壳聚糖与细菌细胞膜相互作用的分子动力学研究 被引量：3

1

作者 朱景一 马振宇 +2 位作者 肖敏 王禄山 蒋绪恺 《生物化学与生物物理进展》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2023年第8期1995-2005,共11页

目的壳聚糖(chitosan,CS)是一种天然的广谱抗菌活性物质。现有研究表明,壳聚糖与细菌细胞膜的相互作用是其发挥抗菌功能的关键。受限于传统实验技术的表征能力,壳聚糖与细菌细胞膜相互作用的具体机制仍有待研究。本文旨在研究壳聚糖与... 目的壳聚糖(chitosan,CS)是一种天然的广谱抗菌活性物质。现有研究表明,壳聚糖与细菌细胞膜的相互作用是其发挥抗菌功能的关键。受限于传统实验技术的表征能力,壳聚糖与细菌细胞膜相互作用的具体机制仍有待研究。本文旨在研究壳聚糖与细菌细胞膜相互作用的分子机制。方法本研究利用全原子分子动力学模拟技术主要探究了完全脱乙酰化的不同聚合度壳聚糖(八聚糖、十二聚糖和十六聚糖)与革兰氏阴性菌外膜(outer membrane,OM)和革兰氏阳性菌质膜(cytoplasmic membrane,CM)相互作用的动态过程。结果壳聚糖主要依靠其氨基、碳6位羟基和碳3位羟基与OM和CM的头部极性区发生快速结合。随后壳聚糖末端糖基单元倾向于插入OM内部,深度约1 nm,并与脂质分子脂肪酸链上的羰基形成稳定的氢键相互作用。与之相比,壳聚糖分子难以稳定地插入CM内部。壳聚糖结合对膜结构性质产生影响,主要表现在降低OM和CM的单分子脂质面积,显著减少OM和CM极性区的Ca2+和Na+数目,破坏阳离子介导的脂质间相互作用。结论本研究证明,壳聚糖带正电的氨基基团是介导其与膜相互作用的关键,并破环脂质间的相互作用,降低细菌膜结构稳定性。这些结果为从原子水平上理解壳聚糖的抗菌机制提供了新的见解。 展开更多

关键词 壳聚糖 细菌外膜 细菌质膜 分子动力学模拟 抗菌活性

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基于近红外光谱的甜菊糖吸湿过程表征及莱鲍迪苷A含量快速测定的研究 被引量：2

2

作者 高乐乐 钟亮 +3 位作者 董海玲 来雨强 李连 臧恒昌 《光谱学与光谱分析》 SCIE EI CAS CSCD 北大核心 2022年第2期415-422,共8页

作为一种绿色安全的食品药品配料,甜菊糖具有广阔的应用前景,然而吸湿性是其面临的一大难题,同时也是大多数制剂原辅料普遍存在的问题,研究分析吸湿的过程状态并提出针对性解决办法具有重要的理论意义和应用价值。利用近红外光谱分析技... 作为一种绿色安全的食品药品配料,甜菊糖具有广阔的应用前景,然而吸湿性是其面临的一大难题,同时也是大多数制剂原辅料普遍存在的问题,研究分析吸湿的过程状态并提出针对性解决办法具有重要的理论意义和应用价值。利用近红外光谱分析技术结合化学计量学方法对甜菊糖吸湿过程进行表征、解析,从而揭示吸湿过程中水的吸附方式和键合作用;通过吸湿过程光谱并采用外部参数正交(EPO)算法消除样品中水分的影响,建立甜菊糖中莱鲍迪苷A(RA)含量的快速分析方法。研究表明,甜菊糖吸湿过程初始,水分子迅速吸附在甜菊糖粉末表面形成单分子层;之后,表面吸附位点变少,吸湿速率明显变慢,水分子将同时吸附在单分子层之上;最后,甜菊糖整体吸湿达到饱和状态,含水量保持稳定。揭示水分吸收规律后,利用EPO算法建立RA定量模型,模型外部测试集的均方根误差、决定系数和预测相对标准偏差分别为0.6695%,0.9570和4.3368,与未使用水分校正所建模型相比有较大提升,表明EPO算法可以有效去除吸湿的影响。该研究利用近红外光谱技术对甜菊糖吸湿过程中水的变化进行了表征,同时利用EPO算法有效消除吸湿的影响,实现对甜菊糖成品中RA的快速测定,为其进一步的研究和使用提供参考。 展开更多

