气候变化是导致生境丧失和生物多样性下降的主要因素之一。研究气候变化对物种生境的影响对于保护物种多样性,维护生态系统功能完整性具有重要意义。本研究以新疆为研究区域,以塔里木兔、草兔和雪兔为研究对象,选取可能影响它们生境分布...气候变化是导致生境丧失和生物多样性下降的主要因素之一。研究气候变化对物种生境的影响对于保护物种多样性,维护生态系统功能完整性具有重要意义。本研究以新疆为研究区域,以塔里木兔、草兔和雪兔为研究对象,选取可能影响它们生境分布的10个环境因子,利用MaxEnt模型预测它们当前和未来RCP 4.5和RCP 8.5两种气候情景下2041—2060年(2050s)、2061—2080年(2070s)的潜在生境分布,并找出影响生境分布的关键因子。研究结果表明,模型预测新疆兔属3个物种生境分布的精度达到较高水平,塔里木兔、草兔、雪兔的模型AUC值分别为0.955、0.853、0.940。从Jackknife环境变量重要性检验结果来看,影响塔里木兔生境分布的主要环境变量有最冷季均温、年均降雨量、坡度、最干季度平均温度;影响草兔生境分布的主要环境变量有最干月份降雨量、等温性、年平均降雨量、昼夜温差月均值;影响雪兔生境分布的主要环境变量有最干月份降雨量、最干月份降雨量、等温性、昼夜温差月均值。对于塔里木兔,当前气候条件下适宜生境面积为210031.3 km 2,主要分布在巴州、阿克苏地区、喀什地区东北部、和田地区西北部和东部。RCP 4.5气候情境下的2050年代和2070年代适宜生境面积分别缩小2.35%和扩大2.96%;RCP 8.5气候情境下的2个年代适宜生境面积分别缩小0.01%和扩大6.3%。对于草兔,当前气候条件下适宜生境面积为228981.3 km 2,主要分布在阿勒泰地区、塔城地区北部、伊宁县、沙湾县、克拉玛依、哈密市北部、南疆的乌恰县和塔西库尔干县;RCP 4.5气候情境下适宜生境面积缩小4.27%和5.37%;RCP 8.5气候情境下适宜生境面积缩小7.22%和5.97%;对于雪兔,当前气候条件下适宜生境面积为112269 km 2,主要分布在阿勒泰地区中北部、塔城地区北部、博州西部,伊宁县、尼勒克县等地区;RCP 4.5气候情境下适宜生境面积缩小5.68%和6.23%;RCP8.5气候情境下适宜生境面积缩小4.66%和4.21%。根据研究分析认为伴随着气候的变化新疆兔属3个物种潜在生境面积都出现不同程度的减小趋势,建议采取适应气候变化的保护措施。展开更多
旨在基于RNA-Seq技术对塔里木马鹿毛色相关基因进行筛选及分析。采用Illumina Hi Seq TM2000测序平台对塔里木马鹿和天山马鹿的皮肤组织进行转录组测序,所得序列经质控、组装后比对到NR、Swiss-Prot、COG、KOG、KEGG、GO和Pfam数据库中...旨在基于RNA-Seq技术对塔里木马鹿毛色相关基因进行筛选及分析。采用Illumina Hi Seq TM2000测序平台对塔里木马鹿和天山马鹿的皮肤组织进行转录组测序,所得序列经质控、组装后比对到NR、Swiss-Prot、COG、KOG、KEGG、GO和Pfam数据库中注释,并对差异表达基因进行筛选、功能注释和富集分析。结果表明,测序获得25 038个有注释信息的Unigenes,比对分析显示,塔里木马鹿与天山马鹿有922个差异表达基因,其中上调表达基因495个,下调表达基因427个;GO功能富集分析结果显示,568个差异表达基因富集到61个GO条目上,分别参与了生物学过程、细胞组分及分子功能;KEGG代谢通路富集分析发现,在差异表达基因中富集最显著的代谢通路是ECM-受体相互作用。利用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)方法分析与塔里木马鹿毛色相关的7个候选基因的转录水平变化来验证转录组测序结果的准确性和可靠性,这些基因的表达趋势与转录组测序结果相一致。ECM-受体相互作用、蛋白质消化与吸收、PI3K-Akt信号通路及与黑色素合成相关的酪氨酸等通路可能与塔里木马鹿的毛色有关;候选基因MITF、Ggt1、VDR、PTPRF、CIITA、ARPC5L、POMC等可能在塔里木马鹿毛色形成过程中发挥重要作用。本研究结果为今后塔里木马鹿毛色相关基因的分子调控机制方面及挖掘潜在的新基因提供了丰富的试验数据。展开更多
