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食管癌中miRNA枢纽靶基因的鉴定和验证
1
作者
赵婷婷
宋爽
+3 位作者
石科
李晓英
李攀阳
李宁宁
《中国临床解剖学杂志》
北大核心
2025年第1期54-62,共9页
目的探讨与食管癌发生发展相关的miRNAs-mRNAs,研究PALB2对人食管癌EC109细胞生物学性状的影响。方法从GEO和TCGA数据库下载食管癌miRNAs数据集筛选交集,通过starbase数据库预测交集miRNAs的潜在靶基因,并使用PPI网络分析确定枢纽靶基因...
目的探讨与食管癌发生发展相关的miRNAs-mRNAs,研究PALB2对人食管癌EC109细胞生物学性状的影响。方法从GEO和TCGA数据库下载食管癌miRNAs数据集筛选交集,通过starbase数据库预测交集miRNAs的潜在靶基因,并使用PPI网络分析确定枢纽靶基因;对靶基因和枢纽靶基因分别进行GO和KEGG功能富集分析。选择预后差异显著的PALB2基因进行细胞试验,合成PALB2的特异性RNA(si-PALB2)转染EC109细胞,RT-qPCR检测细胞中PALB2的表达量,MTT、Transwell和流式分析PALB2对细胞活力、侵袭迁移和凋亡能力的影响;Western blot检测细胞周期蛋白CyclinD1、凋亡抑制蛋白Bcl-2和基质金属蛋白酶MMP-9的表达变化。结果生物信息学分析预测了参与食管癌发生发展的重要miRNAs-mRNAs,并通过实验验证敲降PALB2的表达后,EC109细胞活力、侵袭转移能力均明显降低,凋亡能力明显增加,cyclinD1、Bcl-2及MMP-9表达均明显下调。结论MiRNAs-mRNAs是预测食管癌发生发展的生物标志物;PALB2在食管癌中发挥促癌作用,与调控细胞周期蛋白、抗凋亡蛋白及侵袭转移相关蛋白密切相关,是诊断和治疗的潜在靶点。
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关键词
生物信息学分析
MIRNA
食管癌
PALB2
在线阅读
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职称材料
PSMD7基因在人食管鳞癌组织中的表达及影响癌细胞增殖、凋亡的机制研究
被引量：
2
2
作者
张进忠
石科
+2 位作者
郭丹
杨亮
闫秀明
《中国癌症杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2018年第10期740-748,共9页
背景与目的:26S蛋白酶体非ATP酶调节亚基7(26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 7,PSMD7)作为组成19S蛋白酶体盖子结构的核心成员是否参与肿瘤的发生、发展,以及具体的分子机制尚不清楚。本实验将研究PSMD7基因在人食管鳞癌...
背景与目的:26S蛋白酶体非ATP酶调节亚基7(26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 7,PSMD7)作为组成19S蛋白酶体盖子结构的核心成员是否参与肿瘤的发生、发展,以及具体的分子机制尚不清楚。本实验将研究PSMD7基因在人食管鳞癌组织中的表达,以及对癌细胞增殖及凋亡的影响。方法:采用实时荧光定量聚合酶链反应(real-time fluorescent quantitative polymerase chain reaction,RTFQ-PCR)和蛋白质印迹法(Western blot)检测食管鳞癌及其癌旁正常组织标本中PSMD7的mRNA及蛋白表达情况。在人食管鳞癌细胞系TE-1中,用慢病毒介导的RNA干扰技术下调PSMD7的表达,观察细胞增殖及凋亡的变化,检测线粒体膜电位的变化、细胞质中Cyt C的表达以及凋亡相关因子的表达。结果:PSMD7基因的mRNA和蛋白在食管鳞癌组织中的表达显著高于癌旁正常组织(P<0.05),PSMD7蛋白的高表达与淋巴结转移阳性呈正相关(P<0.05)。抑制PSMD7蛋白的表达可使细胞的增殖能力降低(P<0.05),并促进细胞的凋亡(P<0.05),同时线粒体膜电位降低,促进Cyt C释放进入细胞质,激活caspase级联反应,说明抑制PSMD7的表达诱导细胞凋亡是通过线粒体信号通路进行的。结论:PSMD7在食管鳞癌中呈高表达,并通过线粒体依赖的方式促进TE-1细胞凋亡。
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关键词
PSMD7
食管鳞癌
增殖
凋亡
线粒体
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职称材料
题名
食管癌中miRNA枢纽靶基因的鉴定和验证
1
作者
赵婷婷
宋爽
石科
李晓英
李攀阳
李宁宁
机构
河南
医学
高等
专科学校
组织学与胚胎学
教研室
河南医学高等专科学校生物化学教研室
河南
医学
高等
专科学校
病理学
教研室
出处
《中国临床解剖学杂志》
北大核心
2025年第1期54-62,共9页
基金
河南省科技攻关项目(232102310220)
