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酵母模式生物研究表观遗传调控基因组稳定性的进展
被引量:
3
1
作者
冯碧薇
陈建强
+2 位作者
雷秉坤
潘贤
吕红
《遗传》
CAS
CSCD
北大核心
2010年第8期799-807,共9页
基因组的遗传稳定性是维持正常的细胞复制、增殖和分化的关键。外源因素和内源因素造成的DNA损伤及其修复失败,是各种遗传疾病发生的根本原因。表观遗传调控(包括DNA甲基化、组蛋白修饰和非编码RNA)在DNA损伤修复和细胞周期调控方面发...
基因组的遗传稳定性是维持正常的细胞复制、增殖和分化的关键。外源因素和内源因素造成的DNA损伤及其修复失败,是各种遗传疾病发生的根本原因。表观遗传调控(包括DNA甲基化、组蛋白修饰和非编码RNA)在DNA损伤修复和细胞周期调控方面发挥着重要的作用,也是维持基因组稳定性的基础。酵母作为单细胞真核生物,是最早开展表观遗传学研究的物种之一,特别是在DNA损伤修复和异染色质形成等方面的研究,为揭示遗传稳定性的本质提供了理论依据。国际上前期以酵母为模式生物研究表观遗传学的报道主要集中于组蛋白修饰领域;近期利用裂殖酵母作为模式生物研究RNAi指导的组蛋白修饰也有了一定的进展。文章以酵母作为模式生物,论述了表观遗传修饰在维持基因组遗传稳定性中的研究进展、作用机制和今后的发展趋势。
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关键词
酵母
表观遗传调控
基因组稳定性
组蛋白修饰
RNAI
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职称材料
定量PCR的非同源对照模板的构建
被引量:
2
2
作者
陈燃
金詟
毛裕民
《遗传》
CAS
CSCD
北大核心
2001年第3期247-250,共4页
建立了HCVRNA和hTERTmRNA的竞争定量PCR系统。对照模板的构建方法是 :利用计算机辅助优选设计连接引物 ,低严紧型扩增大肠杆菌DNA ,回收并克隆预期的DNA片段。该片段与靶序列除两端引物序列完全相同外 ,无同源性 ,因此可作为非同源对照...
建立了HCVRNA和hTERTmRNA的竞争定量PCR系统。对照模板的构建方法是 :利用计算机辅助优选设计连接引物 ,低严紧型扩增大肠杆菌DNA ,回收并克隆预期的DNA片段。该片段与靶序列除两端引物序列完全相同外 ,无同源性 ,因此可作为非同源对照模板。这种构建非同源对照模板的方法 ,简便易行 。
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关键词
竞争定量PCR
对照模板
异源双链
大肠杆菌
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职称材料
循环逆转录反应方法及应用条件研究
3
作者
陈燃
金詟
+2 位作者
伍迪
唐榕
毛裕民
《生物化学与生物物理进展》
SCIE
CAS
CSCD
北大核心
2001年第4期560-562,共3页
建立了循环逆转录反应方法 (repeatedreversetranscriptionreaction ,RRTR) .其原理是通过控制高温变性 低温退火延伸的循环过程 ,反复利用起始RNA模板进行逆转录反应 .RNA杂交的结果证明在RRTR过程中 ,RNA模板是保持稳定的 ;点杂交结...
建立了循环逆转录反应方法 (repeatedreversetranscriptionreaction ,RRTR) .其原理是通过控制高温变性 低温退火延伸的循环过程 ,反复利用起始RNA模板进行逆转录反应 .RNA杂交的结果证明在RRTR过程中 ,RNA模板是保持稳定的 ;点杂交结果表明cDNA产物量得到了增加 ;定量PCR的结果表明RRTR是cDNA线性增长过程 .结果提示 ,RRTR可有效地提高RNA检测灵敏度 。
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关键词
循环逆转录反应
RNA
定量分析
应用
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职称材料
雄激素受体(AR)靶miRNA转录过程中转录复合体的形成初探
被引量:
2
4
作者
张聪哲
吴海
李瑶
《复旦学报(医学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2014年第3期291-297,303,共8页
目的探讨雄激素受体(androgen receptor,AR)调控的靶miRNA在转录过程中受到AR以及一系列蛋白辅助因子形成的转录复合体影响的过程。方法通过染色质免疫沉淀(ChIP)和实时荧光定量PCR(qPCR)方法,用相应辅助蛋白因子的抗体研究蛋白质和DNA...
