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遗传性听力损失基因组学研究现状与挑战
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作者 韩东一 王秋菊 《中国耳鼻咽喉头颈外科》 北大核心 2006年第10期659-660,共2页
在21世纪生命科学飞速发展的今天,医学已经进入一个基因组医学时代,人们对健康和疾病的认识在前所未有的分子水平上得到详尽的分析和理解。此时,不寻常的机遇和挑战摆在了我们这些维护生命健康和从事临床实践的医师面前。纵观十余年... 在21世纪生命科学飞速发展的今天,医学已经进入一个基因组医学时代,人们对健康和疾病的认识在前所未有的分子水平上得到详尽的分析和理解。此时,不寻常的机遇和挑战摆在了我们这些维护生命健康和从事临床实践的医师面前。纵观十余年遗传性听力损失的发展历史,毋庸置疑的是,由于基因组学的快速发展和伟大成就才使得我们在一个研究手段有限、研究范围极为狭窄的专业领域中产生了快速的突破。同时,也使我们不得不思考,我们如何面对这样的机遇和挑战? 展开更多
关键词 遗传性疾病(Genetic Diseases) 听觉障碍(Auditory Perceptual Disorders) 基因组学(Genomics)
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新疆少数民族和汉族聋哑学生GJB2基因和线粒体DNA 12SrRNA A1555G突变研究 被引量:13
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作者 满荣军 郭玉芬 +7 位作者 刘晓雯 徐百成 李丽 惠培林 纪育斌 刘穹 历建强 王秋菊 《中国耳鼻咽喉头颈外科》 北大核心 2009年第4期190-193,共4页
目的调查新疆地区聋哑学生GJB2基因和线粒体DNA12SrRNA A1555G突变情况。方法收集本地区402例感音神经性聋患者基因组DNA,聚合酶链反应扩增线粒体DNA和GJB2基因目的片段,AIw26I限制性内切酶检测线粒体DNA12SrRNA A1555G点突变,对酶切阳... 目的调查新疆地区聋哑学生GJB2基因和线粒体DNA12SrRNA A1555G突变情况。方法收集本地区402例感音神经性聋患者基因组DNA,聚合酶链反应扩增线粒体DNA和GJB2基因目的片段,AIw26I限制性内切酶检测线粒体DNA12SrRNA A1555G点突变,对酶切阳性病例和全部GJB2基因PCR产物进行DNA测序。结果维吾尔族、回族和哈萨克族患者中检测到GJB2基因35delG突变,突变携带率分别为5.2%、5.9%和15.4%;汉族和维吾尔族患者检测到GJB2基因235delC突变,突变携带率分别为15.2%和7.1%;维吾尔族患者中发现GJB2基因两种新突变311del14和187delG;9例患者检出线粒体DNA12SrRNA A1555G突变。结论GJB2基因突变在该地区耳聋人群中有较高携带率,新疆地区不同民族GJB2基因突变谱和热点突变存在差异,线粒体DNA12SrRNA A1555G突变是该地区常见聋病基因突变。 展开更多
关键词 听力障碍 连接蛋白类 基因 DNA 线粒体 突变
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胆固醇24S-羟化酶基因多态性与散发性阿尔茨海默病的相关性研究 被引量:1
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作者 赵发国 石进 +6 位作者 王荫华 冯秀丽 杨静芳 汤哲 刘宏军 马秋兰 陈彪 《中华老年心脑血管病杂志》 CAS 北大核心 2010年第10期921-924,共4页
目的探讨胆固醇24S-羟化酶(CYP46)基因多态性是否为散发性阿尔茨海默病(SAD)的遗传易感基因。方法选择SAD患者108例作为SAD组,同期选择年龄、性别相匹配的健康老年人118例作为对照组,用变性高效液相色谱法对CYP46基因的核苷酸序... 目的探讨胆固醇24S-羟化酶(CYP46)基因多态性是否为散发性阿尔茨海默病(SAD)的遗传易感基因。方法选择SAD患者108例作为SAD组,同期选择年龄、性别相匹配的健康老年人118例作为对照组,用变性高效液相色谱法对CYP46基因的核苷酸序列进行扫描,比较2组变异位点的基因型和等位基因频率分布。结果在外显子-内含子交界区检出10个不同的变异位点,5个多态性位点(IVS2~150A〉G,IVS3+43C〉T,IVS3—130C〉T,IVS5+51G〉C,IVS7—65T〉C)是较好的遗传标记。SAD组和对照组在IVS2—150A〉G基因型AG+GG的分布频率差异无统计学意义(χ^2=1.369,P=0.242);SAD组和对照组等位基因G的分布频率差异无统计学意义(χ^2=0.003,P=0.956)。SAD组和对照组携带载脂蛋白E(apoE)ε4与非携带apoEε4者上述基因分布差异均无统计学意义(P〉0.05)。IVS2-150A〉G与SAD无相关性。结论CYP46是一个较为保守的基因,其内含子2上的多态性位点IVS2-150A〉G与SAD的发病无关。 展开更多
