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HPCL2基因表达的选择性剪切分析
被引量:
1
1
作者
牛宇欣
胡松年
杨焕明
《生物化学与生物物理进展》
SCIE
CAS
CSCD
北大核心
2003年第6期919-922,共4页
2 羟基植烷酸辅酶A裂解酶 (2 hydroxypanthyl CoAlyase ,HPCL2 )是 3 甲基脂肪酸α 氧化途径中的关键酶 .采用鸟枪法测序技术 ,得到了HPCL2基因的基因组序列 .结果显示 ,HPCL2基因组大小为 40 82 9bp ,共有 17个外显子 ,16个内含子 ....
2 羟基植烷酸辅酶A裂解酶 (2 hydroxypanthyl CoAlyase ,HPCL2 )是 3 甲基脂肪酸α 氧化途径中的关键酶 .采用鸟枪法测序技术 ,得到了HPCL2基因的基因组序列 .结果显示 ,HPCL2基因组大小为 40 82 9bp ,共有 17个外显子 ,16个内含子 .外显子平均大小为 116bp ,内含子平均大小为 2 42 9bp ,属于结构紧凑基因 .从dbEST数据库中筛选与HPCL2基因的mRNA (GenBankAcc .:AJ13 1753 )相互重叠表达序列标签 (EST)共有2 13个 ,分别来自 2 9个不同的组织 .将EST与基因组序列进行Blast分析 ,共检测 17个EST具有选择性剪切 ,其中 14例属外显子遗漏 (exonskipping) ,2例外显子增加 (exoninclusion)和 1例剪切位点改变 (splicingsiteshift) .外显子遗漏主要发生在 5′端的第 3到第 8个外显子 .结果表明 。
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关键词
基因结构
选择性剪切
外显子遗漏
HPCL2基因
基因表达
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职称材料
题名
HPCL2基因表达的选择性剪切分析
被引量:
1
1
作者
牛宇欣
胡松年
杨焕明
机构
中国科学院遗传与发育生物学
研究
所人类
基因
组
中心
杭州华大基因研究中心
出处
《生物化学与生物物理进展》
SCIE
CAS
CSCD
北大核心
2003年第6期919-922,共4页
基金
国家高技术"86 3"计划资助项目( 86 3 J1 9)
中国科学院创新工程资助项目(KSCX1 D4 )~~
文摘
2 羟基植烷酸辅酶A裂解酶 (2 hydroxypanthyl CoAlyase ,HPCL2 )是 3 甲基脂肪酸α 氧化途径中的关键酶 .采用鸟枪法测序技术 ,得到了HPCL2基因的基因组序列 .结果显示 ,HPCL2基因组大小为 40 82 9bp ,共有 17个外显子 ,16个内含子 .外显子平均大小为 116bp ,内含子平均大小为 2 42 9bp ,属于结构紧凑基因 .从dbEST数据库中筛选与HPCL2基因的mRNA (GenBankAcc .:AJ13 1753 )相互重叠表达序列标签 (EST)共有2 13个 ,分别来自 2 9个不同的组织 .将EST与基因组序列进行Blast分析 ,共检测 17个EST具有选择性剪切 ,其中 14例属外显子遗漏 (exonskipping) ,2例外显子增加 (exoninclusion)和 1例剪切位点改变 (splicingsiteshift) .外显子遗漏主要发生在 5′端的第 3到第 8个外显子 .结果表明 。
关键词
基因结构
选择性剪切
外显子遗漏
HPCL2基因
基因表达
Keywords
HPCL2
gene structure
alternative splicing
exon skipping
分类号
Q753 [生物学—分子生物学]
Q786 [生物学—分子生物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
HPCL2基因表达的选择性剪切分析
牛宇欣
胡松年
杨焕明
《生物化学与生物物理进展》
SCIE
CAS
CSCD
北大核心
2003
1
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职称材料
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参考文献
引证文献
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