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一种新的蛋白酪氨酸磷酸酶基因的克隆、定位和组织表达谱研究 被引量:1
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作者 瞿祥虎 翟云 +2 位作者 魏汉东 鱼咏涛 贺福初 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2001年第6期503-510,共8页
从人胎肝cDNA文库分离出一长度为 5 2 48bp的cDNA克隆 ,该基因包含 2 6个外显子和 2 5个内含子 ,染色体定位于在某些肿瘤细胞中易缺失的 3p2 1.1- 2 1.33。其可读框编码 16 36个氨基酸 ,该蛋白属于蛋白酪氨酸磷酸酶(PTP)家族 ,其C端有... 从人胎肝cDNA文库分离出一长度为 5 2 48bp的cDNA克隆 ,该基因包含 2 6个外显子和 2 5个内含子 ,染色体定位于在某些肿瘤细胞中易缺失的 3p2 1.1- 2 1.33。其可读框编码 16 36个氨基酸 ,该蛋白属于蛋白酪氨酸磷酸酶(PTP)家族 ,其C端有一个典型的PTP结构域 ,N端含有约 80 0氨基酸残基的BRO1样结构域及随后 2个可能的SH3结构域结合位点 ,在这两个结构域之间及C末端还各有一个脯氨酸富集区。Northern杂交和点杂交分析显示 ,该基因以大约 5 .4kb的单一转录物广泛表达于人体各种组织 ,而且在人部分肿瘤细胞中高表达。结果提示 ,人源PTP -TD14是一个新的蛋白酪氨酸磷酸酶。 展开更多
关键词 蛋白酪氨酸磷酸酶 CDNA克隆 人染色体3p21 PTP结构域 BRO1样结构域 组织表达谱 基因克隆 基因定位
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人分化相关基因Ndr2的克隆与组织表达谱研究 被引量:5
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作者 翟芸 魏汉东 +2 位作者 瞿祥虎 周钢桥 贺福初 《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2002年第2期139-144,共6页
人Ndr1基因参与细胞终末分化 ,并且对肿瘤细胞增殖和肿瘤转移具有抑制作用 .从人 2 2周孕龄胎肝cDNA文库中获得与人Ndr1基因同源的一段表达性序列标签 ,继而从成人脑cDNA文库分离出其全长cDNA(2 12 1bp) ,并将该基因命名为Ndr2 .其染色... 人Ndr1基因参与细胞终末分化 ,并且对肿瘤细胞增殖和肿瘤转移具有抑制作用 .从人 2 2周孕龄胎肝cDNA文库中获得与人Ndr1基因同源的一段表达性序列标签 ,继而从成人脑cDNA文库分离出其全长cDNA(2 12 1bp) ,并将该基因命名为Ndr2 .其染色体定位为 14q11 1- 11 2 ,开放阅读框编码 371个氨基酸 ,且与NDR1蛋白一样 ,含有一个典型的α β水解酶折叠类结构域 (α βhydrolasefold) .Northern杂交和点杂交分析显示 ,该基因与Ndr1一样 ,在脑中高表达 ,在胚胎组织的表达较低 ,在 8种人肿瘤细胞中的表达极低 .然而 ,Ndr2基因的组织表达谱与Ndr1又有鲜明的差异 :其在成人骨骼肌和脑等神经组织中表达最高 ,在唾液腺、肝、肾、心肌和气管中的表达次之 .结果提示 ,NDR2具有与NDR1相似或相关的重要功能 . 展开更多
关键词 人分化相关基因 Ndr2 克隆 组织表达谱 细胞分化 染色体定位α/β水解酶折叠类结构域
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应用RH技术定位人胎肝的7个新基因 被引量:6
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作者 翟芸 刘孟珉 +3 位作者 张成岗 瞿祥虎 周钢桥 贺福初 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2001年第2期93-96,共4页
辐射杂交细胞系(RH)技术是一种体细胞遗传学技术,是继荧光原位杂交技术(FISH)后新建立的染色体定位方法。本文应用该技术将发现于22周孕龄人胎肝的7个新基因进行了染色体定位:肝细胞生成素(hepatopoietin,HPO)定位于Chr.16q22.... 辐射杂交细胞系(RH)技术是一种体细胞遗传学技术,是继荧光原位杂交技术(FISH)后新建立的染色体定位方法。本文应用该技术将发现于22周孕龄人胎肝的7个新基因进行了染色体定位:肝细胞生成素(hepatopoietin,HPO)定位于Chr.16q22.1~22.3,HQ0508定位于Chr.22q13.31~13.32,HQ0750定位于Chr.11q24.3,HQ0915定位于Chr.16p13.3,HQ1880定位于Chr.11q13.2~13.4, HQ2180定位于Chr.19q13.2~13.3,HQ3091定位于Chr.12q21.33。 展开更多
