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三七根差异基因表达序列标签生物信息学分析
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作者 和凤美 朱永平 张义正 《山东农业大学学报(自然科学版)》 CSCD 北大核心 2008年第4期524-532,共9页
本研究利用生物信息学方法,对从三七根抑制消减杂交cDNA文库中随机挑选的91个EST序列进行了分析。结果表明:91个克隆组装分析后有4个重叠群和83个单拷贝EST,代表了87个基因。已知功能的基因序列共58个,占66%,按基因功能分类为10类,其中... 本研究利用生物信息学方法,对从三七根抑制消减杂交cDNA文库中随机挑选的91个EST序列进行了分析。结果表明:91个克隆组装分析后有4个重叠群和83个单拷贝EST,代表了87个基因。已知功能的基因序列共58个,占66%,按基因功能分类为10类,其中大多基因与代谢途径和分泌途径有关。未知功能基因序列29个,占33%。对33个氨基酸序列可通读的EST进行跨膜结构和信号肽分析,结果表明:9个克隆有信号肽,其中3个克隆有跨膜结构,可能为膜蛋白,6个克隆可能为分泌蛋白。功能位点分析结果表明:大多数基因与胞外分泌,调节细胞凋亡和细胞周期,信号传导有关。功能结构域分析结果表明:除9个克隆没有预测到功能结构域外,其它克隆的结构域与信号传导,转录调控,电子传递,协迫,光合作用,蛋白折叠等有关。亚细胞定位大多数位于细胞质和细胞核。 展开更多
关键词 三七 生物信息学 差异表达 表达序列标签
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用cDNA微阵列技术快速筛选粗毛栓菌的表达基因(英文) 被引量:1
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作者 孙迅 江明锋 +1 位作者 李校 张义正 《生物化学与生物物理进展》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2004年第4期356-360,共5页
利用cDNA微阵列技术快速筛选具有较强降解木质纤维素能力的白腐真菌粗毛栓菌 (Trametesgallica)的表达基因 .利用木质素生物降解模式菌株黄孢原毛平革菌 (Phanerochaetechrysosporium)的cDNA制备研究所用微阵列 .在含有2 5 96个cDNA片... 利用cDNA微阵列技术快速筛选具有较强降解木质纤维素能力的白腐真菌粗毛栓菌 (Trametesgallica)的表达基因 .利用木质素生物降解模式菌株黄孢原毛平革菌 (Phanerochaetechrysosporium)的cDNA制备研究所用微阵列 .在含有2 5 96个cDNA片段的芯片上共检测到 172个阳性克隆 ,其中有 16 5个克隆的荧光信号比值 (Cy 5 /Cy 3)在 0 5和 2 0之间 ,占所检测阳性克隆数的 95 9% .对应于在限氮条件下生长 5天和 12天的粗毛栓菌培养物 ,分别有 3个和 4个时序特异性差异表达基因 .随机挑取 12 2个克隆进行测序和序列比对 ,发现所测序列中有 118个能够很好地定位于黄孢原毛平革菌的基因组上 .结果显示 ,粗毛栓菌与黄孢原毛平革菌在表达序列上存在较大差异 ,表明这两种真菌之间存在着较远的亲缘关系 .通过同源性比对分析 ,发现 2个令人感兴趣的克隆 ,一个对应于黄孢原毛平革菌过氧化物酶基因lpoB的部分片段 ,另一个为编码一种热激蛋白的基因 . 展开更多
关键词 CDNA微阵列 粗毛栓菌 黄孢原毛平革菌 同源性分析 克隆
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豆豉溶栓酶工程菌的发酵条件及重组溶栓酶的分离纯化 被引量:12
3
作者 肖璐 张仁怀 张义正 《食品与发酵工业》 CAS CSCD 北大核心 2005年第1期66-69,73,共5页
