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双硫死亡相关基因对结直肠癌预后和药物敏感性的预测价值
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作者 孙双一 贺新新 +3 位作者 陈雯桐 吕彬 葛梦潇 郭雨濛 《复旦学报(医学版)》 CAS CSCD 北大核心 2024年第4期473-483,共11页
目的通过生物信息学方法建立基于双硫死亡相关基因表达量预测结直肠癌(colorectal cancer,CRC)预后和药物敏感性的评分模型,并结合CRC患者来源类器官(CRC patient-derived organoids,CRC-PDOs)验证。方法利用NMF(non-negative Matrix Fa... 目的通过生物信息学方法建立基于双硫死亡相关基因表达量预测结直肠癌(colorectal cancer,CRC)预后和药物敏感性的评分模型,并结合CRC患者来源类器官(CRC patient-derived organoids,CRC-PDOs)验证。方法利用NMF(non-negative Matrix Factorization)算法、Cox和LASSO回归分析明确对CRC预后有预测价值的双硫死亡相关基因,构建双硫死亡相关风险评分公式,结合GO(Gene Ontology)和KEGG(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes)分析不同集群之间的差异基因及富集通路。通过GDSC数据库预测不同分组CRC患者对化疗药物的敏感性,并利用CRC-PDOs进行验证。结果NMF算法结果显示基于双硫死亡相关基因可建立CRC患者分群,COX回归分析显示LRPPRC和SLC7A11是能够预测CRC患者预后的潜在基因(P=0.047、0.033),CRC患者肿瘤中的SLC7A11低表达或LRPPRC高表达与总生存率(overall survival,OS)显著相关(P=0.004、0.003)。基于LASSO回归分析,双硫死亡风险评分公式为:Risk score=LRPPRC×(-0.6705)+SLC7A11×0.3112,且能将GSE161158数据集分群为高风险和低风险组。双硫死亡高低危群集间有125个差异表达基因(differentially expressed genes,DEGs),结合GO和KEGG结果,高危群集患者的上调基因主要富集于免疫调节,如白细胞趋化性、粒细胞迁移和Toll样受体结合。低风险集群的特征是与硫化物代谢和运输相关的途径,如硫化物跨膜转运蛋白活性。基于GDSC数据库,双硫死亡相关的双基因表达水平可预测化疗药物敏感性,化疗药物(伊立替康)对于CRC-PDOs的生长抑制结果提示患者的结直肠癌组织中SLC7A11和LRPPRC的相对表达量与其类器官映射疗效呈线性相关(P=0.007、0.040)。结论根据生物信息学分析和CRC-PDOs实验结果,双硫死亡相关评分能够预测结直肠癌患者预后和药物敏感性,具有潜在的临床应用前景。 展开更多
关键词 双硫死亡 结直肠癌(CRC) 生物信息学分析 化疗药物 敏感性 患者来源类器官(PDOs)
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进展期胃癌新辅助化疗原发灶病理完全缓解5例报告及文献复习 被引量:8
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作者 吴留成 黄名威 +3 位作者 覃宇周 陈建思 莫显伟 茹海明 《中国肿瘤临床》 CAS CSCD 北大核心 2016年第6期265-270,共6页
进展期胃癌不可切除率及术后复发率较高,新辅助化疗联合手术切除是最常见的胃癌多学科综合治疗方法之一,具有以下优点:使肿瘤降期,提高R0切除率;对于高强度化疗的耐受性较辅助化疗好,化疗完成率较辅助化疗高;提供活体药敏检测从而避免... 进展期胃癌不可切除率及术后复发率较高,新辅助化疗联合手术切除是最常见的胃癌多学科综合治疗方法之一,具有以下优点:使肿瘤降期,提高R0切除率;对于高强度化疗的耐受性较辅助化疗好,化疗完成率较辅助化疗高;提供活体药敏检测从而避免不必要的手术。虽然高强度化疗产生更高的客观反应率,但是进展期胃癌经新辅助化疗获得病理完全缓解的仍然较少,且缺乏相关诊治规范。现介绍在广西医科大学附属肿瘤医院胃肠外科予新辅助化疗后获得病理完全缓解的5例进展期胃癌,以探讨该类患者的临床病理特征、合理的综合治疗决策及预后的相关因素,使临床诊疗更加规范,患者更多获益。 展开更多
关键词 胃癌 新辅助化疗 预后
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乳腺癌患者外周血SBEM-mRNA和CD44V6-mRNA的检测及其临床意义 被引量:9
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作者 杨华伟 刘剑仑 +2 位作者 曹骥 杨南武 苏建家 《中国肿瘤临床》 CAS CSCD 北大核心 2005年第7期382-385,共4页