文摘气候变化是导致生境丧失和生物多样性下降的主要因素之一。研究气候变化对物种生境的影响对于保护物种多样性,维护生态系统功能完整性具有重要意义。本研究以新疆为研究区域,以塔里木兔、草兔和雪兔为研究对象,选取可能影响它们生境分布的10个环境因子,利用MaxEnt模型预测它们当前和未来RCP 4.5和RCP 8.5两种气候情景下2041—2060年(2050s)、2061—2080年(2070s)的潜在生境分布,并找出影响生境分布的关键因子。研究结果表明,模型预测新疆兔属3个物种生境分布的精度达到较高水平,塔里木兔、草兔、雪兔的模型AUC值分别为0.955、0.853、0.940。从Jackknife环境变量重要性检验结果来看,影响塔里木兔生境分布的主要环境变量有最冷季均温、年均降雨量、坡度、最干季度平均温度;影响草兔生境分布的主要环境变量有最干月份降雨量、等温性、年平均降雨量、昼夜温差月均值;影响雪兔生境分布的主要环境变量有最干月份降雨量、最干月份降雨量、等温性、昼夜温差月均值。对于塔里木兔,当前气候条件下适宜生境面积为210031.3 km 2,主要分布在巴州、阿克苏地区、喀什地区东北部、和田地区西北部和东部。RCP 4.5气候情境下的2050年代和2070年代适宜生境面积分别缩小2.35%和扩大2.96%;RCP 8.5气候情境下的2个年代适宜生境面积分别缩小0.01%和扩大6.3%。对于草兔,当前气候条件下适宜生境面积为228981.3 km 2,主要分布在阿勒泰地区、塔城地区北部、伊宁县、沙湾县、克拉玛依、哈密市北部、南疆的乌恰县和塔西库尔干县;RCP 4.5气候情境下适宜生境面积缩小4.27%和5.37%;RCP 8.5气候情境下适宜生境面积缩小7.22%和5.97%;对于雪兔,当前气候条件下适宜生境面积为112269 km 2,主要分布在阿勒泰地区中北部、塔城地区北部、博州西部,伊宁县、尼勒克县等地区;RCP 4.5气候情境下适宜生境面积缩小5.68%和6.23%;RCP8.5气候情境下适宜生境面积缩小4.66%和4.21%。根据研究分析认为伴随着气候的变化新疆兔属3个物种潜在生境面积都出现不同程度的减小趋势,建议采取适应气候变化的保护措施。
文摘旨在基于RNA-Seq技术对塔里木马鹿毛色相关基因进行筛选及分析。采用Illumina Hi Seq TM2000测序平台对塔里木马鹿和天山马鹿的皮肤组织进行转录组测序,所得序列经质控、组装后比对到NR、Swiss-Prot、COG、KOG、KEGG、GO和Pfam数据库中注释,并对差异表达基因进行筛选、功能注释和富集分析。结果表明,测序获得25 038个有注释信息的Unigenes,比对分析显示,塔里木马鹿与天山马鹿有922个差异表达基因,其中上调表达基因495个,下调表达基因427个;GO功能富集分析结果显示,568个差异表达基因富集到61个GO条目上,分别参与了生物学过程、细胞组分及分子功能;KEGG代谢通路富集分析发现,在差异表达基因中富集最显著的代谢通路是ECM-受体相互作用。利用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)方法分析与塔里木马鹿毛色相关的7个候选基因的转录水平变化来验证转录组测序结果的准确性和可靠性,这些基因的表达趋势与转录组测序结果相一致。ECM-受体相互作用、蛋白质消化与吸收、PI3K-Akt信号通路及与黑色素合成相关的酪氨酸等通路可能与塔里木马鹿的毛色有关;候选基因MITF、Ggt1、VDR、PTPRF、CIITA、ARPC5L、POMC等可能在塔里木马鹿毛色形成过程中发挥重要作用。本研究结果为今后塔里木马鹿毛色相关基因的分子调控机制方面及挖掘潜在的新基因提供了丰富的试验数据。
