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题名FAT10基因单体型与肝细胞癌的相关性研究
被引量：1
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作者
袁荣发
余新
刘秀霞
王庆诺
蔡红平
邵江华
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机构
南昌大学第二附属医院肝胆外科
南昌大学第二附属医院江西省分子医学重点实验室
南昌大学医学院流行病学及统计学教研室
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出处
《中国癌症杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2012年第5期352-357,共6页
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基金
江西省自然科学基金资助项目(No:2008GZY0059)
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文摘
背景与目的:人类白细胞抗原FAT10是类泛素调节子蛋白家族中的一员,被认为与肝细胞癌(hepatocellular carcinoma,HCC)发生、发展密切相关。本研究探讨FAT10基因单体型与肝细胞癌的关系。方法:收集254例肝癌病例和268例健康对照人群外周血标本,提取DNA,通过DNA测序分析方法,检测两组人群FAT10基因外显子和侧翼序列单核苷酸多态性。应用Haploview统计软件分析研究对象的连锁不平衡和单体型,并应用病例对照分析方法进行相关性研究。结果:在肝癌组和对照组FAT10基因外显子和侧翼序列上共检测到10个多态性位点。遗传不平衡发现-143 A/G、-121 A/G、+3446 C/T、+3476 T/C、+3527 T/C、+3607 T/C、+3620 C/G、+3803 C/G、+3809 G/T 9个SNPs在同一个单体型块,其中-121 A/G、+3476 T/C、+3607 T/C、+3620 C/G和+3809 G/T多态位点完全连锁。进一步选择-143 A/G、+3476 T/C和+3527T/C 3个tagSNPs进行关联分析和单体型构建,发现-143 A/G和+3476 T/C基因型与相应的野生型纯合子相比能明显降低肝癌发病的风险(P<0.05)。进一步单体型分析发现ATT、ATC、GCT和ACT 4种单体型,其中肝癌患者的GCT和ACT单体型频率显著低于对照组(P<0.05),而ATT单体型频率显著高于对照组(P<0.05),经过1×108的随机置换检验校正后,ATT和GCT单体型与肝癌的发病风险仍然显著相关。结论:FAT10基因单体型可能与肝癌的发病风险相关,ATT单体型可能是肝癌的遗传标志。
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关键词
肝细胞癌
单体型
病例对照研究
FAT10基因
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Keywords
Hepatocellular carcinoma
Haplotype
Case-control studies
FAT10 gene
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分类号
R735.7
[医药卫生—肿瘤]
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