目的探讨雄激素受体(androgen receptor,AR)调控的靶miRNA在转录过程中受到AR以及一系列蛋白辅助因子形成的转录复合体影响的过程。方法通过染色质免疫沉淀(ChIP)和实时荧光定量PCR(qPCR)方法,用相应辅助蛋白因子的抗体研究蛋白质和DNA的相互作用,qPCR研究蛋白质和DNA结合的增强或者减弱。通过Western blot实验在不同细胞系中初步研究8-羟基鸟嘌呤DNA糖苷酶(OGG1)和前列腺癌恶化的相关性。结果在LNCaP前列腺癌细胞系中,进行双氢睾酮(DHT)刺激后,在AR靶miRNA的雄激素受体调控元件(androgen response element,ARE)位置发现了赖氨酸特异性去甲基化酶1(LSD1),OGG1,脱嘌呤/脱嘧啶核酸内切酶(Apel).RNA聚合酶Ⅱ及拓扑异构酶Ⅱ等辅助蛋白因子结合量上升。通过AR和LSD1的siRNA干扰实验,证明是由AR招募了LSD1,LSD1进而招募其余辅助蛋白因子。结论这些转录因子AR以及LSD1、OGG1、Apel、RNA聚合醇Ⅱ和拓扑异物酶Ⅱ等一系列蛋白因子形成的转录复合物,促进了AR调控的靶miRNA转录的发生,且该转录复合物的形成由AR的招募作用发起。
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关键词
前列腺癌
雄激素受体(AR)
MIRNA
转录复合物
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职称材料
题名
酵母模式生物研究表观遗传调控基因组稳定性的进展
被引量:
3
1
作者
冯碧薇
陈建强
雷秉坤
潘贤
吕红
机构
复旦大学生命科学学院遗传所遗传工程国家重点实验室
出处
《遗传》
CAS
CSCD
北大核心
2010年第8期799-807,共9页
基金
国家重点基础研究发展规划(973计划)项目(编号:2009CB825601)
国家自然科学基金项目(编号啊:30771145)资助
文摘
基因组的遗传稳定性是维持正常的细胞复制、增殖和分化的关键。外源因素和内源因素造成的DNA损伤及其修复失败,是各种遗传疾病发生的根本原因。表观遗传调控(包括DNA甲基化、组蛋白修饰和非编码RNA)在DNA损伤修复和细胞周期调控方面发挥着重要的作用,也是维持基因组稳定性的基础。酵母作为单细胞真核生物,是最早开展表观遗传学研究的物种之一,特别是在DNA损伤修复和异染色质形成等方面的研究,为揭示遗传稳定性的本质提供了理论依据。国际上前期以酵母为模式生物研究表观遗传学的报道主要集中于组蛋白修饰领域;近期利用裂殖酵母作为模式生物研究RNAi指导的组蛋白修饰也有了一定的进展。文章以酵母作为模式生物,论述了表观遗传修饰在维持基因组遗传稳定性中的研究进展、作用机制和今后的发展趋势。
关键词
酵母
表观遗传调控
基因组稳定性
组蛋白修饰
RNAI
Keywords
yeast
epigenetic regulation
genomic integrity
histone modification
RNA interference
分类号
Q343 [生物学—遗传学]
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职称材料
题名
定量PCR的非同源对照模板的构建
被引量:
2
2
作者
陈燃
金詟
毛裕民
机构
复旦大学生命科学学院遗传所遗传工程国家重点实验室
出处
《遗传》
CAS
CSCD
北大核心
2001年第3期247-250,共4页
基金
国家自然科学基金!资助项目 ( 3 970 0 0 82 )
文摘
建立了HCVRNA和hTERTmRNA的竞争定量PCR系统。对照模板的构建方法是 :利用计算机辅助优选设计连接引物 ,低严紧型扩增大肠杆菌DNA ,回收并克隆预期的DNA片段。该片段与靶序列除两端引物序列完全相同外 ,无同源性 ,因此可作为非同源对照模板。这种构建非同源对照模板的方法 ,简便易行 。
关键词
竞争定量PCR
对照模板
异源双链
大肠杆菌
Keywords
competitive quantitative PCR
competitor DNA
heteroduplex DNA
分类号
Q933 [生物学—微生物学]
Q75 [生物学—分子生物学]
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职称材料
题名
循环逆转录反应方法及应用条件研究
3
作者
陈燃
金詟
伍迪
唐榕
毛裕民
机构
