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花椒锈病抗性相关的SNP分子标记筛选
1
作者
张宾珊
阮若玉
+6 位作者
肖欣竹
叶萌
胡映霞
崔慧
尹妍吉
韩珊
贾玉珍
《四川农业大学学报》
北大核心
2025年第1期148-158,共11页
【目的】开发和筛选与花椒锈病抗性相关的SNP分子标记,实现不同花椒品种(系)锈病高效精准的抗性分子鉴定。【方法】基于花椒转录组测序(RNA-Seq)结果,开发出可能与抗性相关的SNP标记,在抗感差异材料中验证与花椒锈病抗性相关的SNP引物...
【目的】开发和筛选与花椒锈病抗性相关的SNP分子标记,实现不同花椒品种(系)锈病高效精准的抗性分子鉴定。【方法】基于花椒转录组测序(RNA-Seq)结果,开发出可能与抗性相关的SNP标记,在抗感差异材料中验证与花椒锈病抗性相关的SNP引物。【结果】以12份抗病株系和感病株系基因组DNA为模板,与人工接种鉴定相结合,获得1个与花椒抗锈病相关的SNP标记,该标记在抗病材料中能够扩增出1条325 bp左右大小的条带(命名为30616-314-2)。使用此引物对现有40份花椒种质资源进行抗性鉴定,获得抗病材料14份,感病材料26份。【结论】筛选出了1个可以用于花椒抗锈病辅助育种选择的SNP分子标记,加速推进花椒抗锈病育种进程。
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关键词
花椒锈病
SNP分子标记
转录组
抗性鉴定
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职称材料
长足大竹象信息素结合蛋白CbuqPBP2互作蛋白的筛选与验证
被引量：
1
2
作者
杨桦
李祥乾
+2 位作者
王帆
方睿
杨伟
《西北农林科技大学学报（自然科学版）》
CSCD
北大核心
2024年第1期87-97,共11页
【目的】筛选长足大竹象(Cyrtotrachelus buqueti)信息素结合蛋白CbuqPBP2的互作蛋白,为实现利用信息物质对长足大竹象种群持续控制提供参考。【方法】利用GST pull-down联合质谱技术,对长足大竹象信息素结合蛋白CbuqPBP2的互作蛋白进...
【目的】筛选长足大竹象(Cyrtotrachelus buqueti)信息素结合蛋白CbuqPBP2的互作蛋白,为实现利用信息物质对长足大竹象种群持续控制提供参考。【方法】利用GST pull-down联合质谱技术,对长足大竹象信息素结合蛋白CbuqPBP2的互作蛋白进行筛选、鉴定和分析,并采用酵母双杂交试验验证了CbuqPBP2与信息素结合蛋白CbuqPBP1的特异性互作。【结果】GST pull-down共筛选出45个与长足大竹象信息素结合蛋白CbuqPBP2特异性结合的候选互作蛋白,包括CbuqPBP1、ND2、CYTB。这些互作蛋白主要参与细胞过程、定位、代谢过程、应激反应以及生物调控等多个生物学过程。使用酵母双杂交体系,构建了pGADT7-PBP1重组猎物质粒与pGBKT7-PBP2重组诱饵质粒,通过诱饵质粒毒性检测和自激活检测,表明重组诱饵质粒对Y2HGold酵母菌无毒性作用。共转化验证结果显示,诱饵质粒pGBKT7-PBP2共转化酵母菌株能够在TDO培养基上生长。【结论】CbuqPBP2和CbuqPBP1之间有相互作用,不同信息素结合蛋白间的互作对深入理解长足大竹象嗅觉感受机制提供了新的思路。
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关键词
长足大竹象
信息素结合蛋白
蛋白互作
酵母双杂交
GST
pull-down
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职称材料
基于MaxEnt的松墨天牛在中国的潜在分布及其对气候变化的响应
被引量：
1
3
作者
刘勇
李祥乾
+2 位作者
李阳娣
杨伟
杨桦
《四川林业科技》
2024年第2期78-87,共10页
由于世界气候变暖而导致的害虫空间分布格局的巨大变化,增加了害虫预防难度。通过MaxEnt模型,结合GIS方法,模拟松墨天牛在中国的潜在分布区,预测、对比、分析松墨天牛在未来3种气候情景(RCP2.6、RCP4.5和RCP8.5)下分布范围和空间布局,...
