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新引进果蔗品种宿根矮化病菌检测
被引量：
3
1
作者
吴夏明
沈万宽
+3 位作者
罗明珠
饶得花
陈培寿
姜子德
《西南农业学报》
CSCD
北大核心
2016年第5期1046-1051,共6页
采用PCR和巢式PCR技术对6个新引进果蔗品种黔蔗08-1497,黔糖5号,云南红皮,广东黄皮,黔蔗08-688,黔糖3号和广东主栽果蔗品种黑皮果蔗(Badila)进行宿根矮化病菌检测,并对其中广东黄皮、云南红皮、黔糖3号及黑皮果蔗(Badila)的巢式PCR第二...
采用PCR和巢式PCR技术对6个新引进果蔗品种黔蔗08-1497,黔糖5号,云南红皮,广东黄皮,黔蔗08-688,黔糖3号和广东主栽果蔗品种黑皮果蔗(Badila)进行宿根矮化病菌检测,并对其中广东黄皮、云南红皮、黔糖3号及黑皮果蔗(Badila)的巢式PCR第二轮扩增产物(编号依次为Lxx-Gd-gz1、Lxx-Gd-gz2、Lxx-Gd-gz3及Lxx-Gd-gz4)进行核苷酸序列测定及分析。结果表明,PCR检测,仅黔蔗08-688甘蔗宿根矮化病菌检出率为20%(1/5),其余6个果蔗品种的宿根矮化病菌检出率均为0%;巢式PCR检测,黔蔗08-1497及黔糖5号宿根矮化病菌检出率为0%,广东黄皮检出率为75%;云南红皮、黔蔗08-688、黔糖3号及黑皮果蔗(Badila)检出率均为100%。Lxx-Gd-gz1、Lxx-Gd-gz2、Lxx-Gd-gz3及Lxx-Gd-gz4基因组相应区段核苷酸序列同源率为100%,均与巴西、澳大利亚、美国路易斯安娜州、中国云南、中国福建及广东湛江株系核苷酸序列同源率均为99%。表明该病菌遗传稳定性极高,变异极小。
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关键词
果蔗
宿根矮化病菌
PCR
巢式PCR
序列分析
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职称材料
甘蔗黑穗病菌SCoT-PCR反应体系优化与引物筛选
被引量：
3
2
作者
徐刚红
姜子德
+2 位作者
沈万宽
罗明珠
饶得花
《华中农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2015年第6期33-39,共7页
以甘蔗黑穗病菌(Sporisorium scitamineum)交配型菌株基因组DNA为模板,在单因素优化试验的基础上,采用L16(45)正交试验设计,对影响甘蔗黑穗病菌SCoT-PCR反应体系的Mg2+、dNTPs、引物、r Taq DNA聚合酶和模板用量5个因素进行优化,建立优...
以甘蔗黑穗病菌(Sporisorium scitamineum)交配型菌株基因组DNA为模板,在单因素优化试验的基础上,采用L16(45)正交试验设计,对影响甘蔗黑穗病菌SCoT-PCR反应体系的Mg2+、dNTPs、引物、r Taq DNA聚合酶和模板用量5个因素进行优化,建立优化的甘蔗黑穗病菌SCoT-PCR反应体系:DNA模板12.50ng、dNTPs 0.17mmol/L、引物0.46μmol/L、Mg2+1.7 mmol/L、r Taq DNA聚合酶0.85U、1×Buffer(Mg2+free),总体积25μL。应用优化体系从30条SCoT引物中筛选扩增条带清晰且多态性丰富的10条引物,并利用这10条引物对10份地理来源和寄主来源不同的甘蔗黑穗病菌交配型菌株基因组DNA进行SCoT标记,结果共扩增出86条带,多态性比率为58.67%,平均每条引物扩增8.60条。UPGMA聚类分析结果表明:在遗传相似系数为0.75的水平上,可将10个菌株分为3类,聚类结果与菌株的地理来源有一定的相关性。
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关键词
甘蔗黑穗病菌
SCoT标记
体系优化
UPGMA聚类分析
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职称材料
甘蔗赤腐病及其病原菌研究进展
被引量：
6
3
作者
吴夏明
沈万宽
+2 位作者
罗明珠
饶得花
陈培寿
《中国糖料》
2015年第6期66-70,共5页
综述了甘蔗赤腐病的发生危害、传播途径、防治措施及其病原菌的形态特征、生物学特性、遗传多样性及快速检测技术等研究进展,并对存在的问题及今后研究策略进行了探讨。
关键词
甘蔗赤腐病
病原菌
发生危害
防治措施
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职称材料
题名
新引进果蔗品种宿根矮化病菌检测
被引量：
3
1
作者
吴夏明
沈万宽
罗明珠
饶得花
陈培寿
姜子德
机构
华南农业大学
农学院
/
农业
部
华南
地区作物栽培科学观测
实验
站
华南农业大学农学院/广东省微生物信号与病害防控重点实验室
出处
《西南农业学报》
CSCD
北大核心
2016年第5期1046-1051,共6页
基金
广东省公益研究与能力创新专项资金项目(2014A020208094)
华南农业大学人才引进启动资金项目(4100k13009)
文摘