对豆豉溶栓酶工程菌株WB DFE5进行了摇瓶发酵条件的研究 ,确定了发酵的优化条件为 :可溶性淀粉 2 % ,酪蛋白 2 % ,大豆蛋白胨 0 5 % ,酵母粉 0 15 % ,K2 HPO40 2 5 % ,KH2 PO40 0 5 % ,CaCl2 0 0 2 % ,MgSO40 0 5 % ,pH7 0。通过... 对豆豉溶栓酶工程菌株WB DFE5进行了摇瓶发酵条件的研究 ,确定了发酵的优化条件为 :可溶性淀粉 2 % ,酪蛋白 2 % ,大豆蛋白胨 0 5 % ,酵母粉 0 15 % ,K2 HPO40 2 5 % ,KH2 PO40 0 5 % ,CaCl2 0 0 2 % ,MgSO40 0 5 % ,pH7 0。通过硫酸铵分段盐析、离子交换和凝胶过滤 ,从 1L工程菌株WB DFE5的发酵液中分离纯化出 12 5mg重组豆豉溶栓酶 ,酶的比活为 5 918 7IU/mg。 展开更多
关键词 豆豉 溶栓酶 大豆蛋白 可溶性淀粉 分离纯化 酪蛋白 发酵条件 酶工程 过硫酸铵 摇瓶发酵
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枯草杆菌DC-2纳豆激酶基因的克隆及其融合蛋白在E.coli中的表达 被引量:21
4
作者 彭勇 黄庆 张义正 《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2002年第5期559-563,共5页
纳豆激酶是一种纤维蛋白溶解酶 ,有望开发成为新型的溶栓药物 .从中国豆豉中分离的具有较强纤溶活性的枯草杆菌DC 2中提取总DNA ,根据纳豆激酶 (NK)基因序列设计引物 ,用PCR法扩增NK基因 .序列分析表明 ,NK基因成熟肽编码区含有 82 5bp ... 纳豆激酶是一种纤维蛋白溶解酶 ,有望开发成为新型的溶栓药物 .从中国豆豉中分离的具有较强纤溶活性的枯草杆菌DC 2中提取总DNA ,根据纳豆激酶 (NK)基因序列设计引物 ,用PCR法扩增NK基因 .序列分析表明 ,NK基因成熟肽编码区含有 82 5bp ,编码 2 75个氨基酸残基 ,与文献报道的序列分别有 93 4 %和 94 5 %同源性 .将NK基因插入载体pGEX 4T1构建表达质粒pGEX NK ,转化大肠杆菌JM10 9后 ,经 1mmol LIPTG诱导 4h ,发现大量NK融合蛋白表达 ,并形成包涵体 .SDS PAGE分析表明 ,NK融合蛋白作为包涵体的分子量为 5 3kD .凝胶自动扫描结果显示 ,NK融合蛋白约占菌体可溶性蛋白的 2 6 % . 展开更多
关键词 枯草杆菌DC-2 纳豆激酶基因 融合蛋白 基因克隆 基因表达 大肠杆菌
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大肠杆菌细胞周质底物结合蛋白gsiB基因的克隆及其表达条件的优化 被引量:12
5
作者 王中山 向泉桔 +1 位作者 王海燕 张义正 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2010年第5期505-511,共7页
为深入研究大肠杆菌谷胱甘肽转运系统的蛋白质结构和功能,对该系统中的gsiB基因进行了克隆和表达条件的优化。根据大肠杆菌谷胱甘肽转运系统中底物结合蛋白gsiB基因序列,利用PCR方法扩增到该基因的编码区序列,利用SLIC(Sequence and lig... 为深入研究大肠杆菌谷胱甘肽转运系统的蛋白质结构和功能,对该系统中的gsiB基因进行了克隆和表达条件的优化。根据大肠杆菌谷胱甘肽转运系统中底物结合蛋白gsiB基因序列,利用PCR方法扩增到该基因的编码区序列,利用SLIC(Sequence and ligation–independent cloning)方法直接将其插入pWaldo-GFPe中,成功构建了重组表达质粒pWaldo-GFP-GsiB。将重组质粒转化不同的大肠杆菌表达菌株进行诱导表达,通过改变培养温度和IPTG浓度等条件,得到了能够大量表达目标蛋白的重组子。结果表明:大肠杆菌BL21(DE3)是gsiB基因表达的最佳宿主菌;18℃低温诱导培养有利于gsiB基因的大量表达;0.1mmol/LIPTG足够诱导gsiB基因表达,增加IPTG浓度(0.1mmol/L~1.0mmol/L)并不能明显地促进gsiB基因的表达。Western blotting结果显示目标蛋白质有表达,其分子量大小与预期相符。 展开更多
关键词 大肠杆菌 谷胱甘肽转运系统 细胞周质底物结合蛋白 gsiB基因 基因表达 蛋白质印迹