由于世界气候变暖而导致的害虫空间分布格局的巨大变化,增加了害虫预防难度。通过MaxEnt模型,结合GIS方法,模拟松墨天牛在中国的潜在分布区,预测、对比、分析松墨天牛在未来3种气候情景(RCP2.6、RCP4.5和RCP8.5)下分布范围和空间布局,及其中心节点移动的规律。结果表明:所有AUC值均超过0.95,准确性也处于“极好”的状态。在当前气候环境下,松墨天牛在中国的适生区范围为90°~125°E,20°~41°N,由西向东呈连续分布,集中分布于我国东南部;在未来气候条件下,中适生区面积减少,低适生区、高适生区面积增加,并向高纬度、高海拔地区扩散,RCP8.5扩散范围最大。适生区中心点向西北、东北方向迁移,迁移趋势在高浓度排放情景下(RCP 8.5)响应最为剧烈。为松墨天牛的合理区划提供了有效手段,为应对气候变暖提供了理论依据。
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关键词
松墨天牛
MAXENT
全球气候变暖
适生区
中心点位移
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职称材料
题名
花椒锈病抗性相关的SNP分子标记筛选
1
作者
张宾珊
阮若玉
肖欣竹
叶萌
胡映霞
崔慧
尹妍吉
韩珊
贾玉珍
机构
四川
农业大学林学院
四川省
森林
和草原防火监测中心
四川省教育厅森林保护重点实验室
四川省
林业科学研究院
森林保护
研究所
出处
《四川农业大学学报》
北大核心
2025年第1期148-158,共11页
基金
四川省科技厅面上项目(2024NSFSC0327)。
文摘
【目的】开发和筛选与花椒锈病抗性相关的SNP分子标记,实现不同花椒品种(系)锈病高效精准的抗性分子鉴定。【方法】基于花椒转录组测序(RNA-Seq)结果,开发出可能与抗性相关的SNP标记,在抗感差异材料中验证与花椒锈病抗性相关的SNP引物。【结果】以12份抗病株系和感病株系基因组DNA为模板,与人工接种鉴定相结合,获得1个与花椒抗锈病相关的SNP标记,该标记在抗病材料中能够扩增出1条325 bp左右大小的条带(命名为30616-314-2)。使用此引物对现有40份花椒种质资源进行抗性鉴定,获得抗病材料14份,感病材料26份。【结论】筛选出了1个可以用于花椒抗锈病辅助育种选择的SNP分子标记,加速推进花椒抗锈病育种进程。
关键词
花椒锈病
SNP分子标记
转录组
抗性鉴定
Keywords
Zanthoxylum bungeanum rust
SNP molecular marker
transcriptome
resistance identification
分类号
S718.3 [农业科学—林学]
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职称材料
题名
长足大竹象信息素结合蛋白CbuqPBP2互作蛋白的筛选与验证
被引量：
1
2
作者
杨桦
李祥乾
王帆
方睿
杨伟
机构
四川
农业大学林学院
四川省教育厅森林保护重点实验室
康定市林业和草原局
出处
《西北农林科技大学学报（自然科学版）》
CSCD
北大核心
2024年第1期87-97,共11页
基金
四川省科技厅国际合作项目(2021YFH0160)。
文摘
【目的】筛选长足大竹象(Cyrtotrachelus buqueti)信息素结合蛋白CbuqPBP2的互作蛋白,为实现利用信息物质对长足大竹象种群持续控制提供参考。【方法】利用GST pull-down联合质谱技术,对长足大竹象信息素结合蛋白CbuqPBP2的互作蛋白进行筛选、鉴定和分析,并采用酵母双杂交试验验证了CbuqPBP2与信息素结合蛋白CbuqPBP1的特异性互作。【结果】GST pull-down共筛选出45个与长足大竹象信息素结合蛋白CbuqPBP2特异性结合的候选互作蛋白,包括CbuqPBP1、ND2、CYTB。