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海水养殖沉积环境微生物总DNA的提取方法研究 被引量:17
1
作者 傅莲英 席峰 +3 位作者 袁建军 王桂忠 田蕴 郑天凌 《厦门大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2006年第6期841-846,共6页
传统的微生物分离与培养技术:无法揭示微生物群落的动态变化.为了阐释虾池沉积环境微生态格局的原始组成情况,本研究先以TENP缓冲液去除沉积物中的腐殖酸。继之以溶菌酶-SDS温和裂解,其总DNA的提取效率达90%以上.所获DNA产量达2... 传统的微生物分离与培养技术:无法揭示微生物群落的动态变化.为了阐释虾池沉积环境微生态格局的原始组成情况,本研究先以TENP缓冲液去除沉积物中的腐殖酸。继之以溶菌酶-SDS温和裂解,其总DNA的提取效率达90%以上.所获DNA产量达2~20μg/g沉积物(湿),片段大小均在23kb左右,不经纯化即可直接进行PCR扩增和限制性酶切.以该DNA为模板进行PCR—DGGE分析,揭示了虾池沉积物丰富的微生物多样性,该方法是一种适用于虾池沉积物总DNA提取的简便、可靠方法. 展开更多
关键词 虾池 DNA提取 PCR 限制酶切 DGGE
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极地环境污染物的微生物降解及其生物修复研究进展 被引量:5
2
作者 曾胤新 郑天凌 《极地研究》 CAS CSCD 2008年第1期64-71,共8页
随着人类社会的发展及其对未知世界探索能力的提高,环境污染目前已演变成为全球性问题,即使是远离人类居住地的南北极地区也不能幸免。任何污染在极地这样一个生态系统组成单调、环境承载能力脆弱的地方都可能带来严重后果,因此极地环... 随着人类社会的发展及其对未知世界探索能力的提高,环境污染目前已演变成为全球性问题,即使是远离人类居住地的南北极地区也不能幸免。任何污染在极地这样一个生态系统组成单调、环境承载能力脆弱的地方都可能带来严重后果,因此极地环境的污染治理尤为迫切。生物修复技术作为环境治理的重要方法与手段,受到了普遍关注。本文简要介绍了极地环境的污染现状以及近年来应用微生物开展极地环境污染物降解与生物修复的主要进展,并就研究中的一些潜在问题展开讨论。极地环境的污染治理与生物修复,将是21世纪环境微生物学研究人员的一项重要使命。 展开更多
关键词 极地 污染 微生物 降解 生物修复
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红树林沉积物中的微生物对苯并[a]芘的降解研究 被引量:15
3
作者 骆苑蓉 胡忠 +1 位作者 郑天凌 黄栩 《厦门大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2005年第B06期75-79,共5页
采用高效液相色谱(HPLC)结合紫外检测研究了一组筛选自红树林沉积物中的混合菌,该混合菌能以苯并[a]芘(BaP)作为唯一碳源和能源进行代谢,结果表明,当BaP浓度为20mg·L-1时,培养63d后有32.85%的BaP被降解.经分离,此混合菌中包含5种菌... 采用高效液相色谱(HPLC)结合紫外检测研究了一组筛选自红树林沉积物中的混合菌,该混合菌能以苯并[a]芘(BaP)作为唯一碳源和能源进行代谢,结果表明,当BaP浓度为20mg·L-1时,培养63d后有32.85%的BaP被降解.经分离,此混合菌中包含5种菌,16SrDNA序列测定结果与GenBank数据库进行同源性比较,显示M151可能为一新种,其余4株菌分别为红球菌属(Rhodococcussp.),微小杆菌属(Exiguobacteriumsp.),节杆菌属(Arthrobactersp.),芽孢杆菌属(Bacillussp.),绘制了系统发育树,并对其系统发育进行分析.同时还强调了红树林微生物在BaP污染环境生物修复中作用的重要性. 展开更多
关键词 苯并[A]芘 红树林沉积物 微生物 高效液相色谱(HPLC) 降解 GENBANK数据库 16SRDNA序列 同源性比较 芽孢杆菌属 系统发育树 sp. 混合菌 紫外检测 红球菌属 测定结果 节杆菌属 生物修复 污染环境 BaP P浓度