关键词 甜菊糖 近红外光谱 吸湿性 二维相关光谱分析 外部正交算法

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近红外光谱技术在川麦冬原位检测中的应用研究 被引量：8

3

作者 杨向春 陈丽芳 +3 位作者 王浩伟 臧恒昌 郭学平 聂磊 《分析测试学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第8期943-951,共9页

原药材检测费时费力一直是川麦冬质量分析中亟待解决的问题。该文将近红外光谱分析技术应用于川麦冬原药材的质量分析,以漫反射模式对麦冬颗粒进行无损原位检测后,采用光谱预处理方法减少因粒径造成的干扰,通过变量筛选方法提取有效信息... 原药材检测费时费力一直是川麦冬质量分析中亟待解决的问题。该文将近红外光谱分析技术应用于川麦冬原药材的质量分析,以漫反射模式对麦冬颗粒进行无损原位检测后,采用光谱预处理方法减少因粒径造成的干扰,通过变量筛选方法提取有效信息,最终建立了快速定量分析模型。结果表明,水分、浸出物和总皂苷含量模型的验证均方根误差(RMSEP)分别为0.1655%、0.4019%、0.0784%,验证集决定系数(R_(val)^(2))分别为0.9651、0.6965、0.8036,相对分析误差(RPD)分别为4.50、2.68、2.22,3个质量指标的RPD均大于2,说明模型性能较好,能够满足川麦冬质量分析的要求。该法通过近红外光谱技术采集川麦冬颗粒的原位光谱,避免了粉碎,真正意义上实现了川麦冬无损、绿色、快速的含量分析,为川麦冬的质量分析提供了参考。 展开更多

关键词 川麦冬 近红外光谱 质量分析 原位检测 水分 浸出物 总皂苷

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工程益生菌用于疾病诊断治疗和细胞工厂的研究进展

4

作者 李浩然 贾敏君 +2 位作者 张健 祁庆生 王倩 《南京工业大学学报（自然科学版）》 CAS 北大核心 2022年第5期523-533,共11页

随着科学技术的发展,益生菌因其独特的生理功能逐渐影响人们的日常生活,其用途已被大众熟知并且接受,而利用合成生物学对益生菌进行改造后得到的工程益生菌也已逐渐成为相关领域的研究热点。作为下一代活性治疗药物,经过改造后得到的工... 随着科学技术的发展,益生菌因其独特的生理功能逐渐影响人们的日常生活,其用途已被大众熟知并且接受,而利用合成生物学对益生菌进行改造后得到的工程益生菌也已逐渐成为相关领域的研究热点。作为下一代活性治疗药物,经过改造后得到的工程益生菌可针对特定疾病发挥其独特作用,例如,在肠道菌群微环境、代谢性疾病的监测以及肿瘤靶向治疗等方面已广泛应用。此外,随着益生菌在食品工业中的出色作用和益生菌的功能,其微生物代谢特性也越来越受到人们的关注,工程益生菌在代谢过程中不仅能产生有机酸、胺类、维生素等多种产物,还能改善发酵食品口味,增加产品营养,在食品工业中广泛应用。重点介绍了对经过改造后的工程益生菌的作用及其应用前景。 展开更多