关键词 阿尔茨海默病 甾类羟化酶类 多态性 单核苷酸 色谱法 高压液相 胆固醇24S-羟化酶
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促细胞增殖新基因TOX的功能研究
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作者 邓唯唯 李静 +4 位作者 高鹏 郝东霞 张璐 石太平 王应 《浙江大学学报(农业与生命科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2013年第4期369-374,共6页
利用GenBank中的数据,通过聚合酶链式反应(polymerase chain reaction,PCR)从人的cDNA文库中克隆得到功能基因TOX(thymocyte selection-associated high mobility group box),运用生物信息学分析其结构特性,并通过逆转录PCR(reverse tra... 利用GenBank中的数据,通过聚合酶链式反应(polymerase chain reaction,PCR)从人的cDNA文库中克隆得到功能基因TOX(thymocyte selection-associated high mobility group box),运用生物信息学分析其结构特性,并通过逆转录PCR(reverse transcription PCR,RT-PCR)分析TOX在细胞系中的表达;利用荧光显微镜观察其亚细胞定位情况;使用细胞生长曲线实验和流式细胞术分析TOX对细胞增殖及细胞周期的影响.结果表明:TOX基因定位于人8号染色体q12.1上,全长4 131bp,编码526个氨基酸,该蛋白质分子质量约为57ku,含有9个外显子和8个内含子,其编码蛋白为高迁移率蛋白家族成员,能参与基因调控等生理过程;TOX基因在白血病细胞系Jurkat和Raji中高表达,并定位于细胞核中;对细胞生长曲线绘制及细胞周期分析表明,TOX能够使细胞生长速度加快,且S期细胞比例明显上升.说明TOX参与了细胞增殖调控,有可能研究开发为药物靶标或疾病标志物. 展开更多
关键词 TOX基因 细胞增殖 细胞周期 药物靶标 疾病标志物
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中国西北地区线粒体DNA12SrRNAA1555G和GJB2基因突变 被引量:44
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作者 郭玉芬 徐百成 +6 位作者 韩东一 关静 兰兰 赵翠 陈之慧 袁虎 王秋菊 《中国耳鼻咽喉头颈外科》 北大核心 2006年第10期666-669,共4页
目的研究mtDNA 12SrRNA A1555G突变和GJB2突变在西北地区非综合征型感音神经性聋患者中的流行情况,探讨GJB2基因与mtDNA A1555G点突变的关系。方法收集本地区221例非综合征感音神经性聋患者的基因组DNA,多聚酶链反应扩增线粒体DNA和GJB... 目的研究mtDNA 12SrRNA A1555G突变和GJB2突变在西北地区非综合征型感音神经性聋患者中的流行情况,探讨GJB2基因与mtDNA A1555G点突变的关系。方法收集本地区221例非综合征感音神经性聋患者的基因组DNA,多聚酶链反应扩增线粒体DNA和GJB2基因目的片断,Alw26 I限制性内切酶检测A1555G点突变,对酶切阳性病例和全部的GJB2基因的PCR产物进行DNA测序。结果21例患者检出mtDNA 12SrRNA A1555G突变;发现GJB2基因11种序列改变,有44例患者检出GJB2致病突变,235 delC占携带致病突变患者的54.54%;在21例A1555G突变患者中,11例为GJB2基因多态改变,9例未检出GJB2基因序列改变,1例为109G→A(V371)突变。结论mDNA 12SrRNAA1555G在这一地区人群中有较高的发生频率,235delC是本地区GJB2基因突变的主要形式,GJB2基因突变不是mtDNA A1555G突变致聋的主要修饰因素。 展开更多
关键词 听力障碍 基因 DNA 线粒体 突变
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异亚丙基莽草酸抗炎作用机制研究 被引量:9