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海洋微生物毒素研究进展 被引量:12
4
作者 王新 郑天凌 +1 位作者 胡忠 苏建强 《海洋科学》 CAS CSCD 北大核心 2006年第7期76-81,共6页
关键词 微生物毒素 海洋世界 生物活性物质 海洋微生物 生物功能材料 生物种类 资源化利用 信息物质 化学结构 河豚毒素
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海洋微生物研究的回顾与展望 被引量:11
5
作者 郑天凌 田蕴 +6 位作者 苏建强 李可 刘慧杰 杨小茹 郑伟 王桂忠 李少菁 《厦门大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2006年第A02期150-157,共8页
报道了本课题组近年来基于新理念、新技术在海洋污染环境的微生物修复、海洋赤潮灾害的微生物调控、海洋微生物对海域生物生产力的调控、海洋微生物资源的保护与利用等研究方面的新成果;介绍了微生态制剂在海水养殖中的应用和海洋极端... 报道了本课题组近年来基于新理念、新技术在海洋污染环境的微生物修复、海洋赤潮灾害的微生物调控、海洋微生物对海域生物生产力的调控、海洋微生物资源的保护与利用等研究方面的新成果;介绍了微生态制剂在海水养殖中的应用和海洋极端环境微生物研究的新趋势;展示了海洋中的微小生物对地球的巨大贡献.强调进一步开展海洋微生物研究的重要性、必要性、可行性和紧迫性. 展开更多
关键词 海洋微生物 生物修复 赤潮控制 水产微生态制剂 微食物环
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海洋环境中降解多环芳烃的微生物 被引量:11
6
作者 田蕴 郑天凌 《海洋科学》 CAS CSCD 北大核心 2004年第9期50-55,共6页
关键词 海洋环境 多环芳烃 微生物 污染物 生物降解
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厦门西港及其邻近海域沉积物中PAHs污染特征及生物修复研究建议 被引量:15
7
作者 田蕴 郑天凌 +2 位作者 王新红 骆苑蓉 张勇 《台湾海峡》 CAS CSCD 2003年第2期192-200,共9页
据 2 0 0 1年 7、1 0月 2个航次对厦门西港水产养殖海区沉积物中 1 6种优先监测的多环芳烃含量及 3种多环芳烃降解菌的数量进行研究 ,并与厦门西港及其邻近海域非养殖区的进行了比较 .结果表明 :其养殖区沉积物中能检测出的多环芳烃以 4... 据 2 0 0 1年 7、1 0月 2个航次对厦门西港水产养殖海区沉积物中 1 6种优先监测的多环芳烃含量及 3种多环芳烃降解菌的数量进行研究 ,并与厦门西港及其邻近海域非养殖区的进行了比较 .结果表明 :其养殖区沉积物中能检测出的多环芳烃以 4~ 6环的为主 ,并且含量明显高于非养殖区 .在养殖海区的沉积物中检测出的苯并 (b)荧蒽、吲哚芘和苯并 (ghi) 艹北等没有最低安全值的高分子量多环芳烃将直接威胁养殖水质和生物的安全 .3种多环芳烃 (菲、荧蒽、芘 )降解菌数量的最低值都出现在养殖海区 ,而这 3种多环芳烃含量的最高值也均出现在养殖海区 .在非养殖区的 3个站位的沉积物中 ,这 3种多环芳烃的含量与其降解菌数量之间存在着一定的相关性 .作者针对沿岸海域水产养殖区多环芳烃污染的现状与特点 。 展开更多
关键词 海洋化学 有机污染物 调查 分布 生物降解 海洋沉积物 福建 生物修复 多环芳烃
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深海微生物生态分布的若干特点 被引量:7
8
作者 席峰 郑天凌 +1 位作者 张瑶 焦念志 《海洋科学》 CAS CSCD 北大核心 2004年第2期64-68,共5页
关键词 深海 微生物 生态分布 细菌数量
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若干新技术研究海洋多环芳烃生物降解的进展 被引量:3