目的:寻找乳腺癌血道微小转移的肿瘤标志物,以利于早期发现乳腺癌的转移。方法:用巢式逆转录聚合酶链反应(Nested-RT-PCR)技术,检测67例乳腺癌、16例乳腺良性肿瘤及20例健康志愿者外周静脉血中的乳腺小粘蛋白(sm allbreastepithelialm u... 目的:寻找乳腺癌血道微小转移的肿瘤标志物,以利于早期发现乳腺癌的转移。方法:用巢式逆转录聚合酶链反应(Nested-RT-PCR)技术,检测67例乳腺癌、16例乳腺良性肿瘤及20例健康志愿者外周静脉血中的乳腺小粘蛋白(sm allbreastepithelialm ucin--SBEM)m RNA和CD44V6-m RNA。结果:SBEM-m RNA在健康志愿者、乳腺良性肿瘤患者外周血中均为阴性;67例乳腺癌患者外周血中SBEM-m RNA表达率为50.7%(34/67),在乳腺癌患者的临床分期Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ和Ⅳ期中SBEM-m RNA表达率分别为25%(2/8)、45.8%(11/24)、43.75%(7/16)、73.7%(14/19),在Ⅳ期乳腺癌患者外周血中SBEM-m RNA的检出率73.7%(14/19)明显高于其他各组(P<0.05﹚。SBEM-m RNA的表达与患者年龄、原发癌灶大小、病理类型、ER和PR的状态无关(P>0.05);在乳腺癌、乳腺良性肿瘤及健康志愿者外周静脉血中的CD44V6-m RNA的检出率为55/67(82.1%)、12/16(75%)、14/20(70%)。结论:SBEM-m RNA特异表达于乳腺癌患者的外周血,有可能作为检测乳腺癌血道微小转移的指标,SBEM-m RNA阳性提示血循环中有乳腺癌细胞,预示着有血源性转移的可能,SBEM-m RNA可能成为诊断乳腺癌和判断预后的一个指标;而CD44V6-m RNA能否作为乳腺癌微小转移的标志物尚需进一步探讨。 展开更多
关键词 巢式逆转录聚合酶链反应 乳腺癌 乳腺小粘蛋白mRNA CD44V6-mRNA
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端粒、端粒酶及端粒酶催化亚基在大肠癌中的作用 被引量:1
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作者 刘剑仑 葛莲英 +1 位作者 黎丹戎 张贵年 《中国癌症杂志》 CAS CSCD 2005年第4期362-364,共3页
目的:探讨端粒、端粒酶活性及端粒酶催化亚基蛋白(hTERT)在大肠癌发生发展、侵袭转移中的作用。方法:应用Southern blot、端粒重复序列扩增(TRAP)和免疫组织化学方法检测端粒长度(terminal restrictionfragments,TRFs)、端粒酶活性及hT... 目的:探讨端粒、端粒酶活性及端粒酶催化亚基蛋白(hTERT)在大肠癌发生发展、侵袭转移中的作用。方法:应用Southern blot、端粒重复序列扩增(TRAP)和免疫组织化学方法检测端粒长度(terminal restrictionfragments,TRFs)、端粒酶活性及hTERT表达水平。结果:大肠癌TRFs明显缩短,且随大肠癌Dukes分期的进展进一步缩短;端粒酶活性及hTERT在大肠癌组织中的阳性表达率分别为83.33%及76.67%,显著高于其他组织(P<0.05);大肠癌组织端粒酶与淋巴结转移关系密切,伴淋巴结转移大肠癌组织中的端粒酶活性及hTERT阳性表达率为80%和70%,显著高于无淋巴结转移者的0%和5%(P<0.05);相关分析显示端粒酶活性与hTERT蛋白表达存在显著相关性(P<0.05)。结论:端粒的短缩及端粒酶的活化与大肠癌的发生发展密切相关,hTERT的表达对端粒酶的激活可能起着重要作用。 展开更多
关键词 大肠癌 端粒 端粒酶 端粒酶催化亚基
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危急患者安全担架的研制与应用
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作者 卢杏新 蓝才武 黄英隆 《护理学杂志》 2009年第18期91-91,共1页
关键词 急危重症 搬运 担架 革新推广
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结直肠癌的治疗真实世界研究进展 被引量:4
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作者 张翔宇 张帅 +2 位作者 赖浩 冯雁(综述) 林源(审校) 《中国肿瘤临床》 CAS CSCD 北大核心 2021年第24期1287-1290,共4页
近年来,在医药卫生领域,利用真实世界数据生成真实世界证据的研究方法在药品研发、审批、适应证拓展等领域取得广泛的关注和认可,开展真实可信、高质量的真实世界研究证据(real world evidence,RWE),已成为循证医学的一个重要发展方向... 近年来,在医药卫生领域,利用真实世界数据生成真实世界证据的研究方法在药品研发、审批、适应证拓展等领域取得广泛的关注和认可,开展真实可信、高质量的真实世界研究证据(real world evidence,RWE),已成为循证医学的一个重要发展方向。本文介绍了近年来国内外关于结直肠癌真实世界研究的现状,将真实世界研究(real world research/study,RWS)与相应的随机对照研究(randomized controlled trial,RCT)的meta分析结果进行对比和评价,以阐述RWS的特征、研究方法、相对于传统RCT研究的优势,并归纳其在肠癌领域的应用现状。在此基础上,对RWS在结直肠癌临床研究中的价值和前景进行总结,为后续研究提供新的思路。 展开更多
关键词 真实世界研究 结直肠癌 随机对照研究
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