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作者 陈小军 顾立刚 +1 位作者 石太平 孙建宁 《中国中医药信息杂志》 CAS CSCD 2008年第3期28-30,共3页
目的观察异亚丙基莽草酸(ISA)对人宫颈癌Hela细胞转录因子STAT1、STAT3、NF-κB表达作用的影响,探讨其抗炎作用机制。方法用MTT法体外检测ISA不同浓度对Hela细胞生长的抑制作用,采用双荧光素酶报告系统检测不同浓度药物对转录因子STAT1... 目的观察异亚丙基莽草酸(ISA)对人宫颈癌Hela细胞转录因子STAT1、STAT3、NF-κB表达作用的影响,探讨其抗炎作用机制。方法用MTT法体外检测ISA不同浓度对Hela细胞生长的抑制作用,采用双荧光素酶报告系统检测不同浓度药物对转录因子STAT1、STAT3、NF-κB表达活性的影响。结果ISA对人宫颈癌Hela细胞的生长没有明显的抑制作用;ISA处理组NF-κB-luc荧光素酶活性下降,而GAS-luc、STAT3-luc荧光素酶活性无明显改变。结论ISA可能通过下调转录因子NF-κB的活性,抑制炎症因子的表达,对炎症反应起到抑制作用。 展开更多
关键词 异亚丙基莽草酸 NF-κ B 抗炎 HELA细胞
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榄香烯乳对人宫颈癌Hela细胞转录因子ELK1及其靶基因的影响 被引量:9
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作者 陈小军 顾立刚 +2 位作者 李佩文 石太平 马大龙 《中国中医药信息杂志》 CAS CSCD 2008年第1期26-27,共2页
目的观察中药榄香烯乳对人宫颈癌Hela细胞转录因子ELK1及其靶基因的影响,以深入了解榄香烯乳的抗癌机制。方法用MTT法检测药物对细胞的抑制作用,双荧光素酶报告系统检测药物对转录因子ELK1的影响,Western Blot检测磷酸化ELK1及其靶基因c... 目的观察中药榄香烯乳对人宫颈癌Hela细胞转录因子ELK1及其靶基因的影响,以深入了解榄香烯乳的抗癌机制。方法用MTT法检测药物对细胞的抑制作用,双荧光素酶报告系统检测药物对转录因子ELK1的影响,Western Blot检测磷酸化ELK1及其靶基因c-fos表达。结果榄香烯乳能明显抑制人宫颈癌Hela细胞的生长,其半数生长抑制剂量为80.6μg/mL;榄香烯乳处理组荧光素酶活性下降,磷酸化的ELK1及其靶基因c-fos的表达均下调。结论榄香烯乳可能通过下调转录因子ELK1的磷酸化水平,抑制c-fos的表达,从而抑制人宫颈癌Hela细胞的生长。 展开更多
关键词 榄香烯乳 HELA细胞 ELK1
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1234例新生儿听力与聋病易感基因联合筛查 被引量:15
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作者 李丽 何健 +11 位作者 郭玉芬 兰兰 袁逸铭 刘亚珍 张虹 丁海娜 满荣军 历建强 杨菊兰 王大勇 郭晖 王秋菊 《中国耳鼻咽喉头颈外科》 北大核心 2009年第4期187-189,共3页
目的探讨新生儿听力与聋病易感基因联合筛查的必要性。方法以2007年11月~2008年10月期间出生的1234例新生儿作为研究对象,对每个研究对象在出生后给予听力筛查和聋病易感基因的同步筛查。进行筛查的3个最为常见聋病基因分别是mtDNA A15... 目的探讨新生儿听力与聋病易感基因联合筛查的必要性。方法以2007年11月~2008年10月期间出生的1234例新生儿作为研究对象,对每个研究对象在出生后给予听力筛查和聋病易感基因的同步筛查。进行筛查的3个最为常见聋病基因分别是mtDNA A1555G、GJB2和SLC26A4。结果基因筛查未通过者32例,其中2例为mtDNA A1555G突变阳性,GJB2基因235delC杂合突变20例,SLC26A4基因IVS7-2A>G杂合突变10例。耳聋基因阳性率26‰(32/1234)。32例中5例未通过听力筛查初筛。1234例中112例未通过听力初筛。结论聋病易感基因的同步筛查,弥补了单纯新生儿听力筛查的不足,应该得到广泛的开展。 展开更多
关键词 新生儿筛查 婴儿 预防卫生服务 基因
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中国散发耳聋患者GJB6基因的突变筛查 被引量:8
9
作者 韩东一 李庆忠 +5 位作者 兰兰 赵亚丽 袁虎 李丽娜 刘穹 王秋菊 《中国耳鼻咽喉头颈外科》 北大核心 2006年第10期670-672,共3页
