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蛋白质纯化虚拟仿真课程的教学设计 被引量:2
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作者 马骋 宫彩霞 《生物化学与生物物理进展》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2022年第10期2063-2074,共12页
目的蛋白质纯化是医学与生物学实验教学课程中的一个重要内容,本文通过设计新的蛋白质纯化虚拟仿真教学内容,开发虚拟仿真教学系统,希望学生能够更有效率地掌握蛋白质纯化技术的要点,提升教学质量。方法利用3D虚拟仿真技术,构建虚拟仿... 目的蛋白质纯化是医学与生物学实验教学课程中的一个重要内容,本文通过设计新的蛋白质纯化虚拟仿真教学内容,开发虚拟仿真教学系统,希望学生能够更有效率地掌握蛋白质纯化技术的要点,提升教学质量。方法利用3D虚拟仿真技术,构建虚拟仿真实验室。结合线下教学经验,确定虚拟仿真教学中需要体现的教学内容、教学重点、核心仪器的特色、评分指标、考核方式、操作体验等。结果本文基于3D虚拟仿真技术构建了蛋白质纯化虚拟仿真实验室,和传统教学相比,虚拟仿真教学可以提高教学效率,节省教学成本和场地占用;教学设计和虚拟仿真教学系统融合了教学、练习和考核模块,根据以往的教学经验优化了评分体系,保证学生更加有效、严谨地掌握技术细节;涵盖了全新的教学内容——荧光检测联用的分子排阻层析,添加了蛋白质层析的常用案例,保证了内容的新颖与实用;完全再现了现实实验室中仪器设备的搭建模式,实现虚拟学习与实际操作的无缝衔接。结论蛋白质纯化虚拟仿真教学系统由虚及实,由点及面,把控细节,保证学生动手能力和探索能力的提高,学以致用,并且拥有传统教学模式不可比拟的优势。 展开更多
关键词 蛋白质纯化 荧光检测联用的分子排阻层析 虚拟仿真 实验教学
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去污剂的性质及其在膜蛋白结构生物学中的应用 被引量:2
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作者 宫彩霞 马骋 《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第1期14-20,共7页
膜蛋白在诸多生物过程,例如呼吸作用、光合作用、信号识别和分子转运等方面发挥重要作用。近年来,去污剂的快速发展,在一定程度上极大地推动了膜蛋白研究的进展。去污剂广泛应用于膜蛋白的提取、增溶、纯化、理化性质及结构研究。然而,... 膜蛋白在诸多生物过程,例如呼吸作用、光合作用、信号识别和分子转运等方面发挥重要作用。近年来,去污剂的快速发展,在一定程度上极大地推动了膜蛋白研究的进展。去污剂广泛应用于膜蛋白的提取、增溶、纯化、理化性质及结构研究。然而,如何选择合适的去污剂通常是一项复杂的任务。本文从以下两个方面入手,系统地描述了去污剂的重要理化性质及其在膜蛋白结构功能研究中的应用:(1)去污剂结构及其对去污剂性质和水溶性的影响,去污剂形成胶束的条件及影响去污剂胶束形成的其他因素。希望这些关于去污剂的基本性质和参数的介绍,可以为相关科研工作者选用去污剂提供理论依据。(2)去污剂抽提膜蛋白的流程和注意细节,对膜蛋白纯化时分子量测定的影响,膜蛋白研究中去污剂的置换与去除,以及膜蛋白结构与功能研究案例的归纳。希望这些应用细节与课题研究,能为相关科研工作者研究膜蛋白结构功能时提供经验借鉴。 展开更多
关键词 膜蛋白 去污剂 结构生物学
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哺乳动物悬浮细胞表达系统进行膜蛋白制备的优化 被引量:1
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作者 马骋 宫彩霞 《实验技术与管理》 CAS 北大核心 2022年第7期42-49,67,共9页
