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褪黑激素对内蒙古绒山羊皮肤中let-7家族及其靶基因的影响 被引量:6
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作者 王建蒙 付绍印 +5 位作者 丽春 白雪 刘斌 季小阳 刘永斌 张文广 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第7期1367-1379,共13页
旨在探索褪黑激素(melatonin, MT)对let-7家族成员及其靶基因在内蒙古绒山羊皮肤周期性表达的影响。本研究选取内蒙古绒山羊罕山型个体6只,分为埋植组(皮下埋植MT,n=3)和对照组(不埋植MT,n=3),连续12个月采集绒山羊个体皮肤组织为试验材... 旨在探索褪黑激素(melatonin, MT)对let-7家族成员及其靶基因在内蒙古绒山羊皮肤周期性表达的影响。本研究选取内蒙古绒山羊罕山型个体6只,分为埋植组(皮下埋植MT,n=3)和对照组(不埋植MT,n=3),连续12个月采集绒山羊个体皮肤组织为试验材料,利用qRT-PCR技术检测皮肤组织中11个let-7家族成员的表达变化,结合RNA-Seq技术分析let-7家族靶基因的表达变化。结果表明:1)在整个皮肤毛囊周期内,MT上调let-7b、let-7e、let-7a-3p的表达,下调let-7f、let-7g、let-7c、let-7a-5p、let-7d、miR-98的表达。2)在4月份,MT上调"let-7g、let-7i、miR-98"的表达,下调PTGS2、PLCG1等靶基因的表达;下调"let-7a-5p、let-7b、let-7c"的表达,上调TGIF2、RBL1等靶基因的表达。3)在6月份,MT下调"let-7g、let-7i、miR-98"的表达,上调PTGS2、PLCG1、SRC等靶基因的表达;上调"let-7a-5p、let-7b、let-7c"的表达,下调GDF5、TGIF2、RBL1等靶基因的表达。4)let-7家族成员的靶基因主要参与VEGF、TGF-β、Oxytocin和NF-kappa B信号通路,在细胞过程、激素调节和转录因子调控方面发挥重要作用。综上表明,MT可能通过改变let-7家族重要成员的表达水平,影响相应靶基因的表达,进而在皮肤毛囊的周期性生长过程中发挥重要作用,研究结果为进一步揭示MT介导miRNAs影响羊绒生长的分子机理提供了理论依据。 展开更多
关键词 内蒙古绒山羊 皮肤 褪黑激素 let-7家族 靶基因
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内蒙古绒山羊TNFRSF1A基因shRNA表达载体的构建及鉴定 被引量:1
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作者 马丽娜 杨峰 +10 位作者 奈日乐 谢遇春 米璐 车天宇 王志新 王志英 王瑞军 苏蕊 张燕军 刘志红 李金泉 《家畜生态学报》 北大核心 2019年第9期14-18,共5页
通过设计和合成TNFRSF1A基因的3条靶向shRNA,并分别插入到pSGU6/GFP/Neo载体中,成功构建出了3个干扰载体,通过脂质体介导法将干扰载体成功转入到内蒙古绒山羊胎儿成纤维细胞中,并利用RealTimePCR检测TNFRSF1A基因的表达量。由结果可知,T... 通过设计和合成TNFRSF1A基因的3条靶向shRNA,并分别插入到pSGU6/GFP/Neo载体中,成功构建出了3个干扰载体,通过脂质体介导法将干扰载体成功转入到内蒙古绒山羊胎儿成纤维细胞中,并利用RealTimePCR检测TNFRSF1A基因的表达量。由结果可知,TNFRSF1A基因的干扰载体经测序鉴定证明构建成功,干扰载体转染内蒙古绒山羊胎儿成纤维细胞24h后可见绿色荧光表达,当到达48h时,转染效率达到最大,shRNA-1、shRNA-2、shRNA-3三组中TNFRSF1A的mRNA表达水平均低于转染空载体的NC组,且shRNA2对TNFRSF1A的mRNA表达具有最佳的干扰效果。综上所述,该研究成功构建了TNFRSF1A干扰载体,为进一步研究绒山羊TNFRSF1A基因在毛囊生长与周期调控的作用奠定基础。 展开更多
关键词 内蒙古绒山羊 载体构建 TNFRSF1A
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绒山羊绒毛品质遗传研究进展 被引量:5
