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TCR-CD3复合物跨膜区自组装的分子机制
1
作者
王凤丽
陈佳林
+1 位作者
何程智
罗施中
《生物化学与生物物理进展》
SCIE
CAS
CSCD
北大核心
2022年第6期1094-1102,共9页
目的T细胞受体-共受体复合物(TCR-CD3)在适应性免疫应答中起着重要作用,其亚基间的相互作用一直是研究热点。由于传统实验的局限性,对于跨膜蛋白TCR-CD3复合物的研究不能深入到微观层面。方法利用分子动力学模拟方法(包括粗粒化模拟、...
目的T细胞受体-共受体复合物(TCR-CD3)在适应性免疫应答中起着重要作用,其亚基间的相互作用一直是研究热点。由于传统实验的局限性,对于跨膜蛋白TCR-CD3复合物的研究不能深入到微观层面。方法利用分子动力学模拟方法(包括粗粒化模拟、拉伸动力学、全原子模拟)分析TCR-CD3复合物的自组装机制。结果通过粗粒化模拟(CGMD)发现,TCR-CD3复合物在组装过程中存在着αβ依次结合δε’、γε、ζζ’的组装顺序,并阐述了α;突变会降低α;与δε’的相互作用。结论本文论证了仅存在TCR-CD3复合物的跨膜区不足以介导TCR-CD3复合物亚基间的特异性相互作用。拉伸动力学(SMD)和全原子模拟(AAMD)的结果说明,ζζ’与TCR-CD3其余部分之间的胞外区相互作用强于跨膜区,同时ζζ’的缺失对αβδε’γε的稳定性影响最小,而δε’的缺失对αβγεζζ’的稳定性影响最大。
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关键词
TCR-CD3复合物
粗粒化模拟
全原子模拟
拉伸动力学模拟
跨膜蛋白
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职称材料
题名
TCR-CD3复合物跨膜区自组装的分子机制
1
作者
王凤丽
陈佳林
何程智
罗施中
机构
北京化工大学生命科学与技术学院北京软物质科学与工程高精尖创新中心
出处
《生物化学与生物物理进展》
SCIE
CAS
CSCD
北大核心
2022年第6期1094-1102,共9页
基金
国家自然科学基金(22077010,11902023)
天津大学精密测试技术及仪器国家重点实验室开放课题(pilab1902)资助项目。
文摘
目的T细胞受体-共受体复合物(TCR-CD3)在适应性免疫应答中起着重要作用,其亚基间的相互作用一直是研究热点。由于传统实验的局限性,对于跨膜蛋白TCR-CD3复合物的研究不能深入到微观层面。方法利用分子动力学模拟方法(包括粗粒化模拟、拉伸动力学、全原子模拟)分析TCR-CD3复合物的自组装机制。结果通过粗粒化模拟(CGMD)发现,TCR-CD3复合物在组装过程中存在着αβ依次结合δε’、γε、ζζ’的组装顺序,并阐述了α;突变会降低α;与δε’的相互作用。结论本文论证了仅存在TCR-CD3复合物的跨膜区不足以介导TCR-CD3复合物亚基间的特异性相互作用。拉伸动力学(SMD)和全原子模拟(AAMD)的结果说明,ζζ’与TCR-CD3其余部分之间的胞外区相互作用强于跨膜区,同时ζζ’的缺失对αβδε’γε的稳定性影响最小,而δε’的缺失对αβγεζζ’的稳定性影响最大。
关键词
TCR-CD3复合物
粗粒化模拟
全原子模拟
拉伸动力学模拟
跨膜蛋白
Keywords
TCR-CD3 complex
coarse-grained simulation
all-atom simulation
steered dynamics
transmembrane protein
分类号
Q6 [生物学—生物物理学]
R9 [医药卫生—药学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
TCR-CD3复合物跨膜区自组装的分子机制
王凤丽
陈佳林
何程智
罗施中
《生物化学与生物物理进展》
SCIE
CAS
CSCD
北大核心
2022
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