目的研究中国散发耳聋患者与缝隙连接蛋白beta-6基因(gap junction protein beta 6 gene,GJB6)突变的相关性。方法分别设计扩增GJB6基因编码区和大片缺失后产物的引物各1对,应用PCR产物直接测序方法对各种感音神经性耳聋患者214例、正... 目的研究中国散发耳聋患者与缝隙连接蛋白beta-6基因(gap junction protein beta 6 gene,GJB6)突变的相关性。方法分别设计扩增GJB6基因编码区和大片缺失后产物的引物各1对,应用PCR产物直接测序方法对各种感音神经性耳聋患者214例、正常听力者86例进行GJB6基因的突变检测及鉴定。结果没有发现在欧美耳聋人群中常见的GJB6大片段缺失,在214例患者中仅发现GJB6基因一种杂合错义突变,为一个新的突变形式233(C→A),进一步的各物种多种连接蛋白氨基酸序列进化分析证实该突变位点位于C×30高度保守的第二跨膜区。86例正常对照组中未发现同样突变。结论通过研究发现GJB6突变不是中国散发耳聋患者中的常见致病因素,为下一步开展耳聋相关基因和临床基因诊断研究打下了基础。 展开更多
关键词 基因 突变 听力障碍
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先天性内耳畸形家系致病基因的定位克隆 被引量:4
10
作者 李庆忠 王秋菊 +3 位作者 赵亚丽 袁虎 李丽娜 韩东一 《中国耳鼻咽喉头颈外科》 北大核心 2006年第10期678-682,共5页
目的应用分子遗传学的方法揭示一个X-连锁遗传先天性内耳畸形家系的分子病理机制。方法利用X染色体上的微卫星标记进行基因组扫描,通过连锁分析的方法进行致病基因的定位;在定位区域内选取候选基因进行突变筛查。结果①家系所有患者成... 目的应用分子遗传学的方法揭示一个X-连锁遗传先天性内耳畸形家系的分子病理机制。方法利用X染色体上的微卫星标记进行基因组扫描,通过连锁分析的方法进行致病基因的定位;在定位区域内选取候选基因进行突变筛查。结果①家系所有患者成员均为男性,表型特征为先天性极重度耳聋,颞骨CT扫描发现内耳道扩大,其基底部骨质缺损,蜗轴发育不全,遗传特点符合X-连锁遗传模式;②通过连锁分析在DXS990处得出的最大LOD值为3.27(θ=0.0),将该家系定位在Xq13.1-23之间的区域内;③对定位区域内的基因进行分析后将POU3F4基因作为候选基因对家系成员进行突变检测,发现了与家系中患者成员内耳畸形表型共分离的POU3F4基因新的突变形式(925T→C),该突变位于POU同源结构域中的保守位点,导致编码蛋白氨基酸第309位的丝氨酸突变成脯氨酸(Ser309Pro),110例正常对照者中没有发现同样的突变。结论POU3F4基因一种新的突变形式是导致中国先天性内耳畸形家系中患者的分子病理机制。 展开更多
关键词 迷路疾病 畸形 基因 突变 定位克隆
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散发感音神经性聋患者中GJB2基因突变检测的临床意义 被引量:1
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作者 韩明鲲 韩东一 +4 位作者 兰兰 王大勇 赵翠 刘晓雯 王秋菊 《中国耳鼻咽喉头颈外科》 北大核心 2008年第4期186-189,共4页
目的探讨散发感音神经性聋患者中GJB2基因突变检测的临床指导意义。方法运用聚合酶链反应对解放军总医院听力诊断中心收集的242例散发感音神经性聋患者(135例语前聋患者,107例语后聋患者)的GJB2基因编码区进行扩增,扩增产物纯化后直接... 目的探讨散发感音神经性聋患者中GJB2基因突变检测的临床指导意义。方法运用聚合酶链反应对解放军总医院听力诊断中心收集的242例散发感音神经性聋患者(135例语前聋患者,107例语后聋患者)的GJB2基因编码区进行扩增,扩增产物纯化后直接测序分析。结果135例语前聋患者中GJB2基因致病突变的复合杂合和纯合个体有26例,占语前聋个体的19.26%;107例语后聋患者中未发现复合杂合和纯合致病突变,仅发现3例235delC杂合突变携带者、1例176del16杂合突变携带者。结论语前聋者GJB2基因致病突变阳性率明显高于语后聋患者,语前聋患者常规进行GJB2基因检测可从基因水平明确诊断,并为耳聋患者提供重要遗传信息。 展开更多
关键词 听觉丧失 感音神经性 GJB2基因 突变
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KCNN4及KPTN基因在中国DFNA4型耳聋中的突变检测