复旦大学生命科学学院遗传所遗传工程国家重点实验室
出处
《生物化学与生物物理进展》
SCIE
CAS
CSCD
北大核心
2001年第4期560-562,共3页
基金
国家自然科学基金资助项目 (3 970 0 0 82 )~~
文摘
建立了循环逆转录反应方法 (repeatedreversetranscriptionreaction ,RRTR) .其原理是通过控制高温变性 低温退火延伸的循环过程 ,反复利用起始RNA模板进行逆转录反应 .RNA杂交的结果证明在RRTR过程中 ,RNA模板是保持稳定的 ;点杂交结果表明cDNA产物量得到了增加 ;定量PCR的结果表明RRTR是cDNA线性增长过程 .结果提示 ,RRTR可有效地提高RNA检测灵敏度 。
关键词
循环逆转录反应
RNA
定量分析
应用
Keywords
repeated reverse transcription reaction (RRTR), RNA, quantification
分类号
Q522 [生物学—生物化学]
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职称材料
题名
雄激素受体(AR)靶miRNA转录过程中转录复合体的形成初探
被引量:
2
4
作者
张聪哲
吴海
李瑶
机构
复旦大学
生命科学
学院
遗传所
-
遗传工程
国家
重点
实验室
出处
《复旦学报(医学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2014年第3期291-297,303,共8页
基金
国家自然科学基金(31171246
31071142)~~
文摘
目的探讨雄激素受体(androgen receptor,AR)调控的靶miRNA在转录过程中受到AR以及一系列蛋白辅助因子形成的转录复合体影响的过程。方法通过染色质免疫沉淀(ChIP)和实时荧光定量PCR(qPCR)方法,用相应辅助蛋白因子的抗体研究蛋白质和DNA的相互作用,qPCR研究蛋白质和DNA结合的增强或者减弱。通过Western blot实验在不同细胞系中初步研究8-羟基鸟嘌呤DNA糖苷酶(OGG1)和前列腺癌恶化的相关性。结果在LNCaP前列腺癌细胞系中,进行双氢睾酮(DHT)刺激后,在AR靶miRNA的雄激素受体调控元件(androgen response element,ARE)位置发现了赖氨酸特异性去甲基化酶1(LSD1),OGG1,脱嘌呤/脱嘧啶核酸内切酶(Apel).RNA聚合酶Ⅱ及拓扑异构酶Ⅱ等辅助蛋白因子结合量上升。通过AR和LSD1的siRNA干扰实验,证明是由AR招募了LSD1,LSD1进而招募其余辅助蛋白因子。结论这些转录因子AR以及LSD1、OGG1、Apel、RNA聚合醇Ⅱ和拓扑异物酶Ⅱ等一系列蛋白因子形成的转录复合物,促进了AR调控的靶miRNA转录的发生,且该转录复合物的形成由AR的招募作用发起。
关键词
前列腺癌
雄激素受体(AR)
MIRNA
转录复合物
Keywords
prostate cancer
androgen receptor (AR)
microRNA
transcription complex
分类号
Q354 [生物学—遗传学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
酵母模式生物研究表观遗传调控基因组稳定性的进展
冯碧薇
陈建强
雷秉坤
潘贤
吕红
《遗传》
CAS
CSCD
北大核心
2010
3
在线阅读
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职称材料
2
定量PCR的非同源对照模板的构建
陈燃
金詟
毛裕民
《遗传》
CAS
CSCD
北大核心
2001
2
在线阅读
下载PDF
职称材料
3
循环逆转录反应方法及应用条件研究
陈燃
金詟
伍迪
唐榕
毛裕民
《生物化学与生物物理进展》
SCIE
CAS
CSCD
北大核心
2001
0
在线阅读
下载PDF
职称材料
4
雄激素受体(AR)靶miRNA转录过程中转录复合体的形成初探
张聪哲
吴海
李瑶
《复旦学报(医学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2014
2
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职称材料
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