采用PCR和巢式PCR技术对6个新引进果蔗品种黔蔗08-1497,黔糖5号,云南红皮,广东黄皮,黔蔗08-688,黔糖3号和广东主栽果蔗品种黑皮果蔗(Badila)进行宿根矮化病菌检测,并对其中广东黄皮、云南红皮、黔糖3号及黑皮果蔗(Badila)的巢式PCR第二轮扩增产物(编号依次为Lxx-Gd-gz1、Lxx-Gd-gz2、Lxx-Gd-gz3及Lxx-Gd-gz4)进行核苷酸序列测定及分析。结果表明,PCR检测,仅黔蔗08-688甘蔗宿根矮化病菌检出率为20%(1/5),其余6个果蔗品种的宿根矮化病菌检出率均为0%;巢式PCR检测,黔蔗08-1497及黔糖5号宿根矮化病菌检出率为0%,广东黄皮检出率为75%;云南红皮、黔蔗08-688、黔糖3号及黑皮果蔗(Badila)检出率均为100%。Lxx-Gd-gz1、Lxx-Gd-gz2、Lxx-Gd-gz3及Lxx-Gd-gz4基因组相应区段核苷酸序列同源率为100%,均与巴西、澳大利亚、美国路易斯安娜州、中国云南、中国福建及广东湛江株系核苷酸序列同源率均为99%。表明该病菌遗传稳定性极高,变异极小。
关键词
果蔗
宿根矮化病菌
PCR
巢式PCR
序列分析
Keywords
Sugarcane
Leifsonia xyli subsp.xyli
PCR detection
Nested-PCR detection
Nucleotide sequence analysis
分类号
S435.661 [农业科学—农业昆虫与害虫防治]
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职称材料
题名
甘蔗黑穗病菌SCoT-PCR反应体系优化与引物筛选
被引量：
3
2
作者
徐刚红
姜子德
沈万宽
罗明珠
饶得花
机构
华南农业大学
农学院
/
农业
部
华南
地区作物栽培科学观测
实验
站
华南农业大学农学院/广东省微生物信号与病害防控重点实验室
出处
《华中农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2015年第6期33-39,共7页
基金
广东省公益研究与能力创新专项(2014A020208094)
华南农业大学人才引进启动资金项目(13009)
文摘
以甘蔗黑穗病菌(Sporisorium scitamineum)交配型菌株基因组DNA为模板,在单因素优化试验的基础上,采用L16(45)正交试验设计,对影响甘蔗黑穗病菌SCoT-PCR反应体系的Mg2+、dNTPs、引物、r Taq DNA聚合酶和模板用量5个因素进行优化,建立优化的甘蔗黑穗病菌SCoT-PCR反应体系:DNA模板12.50ng、dNTPs 0.17mmol/L、引物0.46μmol/L、Mg2+1.7 mmol/L、r Taq DNA聚合酶0.85U、1×Buffer(Mg2+free),总体积25μL。应用优化体系从30条SCoT引物中筛选扩增条带清晰且多态性丰富的10条引物,并利用这10条引物对10份地理来源和寄主来源不同的甘蔗黑穗病菌交配型菌株基因组DNA进行SCoT标记,结果共扩增出86条带,多态性比率为58.67%,平均每条引物扩增8.60条。UPGMA聚类分析结果表明:在遗传相似系数为0.75的水平上,可将10个菌株分为3类,聚类结果与菌株的地理来源有一定的相关性。
关键词
甘蔗黑穗病菌
SCoT标记
体系优化
UPGMA聚类分析
Keywords
Sporisorium scitamineum
start codon targeted polymorphism(SCoT)marker
system optimization
UPGMA cluster analysis
分类号
S432.44 [农业科学—植物病理学]
S435.661 [农业科学—农业昆虫与害虫防治]
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职称材料
题名
甘蔗赤腐病及其病原菌研究进展
被引量：
6
3
作者
吴夏明
沈万宽
罗明珠
饶得花
陈培寿
机构
华南农业大学
农学院
/
农业
部
华南
地区作物栽培科学观测
实验
站
华南农业大学农学院/广东省微生物信号与病害防控重点实验室
出处
《中国糖料》
2015年第6期66-70,共5页
基金
广东省公益研究与能力创新专项资金项目(2014A020208094)
华南农业大学人才引进启动资金项目(4100k13009)
文摘
综述了甘蔗赤腐病的发生危害、传播途径、防治措施及其病原菌的形态特征、生物学特性、遗传多样性及快速检测技术等研究进展,并对存在的问题及今后研究策略进行了探讨。
关键词
甘蔗赤腐病
病原菌
发生危害
防治措施
Keywords
sugarcane red rot disease
pathogenic fungus Colletotrichum falcatum
occurrence and economic losses
control methods
分类号
S435.661 [农业科学—农业昆虫与害虫防治]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
新引进果蔗品种宿根矮化病菌检测
吴夏明
沈万宽
罗明珠
饶得花
陈培寿
姜子德
《西南农业学报》
CSCD
北大核心
2016
3
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
甘蔗黑穗病菌SCoT-PCR反应体系优化与引物筛选
徐刚红
姜子德
沈万宽
罗明珠
饶得花
《华中农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2015
3
在线阅读
下载PDF
职称材料
3
甘蔗赤腐病及其病原菌研究进展
吴夏明
沈万宽
罗明珠
饶得花
陈培寿
《中国糖料》
2015
6
在线阅读
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职称材料
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