9
作者 陈双雅 郑天凌 胡忠 《台湾海峡》 CAS CSCD 2002年第4期504-515,共12页
综述了降解多环芳烃的海洋微生物种类及其降解途径的若干研究进展 ,介绍了研究中所应用到的 1 6SrDNA、PCR、DNA DNA杂交、变性凝胶梯度电泳、转座子诱变等分子生物学技术 ,分析了在海洋多环芳烃微生物降解研究中极具潜力的分子生物学... 综述了降解多环芳烃的海洋微生物种类及其降解途径的若干研究进展 ,介绍了研究中所应用到的 1 6SrDNA、PCR、DNA DNA杂交、变性凝胶梯度电泳、转座子诱变等分子生物学技术 ,分析了在海洋多环芳烃微生物降解研究中极具潜力的分子生物学技术如流式细胞技术、发光酶基因标记技术、生物芯片技术的应用前景 . 展开更多
关键词 多环芳烃 生物降解 海洋 分子生物学技术 流式细胞技术 生物芯片技术 微生物
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Microtox技术在印染废水污染监测中的应用研究 被引量:3
10
作者 王宾香 王慧 郑天凌 《厦门大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2008年第6期869-873,共5页
利用发光细菌毒性检测技术(Microtox)研究了Microtox技术对印染废水毒性检测的条件,活性染料及降解中间产物对发光细菌的毒性反应,并对柠檬酸杆菌降解活性染料降解过程进行了监测.结果表明:Microtox技术可以有效地监测活性染料及其微生... 利用发光细菌毒性检测技术(Microtox)研究了Microtox技术对印染废水毒性检测的条件,活性染料及降解中间产物对发光细菌的毒性反应,并对柠檬酸杆菌降解活性染料降解过程进行了监测.结果表明:Microtox技术可以有效地监测活性染料及其微生物降解中间产物的相对毒性;活性染料的毒性远大于代谢途径中间产物的毒性;活性染料降解过程中培养液萃取物的毒性逐渐降低,但上清液的毒性出现先下降而后又增大的趋势,推测是上清液中存在的中间产物和其它组成成分及pH变化综合作用的结果. 展开更多
关键词 发光菌 Microtox技术 生物毒性 环境检测
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应用双层平板技术评估海水沉积物中多环芳烃-芘的污染研究 被引量:5
11
作者 田蕴 郑天凌 《中国生态农业学报》 CAS CSCD 2004年第1期23-25,共3页
应用双层平板计数技术对厦门西海域海水沉积物中 4环多环芳烃 芘降解菌数量调研结果表明 ,除靠近马銮湾养殖区站位Ⅵ外 ,芘污染较严重站位Ⅳ样品中芘降解菌数量为 4 .7万个 /g(干物质量 ) ,而芘污染相对较轻站位Ⅱ样品中芘降解菌数量为 ... 应用双层平板计数技术对厦门西海域海水沉积物中 4环多环芳烃 芘降解菌数量调研结果表明 ,除靠近马銮湾养殖区站位Ⅵ外 ,芘污染较严重站位Ⅳ样品中芘降解菌数量为 4 .7万个 /g(干物质量 ) ,而芘污染相对较轻站位Ⅱ样品中芘降解菌数量为 1.2万个 / g(干物质量 ) ,海水沉积物中芘含量与芘降解菌数量呈正相关。 展开更多
关键词 海水沉积物 多环芳烃 海洋污染 环境污染评价 双层平板计数技术 芘降解菌数量 芘含量
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厦门西海域表层水中PAHs污染与PAHs降解菌分布的关系 被引量:15
12
作者 田蕴 郑天凌 +2 位作者 王新红 肖清江 张勇 《热带海洋学报》 CAS CSCD 北大核心 2003年第6期15-21,共7页
在厦门西海域设置6个站位,于2001年7月和10月两个航次对各站位表层水中多环芳烃(polycyclicaromatichydrocarbons,PAHs)的含量及几种常见PAHs的降解菌的数量进行调查,结果表明:表层水中PAHs的含量很不稳定,存在明显的时间变化。在7月的... 在厦门西海域设置6个站位,于2001年7月和10月两个航次对各站位表层水中多环芳烃(polycyclicaromatichydrocarbons,PAHs)的含量及几种常见PAHs的降解菌的数量进行调查,结果表明:表层水中PAHs的含量很不稳定,存在明显的时间变化。在7月的调查中,表层水中能检测到的PAHs以2—3环的为主,而在10月以4—6环的为主。低分子量的PAHs—芴和菲的含量与其降解菌的数量之间具有明显的正相关,而高分子量的PAHs—荧蒽和芘的含量与其降解菌的数量之间没有表现出相关性。 展开更多
