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基于糖代谢相关基因的肾透明细胞癌预后模型的构建与评价
1
作者
段霜霜
古丽乃再尔·阿卜杜赛麦提
+1 位作者
孙淼
柳惠斌
《中国肿瘤临床》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第10期493-499,共7页
目的:构建肾透明细胞癌(clear cell renal cell carcinoma,ccRCC)的糖代谢相关基因(carbohydrate metabolism-related genes,CRGs)预后模型并探索其临床意义。方法:选取TCGA数据库中ccRCC的mRNA表达数据,从MSigDB和KEGG数据库获取CRGs...
目的:构建肾透明细胞癌(clear cell renal cell carcinoma,ccRCC)的糖代谢相关基因(carbohydrate metabolism-related genes,CRGs)预后模型并探索其临床意义。方法:选取TCGA数据库中ccRCC的mRNA表达数据,从MSigDB和KEGG数据库获取CRGs。通过LASSO回归建立CRGs预后模型并计算风险评分(RS)。按照RS中位数将患者分为高、低风险组,利用Kaplan-Meier曲线和生物信息学方法分析两组间的生存、免疫浸润、突变和免疫应答之间的差异。依据RS与临床特征构建诺模图,验证其预后预测效能。利用RT-qPCR检测ccRCC样本中CRGs表达量。结果:8个CRGs用于构建ccRCC预后风险模型,生存分析显示低风险组的患者预后较好(P<0.001)。生物信息学分析表明RS与免疫浸润、突变和免疫应答相关。根据RS与临床特征构建的诺模图具有良好的预后预测性能。体外实验证实上述8个CRGs在ccRCC组织和癌旁组织之间的表达存在显著的差异。结论:基于CRGs的预后模型可以用于ccRCC患者的预后预测。
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关键词
肾透明细胞癌
糖代谢
预后模型
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职称材料
PTEN靶向PDK1调控肾透明细胞癌恶性生物学表型的作用机制研究
2
作者
段霜霜
古丽乃再尔·阿卜杜赛麦提
+2 位作者
张丽君
孙淼
柳惠斌
《中国癌症杂志》
2025年第8期761-768,共8页
背景与目的:通常情况下,丙酮酸脱氢酶激酶1(pyruvate dehydrogenase kinase 1,PDK1)异常活化通过介导有氧糖酵解效应驱动肿瘤微环境重塑与转移。10号染色体上缺失的磷酸酶及张力蛋白同源物基因(phosphatase and tensin homolog deleted ...
背景与目的:通常情况下,丙酮酸脱氢酶激酶1(pyruvate dehydrogenase kinase 1,PDK1)异常活化通过介导有氧糖酵解效应驱动肿瘤微环境重塑与转移。10号染色体上缺失的磷酸酶及张力蛋白同源物基因(phosphatase and tensin homolog deleted on chromoseme ten,PTEN)作为关键抑癌磷酸酶,其表达缺失可激活PDK1诱导有氧糖酵解,加速肿瘤进展。但二者在肾透明细胞癌(kidney renal clear cell carcinoma,KIRC)中的分子调控机制亟待阐明。本研究旨在探究PTEN通过靶向调控PDK1抑制KIRC恶性生物学表型的作用机制。方法:采用生物信息学分析癌症基因组图谱计划(The Cancer Genome Atlas,TCGA)-KIRC数据库中PTEN与PDK1的表达差异及其与患者预后的相关性。构建PDK1敲降/过表达的肾癌细胞模型,通过细胞计数试剂盒(cell counting kit-8,CCK-8)增殖检测、克隆形成实验、划痕实验及transwell侵袭实验评估细胞恶性表型。采用PTEN特异性抑制剂处理PDK1过表达的肾癌细胞系,验证二者之间的调控关系。结果:TCGA-KIRC转录组数据显示,KIRC组织中PTEN与PDK1 mRNA表达显著高于配对癌旁组织(P<0.05)。生存分析揭示高表达患者总生存期显著延长(P<0.01),且二者在基因水平的表达呈强正相关(r=0.52,P<0.001)。功能实验证实,抑制PDK1表达可显著增强肾癌细胞的增殖、迁移及侵袭能力(P<0.05),过表达PDK1则呈现相反表型。机制研究发现,PTEN抑制剂处理后可促进肾癌细胞恶性行为,而过表达PDK1能有效逆转该效应。结论:本研究揭示了PTEN-PDK1生物学轴在肾癌中的双重抑癌作用,这一发现有望为确立基于新靶点的肾癌精准治疗策略提供理论依据。
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关键词
肾透明细胞癌
PDK1
PTEN
分子机制
预后
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职称材料
题名
基于糖代谢相关基因的肾透明细胞癌预后模型的构建与评价
1
作者
段霜霜
古丽乃再尔·阿卜杜赛麦提
孙淼