为提高哺乳动物悬浮细胞表达系统用于日常膜蛋白表达制备的实用性、可控性及效率,改善传统工艺缺乏快速检测和质控的方法、缺乏快速且高通量的目的蛋白及融合标签的筛选策略等方面的不足,设计了新的pf系列质粒,优化并建立关联的检测方法... 为提高哺乳动物悬浮细胞表达系统用于日常膜蛋白表达制备的实用性、可控性及效率,改善传统工艺缺乏快速检测和质控的方法、缺乏快速且高通量的目的蛋白及融合标签的筛选策略等方面的不足,设计了新的pf系列质粒,优化并建立关联的检测方法,实现了病毒滴度在转染和扩增阶段的随时监测,并缩短了定量测量病毒感染效力的周期;同时设计了新的筛选策略和ESNX质粒系列,实现了目的蛋白和融合标签质粒库的快速构建以及对其表达效果的快速、高通量检测筛选。基于新质粒和对应使用方案的膜蛋白表达制备新体系提高了效率、实用性和可控性,可以简单地再现并用于各实验室,为膜蛋白的结构、功能等各方面研究提供助力。 展开更多
关键词 哺乳动物细胞 悬浮培养 膜蛋白 表达制备
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AQP水通道的结构生物学研究进展
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作者 马骋 王丽妍 +2 位作者 张华丹 徐彩煌 张兴 《电子显微学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第4期493-504,共12页
水通道(AQP)广泛存在于原核和真核生物中,主要负责水分子的跨膜运输,具有重要的生理功能。其家族成员大都是四聚体,每个单体都具有独立的孔区,可以允许水分子通过。利用X射线晶体学,电子晶体学和单颗粒冷冻电镜等方法,至今已经解析了70... 水通道(AQP)广泛存在于原核和真核生物中,主要负责水分子的跨膜运输,具有重要的生理功能。其家族成员大都是四聚体,每个单体都具有独立的孔区,可以允许水分子通过。利用X射线晶体学,电子晶体学和单颗粒冷冻电镜等方法,至今已经解析了70余个水通道的结构;基于这些高分辨结构,已有较多的研究探讨其快速转运水分子的机制,探究其在转运水的同时又阻止质子的通透的原因;然而水通道四聚体中心孔区的作用一直存在争议。另一方面,水通道单体及四聚体形式的结构功能研究较多,而对其形成更高聚合状态的探讨相对较少。本文重点聚焦于水通道四聚体中心孔区及其形成更高级空间结构的最新研究,希望从一个新的角度探讨水通道的结构生物学研究进展。 展开更多
关键词 水通道 结构解析 中心孔区 高级空间结构
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人源瞬时受体电位M2型通道Nudix水解酶9同源结构域的提取和纯化
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作者 叶培武 余夏飞 +1 位作者 马骋 杨巍 《浙江大学学报(医学版)》 CAS CSCD 北大核心 2019年第1期5-11,共7页
目的:摸索人源瞬时受体电位M2型通道(TRPM2)羧基端Nudix水解酶9(NUDT9)同源结构域(NUDT9-H)的蛋白提取和纯化方法。方法:异丙基硫代半乳糖苷诱导表达的Rosetta(DE3)大肠埃希菌菌株经超声破碎和离心后,将收集到的上清液与GST磁珠结合并... 目的:摸索人源瞬时受体电位M2型通道(TRPM2)羧基端Nudix水解酶9(NUDT9)同源结构域(NUDT9-H)的蛋白提取和纯化方法。方法:异丙基硫代半乳糖苷诱导表达的Rosetta(DE3)大肠埃希菌菌株经超声破碎和离心后,将收集到的上清液与GST磁珠结合并用还原型谷胱甘肽洗脱以抽提GST-NUDT9-H融合蛋白,浓缩离心后再经分子排阻色谱层析纯化,最后经凝血酶酶切并与GST磁珠结合即得NUDT9-H蛋白。结果:含有0.5%的十二烷基-β-D-麦芽糖苷(DDM)裂解溶液体系和0.025%的DDM分子排阻层析色谱溶液体系能够提高GST-NUDT9-H融合蛋白的稳定性,再按每2 mg融合蛋白加入1 U凝血酶切割24 h,即获得高纯度NUDT9-H蛋白。结论:NUDT9-H蛋白稳定性较差,提取和纯化体系中需添加DDM以稳定其构象从而提高目的蛋白的产量和纯度。 展开更多
关键词 瞬时受体电位通道 焦磷酸酶类/药理学 重组融合蛋白质类/分离和提纯 谷胱甘肽转移酶
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