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甘薯谷胱甘肽-S-转移酶基因在胁迫条件下的表达分析 被引量:12
6
作者 刘珣 何博文 张义正 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2009年第8期859-864,共6页
成功地构建了甘薯谷胱甘肽-S-转移酶基因IBGSTU1的原核表达质粒pET-IbGST,并在大肠杆菌BL21(DE3)中进行IPTG诱导表达。重组蛋白部分以包涵体形式存在,部分以可溶性蛋白形式存在。酶活性测定表明可溶的重组蛋白具有GST的活性。纯化的重... 成功地构建了甘薯谷胱甘肽-S-转移酶基因IBGSTU1的原核表达质粒pET-IbGST,并在大肠杆菌BL21(DE3)中进行IPTG诱导表达。重组蛋白部分以包涵体形式存在,部分以可溶性蛋白形式存在。酶活性测定表明可溶的重组蛋白具有GST的活性。纯化的重组蛋白质用于多克隆抗体的制备。半定量RT-PCR和Western blotting分析结果显示,在正常的生长条件下,甘薯组织不启动IBGSTU1基因的转录和翻译,但是在冷胁迫或重金属离子等的作用下,可以检测到该基因的mRNA和编码的蛋白质,表明该基因在甘薯的胁迫耐受中行使重要功能,并发现该基因的表达具有组织特异性。 展开更多
关键词 甘薯 谷胱甘肽-S-转移酶 基因表达 冷胁迫 重金属诱导 RT-PCR 蛋白质印迹
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碱性脂肪酶产生菌的筛选及产酶条件的优化 被引量:13
7
作者 牛冬云 张义正 《食品与发酵工业》 CAS CSCD 北大核心 2003年第5期28-31,共4页
通过固体平板法从含油脂土样中筛选出一株产碱性脂肪酶活力较高的菌株 ,鉴定为解淀粉芽孢杆菌。此菌最佳产酶条件为 :1%淀粉为碳源 ,2 %黄豆粉和 2 %玉米粉为氮源 ,培养基起始 pH 7.0 ,3 0℃培养 72h。对发酵液性质进行初步研究发现 ,... 通过固体平板法从含油脂土样中筛选出一株产碱性脂肪酶活力较高的菌株 ,鉴定为解淀粉芽孢杆菌。此菌最佳产酶条件为 :1%淀粉为碳源 ,2 %黄豆粉和 2 %玉米粉为氮源 ,培养基起始 pH 7.0 ,3 0℃培养 72h。对发酵液性质进行初步研究发现 ,此酶最适反应温度为3 7℃ ,最佳反应 pH为 8.5。 0 .0 1mol/LCa2 + 和K+ 对酶有激活作用 ,而Cu2 + 和Fe3 + 则对该酶有抑制作用。 展开更多
关键词 碱性脂肪酶产生菌 筛选 产酶条件 优化 解淀粉芽孢杆菌 酶性质
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利用血红蛋白基因提高短小芽孢杆菌在低氧条件下的碱性蛋白酶产量 被引量:3
8
作者 张风豪 王海燕 +4 位作者 何明雄 李羚锐 杨春晖 葛建 张义正 《高技术通讯》 CAS CSCD 北大核心 2007年第7期755-760,共6页
将透明颤菌血红蛋白基因vgb成熟肽编码区序列分别与枯草芽孢杆菌(Bacillus subtilis)P43双启动子和短小芽孢杆菌(B. pumilus)碱性蛋白酶基因启动子wBp连接,利用大肠杆菌-枯草芽孢杆菌穿梭载体pSUGV4分别构建组成型表达质粒pSUP43Vgb... 将透明颤菌血红蛋白基因vgb成熟肽编码区序列分别与枯草芽孢杆菌(Bacillus subtilis)P43双启动子和短小芽孢杆菌(B. pumilus)碱性蛋白酶基因启动子wBp连接,利用大肠杆菌-枯草芽孢杆菌穿梭载体pSUGV4分别构建组成型表达质粒pSUP43Vgb和pSUwBpVgb,将其分别转化短小芽孢杆菌UN-31-C-11.SDS-PAGE和CO差异光谱检测表明,融合基因在UN-31-C-11中均得到了表达,并且表达质粒使重组菌株在低氧条件下的生长量在对数生长后期超过对照菌株20%以上,同时促进了短小芽孢杆菌碱性蛋白酶基因的表达,其产量高于对照30%以上. 展开更多
关键词 透明颤菌血红蛋白基因(vgb) 基因启动子 穿梭载体 短小芽孢杆菌 基因表达
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黄孢原毛平革菌乙醇脱氢酶基因的克隆和表达 被引量:2
