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PRKCH的表达对CD8^(+)T细胞功能及黑色素瘤免疫治疗的影响
被引量：
1
1
作者
余忍忍
吕浩
+4 位作者
储涵
金铮
贾罄竹
陈德高
朱波
《陆军军医大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第6期556-566,共11页
目的 探讨PRKCH表达对CD8^(+)T细胞功能的影响及其在黑色素瘤免疫治疗效果预测中的作用。方法 运用Kaplan-Meier法分析黑色素瘤免疫治疗队列以及肿瘤基因组图谱(TCGA)数据中PRKCH在黑色素瘤中的表达及其与总生存期(overall survival, OS...
目的 探讨PRKCH表达对CD8^(+)T细胞功能的影响及其在黑色素瘤免疫治疗效果预测中的作用。方法 运用Kaplan-Meier法分析黑色素瘤免疫治疗队列以及肿瘤基因组图谱(TCGA)数据中PRKCH在黑色素瘤中的表达及其与总生存期(overall survival, OS)的相关性。利用单细胞RNA测序(single-cell RNA-sequencing, scRNA-seq)数据分析PRKCH的细胞表达群体,利用蛋白质互作网络(protein-protein interaction networks, PPI)和基因集富集分析(gene set enrichment analysis, GSEA)评估PRKCH诱导抗肿瘤免疫应答的机制。利用逆转录病毒过表达和敲减PRKCH,检测小鼠CD8^(+)T细胞功能。利用B16-OVA小鼠黑色素瘤模型验证PRKCH过表达的OT-1 CD8^(+)T细胞对肿瘤生长的影响。结果 在黑色素瘤免疫治疗队列和TCGA数据中,高水平的PRKCH显著延长患者OS(P<0.05)。scRNA-seq分析显示PRKCH可以在T细胞表达。PPI、GSEA和scRNA-seq分析显示PRKCH的高表达与更多的细胞毒性和记忆性T细胞形成相关。过表达和敲减PRKCH分别增强和减少CD8^(+)T细胞的增殖及IFN-γ、Granzyme B的表达。过表达PRKCH增强OT-1 CD8^(+)T细胞的肿瘤抑制能力。结论 PRKCH增强CD8^(+)T细胞抑制肿瘤进展的能力,并可以用于预测黑色素瘤免疫治疗效果。
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关键词
PRKCH
黑色素瘤
免疫治疗
肿瘤微环境
CD8^(+)T细胞
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职称材料
肿瘤生物信息学数据库
被引量：
8
2
作者
杨健
蔡浩洋
《生物技术通报》
CAS
CSCD
北大核心
2015年第11期89-101,共13页
恶性肿瘤已经成为严重危害人类健康的主要疾病之一。近年来,高通量检测技术迅速发展,成为肿瘤研究的重要手段之一,使得与肿瘤相关的组学数据迅速积累。这些数据对于研究肿瘤的发生发展机制具有重要意义。对海量生物学数据的管理和挖掘...
恶性肿瘤已经成为严重危害人类健康的主要疾病之一。近年来,高通量检测技术迅速发展,成为肿瘤研究的重要手段之一,使得与肿瘤相关的组学数据迅速积累。这些数据对于研究肿瘤的发生发展机制具有重要意义。对海量生物学数据的管理和挖掘已经成为癌症研究的基础与重要方向。主要介绍人类肿瘤研究中经常用到的生物信息学数据库,包括综合性数据库、基因组、转录组、蛋白组、表观遗传组数据库等。在总结国内外肿瘤数据库发展现状的基础上,讨论了目前数据库开发存在的问题,旨为现有的研究提供帮助。
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关键词
生物信息学
数据库
生物学大数据
肿瘤
组学数据
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职称材料
染色体粉碎——基因组灾难性事件产物
3
作者
杨健
蔡浩洋
《生物化学与生物物理进展》
SCIE
CAS
CSCD
北大核心
2017年第1期21-30,共10页
"染色体粉碎"是最初在肿瘤细胞中发现的一种复杂的基因组重排现象.在该事件中,细胞的一条或几条染色体在短时间内发生大量的DNA双链断裂,形成小的DNA碎片,之后这些碎片被细胞的DNA修复机制随机地拼接起来,形成新的染色体.染...
"染色体粉碎"是最初在肿瘤细胞中发现的一种复杂的基因组重排现象.在该事件中,细胞的一条或几条染色体在短时间内发生大量的DNA双链断裂,形成小的DNA碎片,之后这些碎片被细胞的DNA修复机制随机地拼接起来,形成新的染色体.染色体粉碎事件会造成大量的基因组重排,引起DNA拷贝数的变异和基因融合,从而导致正常细胞向肿瘤细胞的快速转化.这与传统的癌症发生理论不同,传统理论认为肿瘤的发生是由基因突变逐步积累而导致的,因此染色体粉碎现象可能揭示了一种肿瘤发生的新机制.目前,该现象的内在机制还不完全清楚,其判别标准也存在争议.本文综述了近年来关于染色体粉碎现象的判别标准和产生机制,探讨了该现象与肿瘤发生发展的关系,为进一步研究染色体粉碎事件提供参考.