柳惠斌
机构
新疆医科大学
药学院
新疆医科大学附属肿瘤医院药物临床试验机构
出处
《中国肿瘤临床》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第10期493-499,共7页
基金
新疆维吾尔自治区科技支疆项目(编号:2022E02131)资助。
文摘
目的:构建肾透明细胞癌(clear cell renal cell carcinoma,ccRCC)的糖代谢相关基因(carbohydrate metabolism-related genes,CRGs)预后模型并探索其临床意义。方法:选取TCGA数据库中ccRCC的mRNA表达数据,从MSigDB和KEGG数据库获取CRGs。通过LASSO回归建立CRGs预后模型并计算风险评分(RS)。按照RS中位数将患者分为高、低风险组,利用Kaplan-Meier曲线和生物信息学方法分析两组间的生存、免疫浸润、突变和免疫应答之间的差异。依据RS与临床特征构建诺模图,验证其预后预测效能。利用RT-qPCR检测ccRCC样本中CRGs表达量。结果:8个CRGs用于构建ccRCC预后风险模型,生存分析显示低风险组的患者预后较好(P<0.001)。生物信息学分析表明RS与免疫浸润、突变和免疫应答相关。根据RS与临床特征构建的诺模图具有良好的预后预测性能。体外实验证实上述8个CRGs在ccRCC组织和癌旁组织之间的表达存在显著的差异。结论:基于CRGs的预后模型可以用于ccRCC患者的预后预测。
关键词
肾透明细胞癌
糖代谢
预后模型
Keywords
clear cell renal cell carcinoma(ccRCC)
carbohydrate metabolism
prognostic model
分类号
R737.11 [医药卫生—肿瘤]
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职称材料
题名
PTEN靶向PDK1调控肾透明细胞癌恶性生物学表型的作用机制研究
2
作者
段霜霜
古丽乃再尔·阿卜杜赛麦提
张丽君
孙淼
柳惠斌
机构
新疆医科大学
药学院
出处
《中国癌症杂志》
2025年第8期761-768,共8页
基金
国家自然科学基金(2022D01C518)。
文摘
背景与目的:通常情况下,丙酮酸脱氢酶激酶1(pyruvate dehydrogenase kinase 1,PDK1)异常活化通过介导有氧糖酵解效应驱动肿瘤微环境重塑与转移。10号染色体上缺失的磷酸酶及张力蛋白同源物基因(phosphatase and tensin homolog deleted on chromoseme ten,PTEN)作为关键抑癌磷酸酶,其表达缺失可激活PDK1诱导有氧糖酵解,加速肿瘤进展。但二者在肾透明细胞癌(kidney renal clear cell carcinoma,KIRC)中的分子调控机制亟待阐明。本研究旨在探究PTEN通过靶向调控PDK1抑制KIRC恶性生物学表型的作用机制。方法:采用生物信息学分析癌症基因组图谱计划(The Cancer Genome Atlas,TCGA)-KIRC数据库中PTEN与PDK1的表达差异及其与患者预后的相关性。构建PDK1敲降/过表达的肾癌细胞模型,通过细胞计数试剂盒(cell counting kit-8,CCK-8)增殖检测、克隆形成实验、划痕实验及transwell侵袭实验评估细胞恶性表型。采用PTEN特异性抑制剂处理PDK1过表达的肾癌细胞系,验证二者之间的调控关系。结果:TCGA-KIRC转录组数据显示,KIRC组织中PTEN与PDK1 mRNA表达显著高于配对癌旁组织(P<0.05)。生存分析揭示高表达患者总生存期显著延长(P<0.01),且二者在基因水平的表达呈强正相关(r=0.52,P<0.001)。功能实验证实,抑制PDK1表达可显著增强肾癌细胞的增殖、迁移及侵袭能力(P<0.05),过表达PDK1则呈现相反表型。机制研究发现,PTEN抑制剂处理后可促进肾癌细胞恶性行为,而过表达PDK1能有效逆转该效应。结论:本研究揭示了PTEN-PDK1生物学轴在肾癌中的双重抑癌作用,这一发现有望为确立基于新靶点的肾癌精准治疗策略提供理论依据。
关键词
肾透明细胞癌
PDK1
PTEN
分子机制
预后
Keywords
Clear cell renal cell carcinoma
PDK1
PTEN
Molecular mechanisms
Prognosis
分类号
R737.11 [医药卫生]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于糖代谢相关基因的肾透明细胞癌预后模型的构建与评价
段霜霜
古丽乃再尔·阿卜杜赛麦提
孙淼
柳惠斌
《中国肿瘤临床》
CAS
CSCD
北大核心
2024
0
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下载PDF
职称材料
2
PTEN靶向PDK1调控肾透明细胞癌恶性生物学表型的作用机制研究
段霜霜
古丽乃再尔·阿卜杜赛麦提
张丽君
孙淼
柳惠斌
《中国癌症杂志》
2025
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