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作者 李学武 王瑞军 +6 位作者 王志英 娜清 李宏伟 王振宇 苏蕊 张燕军 李金泉 《中国畜牧兽医》 CAS 北大核心 2016年第12期3275-3284,共10页
绒毛品质不仅影响绒山羊养殖的经济效益,还影响绒毛纺织品的质量。近年来,随着产绒量的提高,绒毛品质有下降趋势,为了提高生产效益,在生产过程中提高绒毛品质势在必行。绒毛品质是绒山羊育种中重要的选择参数,而控制绒毛品质的主要性状... 绒毛品质不仅影响绒山羊养殖的经济效益,还影响绒毛纺织品的质量。近年来,随着产绒量的提高,绒毛品质有下降趋势,为了提高生产效益,在生产过程中提高绒毛品质势在必行。绒毛品质是绒山羊育种中重要的选择参数,而控制绒毛品质的主要性状是数量性状,通过数量遗传学和分子遗传学寻找控制数量性状的主效基因,从而研究其生长机理和控制绒毛生长的基因的表达机制。作者综述了近年来有关绒毛品质的研究成果,其中包括通过表型选择来提高绒毛品质,且找到控制绒毛品质性状的HOX、BMP、KAP基因和色素基因等,还有寻找控制目标性状相应的QTL和对不同序列的SNPs进行GWAS分析,通过基因型的选择来提高绒毛品质,这些研究为提高绒毛品质奠定了理论基础,也为今后研究绒毛品质的遗传因素提供借鉴。 展开更多
关键词 绒毛品质 表型选择 基因家族 QTL 技术 GWAS 分析
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绒山羊骨骼肌miRNAs及其靶基因表达谱分析 被引量:7
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作者 韩志玲 赵德超 +4 位作者 付绍印 吕晓曼 高爱琴 张文广 李金泉 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第10期1539-1546,共8页
本试验选取了miR-1、miR-133、miR-24、miR-122、miR-103、miR-143、let7 7个miRNAs,旨在对其表达量及靶基因表达谱进行分析。选用4只绒山羊的背部和后腿肌肉提取RNA,反转录后,利用SYBR荧光定量PCR来检测各miRNAs的表达量,并采用靶基因... 本试验选取了miR-1、miR-133、miR-24、miR-122、miR-103、miR-143、let7 7个miRNAs,旨在对其表达量及靶基因表达谱进行分析。选用4只绒山羊的背部和后腿肌肉提取RNA,反转录后,利用SYBR荧光定量PCR来检测各miRNAs的表达量,并采用靶基因指纹图谱(MTFP)技术获得各miRNAs的靶基因表达谱。结果表明,miR-NA表达量依次为:miR-1>miR-133>miR-24>let7>miR-143>miR-103>miR-122,其中miR-1和miR-133表达规律相似,且这7个miRNAs在成羊中的表达量均高于羔羊;此外,miRNAs表达量的差异还受性别影响,且miR-NA表达量与靶基因个数及其表达量之间具有相关性。对5个miRNAs的10个靶基因测序并比对,表明靶基因分别编码与信号转导、细胞周期等相关的蛋白。通过这7个miRNAs与其靶基因表达的分析,揭示了肌肉发育相关miRNAs及脂肪发育相关miRNAs在绒山羊骨骼肌中的异同,有利于绒山羊肉质基因的研究。 展开更多
关键词 MIRNA 靶基因 表达 绒山羊 骨骼肌
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杜泊羊背最长肌中脂肪酸种类与含量分析 被引量:10
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作者 刘志红 马丽娜 +11 位作者 米璐 谢遇春 车天宇 奈日乐 杨峰 王志英 王瑞军 苏蕊 张燕军 周薇 王志新 李金泉 《家畜生态学报》 北大核心 2019年第12期50-54,共5页
杜泊羊作为一种进口品种,因其胴体嫩、多汁、鲜、瘦而被国际誉为"钻石级肉"。为探讨杜泊羊肉中脂肪酸的含量随月龄的变化规律,本研究利用气相色谱质谱(GC-MS)技术对6月龄与12月龄杜泊羊背最长肌中36种脂肪酸的种类和含量及在... 杜泊羊作为一种进口品种,因其胴体嫩、多汁、鲜、瘦而被国际誉为"钻石级肉"。为探讨杜泊羊肉中脂肪酸的含量随月龄的变化规律,本研究利用气相色谱质谱(GC-MS)技术对6月龄与12月龄杜泊羊背最长肌中36种脂肪酸的种类和含量及在脂肪酸中所含比重进行研究。结果显示,杜泊羊背最长肌共有36种脂肪酸,其中6月龄与12月龄的饱和脂肪酸含量>单不饱和脂肪酸含量>多不饱和脂肪酸,饱和脂肪酸以及长链脂肪酸含量在12月龄显著高于6月龄(P<0.05),多不饱和脂肪酸的含量在12月龄极显著高于6月龄(P<0.01)。C15:1,C17:0在不同月龄表达差异显著(P<0.05),C18:2c6,C18:3n3,C20:3n3在不同月龄表达差异极显著(P<0.01)。脂肪酸分析结果表明,12月龄杜泊羊的肌肉比6月龄营养价值高。 展开更多