关键词 益生菌 合成生物学 工程益生菌 疾病监测 靶向治疗

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基于细菌双组分系统的生物传感器的研究进展 被引量：1

5

作者 赵静宇 张健 +1 位作者 祁庆生 王倩 《合成生物学》 CSCD 北大核心 2024年第1期38-52,共15页

细菌双组分系统能够感知和响应细胞内外的物理、化学和生物刺激,通过耦合传感和调节机制从而引起一系列的细胞反应,是一个普遍存在的信号转导通路家族。当前越来越多的合成生物学家已开始利用双组分系统的特异属性来工程化设计微生物传... 细菌双组分系统能够感知和响应细胞内外的物理、化学和生物刺激,通过耦合传感和调节机制从而引起一系列的细胞反应,是一个普遍存在的信号转导通路家族。当前越来越多的合成生物学家已开始利用双组分系统的特异属性来工程化设计微生物传感系统,并应用于光遗传学、材料科学、肠道微生物组工程、生物炼制和土壤改良等领域。本综述重点介绍了开发基于双组分系统的生物传感器的最新研究进展以及在各个领域中的潜在应用。同时探讨了如何运用新的工程方法提高双组分系统传感器性能的可靠性,包括遗传重构、DNA结合结构域交换、检测阈值调节和磷酸化串扰隔离,以及如何根据特定应用的要求定制双组分系统信号特性。在未来,研究者可以将这些方法与大规模的基因合成、高通量筛选相结合,以加速和帮助发现更多未确定特征输入的双组分系统,并开发新的对广泛的刺激做出反应的基因编码生物传感器,拓展双组分生物传感器在不同领域的应用。 展开更多

关键词 合成生物学 双组分系统 细胞生物传感器 代谢工程 光遗传学 细菌诊断

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质谱技术表征糖药物结构的前沿进展

6

作者 崔雪莹 迟连利 《生物产业技术》 2018年第6期62-67,共6页

目前,小分子药物研究已经进入平台期,而大分子生物药物迅速发展起来。糖药物作为生物药中尤为重要的一类,被广泛应用于肿瘤、心脑血管疾病等的预防和治疗。然而无论骨架糖链还是修饰性糖链,都具有结构复杂且微不均一性的特点,这对现代... 目前,小分子药物研究已经进入平台期,而大分子生物药物迅速发展起来。糖药物作为生物药中尤为重要的一类,被广泛应用于肿瘤、心脑血管疾病等的预防和治疗。然而无论骨架糖链还是修饰性糖链,都具有结构复杂且微不均一性的特点,这对现代分析技术提出了较高的要求。随着软电离技术、多级质谱技术的发展以及分辨率和灵敏度的提高,质谱技术已被广泛应用于糖类药物的分析和表征。对糖药物、质谱技术进行了简要的介绍,并以多糖药物和糖缀合物类药物为例阐述了质谱在糖药物结构表征方面的技术进展,此外还就质谱在糖药物新药及仿制药物研发和注册方面的应用进行了讨论。 展开更多

关键词 质谱 糖药物 结构表征

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槐糖脂的生物合成 被引量：6

7

作者 李慧 马晓静 +2 位作者 郭伟 李加山 宋欣 《安徽农业科学》 CAS 2013年第17期7425-7428,7458,共5页

槐糖脂是一类重要的糖脂类生物表面活性剂。由于其产量较高并具有低毒性、生物可降解性及良好的生物学活性(如抑菌、抗病毒、抗肿瘤活性)等优点,在石油工业、环境保护、医药行业等领域都具有较大的应用前景。文中综述了槐糖脂的结构及... 槐糖脂是一类重要的糖脂类生物表面活性剂。由于其产量较高并具有低毒性、生物可降解性及良好的生物学活性(如抑菌、抗病毒、抗肿瘤活性)等优点,在石油工业、环境保护、医药行业等领域都具有较大的应用前景。文中综述了槐糖脂的结构及性质、产槐糖脂的菌株、槐糖脂的合成通路及合成中的特异酶、槐糖脂产生菌的遗传改造等。 展开更多

关键词 槐糖脂 生物表面活性剂 生物合成 特异酶 遗传改造

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α-氟代半乳糖的合成 被引量：3

8

作者 赵晗 刘军 +1 位作者 卢丽丽 肖敏 《精细化工》 EI CAS CSCD 北大核心 2008年第7期660-663,共4页

α-氟代半乳糖是一类重要的1-氟代糖,可在化学-酶法催化过程中作为糖基供体合成各类重要的半乳糖苷化合物,但这类氟代糖的大量获得至今没有完整实用的合成方法。作者以D-半乳糖为原料,将其全乙酰化获得五乙酰基-β-半乳糖,用吡啶-氟化... α-氟代半乳糖是一类重要的1-氟代糖,可在化学-酶法催化过程中作为糖基供体合成各类重要的半乳糖苷化合物,但这类氟代糖的大量获得至今没有完整实用的合成方法。作者以D-半乳糖为原料,将其全乙酰化获得五乙酰基-β-半乳糖,用吡啶-氟化氢络合物在-20℃进行氟化反应,得到四乙酰基-α-氟代半乳糖,然后用甲醇钠/甲醇溶液进行脱乙酰反应,TLC及核磁共振氢谱验证所得产物,成功获得α-氟代半乳糖(δ=5.57,J1,2=2.7,J1,F=53.9 Hz)。 展开更多

