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新型甲型H_1N_1流感毒株NA基因特征和进化被引量：4: 1; 作者钟静黄平 +3 位作者倪汉忠李昕洁张欣廖家政《第三军医大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2010年第15期1675-1677,共3页; 目的通过对新型甲型H1N1流感毒株神经氨酸酶(NA)基因序列的变异分析,揭示毒株NA基因变异与进化。方法检测广东地区分离毒株NA基因核苷酸序列,同时对全球新型甲型H1N1流感毒株NA基因进行检索下载,采用Lasergene 7.1软件比对和分析NA基因... 展开更多; 关键词新型甲型H1N1 毒株 NA基因特性进化糖基化; 在线阅读下载PDF 职称材料

流感pH1N1病毒血凝素基因进化特征及选择性被引量：2: 2; 作者黄钟洲梁丽君 +2 位作者邹丽容黄平宋颖超《第三军医大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第17期1780-1784,共5页; 目的分析广东地区2012-2013年新型H1N1（pH1N1）病毒血凝素（HA）基因、表位和受体结合位点（receptor binding sites,RBS）进化特征和选择性。方法检测广东地区2012-2013年分离的pH1N1毒株HA基因核苷酸序列,与GenBank中全球相应毒株... 展开更多; 关键词流感病毒 H1N1亚型血凝素表位进化变异选择性; 在线阅读下载PDF 职称材料

用免疫信息学技术设计新型H1N1流感神经氨酸酶抗原表位肽(英文) 被引量：2: 3; 作者黄平许元生 +5 位作者钟静倪汉忠张永慧陈秋霞谭松暖李晖《生物化学与生物物理进展》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2011年第10期929-935,共7页; 神经氨酸酶(NA)是一种具有唾液酸酶活性的流感毒粒表面糖蛋白,切断病毒HA与细胞膜上神经氨酸残基之间的连接,使病毒能够从宿主细胞表面释放.检测了新型H1N1流感NA基因核苷酸序列,用免疫信息学方法预测、筛选和鉴定B细胞表位;人工合成NA... 展开更多; 关键词新型H1N1流感神经氨酸酶(NA) B细胞表位免疫信息学; 在线阅读下载PDF 职称材料

2006年人禽流感H5N1毒株PA基因特性、变异和进化被引量：1: 4; 作者黄平方苓 +6 位作者莫艳玲舒跃龙李晖邹丽容柯昌文陈秋霞俞守义《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2008年第12期1103-1106,共4页; 目的通过对人禽流感H5N1毒株PA基因序列的变异分析,揭示毒株PA基因特征、变异与进化。方法检测广东地区人禽流感H5N1毒株PA基因核苷酸序列,同时检索全球人禽流感H5N1毒株PA基因序列,采用MEGA4.0软件对检索的人禽流感H5N1毒株PA基因核苷... 展开更多; 关键词人禽流感 H5N1毒株 PA基因交异进化; 在线阅读下载PDF 职称材料

人禽流感H_5N_1毒株NS基因特征和进化: 5; 作者黄平李晖 +3 位作者柯昌文邹丽容陈秋霞方苓《中国免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2008年第1期54-58,共5页; 目的:通过对人禽流感H5N1毒株NS基因序列的变异分析,揭示毒株NS基因特征与进化。方法:检测广东地区人禽流感H5N1毒株NS基因核苷酸序列,同时检索全球人禽流感H5N1毒株NS基因序列,采用DNAStar5.0软件对检索的人禽流感H5N1毒株NS基因核苷... 展开更多; 关键词人禽流感 H5N1毒株 NS基因特征进化; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名新型甲型H_1N_1流感毒株NA基因特征和进化被引量：4: 1; 作者钟静黄平倪汉忠李昕洁张欣廖家政; 机构广州市胸科医院内科广东省疾病预防控制中心广东省应急病原学检测重点实验室; 出处《第三军医大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2010年第15期1675-1677,共3页; 基金国家自然科学基金(30972757); 文摘目的通过对新型甲型H1N1流感毒株神经氨酸酶(NA)基因序列的变异分析,揭示毒株NA基因变异与进化。