关键词 杜泊羊 脂肪酸 气相色谱技术
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绒山羊次级毛囊生长调控基因的筛选 被引量:2
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作者 李晓燕 张璐 +4 位作者 王乐乐 邬娇 宋慧子 涂藩镜 张燕军 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2015年第10期1733-1740,共8页
旨在筛选绒山羊次级毛囊生长调控基因。本研究以遗传背景相似,有次级毛囊的绒山羊和无次级毛囊的奶山羊为试验动物,利用Illumina Hiseq2000对4只绒山羊与4只奶山羊3、6、9、12月的32个皮肤样品进行RNASeq测序。测序共获得38G数据,共筛选... 旨在筛选绒山羊次级毛囊生长调控基因。本研究以遗传背景相似,有次级毛囊的绒山羊和无次级毛囊的奶山羊为试验动物,利用Illumina Hiseq2000对4只绒山羊与4只奶山羊3、6、9、12月的32个皮肤样品进行RNASeq测序。测序共获得38G数据,共筛选出20 780个基因。差异表达基因分析表明,绒山羊与奶山羊之间在不同时期共有2 409个差异表达基因,其中上调差异表达基因1 175个,下调差异表达基因1 234个,绒山羊之间在不同生长时期差异表达基因共550个,其中上调差异表达基因302个,下调差异表达基因248个。GO功能注释分类显示,差异表达基因主要在细胞与细胞部分、细胞器部分、结合、催化、生物调控、细胞过程、代谢过程等功能富集。KEGG pathway分析发现,42个差异表达基因富集在与毛囊生长相关的WNT、SHH、TGFβ、TNF、MAPK和Notch信号通路中,由此推测其可能为次级毛囊生长相关基因。本研究为深入开展次级毛囊生长相关基因功能验证提供丰富的资源,为揭示次级毛囊生长调控机制提供重要基础,为绒毛产量及品质的提升提供理论依据。 展开更多
关键词 绒山羊 次级毛囊 调控基因 筛选
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基于RNA-Seq识别山羊肉品质候选基因 被引量:14
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作者 孟宪然 杜琛 +4 位作者 王静 付绍印 郑竹清 张文广 李金泉 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2015年第8期1300-1307,共8页
通过研究不同年龄和不同性别绒山羊背最长肌之间的差异表达基因,筛选影响绒山羊肉品质的候选基因。本研究基于RNA-Seq技术对4个绒山羊背最长肌的转录组进行高通量测序,在测序评估的基础上,对差异表达基因进行筛选、功能注释和富集分析... 通过研究不同年龄和不同性别绒山羊背最长肌之间的差异表达基因,筛选影响绒山羊肉品质的候选基因。本研究基于RNA-Seq技术对4个绒山羊背最长肌的转录组进行高通量测序,在测序评估的基础上,对差异表达基因进行筛选、功能注释和富集分析。本研究通过CLC Genomics Workbench 6.0软件共找到263个候选基因,其中包含123个高表达有利基因和140个高表达有害基因。GO功能注释结果显示,高表达有利基因主要与骨骼肌的生长发育、细胞器的形成和蛋白结合功能有关;高表达有害基因主要与脂质代谢、细胞骨架以及结合功能有关。利用KEGG数据库作为参考,这些基因主要参与糖酵解/糖异生、丝裂原活化蛋白激酶、凝血-补体级联反应和色氨酸代谢等通路中。结合其他家畜基因组学研究,ADIPOQ、PDK4和CD36可能作为参与肉品质重要的候选基因。该结果为绒山羊肉品质的改善以及候选基因的研究提供了理论依据。 展开更多
关键词 绒山羊 背最长肌 肉品质 RNA-SEQ 候选基因
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全基因组关联分析在畜禽重要经济性状中的研究进展 被引量:6
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作者 乔贤 张磊 +11 位作者 李晓凯 范一星 马宇浩 张燕军 刘志红 王瑞军 王志英 王志新 赵艳红 何利兵 李金泉 苏蕊 《家畜生态学报》 北大核心 2017年第10期1-9,共9页
