目的头发是一类重要的皮肤附属物,主要由角蛋白和角蛋白相关蛋白等组成。不同种族及性别样本的头发蛋白质组成和占比存在差异,且目前缺乏高效率提取头发蛋白的方法。本文探究基于定量头发蛋白质组学方法,旨在探索该方法区分不同个体的...目的头发是一类重要的皮肤附属物,主要由角蛋白和角蛋白相关蛋白等组成。不同种族及性别样本的头发蛋白质组成和占比存在差异,且目前缺乏高效率提取头发蛋白的方法。本文探究基于定量头发蛋白质组学方法,旨在探索该方法区分不同个体的可能性。方法以3例头发样本,对样品处理方法和裂解缓冲液进行探究,发展一种名为PLEE(PTM lab for protein extraction from hair with high efficiency)的稳定、高效的头发蛋白质提取方法,对7例人发样本,以PLEE法进行提取,结合胶内消化方法进行蛋白质组学实验,产出蛋白质组学数据,分析个体间的头发蛋白质组成及占比。结果共鉴定274种蛋白质,共有的蛋白质107种,非共有蛋白质种类在57~119,部分样本存在独特鉴定蛋白。使用共鉴定107种蛋白质进行定量蛋白质组分析,通过聚类和主成分分析,可将各样本进行区分,且技术重复样本可聚在一起,表明流程的稳定性。另外,筛选出10个关键蛋白(KRT33A、KRTAP9-6、KRT83、KRTAP7-1、KRT32、BLMH、KRT38、KRTAP11-1、NPAS1、KRTAP4-3)在不同个体之间差异比较大且在同个体中蛋白质鉴定稳定。结论不同个体的头发蛋白质组成存在差异,筛选出的10个蛋白质有望作为区分个体特质的关键蛋白,在个体识别、刑侦方面具有重大的应用潜力。展开更多
微小染色体维持蛋白2(minichromosome maintenance protein 2,MCM2)的异常表达与多种恶性肿瘤的发生发展密切相关。为探索MCM2基因对胆管癌细胞肿瘤生物学行为的影响及其潜在的作用机制,本研究首先采用cell counting kit-8(CCK-8)、平...微小染色体维持蛋白2(minichromosome maintenance protein 2,MCM2)的异常表达与多种恶性肿瘤的发生发展密切相关。为探索MCM2基因对胆管癌细胞肿瘤生物学行为的影响及其潜在的作用机制,本研究首先采用cell counting kit-8(CCK-8)、平板细胞克隆形成、Transwell和Invasion实验证实,MCM2可促进胆管癌细胞的增殖、迁移和侵袭能力;流式细胞术检测结果显示,MCM2可加快细胞周期进程,抑制细胞凋亡。进一步通过对胆管癌组织RNA测序数据集的分析发现,MCM2基因与p53信号通路的激活显著负相关。采用实时定量PCR(quantitative real time polymerase chain reaction,qRT-PCR)和蛋白质免疫印迹(Western blotting,WB)实验发现,在胆管癌细胞中MCM2可显著下调p53和BAX的mRNA和蛋白表达水平,显著上调BCL2和CCND1的mRNA和蛋白表达水平。采用流式细胞术、qRT-PCR和WB实验进一步证实MCM2基因依赖于p53通路发挥影响胆管癌细胞周期和凋亡的功能。最后,通过分析MCM2的表达水平与胆管癌患者临床预后的相关性发现,MCM2在胆管癌组织中的表达显著高于癌旁组织,且其高表达与患者的不良预后显著相关。综上所述,本研究初步揭示MCM2可能通过抑制p53信号通路促进胆管癌的发生发展,并提示MCM2的高表达与胆管癌的不良预后显著相关,为未来胆管癌新的临床诊治措施的研发提供了理论依据。展开更多
文摘目的头发是一类重要的皮肤附属物,主要由角蛋白和角蛋白相关蛋白等组成。不同种族及性别样本的头发蛋白质组成和占比存在差异,且目前缺乏高效率提取头发蛋白的方法。本文探究基于定量头发蛋白质组学方法,旨在探索该方法区分不同个体的可能性。方法以3例头发样本,对样品处理方法和裂解缓冲液进行探究,发展一种名为PLEE(PTM lab for protein extraction from hair with high efficiency)的稳定、高效的头发蛋白质提取方法,对7例人发样本,以PLEE法进行提取,结合胶内消化方法进行蛋白质组学实验,产出蛋白质组学数据,分析个体间的头发蛋白质组成及占比。结果共鉴定274种蛋白质,共有的蛋白质107种,非共有蛋白质种类在57~119,部分样本存在独特鉴定蛋白。使用共鉴定107种蛋白质进行定量蛋白质组分析,通过聚类和主成分分析,可将各样本进行区分,且技术重复样本可聚在一起,表明流程的稳定性。另外,筛选出10个关键蛋白(KRT33A、KRTAP9-6、KRT83、KRTAP7-1、KRT32、BLMH、KRT38、KRTAP11-1、NPAS1、KRTAP4-3)在不同个体之间差异比较大且在同个体中蛋白质鉴定稳定。结论不同个体的头发蛋白质组成存在差异,筛选出的10个蛋白质有望作为区分个体特质的关键蛋白,在个体识别、刑侦方面具有重大的应用潜力。
文摘微小染色体维持蛋白2(minichromosome maintenance protein 2,MCM2)的异常表达与多种恶性肿瘤的发生发展密切相关。为探索MCM2基因对胆管癌细胞肿瘤生物学行为的影响及其潜在的作用机制,本研究首先采用cell counting kit-8(CCK-8)、平板细胞克隆形成、Transwell和Invasion实验证实,MCM2可促进胆管癌细胞的增殖、迁移和侵袭能力;流式细胞术检测结果显示,MCM2可加快细胞周期进程,抑制细胞凋亡。进一步通过对胆管癌组织RNA测序数据集的分析发现,MCM2基因与p53信号通路的激活显著负相关。采用实时定量PCR(quantitative real time polymerase chain reaction,qRT-PCR)和蛋白质免疫印迹(Western blotting,WB)实验发现,在胆管癌细胞中MCM2可显著下调p53和BAX的mRNA和蛋白表达水平,显著上调BCL2和CCND1的mRNA和蛋白表达水平。采用流式细胞术、qRT-PCR和WB实验进一步证实MCM2基因依赖于p53通路发挥影响胆管癌细胞周期和凋亡的功能。最后,通过分析MCM2的表达水平与胆管癌患者临床预后的相关性发现,MCM2在胆管癌组织中的表达显著高于癌旁组织,且其高表达与患者的不良预后显著相关。综上所述,本研究初步揭示MCM2可能通过抑制p53信号通路促进胆管癌的发生发展,并提示MCM2的高表达与胆管癌的不良预后显著相关,为未来胆管癌新的临床诊治措施的研发提供了理论依据。