方法检测广东地区分离毒株NA基因核苷酸序列,同时对全球新型甲型H1N1流感毒株NA基因进行检索下载,采用Lasergene 7.1软件比对和分析NA基因核苷酸和氨基酸序列,结合临床资料分析变异基因进化,同时分析糖基化位点。结果 2009年4-12月69株毒株NA基因16个氨基酸位点置换,占3.41%(16/469);NA蛋白主要置换位点在V106I/H和N248D。毒株GD-801-2009(H1N1)和GD-1202-2009的NA基因明显受到的感染宿主选择性作用,而毒株GD-1-2009的NA基因明显受到的感染宿主负选择性作用。与毒株GD-1-2006(H5N1)NA基因比较,毒株GD-801-2009的NA基因插入Nt145-204,导致H1N1NA蛋白增加第49～68位氨基酸(CNQSVITYENNTWVNQTYVN),其中包括4个糖基化位点。结论广东新型甲型H1N1流感毒株NA基因正向不同方向进化;新型甲型H1N1流感NA蛋白新增4个糖基化位点。; 关键词新型甲型H1N1 毒株 NA基因特性进化糖基化; 分类号 Q373.13 [生物学—遗传学] Q933 [生物学—微生物学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名流感pH1N1病毒血凝素基因进化特征及选择性被引量：2: 2; 作者黄钟洲梁丽君邹丽容黄平宋颖超; 机构广东省疾病预防控制中心广东省应急病原学检测重点实验室南方医科大学第二临床医学院; 出处《第三军医大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第17期1780-1784,共5页; 基金中央财政转移支付2013年流感项目广州市科技计划项目(2014J4100084) 国家自然科学基金(30972757)~~; 文摘目的分析广东地区2012-2013年新型H1N1（pH1N1）病毒血凝素（HA）基因、表位和受体结合位点（receptor binding sites,RBS）进化特征和选择性。方法检测广东地区2012-2013年分离的pH1N1毒株HA基因核苷酸序列,与GenBank中全球相应毒株序列比对,应用MEGA 6.05构建进化树,通过Chimera v1.8.1建模并标记,应用DATAMONKEY筛选HA选择性位点。结果与疫苗株A/California/07/2009的HA基因比较,广东地区2012-2013年pH1N1毒株的HA基因同源性为98.1%~98.7%;变异位点H155Q、K180Q/N和S202T分别位于HA抗原的Ca2、Sa和Sb表位,S220T和R222K均位于HA抗原的Ca1表位区域;位点A151V位于RBS的140环上。正向选择位点为AA202位点。广东毒株A/Guangdong/64/2013与其他毒株相比,发生6个氨基酸位点变异,包括V6I、N55S、S101G、A151V、H155Q和V267A。结论广东2012-2013年pH1N1毒株HA基因变异导致了HA抗原表位和RBS 140环位点变异将分别影响毒株的抗原性和受体功能;正向选择位点AA202位点承受着较大的免疫压力;毒株A/Guangdong/64/2013的抗原表位Ca2和RBS位点变异可能是下个流感流行季节优势毒株的分子基础。; 关键词流感病毒 H1N1亚型血凝素表位进化变异选择性; Keywords influenza virus HIN1 subtype hemagglutinin epitope evolution mutation selection; 分类号 R373.13 [医药卫生—病原生物学] R393-33 [医药卫生—基础医学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名用免疫信息学技术设计新型H1N1流感神经氨酸酶抗原表位肽(英文) 被引量：2: 3; 作者黄平许元生钟静倪汉忠张永慧陈秋霞谭松暖李晖; 机构广东省疾病预防控制中心广东省应急病原学检测重点实验室广州百奥泰生物科技有限公司广州市胸科医院传染病科; 出处《生物化学与生物物理进展》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2011年第10期929-935,共7页; 基金 supported by a grant from The National Natural ScienceFoundation of China(30972757)~~; 文摘神经氨酸酶(NA)是一种具有唾液酸酶活性的流感毒粒表面糖蛋白,切断病毒HA与细胞膜上神经氨酸残基之间的连接,使病毒能够从宿主细胞表面释放.