关键词 D-半乳糖 1-氟代糖 α-氟代半乳糖 糖基供体

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新结构Rho激酶抑制剂对离体胸主动脉血管环舒张作用及机制研究 被引量：2

9

作者 袁天翊 王夙博 +5 位作者 张惠芳 陈俞材 焦晓臻 谢平 方莲花 杜冠华 《中国药理学通报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第10期1404-1410,共7页

目的评价2个全新结构小分子Rho激酶抑制剂J35242和J35243对离体大鼠胸主动脉血管环的舒张作用,并探讨其作用机制。方法利用离体大鼠胸主动脉血管环模型,分别用高浓度KCl和去甲肾上腺素(norepinephrine,NE)预刺激,评价化合物的舒张血管活... 目的评价2个全新结构小分子Rho激酶抑制剂J35242和J35243对离体大鼠胸主动脉血管环的舒张作用,并探讨其作用机制。方法利用离体大鼠胸主动脉血管环模型,分别用高浓度KCl和去甲肾上腺素(norepinephrine,NE)预刺激,评价化合物的舒张血管活性;通过各种工具药干预,观察化合物舒张血管作用的内皮相关机制、钾通道相关机制和钙离子相关机制。结果 J35242和J35243可以剂量依赖性舒张高浓度KCl和NE预收缩的血管环,并呈现一定的内皮依赖性;L-NAME和亚甲蓝可在一定程度上影响其舒张作用;化合物还明显抑制由细胞内钙释放和外钙内流引起的血管收缩,说明其可能通过阻断钙离子通道发挥舒张血管作用;另外两个化合物可能不是通过开放钾离子通道发挥舒张血管作用。结论 J35242和J35243在体外具有一定的舒张血管作用,并且J35242的作用要强于J35243,其机制可能依赖于血管内皮功能,另外可能与抑制平滑肌细胞钙离子通道,降低细胞内钙离子浓度相关。 展开更多

关键词 RHO激酶抑制剂 离体血管环 血管舒张 血管内皮细胞 钾离子通道 钙离子通道

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藏茵陈化学成分和药理作用研究及质量标志物预测分析 被引量：6

10

作者 林泊然 孙钟毓 +7 位作者 聂磊 张梦琪 杨继元 马晓博 赵冰 李连 孙菁 臧恒昌 《中华中医药学刊》 CAS 北大核心 2023年第12期99-107,共9页

藏药历史悠久,是中华传统医学的重要组成部分。相较于中药质量标准,藏药质量标准中存在基原不清、有效成分不明、专属性不强、安全性和质量控制研究薄弱等问题,在一定程度上制约了藏药的发展。藏茵陈作为“藏药八珍”之一,是藏药中具有... 藏药历史悠久,是中华传统医学的重要组成部分。相较于中药质量标准,藏药质量标准中存在基原不清、有效成分不明、专属性不强、安全性和质量控制研究薄弱等问题,在一定程度上制约了藏药的发展。藏茵陈作为“藏药八珍”之一,是藏药中具有代表性的治疗肝胆疾病的药物。该研究首先对藏茵陈的化学成分和药理作用进行系统总结;其次对比中药和藏药在基础理论、药性、配伍、制剂等特点的异同,以质量标志物的核心内容“五要素”为基础,提出符合藏药的质量标志物的研究方法;最后结合藏茵陈传统功效、传统药性、生源途径、传递与溯源与可测性等研究对藏茵陈质量标志物进行预测分析,将龙胆苦苷、獐芽菜苦苷、獐牙菜苷、芒果苷、齐墩果酸作为藏茵陈的候选质量标志物。该文可为藏茵陈的质量评价及控制提供依据,并为质量标志物理论在藏药中的应用提供参考。 展开更多