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作者 纵亮 韩东一 +4 位作者 兰兰 郭维维 赵亚丽 袁虎 王秋菊 《中国耳鼻咽喉头颈外科》 北大核心 2006年第10期673-677,共5页
目的应用位置候选基因法了解中国DFNA4型耳聋家系定位区域内的两个基因KCNN4、KPTN与该家系耳聋表型的相关性。方法对一个6代相传、全基因组扫描连锁分析定位于DFNA4座位的常染色体显性遗传性耳聋中国家系成员,针对候选基因KCNN4、KPTN... 目的应用位置候选基因法了解中国DFNA4型耳聋家系定位区域内的两个基因KCNN4、KPTN与该家系耳聋表型的相关性。方法对一个6代相传、全基因组扫描连锁分析定位于DFNA4座位的常染色体显性遗传性耳聋中国家系成员,针对候选基因KCNN4、KPTN的全部编码序列设计引物,应用PCR扩增反应、产物纯化后直接测序的方法进行突变或多态性位点的检测与鉴定。结果两种基因的各对引物均有较好的扩增效果,直接测序结果与标准序列比对分析显示在KCNN4基因的所有编码区未检测到突变;在KPTN基因外显子10的编码区鉴定出一处同义突变(2154G/A,P302P),该突变不与家系的耳聋表型共分离,为已报道的单核苷酸多态性(SNP)位点(rs2293424)。结论该中国DFNA4家系的耳聋表型不是由其定位区域内的KCNN4、KPTN基因编码区的突变所导致,但这两个基因仍是极好的耳聋候选基因,其与遗传性耳聋的相关性有待进一步研究。 展开更多
关键词 基因 突变 DFNA4型
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人辅脂酶样3基因hCLPSL3及其同源基因cDNA克隆及鉴定
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作者 卢艳 薛永常 +1 位作者 于鹏 王平章 《浙江大学学报(农业与生命科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2012年第5期575-584,共10页
为发现新的辅脂酶样家族成员,通过EST拼接获得1个新的人类辅脂酶样蛋白编码基因hCLPSL3(human colipase-like 3);同时,通过同源性分析,对小鼠(Mus musculus)、大鼠(Rattus norvegicus)同源基因Clpsl3的完整编码区进行分析和预测。利用RT... 为发现新的辅脂酶样家族成员,通过EST拼接获得1个新的人类辅脂酶样蛋白编码基因hCLPSL3(human colipase-like 3);同时,通过同源性分析,对小鼠(Mus musculus)、大鼠(Rattus norvegicus)同源基因Clpsl3的完整编码区进行分析和预测。利用RT-PCR技术以人细胞系cDNA为模板成功扩增到hCLPSL3的2个转录变异体,即hCLPSL3-v1和-v2,前者包含完整的开放阅读框架(ORF),后者ORF被提前终止密码子(premature stop codon,PTC)中断;hCLPSL3-v1包含159个氨基酸,含有1个典型的信号肽,2个高度同源的内部序列重复区以及2个不完整的辅脂酶样结构域。通过真核表达载体构建,在人293T细胞中以过表达方式证实了hCLPSL3-v1能够分泌。通过RT-PCR技术,在小鼠肾、结肠和脾脏组织中各获得1个Clpsl3转录变异体序列,分别称为mCLPSL3-v1、-v2和-v3,其中mCLPSL3-v1包含完整的编码区,编码产物含161个氨基酸,而mCLPSL3-v2和-v3的ORF均被PTC中断;从大鼠结肠和小肠组织中克隆到大鼠Clpsl3的cDNA序列,即rCLPSL3,其编码162个氨基酸。此外,CLPSL3在哺乳动物中广泛存在,基因结构相似,均含有高度保守的18个半胱氨酸,推测与二硫键形成有关。这些工作为CLPSL3的功能研究奠定了基础。 展开更多
关键词 克隆 辅脂酶 人辅脂酶样3基因
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毛细管阵列电泳与规模化DNA测序 被引量:5
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作者 甄志成 姚志建 《色谱》 CAS CSCD 北大核心 2001年第4期361-364,共4页
根据 10 0 80份基因组DNA测序的结果 ,讨论了毛细管阵列电泳测序方法的技术特点 ,并对影响测序结果的一些因素进行了分析。在此基础上与平板凝胶电泳方法进行比较 ,显示了毛细管阵列电泳的优点。
关键词 毛细管阵列电泳 DNA测序 基因组 规模化测序 凝胶平板电泳DNA测序仪
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