针对小样本学习过程中样本数量不足导致的性能下降问题,基于原型网络(Prototype network,ProtoNet)的小样本学习方法通过实现查询样本与支持样本原型特征间的距离度量,从而达到很好的分类性能.然而,这种方法直接将支持集样本均值视为类...针对小样本学习过程中样本数量不足导致的性能下降问题,基于原型网络(Prototype network,ProtoNet)的小样本学习方法通过实现查询样本与支持样本原型特征间的距离度量,从而达到很好的分类性能.然而,这种方法直接将支持集样本均值视为类原型,在一定程度上加剧了对样本数量稀少情况下的敏感性.针对此问题,提出了基于自适应原型特征类矫正的小样本学习方法(Few-shot learning based on class rectification via adaptive prototype features,CRAPF),通过自适应生成原型特征来缓解方法对数据细微变化的过度响应,并同步实现类边界的精细化调整.首先,使用卷积神经网络构建自适应原型特征生成模块,该模块采用非线性映射获取更为稳健的原型特征,有助于减弱异常值对原型构建的影响;然后,通过对原型生成过程的优化,提升不同类间原型表示的区分度,进而强化原型特征对类别表征的整体效能;最后,在3个广泛使用的基准数据集上的实验结果显示,该方法提升了小样本学习任务的表现.展开更多
超过6000种人类疾病是由非同义单核苷酸变异(Non-synonymous single nucleotide variations,nsSNVs)引发的,快速准确地预测nsSNVs的致病性,有助于理解发病原理和设计新药物,也是生物信息领域的重要研究课题之一。该文给出了nsSNVs致病...超过6000种人类疾病是由非同义单核苷酸变异(Non-synonymous single nucleotide variations,nsSNVs)引发的,快速准确地预测nsSNVs的致病性,有助于理解发病原理和设计新药物,也是生物信息领域的重要研究课题之一。该文给出了nsSNVs致病性研究的重要意义与背景知识;总结了国内外研究的主流方法,包括基于突变频率的方法、基于通路的方法、结合基因组和转录信息的方法、基于序列进化保守性的方法、基于序列和结构混合特征的方法以及综合评价类方法,对代表性方法进行了阐述;给出了nsSNVs致病性研究中常用的数据库、特征表示方法以及性能评价指标,多角度地对12种nsSNVs致病性预测方法进行了比较;最后,展望了nsSNVs致病性预测中可能取得突破的若干研究方向。展开更多
文摘针对小样本学习过程中样本数量不足导致的性能下降问题,基于原型网络(Prototype network,ProtoNet)的小样本学习方法通过实现查询样本与支持样本原型特征间的距离度量,从而达到很好的分类性能.然而,这种方法直接将支持集样本均值视为类原型,在一定程度上加剧了对样本数量稀少情况下的敏感性.针对此问题,提出了基于自适应原型特征类矫正的小样本学习方法(Few-shot learning based on class rectification via adaptive prototype features,CRAPF),通过自适应生成原型特征来缓解方法对数据细微变化的过度响应,并同步实现类边界的精细化调整.首先,使用卷积神经网络构建自适应原型特征生成模块,该模块采用非线性映射获取更为稳健的原型特征,有助于减弱异常值对原型构建的影响;然后,通过对原型生成过程的优化,提升不同类间原型表示的区分度,进而强化原型特征对类别表征的整体效能;最后,在3个广泛使用的基准数据集上的实验结果显示,该方法提升了小样本学习任务的表现.
文摘超过6000种人类疾病是由非同义单核苷酸变异(Non-synonymous single nucleotide variations,nsSNVs)引发的,快速准确地预测nsSNVs的致病性,有助于理解发病原理和设计新药物,也是生物信息领域的重要研究课题之一。该文给出了nsSNVs致病性研究的重要意义与背景知识;总结了国内外研究的主流方法,包括基于突变频率的方法、基于通路的方法、结合基因组和转录信息的方法、基于序列进化保守性的方法、基于序列和结构混合特征的方法以及综合评价类方法,对代表性方法进行了阐述;给出了nsSNVs致病性研究中常用的数据库、特征表示方法以及性能评价指标,多角度地对12种nsSNVs致病性预测方法进行了比较;最后,展望了nsSNVs致病性预测中可能取得突破的若干研究方向。