关键词 多环芳烃(polycyclic AROMATIC hydrocarbons PAHs) 表层水 PAHs降解菌
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菌-藻相互作用下胞外酶活性变化研究 被引量:17
13
作者 郑天凌 徐美珠 +1 位作者 俞志明 宋秀贤 《海洋科学》 CAS CSCD 北大核心 2002年第12期41-45,共5页
报道了在实验室培养条件下塔马亚历山大藻 (Alexandriumtamarense)与几株海洋细菌之间的生态关系。实验表明 ,在培养前期 ,培养液中的营养成分尚足以维持藻类和细菌的生长 ,细菌的加入是胞外酶活性升高的主要原因所在 ;在培养的后期 ,... 报道了在实验室培养条件下塔马亚历山大藻 (Alexandriumtamarense)与几株海洋细菌之间的生态关系。实验表明 ,在培养前期 ,培养液中的营养成分尚足以维持藻类和细菌的生长 ,细菌的加入是胞外酶活性升高的主要原因所在 ;在培养的后期 ,混合培养液和藻对照培养液中胞外酶活性持续升高。A.tamarense在单独培养下 ,其胞外酶活性从第12天起才有明显的提高 ,第16天增加较快,达到0.104μmol/(L·h);至第20天藻体衰败时 ,胞外酶活性达到最高水平 ,为0.385μmol/(L·h)。Z7 细菌单独培养时 ,其胞外酶活性在单独培养的2d后有一个高峰值0.133μmol/(L·h) ,随着培养时间的延长 ,其酶活性逐渐降低。细菌Z7 和Z10 与A.tamarense共培养下 ,两者胞外酶活性变化趋势相似。 展开更多
关键词 菌-藻相互作用 胞外酶活性 塔马亚历山大藻 细菌胞外酶 菌藻关系 赤潮
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泉州湾表层沉积物对多环芳烃潜在降解活性的研究 被引量:6
14
作者 谷体华 袁建军 +1 位作者 郑天凌 田蕴 《厦门大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2005年第B06期102-106,共5页
在泉州湾设置7个站位,测定了2004年2月航次表层沉积物在添加PAHs后呼吸活性的变化,结合多环芳烃降解菌的数量及细菌总量的测定,对泉州湾海域表层沉积物对多环芳烃的降解潜力进行综合分析.结果显示,添加碳源在一定程度上提高了土壤的呼... 在泉州湾设置7个站位,测定了2004年2月航次表层沉积物在添加PAHs后呼吸活性的变化,结合多环芳烃降解菌的数量及细菌总量的测定,对泉州湾海域表层沉积物对多环芳烃的降解潜力进行综合分析.结果显示,添加碳源在一定程度上提高了土壤的呼吸活性,外加PAHs对各站点的影响有别,同一样品受菲、芘、荧蒽的影响各不相同,其影响程度与本土降解菌的数量有一定相关性,表明细菌在海洋环境PAHs的生物降解中起着至关重要的作用;19d后各样品的呼吸作用强度逐渐接近自然对照样,可见该海域表层沉积物中微生物有着强大的适应不良环境的能力与降解PAHs的潜力. 展开更多
关键词 表层沉积物 泉州湾 降解活性 多环芳烃降解菌 2004年2月 PAHS 呼吸活性 综合分析 影响程度 生物降解 海洋环境 接近自然 作用强度 相关性 微生物 样品 添加 潜力 海域 测定 细菌
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组合工艺处理印染废水研究 被引量:12
15
作者 丛利泽 王慧 +1 位作者 熊小京 郑天凌 《厦门大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2008年第3期457-460,共4页