关键词 藏茵陈 质量标志物 质量标准 藏药

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不同相对分子质量的黑根霉胞外多糖的生物活性 被引量：2

11

作者 李璋 许晅 +4 位作者 孟迎 马群飞 Huma Farooque Hashmi 张鹏英 陈靠山 《南方医科大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第10期1540-1546,共7页

目的探讨不同相对分子质量黑根霉胞外多糖的抗氧化、抗肿瘤和免疫调节活性。方法通过分级醇沉从黑根霉的发酵液中分离得到3种不同相对分子质量的多糖,分别命名为RPS-1,RPS-2和RPS-3,检测3种多糖对DPPH、ABTS和羟自由基的清除活性。体外... 目的探讨不同相对分子质量黑根霉胞外多糖的抗氧化、抗肿瘤和免疫调节活性。方法通过分级醇沉从黑根霉的发酵液中分离得到3种不同相对分子质量的多糖,分别命名为RPS-1,RPS-2和RPS-3,检测3种多糖对DPPH、ABTS和羟自由基的清除活性。体外培养小鼠前胃癌细胞MFC、人非小细胞肺癌细胞A549和小鼠巨噬细胞RAW 264.7,给药48 h或24h后CCK-8法检测各组细胞存活率,一氧化氮试剂盒检测RAW264.7细胞上清液中的NO水平,流式细胞仪检测3种多糖对A549细胞凋亡率的影响。结果RPS-1,RPS-2和RPS-3均具有较好的抗氧化活性,中等相对分子质量多糖RPS-1对DPPH和ABTS自由基的清除活性显著高于RPS-2和RPS-3(P<0.05),低相对分子质量多糖RPS-3对羟自由基的清除活性显著高于RPS-1和RPS-2(P<0.01)。3种多糖均能够抑制MFC细胞和A549细胞的增殖,激活巨噬细胞RAW 264.7,诱导A549细胞凋亡。高相对分子质量多糖RPS-2对MFC和A549细胞增殖的抑制活性高于RPS-1和RPS-3(P>0.05),RPS-2处理后A549细胞的凋亡率显著高于RPS-1和RPS-3(P<0.05)。高相对分子质量多糖RPS-2促进RAW 264.7细胞增殖的活性显著高于RPS-1和RPS-3(P<0.05),RPS-2处理后的RAW 264.7细胞释放的NO含量显著高于RPS-1和RPS-3(P<0.01)。结论3种不同相对分子质量的多糖均具有抗氧化、抗肿瘤和免疫调节活性,低、中相对分子质量多糖RPS-1和RPS-3具有较好的抗氧化活性,高相对分子质量多糖RPS 2具有较好的抗肿瘤和免疫调节活性。 展开更多

关键词 黑根霉胞外多糖 抗氧化 抗肿瘤 巨噬细胞

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唾液酸苷酶的催化机理及水解与合成寡糖进展 被引量：2

12

作者 郭龙成 马忠轩 +1 位作者 卢丽丽 肖敏 《生物化学与生物物理进展》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2019年第2期181-192,共12页

唾液酸苷酶(EC.3.2.1.18)是一类重要的糖苷水解酶,在动物和微生物中广泛存在.该类酶催化寡糖或糖缀合物上非还原末端唾液酸水解,具有重要的生物学功能,如参与溶酶体降解代谢物、癌症发生、微生物致病等多种生理和病理过程.除了水解活性... 唾液酸苷酶(EC.3.2.1.18)是一类重要的糖苷水解酶,在动物和微生物中广泛存在.该类酶催化寡糖或糖缀合物上非还原末端唾液酸水解,具有重要的生物学功能,如参与溶酶体降解代谢物、癌症发生、微生物致病等多种生理和病理过程.除了水解活性外,有的唾液酸苷酶还具有转糖基活性,能够以唾液酸单糖或糖苷为糖基供体,催化唾液酸转移到受体分子上,一步合成寡糖和糖苷化合物.这种合成活性对于唾液酸相关糖链的大量获得具有重要意义,有利于推动该类寡糖的基础研究及其在食品和医药中的应用.本文综述了唾液酸苷酶的结构和催化机理、生理功能、转糖基作用及其在寡糖合成中的应用. 展开更多