9
作者 何川 吴近名 +2 位作者 张希根 吴波 张义正 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2009年第5期546-551,共6页
乙醇是黄孢原毛平革菌(Phanerochaete chrysosporium)在限氧培养条件下重要的代谢物之一,为了更好的理解P.chrysosporium在低氧条件下的代谢机制,文章从P.chrysosporium中克隆到一个长1071 bp的乙醇脱氢酶基因PCAdh1 cDNA,该基因编码一... 乙醇是黄孢原毛平革菌(Phanerochaete chrysosporium)在限氧培养条件下重要的代谢物之一,为了更好的理解P.chrysosporium在低氧条件下的代谢机制,文章从P.chrysosporium中克隆到一个长1071 bp的乙醇脱氢酶基因PCAdh1 cDNA,该基因编码一个由356个氨基酸组成的蛋白质,它与其他生物的乙醇脱氢酶的氨基酸序列的相似性很低,但酶催化活性位点序列却高度保守。将PCAdh1在大肠杆菌中表达,并获得有酶活性的重组蛋白。纯化的蛋白质用于制备抗体。半定量RT-PCR和Western blot分析结果显示,在限氧条件的培养过程中,PCAdh1基因在mRNA水平和蛋白水平上都保持相对稳定,表明该基因的表达是组成型的;但从菌丝体提取的粗蛋白中的乙醇脱氢酶活性却随着培养时间的增加及氧气含量的持续降低而逐渐升高,这暗示P.chrysospo-rium中存在其他低氧诱导型乙醇脱氢酶基因的表达。 展开更多
关键词 黄孢原毛平革菌 乙醇脱氢酶 基因克隆 基因表达 RT-PCR 蛋白质印迹
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甘薯非特异性脂质转移蛋白基因克隆与表达分析(英文) 被引量:1
10
作者 李雪丹 魏昌赫 +3 位作者 邵欢欢 吴燕 张义正 王海燕 《植物科学学报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第4期583-592,共10页
非特异脂质转移蛋白(ns LTP)是植物界普遍存在的一类涉及多种胁迫反应的可溶性蛋白。为了阐明甘薯中非特异性脂质转移蛋白基因IbLTP1和IbLTP2在盐胁迫反应中的功能,本研究运用PCR技术,对IbLTP1和IbLTP2基因进行了克隆,并通过生物信息学... 非特异脂质转移蛋白(ns LTP)是植物界普遍存在的一类涉及多种胁迫反应的可溶性蛋白。为了阐明甘薯中非特异性脂质转移蛋白基因IbLTP1和IbLTP2在盐胁迫反应中的功能,本研究运用PCR技术,对IbLTP1和IbLTP2基因进行了克隆,并通过生物信息学方法分析了序列结构、蛋白质保守结构域和系统进化关系;利用q RT-PCR方法检测了这两个基因在不同组织中的表达模式以及盐胁迫条件下的表达差异;将IbLTP1和IbLTP2基因克隆到大肠杆菌的原核表达载体p ET32a中,对重组菌BL21(p ET32a-LTP)的耐盐性进行分析。序列分析表明:IbLTP1和IbLTP2编码区均不含内含子并都具有等位基因。IbLTP1和IbLTP2基因的蛋白质序列分别包括114和94个氨基酸残基并且不含色氨酸残基,蛋白序列N端含有信号肽序列。保守结构域和系统进化分析结果表明:IbLTP1和IbLTP2均含有ns LTP蛋白的保守结构域,IbLTP1属于TypeⅠ而IbLTP2属于TypeⅡ。实时荧光定量PCR分析表明:IbLTP1在幼叶中表达量最高,根中表达量最低;而IbLTP2在茎中表达量最高,成熟叶中表达量最低。在Na Cl胁迫条件下,IbLTP1和IbLTP2表达量在根中基本无变化而在茎和叶中上调。大肠杆菌BL21(DE3)中异源表达IbLTP1和IbLTP2基因能够提高转基因菌株对Na Cl的耐受性。因此,本研究推测IbLTP1和IbLTP2基因可能在甘薯盐胁迫反应中发挥了作用。 展开更多
关键词 甘薯 非特异性脂质转移蛋白 氯化钠胁迫 基因克隆 基因表达 实时荧光定量PCR
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甘薯β—淀粉酶cDNA克隆及其在大肠杆菌中的表达 被引量:2
11