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关键词
染色体粉碎
DNA断裂
基因组重排
肿瘤
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职称材料
题名
PRKCH的表达对CD8^(+)T细胞功能及黑色素瘤免疫治疗的影响
被引量：
1
1
作者
余忍忍
吕浩
储涵
金铮
贾罄竹
陈德高
朱波
机构
温州医科
大学
附属第一医院肿瘤科
陆军军医
大学
(第三军医
大学
)第二附属医院肿瘤科
四川大学生命科学学院生长代谢衰老研究中心
上海仁东医学检验所有限公司
肿瘤免疫治疗重庆市重点实验室
出处
《陆军军医大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第6期556-566,共11页
基金
国家杰出青年科学基金资助项目(81925030)。
文摘
目的 探讨PRKCH表达对CD8^(+)T细胞功能的影响及其在黑色素瘤免疫治疗效果预测中的作用。方法 运用Kaplan-Meier法分析黑色素瘤免疫治疗队列以及肿瘤基因组图谱(TCGA)数据中PRKCH在黑色素瘤中的表达及其与总生存期(overall survival, OS)的相关性。利用单细胞RNA测序(single-cell RNA-sequencing, scRNA-seq)数据分析PRKCH的细胞表达群体,利用蛋白质互作网络(protein-protein interaction networks, PPI)和基因集富集分析(gene set enrichment analysis, GSEA)评估PRKCH诱导抗肿瘤免疫应答的机制。利用逆转录病毒过表达和敲减PRKCH,检测小鼠CD8^(+)T细胞功能。利用B16-OVA小鼠黑色素瘤模型验证PRKCH过表达的OT-1 CD8^(+)T细胞对肿瘤生长的影响。结果 在黑色素瘤免疫治疗队列和TCGA数据中,高水平的PRKCH显著延长患者OS(P<0.05)。scRNA-seq分析显示PRKCH可以在T细胞表达。PPI、GSEA和scRNA-seq分析显示PRKCH的高表达与更多的细胞毒性和记忆性T细胞形成相关。过表达和敲减PRKCH分别增强和减少CD8^(+)T细胞的增殖及IFN-γ、Granzyme B的表达。过表达PRKCH增强OT-1 CD8^(+)T细胞的肿瘤抑制能力。结论 PRKCH增强CD8^(+)T细胞抑制肿瘤进展的能力,并可以用于预测黑色素瘤免疫治疗效果。
关键词
PRKCH
黑色素瘤
免疫治疗
肿瘤微环境
CD8^(+)T细胞
Keywords
PRKCH
melanoma
immunotherapy
tumor microenvironment
CD8^(+)T cells
分类号
R394.3 [医药卫生—医学遗传学]
R730.51 [医药卫生—肿瘤]
R739.5 [医药卫生—肿瘤]
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职称材料
题名
肿瘤生物信息学数据库
被引量：
8
2
作者
杨健
蔡浩洋
机构
四川大学生命科学学院生长代谢衰老研究中心
出处
《生物技术通报》
CAS
CSCD
北大核心
2015年第11期89-101,共13页
文摘
恶性肿瘤已经成为严重危害人类健康的主要疾病之一。近年来,高通量检测技术迅速发展,成为肿瘤研究的重要手段之一,使得与肿瘤相关的组学数据迅速积累。这些数据对于研究肿瘤的发生发展机制具有重要意义。对海量生物学数据的管理和挖掘已经成为癌症研究的基础与重要方向。主要介绍人类肿瘤研究中经常用到的生物信息学数据库,包括综合性数据库、基因组、转录组、蛋白组、表观遗传组数据库等。在总结国内外肿瘤数据库发展现状的基础上,讨论了目前数据库开发存在的问题,旨为现有的研究提供帮助。
关键词
生物信息学
数据库
生物学大数据
肿瘤
组学数据
Keywords
bioinformatics
database
biological big data
tumor
OMICs data
分类号
R730 [医药卫生—肿瘤]
Q811.4 [生物学—生物工程]
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职称材料
题名
染色体粉碎——基因组灾难性事件产物
3
作者
杨健
蔡浩洋
机构
四川大学生命科学学院生长代谢衰老研究中心
出处
《生物化学与生物物理进展》
SCIE
CAS
CSCD
北大核心
2017年第1期21-30,共10页
基金
国家自然科学基金资助项目(31571314)~~
文摘
"染色体粉碎"是最初在肿瘤细胞中发现的一种复杂的基因组重排现象.在该事件中,细胞的一条或几条染色体在短时间内发生大量的DNA双链断裂,形成小的DNA碎片,之后这些碎片被细胞的DNA修复机制随机地拼接起来,形成新的染色体.染色体粉碎事件会造成大量的基因组重排,引起DNA拷贝数的变异和基因融合,从而导致正常细胞向肿瘤细胞的快速转化.这与传统的癌症发生理论不同,传统理论认为肿瘤的发生是由基因突变逐步积累而导致的,因此染色体粉碎现象可能揭示了一种肿瘤发生的新机制.目前,该现象的内在机制还不完全清楚,其判别标准也存在争议.本文综述了近年来关于染色体粉碎现象的判别标准和产生机制,探讨了该现象与肿瘤发生发展的关系,为进一步研究染色体粉碎事件提供参考.
关键词
染色体粉碎
DNA断裂
基因组重排
肿瘤
Keywords
chromothripsis
DNA breakage
genome rearrangement
cancer
分类号
Q7 [生物学—分子生物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
PRKCH的表达对CD8^(+)T细胞功能及黑色素瘤免疫治疗的影响
余忍忍
吕浩
储涵
金铮
贾罄竹
陈德高
朱波
《陆军军医大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2024
1
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职称材料
2
肿瘤生物信息学数据库
杨健
蔡浩洋
《生物技术通报》
CAS
CSCD
北大核心
2015
8
在线阅读
下载PDF
职称材料
3
染色体粉碎——基因组灾难性事件产物
杨健
蔡浩洋
《生物化学与生物物理进展》
SCIE
CAS
CSCD
北大核心
2017
0
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职称材料
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