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原核生物基因组肽编码sORFs分布及功能特征
被引量：
2
1
作者
陈宜亭
张凤
+3 位作者
赵佳
于家峰
沙玉杰
王吉华
《生物化学与生物物理进展》
SCIE
CAS
CSCD
北大核心
2018年第1期59-67,共9页
近期,从非编码RNA中发现具有肽编码能力的小开放阅读框(sORFs),激发了人们对这种长期被忽略的基因组元件的研究兴趣,sORFs迅速成为当前重点研究领域.由于表达水平及丰度低、序列短等因素,对肽编码sORFs的有效研究方法及数据资源还很缺乏...
近期,从非编码RNA中发现具有肽编码能力的小开放阅读框(sORFs),激发了人们对这种长期被忽略的基因组元件的研究兴趣,sORFs迅速成为当前重点研究领域.由于表达水平及丰度低、序列短等因素,对肽编码sORFs的有效研究方法及数据资源还很缺乏,现有研究仅集中在少数真核模式生物,对自然界中广泛存在的原核生物研究非常少,肽编码sORFs的发现为目前精准背景下的基因组注释提出严峻挑战.在此背景下,本文首先系统研究了80余种不同类型原核生物中长度小于100个氨基酸的肽编码sORFs分布及功能特征,并对不同长度区间sORFs的序列组成、分布及进化特征进行了对比分析.结果表明,肽编码sORFs在原核生物基因组普遍存在,随着序列长度的降低,其序列复杂度降低,行使的生物功能也相对集中.在此基础上,进一步结合当前肽编码sORFs研究现状,深入总结了肽编码sORFs研究存在的问题及挑战,为今后肽编码sORFs研究奠定了坚实理论基础.
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关键词
小开放阅读框
原核生物基因组注释
蛋白质编码基因
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职称材料
不同类型细胞穿膜肽二级结构特征研究
被引量：
2
2
作者
屈昂
王哲
+1 位作者
于家峰
王吉华
《原子与分子物理学报》
CAS
北大核心
2018年第5期751-757,共7页
细胞穿膜肽是一类能以受体依赖或非受体依赖方式介导胞吞作用的小分子短肽,能够携带不同分子穿过细胞膜,这一特性使细胞穿膜肽成为一种有效的运输载体,为药物靶向治疗提供了新希望.本文从生物信息角度针对不同长度区间、运输不同类型分...
细胞穿膜肽是一类能以受体依赖或非受体依赖方式介导胞吞作用的小分子短肽,能够携带不同分子穿过细胞膜,这一特性使细胞穿膜肽成为一种有效的运输载体,为药物靶向治疗提供了新希望.本文从生物信息角度针对不同长度区间、运输不同类型分子细胞穿膜肽之间的异同二级结构特征进行了系统研究,同时进一步对不同穿膜方式对应的细胞穿膜肽二级结构特征进行了对比研究,结果表明不同类型细胞穿膜肽之间在二级结构组成上具有不同程度差异特征,为今后揭示细胞穿膜肽相关分子结构机制奠定可靠的理论基础.
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关键词
细胞穿膜肽
二级结构
特征分析
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职称材料
题名
原核生物基因组肽编码sORFs分布及功能特征
被引量：
2
1
作者
陈宜亭
张凤
赵佳
于家峰
沙玉杰
王吉华
机构
山东省生物物理省级重点实验室德州学院生物物理研究所
德州
学院
物理
与电子信息
学院
山东
师范大学生命科
学院
出处
《生物化学与生物物理进展》
SCIE
CAS
CSCD
北大核心
2018年第1期59-67,共9页
基金
国家自然科学基金(61771093
61671107)
山东省自然科学基金重点项目(ZR2016JL027)资助~~
文摘
近期,从非编码RNA中发现具有肽编码能力的小开放阅读框(sORFs),激发了人们对这种长期被忽略的基因组元件的研究兴趣,sORFs迅速成为当前重点研究领域.由于表达水平及丰度低、序列短等因素,对肽编码sORFs的有效研究方法及数据资源还很缺乏,现有研究仅集中在少数真核模式生物,对自然界中广泛存在的原核生物研究非常少,肽编码sORFs的发现为目前精准背景下的基因组注释提出严峻挑战.在此背景下,本文首先系统研究了80余种不同类型原核生物中长度小于100个氨基酸的肽编码sORFs分布及功能特征,并对不同长度区间sORFs的序列组成、分布及进化特征进行了对比分析.结果表明,肽编码sORFs在原核生物基因组普遍存在,随着序列长度的降低,其序列复杂度降低,行使的生物功能也相对集中.在此基础上,进一步结合当前肽编码sORFs研究现状,深入总结了肽编码sORFs研究存在的问题及挑战,为今后肽编码sORFs研究奠定了坚实理论基础.
关键词
小开放阅读框
原核生物基因组注释
蛋白质编码基因
Keywords
small open reading frame, prokaryotic genome annotation, protein-coding RNA
分类号
Q61 [生物学—生物物理学]
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职称材料
题名
不同类型细胞穿膜肽二级结构特征研究
被引量：
2
2
作者
屈昂
王哲
于家峰
王吉华
机构
山东省生物物理省级重点实验室德州学院生物物理研究所
德州
学院
物理
与电子信息
学院
出处
《原子与分子物理学报》
CAS
北大核心
2018年第5期751-757,共7页
基金
国家自然科学基金(61302186)
山东省自然科学基金重点项目(ZR2016JL027)
文摘
细胞穿膜肽是一类能以受体依赖或非受体依赖方式介导胞吞作用的小分子短肽,能够携带不同分子穿过细胞膜,这一特性使细胞穿膜肽成为一种有效的运输载体,为药物靶向治疗提供了新希望.本文从生物信息角度针对不同长度区间、运输不同类型分子细胞穿膜肽之间的异同二级结构特征进行了系统研究,同时进一步对不同穿膜方式对应的细胞穿膜肽二级结构特征进行了对比研究,结果表明不同类型细胞穿膜肽之间在二级结构组成上具有不同程度差异特征,为今后揭示细胞穿膜肽相关分子结构机制奠定可靠的理论基础.
关键词
细胞穿膜肽
二级结构
特征分析
Keywords
Cell penetrating peptide
Secondary structure
Characteristic analysis
分类号
O65 [理学—分析化学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
原核生物基因组肽编码sORFs分布及功能特征
陈宜亭
张凤
赵佳
于家峰
沙玉杰
王吉华
《生物化学与生物物理进展》
SCIE
CAS
CSCD
北大核心
2018
2
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
不同类型细胞穿膜肽二级结构特征研究
屈昂
王哲
于家峰
王吉华
《原子与分子物理学报》
CAS
北大核心
2018
2
在线阅读
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职称材料
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参考文献
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