG法测定化合物的乙酰胆碱酯酶抑制活性和α-葡萄糖苷酶抑制活性,结果显示上述化合物1、2、4具有乙酰胆碱酯酶抑制活性,而化合物1、3、5具有α-葡萄糖苷酶抑制活性。本文中化合物1~2为首次从曲霉属中分离得到,并首次报道具有乙酰胆碱酯酶和α-葡萄糖苷酶抑制活性。 展开更多

关键词 沉香 真菌 分离鉴定 次生代谢产物 生物活性

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