以往通过候选基因分析和数量性状位点(quantitative trait locus,QTL)连锁分析等策略使我们对一些基因的功能有了一定了解,但是很多控制畜禽经济性状的基因还无法分离和鉴定。随着高通量测序技术的不断发展以及人类全基因组计划(human g... 以往通过候选基因分析和数量性状位点(quantitative trait locus,QTL)连锁分析等策略使我们对一些基因的功能有了一定了解,但是很多控制畜禽经济性状的基因还无法分离和鉴定。随着高通量测序技术的不断发展以及人类全基因组计划(human genome project,HGP)和许多动植物的全基因组测序完成,全基因组关联分析(genome-wide association study,GWAS)已经成为研究复杂性状的重要方法。文章针对GWAS在重要畜种复杂经济性状中的研究进展进行综述,梳理了近几年在动物经济性状研究中利用GWAS取得的成果,并且对GWAS研究策略与方法进行了归纳总结,旨在利用GWAS为畜禽复杂性状的遗传基础研究提供参考,同时为今后的动物育种工作奠定基础。 展开更多
关键词 全基因组关联分析(GWAS) 畜禽 复杂性状 单核苷酸多态性(SNP) 遗传变异
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不同抗氧化剂对驴冷冻精液质量的影响 被引量:2
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作者 陈小辛 哈斯高娃 +2 位作者 王学峰 张勇伟 娜仁花 《吉林畜牧兽医》 2021年第12期1-3,共3页
本试验旨在研究白藜芦醇Res和MnCl2对驴精液冷冻质量的改善效果。用假阴道法采集种公驴精液,用添加不同浓度的Res(0、5、10、20、40、100μm)和MnCl_(2)(0、0.1、0.5、2、5、10μm)的冷冻稀释液稀释后进行0.25 mL细管分装,以不添加抗氧... 本试验旨在研究白藜芦醇Res和MnCl2对驴精液冷冻质量的改善效果。用假阴道法采集种公驴精液,用添加不同浓度的Res(0、5、10、20、40、100μm)和MnCl_(2)(0、0.1、0.5、2、5、10μm)的冷冻稀释液稀释后进行0.25 mL细管分装,以不添加抗氧化剂组为对照组,在4℃平衡110 min后,将细管于液氮蒸气中熏蒸降温,最终在液氮中保存。37℃水浴解冻后测定精子活力、顶体完整性、膜完整性、ROS、细胞内抗氧化酶含量等指标。结果表明:当Res浓度为40μm时冷冻效果最佳,其活力、质膜完整率、顶体完整率显著高于对照组(p<0.05),ROS含量显著低于对照组(p<0.05),抗氧化酶活性(SOD、CAT、GSH-Px)显著高于对照组(p<0.05)。当MnCl2浓度为5μm时冷冻效果最佳,其活力、质膜完整率、顶体完整率显著高于对照组(p<0.05),SOD和CAT的酶活性显著高于对照组(p<0.05)。 展开更多
关键词 白藜芦醇 MnCl2 精液冷冻 抗氧化酶
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基于GBLUP和Bayes方法实现山羊体重基因组选择 被引量:3
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作者 王志英 洪磊 +5 位作者 李宏伟 王瑞军 张燕军 苏蕊 刘志红 李金泉 《家畜生态学报》 北大核心 2019年第7期22-26,共5页
为有效实现山羊基因组选择,提高选择准确性,根据前期对内蒙古绒山羊生产性能的遗传评估结果,以山羊的体重(h2=0.11)性状为例,结合NCBI已经公布的山羊基因组序列信息,设定群体传递过程和基因组参数,模拟获得个体表型和基因型数据,利用GB... 为有效实现山羊基因组选择,提高选择准确性,根据前期对内蒙古绒山羊生产性能的遗传评估结果,以山羊的体重(h2=0.11)性状为例,结合NCBI已经公布的山羊基因组序列信息,设定群体传递过程和基因组参数,模拟获得个体表型和基因型数据,利用GBLUP和Bayes方法进行基因组育种值估计。结果表明,不同历史群体变化模式下,基因组选择对山羊体重基因组育种估计值准确性无显著影响(P>0.05)。GBLUP法估计的准确性高于Bayes Lasso,准确性达0.40。在历史群体下降模式下,基因组选择准确性高于恒定模式。 展开更多
关键词 山羊 体重 GBLUP和Bayes方法 基因组选择准确性
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