河南省高等学校重点科研项目(23A320068)
河南省医学科技攻关项目(项目编号:LHGJ20220707)。
文摘
目的探讨与食管癌发生发展相关的miRNAs-mRNAs,研究PALB2对人食管癌EC109细胞生物学性状的影响。方法从GEO和TCGA数据库下载食管癌miRNAs数据集筛选交集,通过starbase数据库预测交集miRNAs的潜在靶基因,并使用PPI网络分析确定枢纽靶基因;对靶基因和枢纽靶基因分别进行GO和KEGG功能富集分析。选择预后差异显著的PALB2基因进行细胞试验,合成PALB2的特异性RNA(si-PALB2)转染EC109细胞,RT-qPCR检测细胞中PALB2的表达量,MTT、Transwell和流式分析PALB2对细胞活力、侵袭迁移和凋亡能力的影响;Western blot检测细胞周期蛋白CyclinD1、凋亡抑制蛋白Bcl-2和基质金属蛋白酶MMP-9的表达变化。结果生物信息学分析预测了参与食管癌发生发展的重要miRNAs-mRNAs,并通过实验验证敲降PALB2的表达后,EC109细胞活力、侵袭转移能力均明显降低,凋亡能力明显增加,cyclinD1、Bcl-2及MMP-9表达均明显下调。结论MiRNAs-mRNAs是预测食管癌发生发展的生物标志物;PALB2在食管癌中发挥促癌作用,与调控细胞周期蛋白、抗凋亡蛋白及侵袭转移相关蛋白密切相关,是诊断和治疗的潜在靶点。
关键词
生物信息学分析
MIRNA
食管癌
PALB2
Keywords
Bioinformatics analysis
miRNA
Esophageal cancer
PALB2
分类号
R735.1 [医药卫生—肿瘤]
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职称材料
题名
PSMD7基因在人食管鳞癌组织中的表达及影响癌细胞增殖、凋亡的机制研究
被引量：
2
2
作者
张进忠
石科
郭丹
杨亮
闫秀明
机构
河南医学高等专科学校生物化学教研室
郑州大学细胞
生物
研究室
出处
《中国癌症杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2018年第10期740-748,共9页
基金
河南省高等学校重点科研项目(16A310008
18A310015)
+2 种基金
河南省科技攻关计划项目(152102310161
162102310047)
河南省医学科技攻关计划项目(201601027)
文摘
背景与目的:26S蛋白酶体非ATP酶调节亚基7(26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 7,PSMD7)作为组成19S蛋白酶体盖子结构的核心成员是否参与肿瘤的发生、发展,以及具体的分子机制尚不清楚。本实验将研究PSMD7基因在人食管鳞癌组织中的表达,以及对癌细胞增殖及凋亡的影响。方法:采用实时荧光定量聚合酶链反应(real-time fluorescent quantitative polymerase chain reaction,RTFQ-PCR)和蛋白质印迹法(Western blot)检测食管鳞癌及其癌旁正常组织标本中PSMD7的mRNA及蛋白表达情况。在人食管鳞癌细胞系TE-1中,用慢病毒介导的RNA干扰技术下调PSMD7的表达,观察细胞增殖及凋亡的变化,检测线粒体膜电位的变化、细胞质中Cyt C的表达以及凋亡相关因子的表达。结果:PSMD7基因的mRNA和蛋白在食管鳞癌组织中的表达显著高于癌旁正常组织(P<0.05),PSMD7蛋白的高表达与淋巴结转移阳性呈正相关(P<0.05)。抑制PSMD7蛋白的表达可使细胞的增殖能力降低(P<0.05),并促进细胞的凋亡(P<0.05),同时线粒体膜电位降低,促进Cyt C释放进入细胞质,激活caspase级联反应,说明抑制PSMD7的表达诱导细胞凋亡是通过线粒体信号通路进行的。结论:PSMD7在食管鳞癌中呈高表达,并通过线粒体依赖的方式促进TE-1细胞凋亡。
关键词
PSMD7
食管鳞癌
增殖
凋亡
线粒体
Keywords
PSMD7
Esophageal squamous cell carcinoma
Proliferation
Apoptosis
Mitochondria
分类号
R735.1 [医药卫生—肿瘤]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
食管癌中miRNA枢纽靶基因的鉴定和验证
赵婷婷
宋爽
石科
李晓英
李攀阳
李宁宁
《中国临床解剖学杂志》
北大核心
2025
0
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
PSMD7基因在人食管鳞癌组织中的表达及影响癌细胞增殖、凋亡的机制研究
张进忠
石科
郭丹
杨亮
闫秀明
《中国癌症杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2018
2
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职称材料
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