针对印染废水成分复杂、色度大、浓度高且生物难降解物质多等特点,本文作者采用了混凝沉淀法对印染废水进行预处理,而后以膜生物反应器与反渗透膜分离系统组合工艺处理,研究该工艺对印染废水COD及色度的去除特性.实验结果表明:采用混凝... 针对印染废水成分复杂、色度大、浓度高且生物难降解物质多等特点,本文作者采用了混凝沉淀法对印染废水进行预处理,而后以膜生物反应器与反渗透膜分离系统组合工艺处理,研究该工艺对印染废水COD及色度的去除特性.实验结果表明:采用混凝沉淀预处理,膜生物反应器与反渗透膜系统组合工艺处理印染废水具有很好的效果.当原水COD高达2500 mg/L,色度高达10000倍,经该工艺处理后COD降到30 mg/L,NH3-N降到8 mg/L,色度为0,已经达到废水回用标准. 展开更多
关键词 印染废水 混凝沉淀 膜生物反应器 反渗透膜系统
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厦门西港表层沉积物中多环芳烃(PAHs)的含量、分布及来源 被引量:17
16
作者 田蕴 郑天凌 王新红 《海洋与湖沼》 CAS CSCD 北大核心 2004年第1期15-20,共6页
采用气相色谱与质谱联用 (GC/MS)技术 ,通过 3个航次对厦门西港沉积物中 1 6种优先监控的PAHs的污染状况进行不同季节的连续调查。结果表明 ,厦门西港沉积物中检出的PAHs均以 4— 6环的为主 ,其中荧蒽和芘在不同航次及不同站位均为优势... 采用气相色谱与质谱联用 (GC/MS)技术 ,通过 3个航次对厦门西港沉积物中 1 6种优先监控的PAHs的污染状况进行不同季节的连续调查。结果表明 ,厦门西港沉积物中检出的PAHs均以 4— 6环的为主 ,其中荧蒽和芘在不同航次及不同站位均为优势组分。PAHs的总含量变化不明显 ,但高分子量的PAHs(5— 6环 )的含量却有升高的趋势。厦门西港沉积物中的PAHs主要来源于矿物的不完全燃烧 ,与 1 993年的调查结果相比 ,厦门西港沉积物中PAHs的含量有所减少 。 展开更多
关键词 多环芳烃 PAHS 表层沉积物 厦门西港
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深海产低温碱性淀粉酶菌Halomonas sp.W7的筛选及发酵条件研究 被引量:12
17
作者 戴世鲲 郑天凌 +1 位作者 王晓颖 郑伟 《海洋科学》 CAS CSCD 北大核心 2007年第11期27-32,共6页
从27份深海沉积物中筛选到30株产淀粉酶细菌,并对其中的W7菌株的产酶条件及酶学性质进行了研究。对W7菌株进行16SrDNA序列分析表明该菌株属于盐单胞菌属(Halomonas)。其最适生长温度为25℃,能适应pH值7~13和盐度0~100的环境条件。该... 从27份深海沉积物中筛选到30株产淀粉酶细菌,并对其中的W7菌株的产酶条件及酶学性质进行了研究。对W7菌株进行16SrDNA序列分析表明该菌株属于盐单胞菌属(Halomonas)。其最适生长温度为25℃,能适应pH值7~13和盐度0~100的环境条件。该菌株可利用多种碳源,但只在淀粉存在的条件下产酶,可利用有机氮源和无机氮源,但有机氮源更能促进淀粉酶的产生。产酶的最适条件为:25℃,pH10,接种量2%,盐度50,150r/min摇床培养36~48h。粗酶液的最适作用温度为40℃,最适pH值为10。该菌具有反硝化和氨化活性。 展开更多
关键词 深海微生物 淀粉酶 发酵条件
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虾池沉积环境中若干功能菌及弧菌的时空变化 被引量:5
18
作者 王晓颖 席峰 +3 位作者 袁建军 田蕴 王桂忠 郑天凌 《厦门大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2006年第B05期250-256,共7页