关键词 染色体定位 辐射杂交细胞系 新基因 胎儿肝脏
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基于PC/Linux的核酸序列分析系统的构建及其应用 被引量:15
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作者 张成岗 欧阳曙光 +5 位作者 张绍文 瞿祥虎 鱼咏涛 周钢桥 吴松锋 贺福初 《生物化学与生物物理进展》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2001年第2期263-266,共4页
基于PC机和Linux操作系统 ,利用Phred/Phrap/Consed软件和Blast软件 ,构建了核酸序列大规模自动分析系统 .该套系统可自动完成从测序峰图向核酸序列的转化、载体序列去除、序列自动拼接、重复序列鉴定以及序列的相似性分析 ,可加速对大... 基于PC机和Linux操作系统 ,利用Phred/Phrap/Consed软件和Blast软件 ,构建了核酸序列大规模自动分析系统 .该套系统可自动完成从测序峰图向核酸序列的转化、载体序列去除、序列自动拼接、重复序列鉴定以及序列的相似性分析 ,可加速对大规模测序数据的分析和利用 . 展开更多
关键词 PC机 LINUX操作系统 软件 生物信息学 大规模测序 核酸序列
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序列同源性分析软件Blast的WEB界面构建及其应用 被引量:8
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作者 张成岗 张利达 +2 位作者 欧阳曙光 张启发 贺福初 《生物化学与生物物理进展》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2001年第6期916-918,共3页
基于局域网 (Intranet)内的PC/Linux服务器 ,构建了序列同源性分析软件Blast的WEB界面 .局域网内的所有计算机均可通过WEB方式访问该服务器进行公共数据库和自建数据库的查询 ,具有保密、高效、免费的优点 ,能够满足实验室和研究院所的... 基于局域网 (Intranet)内的PC/Linux服务器 ,构建了序列同源性分析软件Blast的WEB界面 .局域网内的所有计算机均可通过WEB方式访问该服务器进行公共数据库和自建数据库的查询 ,具有保密、高效、免费的优点 ,能够满足实验室和研究院所的大规模。 展开更多
关键词 微机 LINUX操作系统 局域网 Blast软件 WEB界面 生物信息学 序列同源性 分析软件
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BCR3/ABL2核酶的设计、构建及对K562细胞增殖与集落形成的抑制作用和凋亡诱导作用 被引量:2
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作者 李满文 贺福初 《中国生物化学与分子生物学报》 CSCD 2000年第1期10-16,共7页
利用计算机模拟设计合成了针对 K5 62细胞致癌融合 bcr3/abl2 m RNA的锤头状核酶 .该核酶以融合点附近 UUC为识别切割三联体 ,在核酶的 3′端增加一段 T7噬菌体终止子序列 .用基因克隆结合体外转录的方法 ,肯定了核酶的体外切割活性 .... 利用计算机模拟设计合成了针对 K5 62细胞致癌融合 bcr3/abl2 m RNA的锤头状核酶 .该核酶以融合点附近 UUC为识别切割三联体 ,在核酶的 3′端增加一段 T7噬菌体终止子序列 .用基因克隆结合体外转录的方法 ,肯定了核酶的体外切割活性 .进而将核酶基因克隆到 p CEP4真核细胞高效表达载体上 ,利用脂质体 Lipofectin AMINE介导的转染技术将核酶与核酶基因导入靶细胞 ,从抑制靶细胞 K5 62的增殖与集落形成及引起靶细胞凋亡等方面验证了核酶在细胞水平上对融合基因 bcr3/abl2 m RNA的特异切割作用 ,并观察到了 T7噬菌体终止子序列对核酶切割效率的增强影响 . 展开更多
关键词 锤头状核酶 bcr3/abl2 CML K562细胞 细胞凋亡
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