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猪瘟病毒广西流行毒株E0基因的克隆与分析
被引量:
4
1
作者
曾咏芳
曹佳媛
+3 位作者
杨可妍
吴军
覃雨阳
熊毅
《动物医学进展》
北大核心
2015年第1期31-35,共5页
应用RT-PCR方法对猪瘟病毒E0基因进行扩增、克隆及测序,用DNA Star分析软件对6株毒株与猪瘟兔化弱毒苗(HCLV)、石门(Shimen)株、Paderborn株、GXWZ02株的相应片段进行比较分析,构建了CSFV遗传进化树。序列分析表明,广西流行株与HCL...
应用RT-PCR方法对猪瘟病毒E0基因进行扩增、克隆及测序,用DNA Star分析软件对6株毒株与猪瘟兔化弱毒苗(HCLV)、石门(Shimen)株、Paderborn株、GXWZ02株的相应片段进行比较分析,构建了CSFV遗传进化树。序列分析表明,广西流行株与HCLV株、Shimen株、Paderborn株、GXWZ02株之间核苷酸的同源性分别为80.8%-81.5%、82.8%-83.3%、93.1%-94.2%、93.7%-94.2%,推导的氨基酸同源性分别为88.3%-89.7%、89.7%-91.1%、96.2%-97.7%、97.7%-99.1%;6株广西CSFV流行毒株与国内外已发表的14株病毒相应序列进行比较,构建遗传进化树,结果表明所比较的20株毒株分为2个基因群,广西流行毒株均属于基因群Ⅱ。本研究成功地对广西流行猪瘟病毒株的E0基因进行了测序分析,表明近年来广西流行毒株未发生较大的变异,但病毒株有远离疫苗株发展的趋势。
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关键词
猪瘟病毒
E0基因
序列分析
同源性比较
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职称材料
马源禽Ⅰ型副黏病毒HN基因的克隆与序列分析
2
作者
梁丹洁
欧莹
+7 位作者
李春英
蒋家霞
张欣明
孙翔翔
曾咏芳
周师师
吴军
熊毅
《中国动物检疫》
CAS
2013年第7期59-62,共4页
为了解禽Ⅰ型副黏病毒的跨种传播以及对HN基因进行序列分析,运用RT-PCR方法,扩增马源禽I型副黏病毒广西分离株M10株的HN基因,将其克隆至PMD18-T载体中,进行序列测定,序列分析表明,M10株的HN基因片段长度约为2.0kb,ORF为1716个碱基,编码...
为了解禽Ⅰ型副黏病毒的跨种传播以及对HN基因进行序列分析,运用RT-PCR方法,扩增马源禽I型副黏病毒广西分离株M10株的HN基因,将其克隆至PMD18-T载体中,进行序列测定,序列分析表明,M10株的HN基因片段长度约为2.0kb,ORF为1716个碱基,编码571个氨基酸;ORF区与参考毒株的核苷酸同源性为80.9%-99.2%,推导的氨基酸同源性为88.6%-98.6%。在同源性比较的基础上,进一步绘制禽I型副粘病毒HN基因的系统进化树,分析表明,M10株与参考毒株YG03、NDV-03、FP1等亲缘关系较近。
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关键词
禽Ⅰ型副黏病毒
HN基因
序列分析
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职称材料
题名
猪瘟病毒广西流行毒株E0基因的克隆与分析
被引量:
4
1
作者
曾咏芳
曹佳媛
杨可妍
吴军
覃雨阳
熊毅
机构
广西
大学
动物
科学技术学院
广西区动物疫病预防与控制中心
出处
《动物医学进展》
北大核心
2015年第1期31-35,共5页
基金
南宁市科技攻关项目(南桂20142078)
文摘
应用RT-PCR方法对猪瘟病毒E0基因进行扩增、克隆及测序,用DNA Star分析软件对6株毒株与猪瘟兔化弱毒苗(HCLV)、石门(Shimen)株、Paderborn株、GXWZ02株的相应片段进行比较分析,构建了CSFV遗传进化树。序列分析表明,广西流行株与HCLV株、Shimen株、Paderborn株、GXWZ02株之间核苷酸的同源性分别为80.8%-81.5%、82.8%-83.3%、93.1%-94.2%、93.7%-94.2%,推导的氨基酸同源性分别为88.3%-89.7%、89.7%-91.1%、96.2%-97.7%、97.7%-99.1%;6株广西CSFV流行毒株与国内外已发表的14株病毒相应序列进行比较,构建遗传进化树,结果表明所比较的20株毒株分为2个基因群,广西流行毒株均属于基因群Ⅱ。本研究成功地对广西流行猪瘟病毒株的E0基因进行了测序分析,表明近年来广西流行毒株未发生较大的变异,但病毒株有远离疫苗株发展的趋势。
关键词
猪瘟病毒
E0基因
序列分析
同源性比较
Keywords
Classical swine fever virus
E0 gene
sequence analysis
homology
分类号
Q785 [生物学—分子生物学]
S852.651 [农业科学—基础兽医学]
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职称材料
题名
马源禽Ⅰ型副黏病毒HN基因的克隆与序列分析
2
作者
梁丹洁
欧莹
李春英
蒋家霞
张欣明
孙翔翔
曾咏芳
周师师
吴军
熊毅
机构
广西
大学
动物
科学技术学院
广西区动物疫病预防与控制中心
出处
《中国动物检疫》
CAS
2013年第7期59-62,共4页
文摘
为了解禽Ⅰ型副黏病毒的跨种传播以及对HN基因进行序列分析,运用RT-PCR方法,扩增马源禽I型副黏病毒广西分离株M10株的HN基因,将其克隆至PMD18-T载体中,进行序列测定,序列分析表明,M10株的HN基因片段长度约为2.0kb,ORF为1716个碱基,编码571个氨基酸;ORF区与参考毒株的核苷酸同源性为80.9%-99.2%,推导的氨基酸同源性为88.6%-98.6%。在同源性比较的基础上,进一步绘制禽I型副粘病毒HN基因的系统进化树,分析表明,M10株与参考毒株YG03、NDV-03、FP1等亲缘关系较近。
关键词
禽Ⅰ型副黏病毒
HN基因
序列分析
Keywords
Avian Paramyxovirus Type Ⅰ
HN gene
sequence and analysis
分类号
S852.65 [农业科学—基础兽医学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
猪瘟病毒广西流行毒株E0基因的克隆与分析
曾咏芳
曹佳媛
杨可妍
吴军
覃雨阳
熊毅
《动物医学进展》
北大核心
2015
4
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
马源禽Ⅰ型副黏病毒HN基因的克隆与序列分析
梁丹洁
欧莹
李春英
蒋家霞
张欣明
孙翔翔
曾咏芳
周师师
吴军
熊毅
《中国动物检疫》
CAS
2013
0
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