关键词 唾液酸 唾液酸苷酶 结构及催化机理 转糖基作用 分子改造

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分子模拟在多黏菌素药理机制研究中的应用

13

作者 蒋绪恺 肖敏 王禄山 《生物化学与生物物理进展》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2023年第5期919-925,共7页

多黏菌素是一种膜靶向的脂肽类抗生素,是临床上治疗革兰氏阴性多重耐药菌感染的最后一道防线。通过与脂多糖相互作用,多黏菌素破坏细菌外膜结构并导致细菌死亡。然而,受限于生物化学和结构生物学手段对细胞膜-药物相互作用的表征能力,... 多黏菌素是一种膜靶向的脂肽类抗生素,是临床上治疗革兰氏阴性多重耐药菌感染的最后一道防线。通过与脂多糖相互作用,多黏菌素破坏细菌外膜结构并导致细菌死亡。然而,受限于生物化学和结构生物学手段对细胞膜-药物相互作用的表征能力,目前对多黏菌素药理机制的认识还不充分,从而限制了新一代多黏菌素药物的设计和开发。为此,本文总结了近年来利用分子动力学方法对细胞膜系统与多黏菌素相互作用的研究进展,为深入理解多黏菌素药理机制与细胞膜系统的内在联系,加快新型抗生素药物研发提供新思路。 展开更多

关键词 细菌耐药 细胞膜 多黏菌素 分子动力学模拟 抗生素设计

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乳腺癌细胞的HER2过表达降低其对紫杉醇的药物敏感性 被引量：10

14

作者 师以康 张胜华 +2 位作者 黄云虹 邵荣光 甄永苏 《中国药理学通报》 CAS CSCD 北大核心 2009年第4期444-448,共5页

目的紫杉醇的耐药性由多种因素引起,本文研究乳腺癌细胞中的HER2蛋白水平是否影响细胞对紫杉醇的药物敏感性。方法以HER2低表达的MCF-7/pcDNA3.1细胞和经稳定转染获得的HER2高表达的MCF-7/HER2细胞为研究对象,MTT方法测定紫杉醇对这两... 目的紫杉醇的耐药性由多种因素引起,本文研究乳腺癌细胞中的HER2蛋白水平是否影响细胞对紫杉醇的药物敏感性。方法以HER2低表达的MCF-7/pcDNA3.1细胞和经稳定转染获得的HER2高表达的MCF-7/HER2细胞为研究对象,MTT方法测定紫杉醇对这两种细胞的生长抑制作用,流式细胞仪测定紫杉醇对细胞周期分布的影响,An-nexin V-FITC/PI实验测定紫杉醇诱导的细胞凋亡,两种细胞的裸鼠移植瘤实验测定紫杉醇的抑瘤率。结果紫杉醇对MCF-7/HER2细胞的IC50值是MCF-7/pcDNA3.1细胞的6.2倍;紫杉醇诱导细胞G2/M期阻滞,且是HER2非依赖性的;0.01、0.1和1.0μmol.L-1紫杉醇诱导MCF-7/pcDNA3.1细胞凋亡的百分比分别是15.1%±2.1%、21.0%±2.9%和35.7%±3.8%,诱导MCF-7/HER2细胞凋亡的百分比分别是7.5%±1.7%、14.1%±2.3%和24.2%±3.4%,同一浓度的紫杉醇诱导两细胞的凋亡百分比差异有显著性;5、10和20 mg.kg-1的紫杉醇对裸鼠移植MCF-7/pcDNA3.1肿瘤生长抑制率分别是36.9%、58.7%和75.4%,对裸鼠移植MCF-7/HER2肿瘤生长抑制率分别是20.1%、33.3%和67.3%。在相同剂量下紫杉醇对裸鼠移植的两种肿瘤的抑瘤率差异有显著性。结论HER2蛋白的高表达可降低乳腺癌细胞对紫杉醇的药物敏感性。 展开更多

关键词 紫杉醇 HER2 乳腺癌 MCF-7细胞

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合成生物学与微生物遗传物质的重构 被引量：3

15

作者 梁泉峰 王倩 祁庆生 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2011年第10期1102-1112,共11页