2003年10月~2004年5月在泉州东海一新建虾池与一池龄15年的老旧虾池,采用平板计数方法研究底泥环境中可培养异养菌(HB)、淀粉降解菌(AB)、有机磷降解菌(OPB)、无机磷溶解菌(INP)、几丁质降解菌(CB)、油脂降解菌(LB)、纤... 2003年10月~2004年5月在泉州东海一新建虾池与一池龄15年的老旧虾池,采用平板计数方法研究底泥环境中可培养异养菌(HB)、淀粉降解菌(AB)、有机磷降解菌(OPB)、无机磷溶解菌(INP)、几丁质降解菌(CB)、油脂降解菌(LB)、纤维素降解菌(CLB)、硫氧化细菌(SOB)等各种功能菌以及弧菌(VB)数量的变化情况,并对它们与可培养异养菌之间的相关关系进行了探讨.结果表明,在整个养殖期中,新池泥样中可培养异养菌总数范围在1.95×10^4~7.7×10^5 CFU/g之间,旧池泥样中可培养异养菌总数范围在2×10^4~1.88×10^5 CFU/g之间,两池的数量变化波动均较大,其它功能菌与异养菌相似,在整个养殖周期也是呈现较大的波动幅度,但统计分析表明淀粉降解菌、有机磷降解菌、油脂降解菌、弧菌等与可培养异养细菌之间呈现着明显的正相关,而几丁质降解菌、无机磷溶解菌、纤维素降解菌以及硫氧化细菌与异养菌之间则无明显的相关关系. 展开更多
关键词 虾池 可培养异养菌 功能菌 动态变化 相关性
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EEA——一种新的、重要的海洋生态学参数及其应用 被引量:7
19
作者 郑天凌 徐美珠 +1 位作者 张瑶 王斐 《台湾海峡》 CAS CSCD 2001年第4期453-461,共9页
细菌胞外酶作为海洋环境中有机物与细菌相互作用的中介 ,其活性高低反映了细菌对相关有机组分的改造程度及该有机组分对细菌生长繁殖的营养贡献 .胞外酶活性 (extracellularenzymeactivity ,EEA)研究对于深入了解海洋生态系有着重要意... 细菌胞外酶作为海洋环境中有机物与细菌相互作用的中介 ,其活性高低反映了细菌对相关有机组分的改造程度及该有机组分对细菌生长繁殖的营养贡献 .胞外酶活性 (extracellularenzymeactivity ,EEA)研究对于深入了解海洋生态系有着重要意义 .本文概述了胞外酶活性特征、影响因素及调控机制 ;台湾海峡胞外酶活性研究原理 ,现场测定方法及影响因素 ,分析了台湾海峡 β 葡萄糖苷酶与细菌产量。 展开更多
关键词 胞外酶活性 生态学关键参数 海洋生态学 微生物 台湾海峡 β-葡萄糖苷酶活性
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深海沉积物中产淀粉酶细菌的rep-PCR基因指纹分析 被引量:5
20
作者 戴世鲲 郑天凌 +1 位作者 郑伟 王晓颖 《厦门大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2005年第B06期171-174,共4页
利用淀粉酶筛选培养基平板从27个深海沉积物样品中筛选得到30个具有胞外淀粉酶活性的菌株.其中革兰氏阴性细菌有22株,阳性细菌有8株.对这些细菌的基因组DNA进行ERICPCR和BOXPCR扩增,指纹图谱显示大部分菌株均存在数目不等的各自独特的带... 利用淀粉酶筛选培养基平板从27个深海沉积物样品中筛选得到30个具有胞外淀粉酶活性的菌株.其中革兰氏阴性细菌有22株,阳性细菌有8株.对这些细菌的基因组DNA进行ERICPCR和BOXPCR扩增,指纹图谱显示大部分菌株均存在数目不等的各自独特的带型,各特异性扩增的主带型能重复稳定出现.比较两种引物的指纹图谱,显示ERICPCR比BOXPCR具有较丰富的图谱多态性.对产生的指纹图谱进行聚类学分析,30株细菌可分为10组,其中5株细菌分别独立成组,最多的第Ⅱ组包含有8株细菌,而在同一聚类组内的细菌可能是处于进化上亲缘关系较近的位置.研究显示,30株菌具有丰富的种属多样性,揭示了深海微生物资源的丰富和潜力.ERICPCR和BOXPCR技术可用于对深海微生物群落组成和多样性的研究. 展开更多
关键词 深海沉积物 指纹分析 R基因 rep 革兰氏阴性细菌 指纹图谱 ERIC 基因组DNA 特异性扩增 PCR扩增 淀粉酶活性 筛选培养基 深海微生物 PCR技术 微生物资源 BOX 亲缘关系 群落组成 多样性 显示 聚类组 多态性 丰富 带型 菌株
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