检测了新型H1N1流感NA基因核苷酸序列,用免疫信息学方法预测、筛选和鉴定B细胞表位;人工合成NA抗原多肽SE8和RE6,并免疫新西兰兔制备抗血清.两种抗血清具有体外中和新型H1N1流感病毒能力(微量中和实验),而且还具有拮抗血凝释放作用.根据2009年全球毒株NA基因序列检测和比对结果,发现多肽SE8和RE6序列未变异.实验揭示,多肽SE8和RE6可以作为新型H1N1流感候选多肽疫苗.; 关键词新型H1N1流感神经氨酸酶(NA) B细胞表位免疫信息学; Keywords 2009 A H1N1, neuraminidase （NA）, B-cell epitope, immunoinformatics; 分类号 R392 [医药卫生—免疫学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名2006年人禽流感H5N1毒株PA基因特性、变异和进化被引量：1: 4; 作者黄平方苓莫艳玲舒跃龙李晖邹丽容柯昌文陈秋霞俞守义; 机构广东省疾病预防控制中心广东省应急病原学检测重点实验室中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所南方医科大学公共卫生与热带医学学院流行病学系; 出处《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2008年第12期1103-1106,共4页; 基金广东省科技项目(2004A2090102)资助; 文摘目的通过对人禽流感H5N1毒株PA基因序列的变异分析,揭示毒株PA基因特征、变异与进化。方法检测广东地区人禽流感H5N1毒株PA基因核苷酸序列,同时检索全球人禽流感H5N1毒株PA基因序列,采用MEGA4.0软件对检索的人禽流感H5N1毒株PA基因核苷酸序列进行比对和分析;并结合流行病学资料对变异毒株进行进化速度分析。结果PA蛋白呈酸性,等电点pH5.4。1997-2006年52株毒株PA基因核苷酸序列同源性分成两组,1997年毒株为第一组(G1),2003-2006年香港、越南、泰国、印尼、中国大陆毒株、土耳其、伊拉克、阿塞拜疆、埃及毒株为第二组(G2)。PA基因114个氨基酸位点置换,占15.9(114/716),其中2003-2006年毒株PA基因有17个氨基酸位点不同于1997年毒株。PA基因Ks值为30.9×10-6～46.1×10-6Nt/d,Ka值为4.50×10-6～8.13×10-6Nt/d;而PA基因的同义突变速度是错义突变速度的5.7～6.9倍,显示PA基因受到机体免疫压力较小;检验发现PA基因进化存在负选择性压力。PA基因中潜在的7个糖基化位点基本稳定,毒株IDNS-569H-06的PA基因半胱氨酸发生置换(S224C)。结论PA基因进化分成两系列,PA基因进化特点是自发突变较快,而受到机体免疫机制压力较小;A基因与其它多聚酶基因(PB2和PB1)比较,核苷酸序列同源性和进化在时间特征和地区特征方面具有一致性;来自中国大陆的毒株进化值得关注。人禽流感H5N1毒株PA基因在自然界变异频繁,可能影响HN毒株致病性和在人-人传播能力。; 关键词人禽流感 H5N1毒株 PA基因交异进化; Keywords human avian influenza H5N1 strain PA gene mutation evolution; 分类号 R373 [医药卫生—病原生物学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名人禽流感H_5N_1毒株NS基因特征和进化: 5; 作者黄平李晖柯昌文邹丽容陈秋霞方苓; 机构广东省疾病预防控制中心广东省应急病原学检测重点实验室; 出处《中国免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2008年第1期54-58,共5页; 基金广东省科技项目(2004A2090102) 广东省重点科技项目(2003B60127)资助; 文摘目的:通过对人禽流感H5N1毒株NS基因序列的变异分析,揭示毒株NS基因特征与进化。