作为一门新兴学科的合成生物学已经展现出巨大的科学价值和应用前景。近年来已经发表了多篇综述文章,从不同角度对合成生物学进行了总结和论述。文章首次对合成生物学和微生物遗传学之间的关系进行了阐述,同时介绍了合成生物学在微生物... 作为一门新兴学科的合成生物学已经展现出巨大的科学价值和应用前景。近年来已经发表了多篇综述文章,从不同角度对合成生物学进行了总结和论述。文章首次对合成生物学和微生物遗传学之间的关系进行了阐述,同时介绍了合成生物学在微生物遗传物质的重构方面最近的研究进展,包括微生物遗传物质的合成、设计和精简,遗传元件的标准化和遗传线路的模块化。也探讨了合成生物学与微生物遗传工程的关系。 展开更多

关键词 合成生物学 遗传学 微生物 遗传物质 微生物遗传工程

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药物分子伴侣：蛋白质折叠运输缺陷的新疗法

16

作者 卢丽丽 肖敏 +2 位作者 赵晗 徐晓东 王凤山 《生物化学与生物物理进展》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2008年第8期875-885,共11页

大量遗传性疾病的发生是由于基因突变引起蛋白质错误折叠而不能运输到作用位点,从而导致功能缺陷.近年来兴起的药物分子伴侣是恢复蛋白质折叠运输缺陷的新疗法,这类化合物一般为目的蛋白的底物类似物、受体配基或酶抑制剂等化学小分子,... 大量遗传性疾病的发生是由于基因突变引起蛋白质错误折叠而不能运输到作用位点,从而导致功能缺陷.近年来兴起的药物分子伴侣是恢复蛋白质折叠运输缺陷的新疗法,这类化合物一般为目的蛋白的底物类似物、受体配基或酶抑制剂等化学小分子,具细胞通透性,能在内质网中特异性识别并结合突变蛋白,校正并稳定其正确构象,协助其运输到正确位点,直接恢复突变蛋白功能,可治疗各种由蛋白质折叠运输缺陷导致的内分泌及代谢疾病.目前已报道的由药物分子伴侣恢复功能的突变蛋白主要为质膜蛋白及细胞器蛋白,如ATP结合盒转运蛋白、G-蛋白耦联受体及溶酶体酶等.大量的细胞及动物实验结果显示了药物分子伴侣的临床应用前景广阔,目前已有一例临床实验获得了成功. 展开更多

关键词 药物分子伴侣 蛋白折叠运输缺陷 ABC转运蛋白 G-蛋白耦联受体 溶酶体酶

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pH及溶氧对重组大肠杆菌发酵生产5-氨基乙酰丙酸的影响 被引量：3

17

作者 程雪莲 王倩 祁庆生 《中国酿造》 CAS 北大核心 2016年第11期145-148,共4页

以重组大肠杆菌DALA为实验菌株，研究了该菌株在机械搅拌通风发酵罐发酵过程中pH以及溶解氧对5-氨基乙酰丙酸（ALA）积累的影响。结果发现，发酵前期（0-27h）pH保持为6．51稳定期后期（28-48h），pH为6．0时有利于5．ALA的积累。其次... 以重组大肠杆菌DALA为实验菌株，研究了该菌株在机械搅拌通风发酵罐发酵过程中pH以及溶解氧对5-氨基乙酰丙酸（ALA）积累的影响。结果发现，发酵前期（0-27h）pH保持为6．51稳定期后期（28-48h），pH为6．0时有利于5．ALA的积累。其次，通过控制转速与通气量调节发酵液中的溶氧，发现发酵前期转速为500r／min，通气量为2vvm；稳定期后期，转速降低至250r／min，通气量减少为1vvm，有利于重组菌DALA发酵生产5．ALA，在此条件下发酵5-ALA的产量可达到3．46g／L。 展开更多

关键词 重组大肠杆菌 5-氨基乙酰丙酸 溶解氧

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不同酶处理的啤酒酵母蛋白酶解液功能肽组学分析 被引量：1

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作者 燕禹彤 高春雨 +5 位作者 张晓梅 安子哲 马蕴真 韩林林 张鸿伟 赵雪 《色谱》 CAS CSCD 北大核心 2023年第11期995-1001,共7页