作者 张勇为 张义正 《高技术通讯》 EI CAS CSCD 2004年第9期29-33,共5页
用RT-PCR技术从甘薯新大紫(Ipornoea batatas Lam cv.Xindazi)块根总RNA中扩增出预期大小的DNA片段(约1.5kb)。将该片段克隆至pMD—T载体,经酶切分析和序列测定后,正向插入的重组子命名为pMD—cAmy,插入片段长1521bp,编码499个氨... 用RT-PCR技术从甘薯新大紫(Ipornoea batatas Lam cv.Xindazi)块根总RNA中扩增出预期大小的DNA片段(约1.5kb)。将该片段克隆至pMD—T载体,经酶切分析和序列测定后,正向插入的重组子命名为pMD—cAmy,插入片段长1521bp,编码499个氨基酸残基的多肽,分子量55998kD。克隆的β—淀粉酶cDNA与报道的甘薯另一品种Kokei No.14的mRNA有99%的序列相同,与Calystegia sepiumβ—淀粉酶mRNA有87%相同。重组子pMD—cAmy经IPTG诱导后,胞内可溶性提取物经凝胶电泳和活性染色,出现明显的淀粉酶活性带。SDS—PAGE表明,大肠杆菌表达的β-淀粉酶亚基的分子量约为50kD。重组子pMD—cAmy在淀粉平板上形成明显的水解圈,说明甘薯β-淀粉酶cDNA不仅能在大肠杆菌表达,而且能将有活性的β-淀粉酶分泌到胞外。对重组子pMD—cAmy和甘薯块根可溶性提取物的比较发现,大肠杆菌表达的β-淀粉酶与甘薯块根的β-淀粉酶除迁移率不同外,对淀粉酶活性抑制剂EDTA和β-巯基乙醇的敏感性相同。 展开更多
关键词 大肠杆菌表达 Β-淀粉酶 提取物 RNA RT-PCR技术 β-巯基乙醇 可溶性 甘薯 块根 薯块 CDNA克隆
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木质素降解条件下黄孢原毛平革菌lip基因转录调控序列的筛选与鉴定 被引量:1
12
作者 江明锋 张义正 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2005年第3期435-441,共7页
用DNA蛋白质体外结合实验和凝胶迁移率变动分析技术筛选黄孢原毛平革菌(Phanerochaetechrysospori um)木质素过氧化物酶基因lipA、lipC、lipF的5′端调控区内能与该菌在木质素降解条件下形成的蛋白特异结合的顺式作用元件。结果表明,来... 用DNA蛋白质体外结合实验和凝胶迁移率变动分析技术筛选黄孢原毛平革菌(Phanerochaetechrysospori um)木质素过氧化物酶基因lipA、lipC、lipF的5′端调控区内能与该菌在木质素降解条件下形成的蛋白特异结合的顺式作用元件。结果表明,来自lipC、lipF基因的5′端片段LG2P3(396bp)和LG6S12(738bp)能特异结合培养于Kirk低氮培养基中的菌丝体蛋白;而来自于lipF基因的5′端的LG6S2(226bp)DNA片段能特异结合培养于天然冷杉木片中的菌丝体蛋白。对这些片段的DNA序列分析表明,它们均存在各种顺式作用元件,由此推测它们可能是被一些木质素过氧化物酶基因转录调控相关的蛋白质所结合的序列。 展开更多
关键词 黄孢原毛平革菌 木质素过氧化物酶基因 凝胶迁移率变动分析 DNA结合蛋白 顺式作用元件
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粗毛栓菌cDNA文库的构建和漆酶基因的表达分析 被引量:3
13
作者 张希根 何川 张义正 《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2009年第6期528-533,共6页