这些互作蛋白主要参与细胞过程、定位、代谢过程、应激反应以及生物调控等多个生物学过程。使用酵母双杂交体系,构建了pGADT7-PBP1重组猎物质粒与pGBKT7-PBP2重组诱饵质粒,通过诱饵质粒毒性检测和自激活检测,表明重组诱饵质粒对Y2HGold酵母菌无毒性作用。共转化验证结果显示,诱饵质粒pGBKT7-PBP2共转化酵母菌株能够在TDO培养基上生长。【结论】CbuqPBP2和CbuqPBP1之间有相互作用,不同信息素结合蛋白间的互作对深入理解长足大竹象嗅觉感受机制提供了新的思路。
关键词
长足大竹象
信息素结合蛋白
蛋白互作
酵母双杂交
GST
pull-down
Keywords
Cyrtotrachelus buqueti
pheromone binding protein(PBPs)
protein interaction
yeast two-hybrid system
GST pull-down
分类号
S763.306.1 [农业科学—森林保护学]
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职称材料
题名
基于MaxEnt的松墨天牛在中国的潜在分布及其对气候变化的响应
被引量：
1
3
作者
刘勇
李祥乾
李阳娣
杨伟
杨桦
机构
兴文县林业和竹业发展服务中心
康定市林业和草原局
四川
农业大学林学院
四川省教育厅森林保护重点实验室
出处
《四川林业科技》
2024年第2期78-87,共10页
基金
四川省科技厅国际合作项目(2021YFH0160)。
文摘
由于世界气候变暖而导致的害虫空间分布格局的巨大变化,增加了害虫预防难度。通过MaxEnt模型,结合GIS方法,模拟松墨天牛在中国的潜在分布区,预测、对比、分析松墨天牛在未来3种气候情景(RCP2.6、RCP4.5和RCP8.5)下分布范围和空间布局,及其中心节点移动的规律。结果表明:所有AUC值均超过0.95,准确性也处于“极好”的状态。在当前气候环境下,松墨天牛在中国的适生区范围为90°~125°E,20°~41°N,由西向东呈连续分布,集中分布于我国东南部;在未来气候条件下,中适生区面积减少,低适生区、高适生区面积增加,并向高纬度、高海拔地区扩散,RCP8.5扩散范围最大。适生区中心点向西北、东北方向迁移,迁移趋势在高浓度排放情景下(RCP 8.5)响应最为剧烈。为松墨天牛的合理区划提供了有效手段,为应对气候变暖提供了理论依据。
关键词
松墨天牛
MAXENT
全球气候变暖
适生区
中心点位移
Keywords
Monochamus alternatus Hope
MaxEnt
global warming
suitable area
mean point migration
分类号
S763.38 [农业科学—森林保护学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
花椒锈病抗性相关的SNP分子标记筛选
张宾珊
阮若玉
肖欣竹
叶萌
胡映霞
崔慧
尹妍吉
韩珊
贾玉珍
《四川农业大学学报》
北大核心
2025
0
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
长足大竹象信息素结合蛋白CbuqPBP2互作蛋白的筛选与验证
杨桦
李祥乾
王帆
方睿
杨伟
《西北农林科技大学学报（自然科学版）》
CSCD
北大核心
2024
1
在线阅读
下载PDF
职称材料
3
基于MaxEnt的松墨天牛在中国的潜在分布及其对气候变化的响应
刘勇
李祥乾
李阳娣
杨伟
杨桦
《四川林业科技》
2024
1
在线阅读
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职称材料
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