方法:检测广东地区人禽流感H5N1毒株NS基因核苷酸序列,同时检索全球人禽流感H5N1毒株NS基因序列,采用DNAStar5.0软件对检索的人禽流感H5N1毒株NS基因核苷酸序列进行比对和分析;并结合流行病学资料对变异毒株进行进化速度分析。结果:根据对NS1基因和NS2基因核苷酸序列进行同源性比较,发现分成两个系列:1997～1998年人禽流感毒株为一个系列(G1),2003～2006年毒株为另一个系列(G2);其中,2003～2006年毒株NS1基因和NS2基因中,2004～2006年越南、泰国毒株为第1亚组(G2a),2005～2006年印尼毒株为第2亚组(G2b),2006年中国大陆毒株和2003年香港毒株为第3亚组(G2c)、2006年中西亚、北非毒株为第4亚组(G2d)。NS1基因74个氨基酸位点置换,占32.2%(74/230);其中,中国大陆2006年2株毒株(ZJ-16-06、GD-01-06)的NS1基因有3个位点有改变:A086T、F201Y和P215L。NS2基因共有31个氨基酸发生置换,置换率为25.6%(31/121);中国大陆2006年2株毒株(ZJ-16-06、GD-01-06)的NS1基因有3个位点有改变,包括E/K036G、S044T和L058F。NS1基因Ks值为10.1×10-6～33.4×10-6Nt/d,Ka值为11.6×10-6～17.6×10-6Nt/d;显示NS1基因受到机体免疫压力较大,检验发现基因进化存在明显选择性压力存在,而GD-01-06的NS1基因受到选择性压力较小;与NS1基因比较,NS2基因的同义突变和错义突变速度均降低,但尤以错义突变速度降低明显(Ks值为15.5×10-6～25.5×10-6Nt/d,Ka值为7.39×10-6～10.1×10-6Nt/d)。2003～2006年毒株NS1基因丢失第80～84位氨基酸序列(TIASV),引起氨基酸结构改变;而糖基化位点未改变。结论:目前NS1基因和NS2基因进化分成两组;NS1基因除自发置换进化较快外,受到明显机体免疫机制压力,第80～84位氨基酸TIASV丢失可能对致病性发生影响。2006年中国大陆毒株NS1基因和NS2基因均有3个氨基酸与其它毒株有别,显示中国大陆人禽流感H5N1毒株NS基因正在向另一方向进化。人禽流感H5N1毒株NS基因在自然界变异非常频繁,不断变异将影响H5N1毒株在人-人传播能力和引发大流行。; 关键词人禽流感 H5N1毒株 NS基因特征进化; Keywords Human avian influenza H5N1 Strain NS Gene Characteristic Evolution; 分类号 R392 [医药卫生] R373 [医药卫生—免疫学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

	题名	作者	出处	发文年	被引量	操作
1	新型甲型H_1N_1流感毒株NA基因特征和进化	钟静黄平倪汉忠李昕洁张欣廖家政	《第三军医大学学报》 CAS CSCD 北大核心	2010	4	在线阅读下载PDF 职称材料
2	流感pH1N1病毒血凝素基因进化特征及选择性	黄钟洲梁丽君邹丽容黄平宋颖超	《第三军医大学学报》 CAS CSCD 北大核心	2014	2	在线阅读下载PDF 职称材料
3	用免疫信息学技术设计新型H1N1流感神经氨酸酶抗原表位肽(英文)	黄平许元生钟静倪汉忠张永慧陈秋霞谭松暖李晖	《生物化学与生物物理进展》 SCIE CAS CSCD 北大核心	2011	2	在线阅读下载PDF 职称材料
4	2006年人禽流感H5N1毒株PA基因特性、变异和进化	黄平方苓莫艳玲舒跃龙李晖邹丽容柯昌文陈秋霞俞守义	《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心	2008	1	在线阅读下载PDF 职称材料
5	人禽流感H_5N_1毒株NS基因特征和进化	黄平李晖柯昌文邹丽容陈秋霞方苓	《中国免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心	2008		在线阅读下载PDF 职称材料