粗毛栓菌(Trametesgallica)能够分泌多种胞外氧化酶并且快速降解木质纤维素.为了快速高效分离鉴定粗毛栓菌木质纤维素降解酶相关基因,用Trizol试剂提取不同培养条件下粗毛栓菌总RNA,用CreatorTM SMARTTM cDNA Library Construction Kit... 粗毛栓菌(Trametesgallica)能够分泌多种胞外氧化酶并且快速降解木质纤维素.为了快速高效分离鉴定粗毛栓菌木质纤维素降解酶相关基因,用Trizol试剂提取不同培养条件下粗毛栓菌总RNA,用CreatorTM SMARTTM cDNA Library Construction Kit和Advantage 2PCR Kit成功构建了该菌全长cDNA文库.原始文库滴度为1.5×105cfu,重组率达99%,插入片段在0.7~2.0kb之间,平均大小约1kb.随机取16个重组子进行测序,全长cDNA序列完整性率为85.7%;并筛选到1个漆酶基因,编码区长1551bp,预测的蛋白质由517个氨基酸残基组成,分子量为55.41kD,等电点为4.76.用半定量RT-PCR法分析了该漆酶基因在不同培养条件下的表达水平.结果显示,高浓度的碳源,氮源,Cu2+均能诱导此基因的表达,该结果为漆酶基因的表达调控机制的深入研究奠定了基础. 展开更多
关键词 粗毛栓菌 CDNA文库 漆酶 基因表达 反转录PCR分析
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短小芽孢杆菌碱性蛋白酶基因启动子的克隆、鉴定及其应用 被引量:3
14
作者 杨春晖 王海燕 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2007年第7期874-880,共7页
利用TAIL-PCR(Thermal asymmetric interlaced PCR)从短小芽孢杆菌基因组中扩增到碱性蛋白酶基因编码区上游的启动子片段。对该片段的序列测定和分析表明,此片段长797bp,但与基因表达有关的序列长约390bp。对启动子片段进行不同长度的... 利用TAIL-PCR(Thermal asymmetric interlaced PCR)从短小芽孢杆菌基因组中扩增到碱性蛋白酶基因编码区上游的启动子片段。对该片段的序列测定和分析表明,此片段长797bp,但与基因表达有关的序列长约390bp。对启动子片段进行不同长度的缺失突变,以获得最小的基因启动子片段,结果表明,该基因起始密码子上游约160bp的DNA片段就可以启动基因的表达。将含有该片段的碱性蛋白酶基因WApQ3插入大肠杆菌?芽孢杆菌穿梭质粒载体pSUGV4中,构建了碱性蛋白酶基因表达质粒pSUBpWApQ3。将该质粒分别转入枯草芽孢杆菌和短小芽孢杆菌中表达,可在胞外检测到碱性蛋白酶活性,最高酶活分别为466.5U/mL和3060U/mL。 展开更多
关键词 短小芽孢杆菌 枯草芽孢杆菌 碱性蛋白酶 基因启动子 基因表达
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西藏胡黄连根状茎差异表达基因的筛选及分析(英文)
15
作者 冯燕丽 马欣荣 +2 位作者 夏庆杰 谈心 张义正 《中山大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2009年第2期76-83,共8页
西藏胡黄连是著名的濒危西藏药材,其粗壮的根茎部是重要的合成和储存药用萜类物质器官,萜类含量显著高于叶部。为克隆西藏胡黄连根状茎和叶的差异表达基因,利用抑制消减杂交技术,构建了根状茎特定的抑制消减文库。从该SSH文库中随机挑... 西藏胡黄连是著名的濒危西藏药材,其粗壮的根茎部是重要的合成和储存药用萜类物质器官,萜类含量显著高于叶部。为克隆西藏胡黄连根状茎和叶的差异表达基因,利用抑制消减杂交技术,构建了根状茎特定的抑制消减文库。从该SSH文库中随机挑取片段不一的阳性克隆测序,采用B lastx进行同源比对,获得了27个表达序列标签(EST),并获登录号。序列统计分析结果表明,其中有11个EST在GenBank中无同源性序列,推测可能是新基因片断。蛋白质功能分类结果表明,这些蛋白质与翻译、能量代谢、转运与结合、细胞膜合成、氨基酸生物合成及中间代谢6大类蛋白功能有关。为深入研究与萜类生物合成直接或间接相关基因,选择了长595 bp的差异表达EST序列EX172715进行了同源比对和蛋白系统进化分析。结果表明,EX172715具有细胞色素P450单加氧酶的特征结构,与拟南芥的细胞色素P450单加氧酶蛋白的同源性高于水稻和小麦。提供了一组与西藏胡黄连次生代谢相关的新基因库。 展开更多
关键词 西藏胡黄连 根状茎特异表达基因 抑制消减杂交 表达序列标签 同源性分析 细胞色素P450单加氧酶
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