采用超高效液相色谱⁃高分辨质谱(UHPLC⁃HRMS)联用技术,结合PEAKS Online 1.7肽组学分析软件和Peptide Ranker、BIOPEP数据库,分析比较了啤酒酵母的中性蛋白酶和木瓜蛋白酶酶解液的肽指纹谱图和活性肽差异,旨在探究不同酶处理的啤酒酵母... 采用超高效液相色谱⁃高分辨质谱(UHPLC⁃HRMS)联用技术,结合PEAKS Online 1.7肽组学分析软件和Peptide Ranker、BIOPEP数据库,分析比较了啤酒酵母的中性蛋白酶和木瓜蛋白酶酶解液的肽指纹谱图和活性肽差异,旨在探究不同酶处理的啤酒酵母蛋白酶解液的肽组学差异。PEAKS Online采用de novo测序,相较于传统数据库,更全面地分析得到五肽及其以下寡肽,使样品中的肽段数据更加完整。实验在中性蛋白酶和木瓜蛋白酶的最佳酶解工艺下制备得到啤酒酵母蛋白酶解液,然后进行UHPLC⁃HRMS分离鉴定及数据检索和分析。研究结果表明,中性蛋白酶、木瓜蛋白酶的酶解产物中分别鉴定出7221和7062条多肽,其中共有肽为980条,而特有肽分别为6241条和6082条,说明两种不同蛋白酶降解产物的肽指纹谱图有很大的差异。使用Peptide Ranker预测出中性蛋白酶和木瓜蛋白酶的酶解产物中有3013和3095条肽为潜在活性肽,其占比分别为41.73%和43.83%。搜索BIOPEP数据库发现,中性蛋白酶和木瓜蛋白酶的酶解产物中有295条和357条活性肽,其中主要是血管紧张素转化酶(ACE)抑制肽、二肽基肽酶Ⅳ抑制肽和抗氧化肽。比较发现,木瓜蛋白酶产物中活性肽数量高于中性蛋白酶产物,但是活性肽的相对含量低于中性蛋白酶产物,本研究更好地揭示了不同蛋白酶对啤酒酵母蛋白肽产品组成的影响。上述结果为啤酒酵母蛋白肽的功能产品开发和啤酒酵母资源的高值化利用提供了参考。 展开更多

关键词 超高效液相色谱⁃高分辨质谱 肽指纹谱图 活性肽 啤酒酵母

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外切型琼胶酶AgaO的高效表达及酶学性质表征

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作者 程媛媛 陈庆敏 +3 位作者 李俊鸽 李淑焕 王延辉 韩文君 《食品工业科技》 CAS 北大核心 2019年第7期107-113,共7页

根据大肠杆菌的密码子偏好性,优化外切型琼胶酶AgaO的基因并人工全合成,克隆入表达载体质粒pET-30a(+),转化大肠杆菌BL21(DE3),优化表达条件即诱导温度、诱导时间和诱导剂IPTG终浓度,纯化重组蛋白rEAgaO,并分析其酶学性质变化。结果表明... 根据大肠杆菌的密码子偏好性,优化外切型琼胶酶AgaO的基因并人工全合成,克隆入表达载体质粒pET-30a(+),转化大肠杆菌BL21(DE3),优化表达条件即诱导温度、诱导时间和诱导剂IPTG终浓度,纯化重组蛋白rEAgaO,并分析其酶学性质变化。结果表明,重组酶rEAgaO在16℃、IPTG终浓度0.1 mmol/L条件下诱导20 h时表达量最高;95%以上的重组蛋白质为水溶性表达,产量约为1432.7 mg/L,较优化前原始基因的产量提高了10.9倍;重组酶rEAgaO的最适反应温度为45℃,在低于40℃的温度下预处理2 h后,仍然具有90%以上的残余活性,最适pH为7.0,在pH6.0～10.0不同缓冲体系4℃处理2 h仍保留69.5%以上的活性;该酶降解琼脂糖后的最终产物经TLC分析鉴定为新琼二糖。基因密码子优化虽不改变蛋白质氨基酸序列,但可明显提高水溶性重组蛋白质的产率及酶活,对促进相关酶类的生产和应用具有借鉴意义。 展开更多

关键词 琼胶酶 密码子优化 原核表达 酶学性质 新琼二糖

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